MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 102345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019897	ACC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748363
502	NC_019897	GAA	2	6	21124	21129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748363
503	NC_019897	CAT	2	6	21151	21156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748363
504	NC_019897	TCA	2	6	21165	21170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748363
505	NC_019897	GAT	2	6	21178	21183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
506	NC_019897	GCA	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748363
507	NC_019897	CTTT	2	8	21244	21251	0 %	75 %	0 %	25 %	430748363
508	NC_019897	CCA	2	6	21252	21257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748363
509	NC_019897	AAT	2	6	21265	21270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748363
510	NC_019897	CGC	3	9	21283	21291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748363
511	NC_019897	GAT	2	6	21301	21306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
512	NC_019897	GAT	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
513	NC_019897	CGCGC	2	10	21417	21426	0 %	0 %	40 %	60 %	430748363
514	NC_019897	GCCAGT	2	12	21495	21506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748363
515	NC_019897	CGA	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748363
516	NC_019897	CAT	2	6	21571	21576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748363
517	NC_019897	CG	3	6	21600	21605	0 %	0 %	50 %	50 %	430748363
518	NC_019897	CGG	2	6	21624	21629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748363
519	NC_019897	ATG	3	9	21644	21652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
520	NC_019897	GCC	2	6	21748	21753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748363
521	NC_019897	TCG	2	6	21804	21809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748363
522	NC_019897	TAA	2	6	21837	21842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748363
523	NC_019897	ATG	2	6	21878	21883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
524	NC_019897	GGC	2	6	21919	21924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748363
525	NC_019897	CGC	2	6	21934	21939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748363
526	NC_019897	GGC	2	6	21946	21951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748363
527	NC_019897	ATG	2	6	21953	21958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748363
528	NC_019897	TG	3	6	21972	21977	0 %	50 %	50 %	0 %	430748363
529	NC_019897	TTC	2	6	21982	21987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748363
530	NC_019897	TGT	2	6	21990	21995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748363
531	NC_019897	TC	3	6	21996	22001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_019897	GCC	2	6	22016	22021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_019897	GGATC	2	10	22030	22039	20 %	20 %	40 %	20 %	430748364
534	NC_019897	GCT	2	6	22048	22053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748364
535	NC_019897	AGC	2	6	22123	22128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748364
536	NC_019897	TCGC	2	8	22141	22148	0 %	25 %	25 %	50 %	430748364
537	NC_019897	GCA	2	6	22154	22159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748364
538	NC_019897	CTC	2	6	22170	22175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748364
539	NC_019897	CGGCG	2	10	22193	22202	0 %	0 %	60 %	40 %	430748364
540	NC_019897	TCG	2	6	22204	22209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748364
541	NC_019897	TCACGG	2	12	22259	22270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748364
542	NC_019897	CAG	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748364
543	NC_019897	TGC	2	6	22381	22386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748364
544	NC_019897	GCT	2	6	22403	22408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748364
545	NC_019897	TTC	2	6	22642	22647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_019897	TGA	2	6	22667	22672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019897	CTT	2	6	22688	22693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_019897	TTG	2	6	22738	22743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019897	ATG	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019897	CTT	2	6	22909	22914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_019897	GCTA	2	8	22958	22965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_019897	AGA	2	6	23035	23040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019897	TTC	2	6	23044	23049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_019897	CGTC	2	8	23147	23154	0 %	25 %	25 %	50 %	430748365
555	NC_019897	CTT	2	6	23160	23165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
556	NC_019897	CG	3	6	23176	23181	0 %	0 %	50 %	50 %	430748365
557	NC_019897	CGC	2	6	23213	23218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
558	NC_019897	TTC	2	6	23263	23268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
559	NC_019897	TTG	2	6	23294	23299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748365
560	NC_019897	GCC	3	9	23317	23325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
561	NC_019897	TGT	2	6	23334	23339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748365
562	NC_019897	CTT	2	6	23448	23453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
