MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 102345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019897	CGG	3	9	236666	236674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5502	NC_019897	GCG	2	6	236709	236714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5503	NC_019897	GCC	2	6	236753	236758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5504	NC_019897	GCC	2	6	236800	236805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5505	NC_019897	GGC	2	6	236807	236812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5506	NC_019897	CGG	2	6	236819	236824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5507	NC_019897	GTC	2	6	236841	236846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5508	NC_019897	GTC	2	6	236859	236864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5509	NC_019897	GCC	2	6	236904	236909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5510	NC_019897	GCT	4	12	236924	236935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5511	NC_019897	GCC	2	6	236970	236975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5512	NC_019897	CGG	2	6	237028	237033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5513	NC_019897	CGCCGG	2	12	237089	237100	0 %	0 %	50 %	50 %	430748548
5514	NC_019897	GGA	2	6	237182	237187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748548
5515	NC_019897	ACGG	2	8	237243	237250	25 %	0 %	50 %	25 %	430748548
5516	NC_019897	GCCGG	2	10	237264	237273	0 %	0 %	60 %	40 %	430748548
5517	NC_019897	GGCC	2	8	237322	237329	0 %	0 %	50 %	50 %	430748548
5518	NC_019897	CGG	3	9	237337	237345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5519	NC_019897	TGGA	2	8	237348	237355	25 %	25 %	50 %	0 %	430748548
5520	NC_019897	GCT	2	6	237359	237364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5521	NC_019897	CCG	2	6	237392	237397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5522	NC_019897	GCT	2	6	237410	237415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5523	NC_019897	CGT	2	6	237416	237421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5524	NC_019897	GCG	2	6	237446	237451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5525	NC_019897	CGC	2	6	237512	237517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748548
5526	NC_019897	GGC	2	6	237524	237529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748548
5527	NC_019897	TGC	2	6	237532	237537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5528	NC_019897	CGA	2	6	237566	237571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5529	NC_019897	TGA	2	6	237598	237603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748548
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5531	NC_019897	CGA	2	6	237629	237634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5532	NC_019897	GGCG	2	8	237731	237738	0 %	0 %	75 %	25 %	430748548
5533	NC_019897	CG	3	6	237741	237746	0 %	0 %	50 %	50 %	430748548
5534	NC_019897	CGA	2	6	237791	237796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5535	NC_019897	CAT	2	6	237864	237869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748548
5536	NC_019897	AGG	2	6	237887	237892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_019897	TGA	2	6	237899	237904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748549
5538	NC_019897	CAG	2	6	237976	237981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748549
5539	NC_019897	AGA	2	6	237989	237994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748549
5540	NC_019897	CGGT	2	8	237997	238004	0 %	25 %	50 %	25 %	430748549
5541	NC_019897	GGA	2	6	238014	238019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748549
5542	NC_019897	CCG	2	6	238035	238040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748549
5543	NC_019897	TCA	2	6	238073	238078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748549
5544	NC_019897	GCT	2	6	238095	238100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748549
5545	NC_019897	GCCG	2	8	238117	238124	0 %	0 %	50 %	50 %	430748549
5546	NC_019897	GAA	2	6	238125	238130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748549
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5548	NC_019897	CGA	2	6	238221	238226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748549
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5550	NC_019897	GCG	2	6	238273	238278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748550
5551	NC_019897	G	10	10	238281	238290	0 %	0 %	100 %	0 %	430748550
5552	NC_019897	ACGG	2	8	238303	238310	25 %	0 %	50 %	25 %	430748550
5553	NC_019897	GCG	2	6	238311	238316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748550
5554	NC_019897	GGC	2	6	238336	238341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748550
5555	NC_019897	TCG	2	6	238423	238428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748550
5556	NC_019897	ACG	2	6	238458	238463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748550
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5558	NC_019897	GTC	2	6	238514	238519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748550
5559	NC_019897	GCG	2	6	238581	238586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748550
5560	NC_019897	CGGC	2	8	238598	238605	0 %	0 %	50 %	50 %	430748550
5561	NC_019897	CGC	2	6	238619	238624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748550
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5568	NC_019897	CGG	3	9	238874	238882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748550
5569	NC_019897	TGCGGC	2	12	238910	238921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430748550
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5572	NC_019897	GCC	2	6	239085	239090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_019897	GAG	2	6	239096	239101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_019897	CGG	2	6	239138	239143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_019897	GCC	2	6	239147	239152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_019897	TG	3	6	239153	239158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_019897	GCC	2	6	239166	239171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_019897	CGG	2	6	239186	239191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_019897	CTG	2	6	239245	239250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_019897	TTC	2	6	239279	239284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_019897	C	7	7	239352	239358	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5582	NC_019897	T	6	6	239392	239397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_019897	TTC	2	6	239444	239449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_019897	CCGG	2	8	239460	239467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_019897	CGC	2	6	239546	239551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_019897	C	12	12	239554	239565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5587	NC_019897	TCGACC	2	12	239658	239669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748551
