MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019902	GC	3	6	241023	241028	0 %	0 %	50 %	50 %	430759578
5502	NC_019902	CCA	2	6	241044	241049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759578
5503	NC_019902	GAC	2	6	241056	241061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759578
5504	NC_019902	CG	3	6	241085	241090	0 %	0 %	50 %	50 %	430759578
5505	NC_019902	TTC	2	6	241146	241151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759578
5506	NC_019902	CCG	2	6	241163	241168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759578
5507	NC_019902	CAG	3	9	241197	241205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759578
5508	NC_019902	ACG	2	6	241219	241224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759578
5509	NC_019902	ATC	2	6	241225	241230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759578
5510	NC_019902	CTC	2	6	241244	241249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_019902	GTGG	2	8	241266	241273	0 %	25 %	75 %	0 %	430759579
5512	NC_019902	CGGTC	2	10	241286	241295	0 %	20 %	40 %	40 %	430759579
5513	NC_019902	GCTG	2	8	241380	241387	0 %	25 %	50 %	25 %	430759579
5514	NC_019902	ACGG	2	8	241438	241445	25 %	0 %	50 %	25 %	430759579
5515	NC_019902	CGT	2	6	241540	241545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759579
5516	NC_019902	GCA	2	6	241650	241655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759579
5517	NC_019902	CAC	2	6	241659	241664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759579
5518	NC_019902	GCC	3	9	241736	241744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759580
5519	NC_019902	TGG	2	6	241775	241780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759580
5520	NC_019902	TCC	2	6	241801	241806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759580
5521	NC_019902	ACC	2	6	241826	241831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759580
5522	NC_019902	TCGC	2	8	241872	241879	0 %	25 %	25 %	50 %	430759580
5523	NC_019902	GTT	2	6	241909	241914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759580
5524	NC_019902	GCC	2	6	241923	241928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759580
5525	NC_019902	GGC	2	6	241969	241974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759580
5526	NC_019902	TCG	2	6	242019	242024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759580
5527	NC_019902	ACG	2	6	242070	242075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759580
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5530	NC_019902	GCAGG	2	10	242374	242383	20 %	0 %	60 %	20 %	430759580
5531	NC_019902	CGA	2	6	242464	242469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759580
5532	NC_019902	GC	3	6	242550	242555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_019902	TGC	2	6	242577	242582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_019902	CGGG	2	8	242603	242610	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_019902	CGC	2	6	242614	242619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_019902	CGC	2	6	242623	242628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_019902	TTA	2	6	242636	242641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_019902	CTGTG	2	10	242687	242696	0 %	40 %	40 %	20 %	430759581
5539	NC_019902	GCT	2	6	242704	242709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759581
5540	NC_019902	CGT	2	6	242712	242717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759581
5541	NC_019902	CGAA	2	8	242844	242851	50 %	0 %	25 %	25 %	430759581
5542	NC_019902	TCG	2	6	242874	242879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759581
5543	NC_019902	GC	3	6	242891	242896	0 %	0 %	50 %	50 %	430759581
5544	NC_019902	GCTG	2	8	242908	242915	0 %	25 %	50 %	25 %	430759581
5545	NC_019902	CGC	2	6	243067	243072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759581
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5548	NC_019902	GC	3	6	243222	243227	0 %	0 %	50 %	50 %	430759582
5549	NC_019902	GTG	2	6	243232	243237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759582
5550	NC_019902	TTG	2	6	243241	243246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759582
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5552	NC_019902	TGCA	2	8	243344	243351	25 %	25 %	25 %	25 %	430759582
5553	NC_019902	GCG	2	6	243362	243367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759582
5554	NC_019902	TCG	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759582
5555	NC_019902	GCT	2	6	243402	243407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759582
5556	NC_019902	GTC	2	6	243412	243417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759582
5557	NC_019902	GACC	2	8	243447	243454	25 %	0 %	25 %	50 %	430759582
5558	NC_019902	GTCG	2	8	243517	243524	0 %	25 %	50 %	25 %	430759582
5559	NC_019902	GCCGGA	2	12	243627	243638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759582
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5561	NC_019902	ATCGGC	2	12	243682	243693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430759582
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5563	NC_019902	CCG	2	6	243759	243764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759583
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5565	NC_019902	CAG	2	6	243797	243802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759583
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5570	NC_019902	GCC	2	6	243969	243974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759583
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5574	NC_019902	TCCAG	2	10	244054	244063	20 %	20 %	20 %	40 %	430759583
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5582	NC_019902	TCG	2	6	244437	244442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759583
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5589	NC_019902	GCT	2	6	244645	244650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759583
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5591	NC_019902	GC	3	6	244752	244757	0 %	0 %	50 %	50 %	430759583
5592	NC_019902	TGG	2	6	244801	244806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759583
5593	NC_019902	CGA	2	6	244819	244824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759583
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5595	NC_019902	GATGCG	2	12	244883	244894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430759583
5596	NC_019902	TGGCT	2	10	244927	244936	0 %	40 %	40 %	20 %	430759583
5597	NC_019902	AAG	2	6	244946	244951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_019902	GAGC	2	8	244993	245000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_019902	CCG	2	6	245009	245014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_019902	GCG	2	6	245038	245043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_019902	GC	3	6	245063	245068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_019902	CCGCA	2	10	245117	245126	20 %	0 %	20 %	60 %	430759584
5603	NC_019902	GCC	2	6	245184	245189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759584
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5606	NC_019902	TGCGC	2	10	245386	245395	0 %	20 %	40 %	40 %	430759584
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5609	NC_019902	GCAGC	2	10	245488	245497	20 %	0 %	40 %	40 %	430759584
5610	NC_019902	GC	3	6	245508	245513	0 %	0 %	50 %	50 %	430759584
