MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermobacillus composti KWC4 plasmid pTHECO01

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019898	TTTAAC	2	12	2079	2090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	430748201
2	NC_019898	TCCTCG	2	12	2325	2336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748201
3	NC_019898	CCTATT	2	12	2500	2511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019898	GTAATA	2	12	3847	3858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019898	GAAACC	2	12	9431	9442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430748206
6	NC_019898	ATGGAG	2	12	9667	9678	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430748207
7	NC_019898	TCCCGC	2	12	11305	11316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	430748210
8	NC_019898	ACCGTA	2	12	14155	14166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019898	CACATA	2	12	18457	18468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	430748217
10	NC_019898	AGCTTC	2	12	20823	20834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430748222
11	NC_019898	GCTTCC	2	12	20838	20849	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748222
12	NC_019898	CCGGTA	2	12	21810	21821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748224
13	NC_019898	TTTTGA	2	12	26623	26634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	430748230
14	NC_019898	AAACAT	2	12	29108	29119	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	430748236
15	NC_019898	ATTGCA	2	12	32319	32330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	430748237
16	NC_019898	CCCAGT	2	12	36326	36337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748239
17	NC_019898	TTTTTG	2	12	37859	37870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430748242
18	NC_019898	CGTTTA	2	12	38971	38982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430748244
19	NC_019898	GCTTCC	2	12	39296	39307	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748244
20	NC_019898	TGAAAT	2	12	46144	46155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	430748248
21	NC_019898	AAGATG	2	12	46617	46628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430748248
22	NC_019898	GGATGA	2	12	50895	50906	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430748254
23	NC_019898	TTGGAC	2	12	51307	51318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430748254
24	NC_019898	CCACAA	2	12	52041	52052	50 %	0 %	0 %	50 %	430748255
25	NC_019898	ACCAGA	2	12	53299	53310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430748256
26	NC_019898	AACGAA	2	12	54291	54302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019898	ATTGAG	2	12	54726	54737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019898	TCGCAA	2	12	57781	57792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748259
29	NC_019898	TTTCTT	2	12	57814	57825	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	430748259
30	NC_019898	AACGTT	2	12	63605	63616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	430748265
31	NC_019898	AAACTC	2	12	64511	64522	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	430748266
32	NC_019898	AGTTTG	2	12	68631	68642	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430748268
33	NC_019898	TAATAT	2	12	71799	71810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019898	TAATGA	2	12	72475	72486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	430748271
35	NC_019898	GTGTCG	2	12	72986	72997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430748271
36	NC_019898	ACGCTG	2	12	76409	76420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748271
37	NC_019898	TACACG	2	12	77807	77818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748271
38	NC_019898	TCACGG	2	12	78147	78158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748271
39	NC_019898	GCGGAG	2	12	78393	78404	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430748271
40	NC_019898	GCCTCG	2	12	87432	87443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430748280
41	NC_019898	GATCCG	2	12	93937	93948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748286
42	NC_019898	AGAAAA	2	12	94950	94961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	430748287
43	NC_019898	CAAGCA	2	12	95176	95187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430748287
44	NC_019898	GAAGAT	2	12	97900	97911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	430748290
45	NC_019898	CCCGAT	2	12	102178	102189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748295
46	NC_019898	TAACCG	2	12	103504	103515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019898	ATGTCG	2	12	120494	120505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430748314
48	NC_019898	TTTTTG	2	12	121070	121081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430748314
49	NC_019898	CAATAA	2	12	121229	121240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019898	AATTTC	2	12	122111	122122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	430748315
51	NC_019898	AGAAGG	2	12	126222	126233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019898	CAAATG	2	12	129149	129160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	430748324
53	NC_019898	AATTTC	2	12	130526	130537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019898	TCAACG	2	12	137734	137745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748333
55	NC_019898	GTAATG	2	12	139553	139564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019898	TGCGGA	2	12	141964	141975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430748337
57	NC_019898	GAAAAA	2	12	145667	145678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019898	CTCCAG	2	12	146209	146220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748346
59	NC_019898	CCGGAA	2	12	146334	146345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748346
60	NC_019898	GGCAAT	2	12	148353	148364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430748348

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.