563	NC_019897	CAG	2	6	23476	23481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
564	NC_019897	AGT	2	6	23568	23573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748365
565	NC_019897	CCGT	2	8	23579	23586	0 %	25 %	25 %	50 %	430748365
566	NC_019897	CGC	2	6	23596	23601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
567	NC_019897	GAT	2	6	23602	23607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748365
568	NC_019897	CTC	2	6	23608	23613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748365
569	NC_019897	TCT	4	12	23619	23630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
570	NC_019897	GAT	2	6	23647	23652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748365
571	NC_019897	TCA	2	6	23718	23723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748365
572	NC_019897	GTC	2	6	23731	23736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
573	NC_019897	ATC	2	6	23737	23742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748365
574	NC_019897	GCC	2	6	23785	23790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
575	NC_019897	GTC	2	6	23908	23913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
576	NC_019897	GC	3	6	23929	23934	0 %	0 %	50 %	50 %	430748365
577	NC_019897	TCCGC	2	10	23940	23949	0 %	20 %	20 %	60 %	430748365
578	NC_019897	T	6	6	23982	23987	0 %	100 %	0 %	0 %	430748365
579	NC_019897	CGA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
580	NC_019897	CATGCC	2	12	24070	24081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748365
581	NC_019897	GCC	3	9	24079	24087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
582	NC_019897	ACG	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
583	NC_019897	AGC	2	6	24107	24112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
584	NC_019897	ACGTCA	2	12	24158	24169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748365
585	NC_019897	CGG	2	6	24175	24180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748365
586	NC_019897	TCC	2	6	24236	24241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748365
587	NC_019897	CGT	2	6	24246	24251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
588	NC_019897	GCT	2	6	24322	24327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
589	NC_019897	TTC	2	6	24332	24337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
590	NC_019897	CGC	2	6	24411	24416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
591	NC_019897	GGC	2	6	24418	24423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748365
592	NC_019897	AGC	2	6	24434	24439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
593	NC_019897	CGT	2	6	24441	24446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
594	NC_019897	CTT	2	6	24450	24455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
595	NC_019897	CTT	2	6	24463	24468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
596	NC_019897	TGA	2	6	24480	24485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748365
597	NC_019897	CGT	2	6	24511	24516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
598	NC_019897	TGCCGT	2	12	24528	24539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
599	NC_019897	CG	3	6	24545	24550	0 %	0 %	50 %	50 %	430748365
600	NC_019897	CATC	2	8	24555	24562	25 %	25 %	0 %	50 %	430748365
601	NC_019897	CTG	2	6	24571	24576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
602	NC_019897	CCG	2	6	24590	24595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
603	NC_019897	GCC	2	6	24596	24601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748365
604	NC_019897	CGCACC	2	12	24602	24613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430748365
605	NC_019897	GTC	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748365
606	NC_019897	AGC	2	6	24701	24706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
607	NC_019897	CTT	2	6	24787	24792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748365
608	NC_019897	CAG	2	6	24832	24837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748365
609	NC_019897	GTT	2	6	24838	24843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748365
610	NC_019897	TTTCA	2	10	24877	24886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
611	NC_019897	CTG	2	6	24926	24931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748366
612	NC_019897	CGG	2	6	24949	24954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748366
613	NC_019897	GAT	2	6	24986	24991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748366
614	NC_019897	TCG	2	6	25032	25037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748366
615	NC_019897	GAC	2	6	25049	25054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748366
616	NC_019897	TGC	2	6	25107	25112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748366
617	NC_019897	TCT	2	6	25120	25125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748366
618	NC_019897	CCTT	2	8	25170	25177	0 %	50 %	0 %	50 %	430748366
619	NC_019897	CAGC	2	8	25178	25185	25 %	0 %	25 %	50 %	430748366
620	NC_019897	TCC	2	6	25269	25274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748366
621	NC_019897	GCCCG	2	10	25313	25322	0 %	0 %	40 %	60 %	430748366
622	NC_019897	ATG	2	6	25326	25331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748366
623	NC_019897	CTG	2	6	25373	25378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748366
624	NC_019897	ACGT	2	8	25422	25429	25 %	25 %	25 %	25 %	430748366
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