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5620	NC_019902	GAG	2	6	245987	245992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759584
5621	NC_019902	GCGCG	2	10	245998	246007	0 %	0 %	60 %	40 %	430759584
5622	NC_019902	CAG	3	9	246089	246097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759584
5623	NC_019902	CGC	2	6	246104	246109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_019902	GGT	2	6	246125	246130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5643	NC_019902	CAG	2	6	247189	247194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759585
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5673	NC_019902	GGGCG	2	10	248328	248337	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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5742	NC_019902	ACCGG	2	10	251718	251727	20 %	0 %	40 %	40 %	430759590
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5744	NC_019902	CGA	2	6	251795	251800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5745	NC_019902	CTGCGC	2	12	251803	251814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430759590
5746	NC_019902	GAC	2	6	251818	251823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5747	NC_019902	CTG	2	6	251866	251871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5748	NC_019902	GCT	2	6	251886	251891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5749	NC_019902	CGA	2	6	251970	251975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759590
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5751	NC_019902	GCT	2	6	251988	251993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5752	NC_019902	CGG	2	6	252009	252014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759590
5753	NC_019902	CGG	2	6	252048	252053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759590
5754	NC_019902	GGCC	2	8	252090	252097	0 %	0 %	50 %	50 %	430759590
5755	NC_019902	CGG	2	6	252102	252107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759590
5756	NC_019902	TGC	3	9	252158	252166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
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5759	NC_019902	CTG	2	6	252271	252276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
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5764	NC_019902	GCG	2	6	252391	252396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759590
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5772	NC_019902	CGG	2	6	252597	252602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759590
5773	NC_019902	GCT	2	6	252615	252620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759590
5774	NC_019902	CG	3	6	252741	252746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5775	NC_019902	GC	3	6	252765	252770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5776	NC_019902	CG	3	6	252787	252792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5777	NC_019902	GCC	2	6	252808	252813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5778	NC_019902	GGC	2	6	252819	252824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5779	NC_019902	GGTC	2	8	252860	252867	0 %	25 %	50 %	25 %	430759591
5780	NC_019902	GCTG	2	8	252882	252889	0 %	25 %	50 %	25 %	430759591
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5823	NC_019902	TACAT	2	10	254973	254982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5824	NC_019902	CGC	2	6	255018	255023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5825	NC_019902	TA	5	10	255052	255061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5826	NC_019902	GT	3	6	255072	255077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5827	NC_019902	GGT	2	6	255186	255191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5828	NC_019902	TA	3	6	255236	255241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5829	NC_019902	CGAT	2	8	255302	255309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5830	NC_019902	AGC	2	6	255335	255340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5831	NC_019902	GCA	2	6	255349	255354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5832	NC_019902	ATC	2	6	255360	255365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759593
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5835	NC_019902	GAG	2	6	255570	255575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759593
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5837	NC_019902	CTGT	2	8	255642	255649	0 %	50 %	25 %	25 %	430759593
5838	NC_019902	GATGC	2	10	255700	255709	20 %	20 %	40 %	20 %	430759594
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5844	NC_019902	GTC	2	6	256054	256059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759594
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5849	NC_019902	CG	3	6	256385	256390	0 %	0 %	50 %	50 %	430759594
5850	NC_019902	CGTG	2	8	256392	256399	0 %	25 %	50 %	25 %	430759594
5851	NC_019902	CAG	2	6	256468	256473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759594
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5853	NC_019902	TCG	2	6	256635	256640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759594
5854	NC_019902	CTT	2	6	256650	256655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759594
5855	NC_019902	CTT	2	6	256701	256706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759594
5856	NC_019902	CCA	2	6	256721	256726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759594
5857	NC_019902	GCG	2	6	256732	256737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759594
5858	NC_019902	GCA	2	6	256749	256754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759594
5859	NC_019902	CAGCCA	2	12	256860	256871	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759594
5860	NC_019902	CGC	2	6	256877	256882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759594
5861	NC_019902	ATG	2	6	256888	256893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759594
5862	NC_019902	GAT	2	6	257013	257018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759594
5863	NC_019902	GGA	2	6	257055	257060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759594
5864	NC_019902	ACG	2	6	257090	257095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759594
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5988	NC_019902	GGT	3	9	261890	261898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600
5989	NC_019902	GGCGG	2	10	261953	261962	0 %	0 %	80 %	20 %	430759600
5990	NC_019902	TGG	3	9	262024	262032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600
5991	NC_019902	CGC	2	6	262033	262038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759600
5992	NC_019902	CAG	2	6	262047	262052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759600
5993	NC_019902	CGG	2	6	262087	262092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759600
5994	NC_019902	GGC	2	6	262246	262251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759600
5995	NC_019902	G	6	6	262258	262263	0 %	0 %	100 %	0 %	430759600
5996	NC_019902	GC	3	6	262281	262286	0 %	0 %	50 %	50 %	430759600
5997	NC_019902	CTG	2	6	262305	262310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759600
5998	NC_019902	CGA	2	6	262349	262354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759600
5999	NC_019902	GCGG	2	8	262361	262368	0 %	0 %	75 %	25 %	430759600
6000	NC_019902	TGG	2	6	262393	262398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600

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