5588	NC_019897	GAC	2	6	239713	239718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5589	NC_019897	CTC	2	6	239729	239734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748551
5590	NC_019897	GGCG	2	8	239740	239747	0 %	0 %	75 %	25 %	430748551
5591	NC_019897	AAG	2	6	239801	239806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748551
5592	NC_019897	GGC	2	6	239851	239856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5593	NC_019897	GC	3	6	239855	239860	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5594	NC_019897	TGCG	2	8	239936	239943	0 %	25 %	50 %	25 %	430748551
5595	NC_019897	CGG	2	6	240003	240008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5596	NC_019897	TACGA	2	10	240050	240059	40 %	20 %	20 %	20 %	430748551
5597	NC_019897	GCG	2	6	240096	240101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
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5599	NC_019897	CTG	2	6	240113	240118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5600	NC_019897	CG	3	6	240140	240145	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5601	NC_019897	CGC	2	6	240166	240171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748551
5602	NC_019897	CAA	2	6	240208	240213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748551
5603	NC_019897	CGA	2	6	240226	240231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
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5605	NC_019897	GAC	2	6	240241	240246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5606	NC_019897	CGA	2	6	240316	240321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5607	NC_019897	CGT	2	6	240391	240396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5608	NC_019897	GGCGC	2	10	240426	240435	0 %	0 %	60 %	40 %	430748551
5609	NC_019897	GCG	2	6	240533	240538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5610	NC_019897	GACC	2	8	240586	240593	25 %	0 %	25 %	50 %	430748551
5611	NC_019897	CGAA	2	8	240660	240667	50 %	0 %	25 %	25 %	430748551
5612	NC_019897	GAA	2	6	240749	240754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748551
5613	NC_019897	TCG	2	6	240786	240791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5614	NC_019897	ACG	2	6	240864	240869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5615	NC_019897	ATC	2	6	240887	240892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748551
5616	NC_019897	ACG	2	6	240920	240925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5617	NC_019897	GCG	2	6	240947	240952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5618	NC_019897	CG	4	8	241017	241024	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5619	NC_019897	GAT	2	6	241045	241050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748551
5620	NC_019897	GAG	2	6	241130	241135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748551
5621	NC_019897	AGTCGC	2	12	241158	241169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5622	NC_019897	CGA	2	6	241183	241188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5623	NC_019897	GACC	2	8	241252	241259	25 %	0 %	25 %	50 %	430748551
5624	NC_019897	GAC	2	6	241316	241321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5625	NC_019897	GTC	2	6	241325	241330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5626	NC_019897	TGA	2	6	241332	241337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748551
5627	NC_019897	TCA	2	6	241377	241382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748551
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5629	NC_019897	CG	3	6	241415	241420	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5630	NC_019897	GAC	2	6	241427	241432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5631	NC_019897	GCG	2	6	241450	241455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5632	NC_019897	CG	3	6	241476	241481	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5633	NC_019897	GGA	2	6	241564	241569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748551
5634	NC_019897	CGCC	2	8	241599	241606	0 %	0 %	25 %	75 %	430748551
5635	NC_019897	GTTCGG	2	12	241612	241623	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430748551
5636	NC_019897	CGG	3	9	241678	241686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5637	NC_019897	GGC	3	9	241691	241699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5638	NC_019897	CGG	3	9	241702	241710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5639	NC_019897	GCGCC	2	10	241725	241734	0 %	0 %	40 %	60 %	430748551
5640	NC_019897	GGC	2	6	241751	241756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748551
5641	NC_019897	GCCG	2	8	241783	241790	0 %	0 %	50 %	50 %	430748551
5642	NC_019897	CAAC	2	8	241821	241828	50 %	0 %	0 %	50 %	430748551
5643	NC_019897	GTC	2	6	241883	241888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
5644	NC_019897	GCT	2	6	241957	241962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748551
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5648	NC_019897	TCA	2	6	242115	242120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748552
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5650	NC_019897	ACG	2	6	242145	242150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748552
5651	NC_019897	CGT	2	6	242179	242184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748552
5652	NC_019897	CGG	2	6	242212	242217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748552
5653	NC_019897	GCACCG	2	12	242242	242253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430748552
5654	NC_019897	GAC	2	6	242291	242296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748552
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5656	NC_019897	CG	3	6	242457	242462	0 %	0 %	50 %	50 %	430748552
5657	NC_019897	CGT	2	6	242470	242475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748552
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5659	NC_019897	GC	3	6	242646	242651	0 %	0 %	50 %	50 %	430748552
5660	NC_019897	CCG	2	6	242676	242681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748552
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5671	NC_019897	CCG	2	6	243166	243171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748552
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5673	NC_019897	CGA	2	6	243208	243213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748552
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5676	NC_019897	ATC	2	6	243230	243235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748552
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5693	NC_019897	AGGCGG	2	12	243765	243776	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430748552
5694	NC_019897	CGGC	2	8	243779	243786	0 %	0 %	50 %	50 %	430748552
5695	NC_019897	GTC	2	6	243844	243849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748552
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5699	NC_019897	GCA	2	6	243954	243959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748552
5700	NC_019897	CGA	3	9	243997	244005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748552
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5702	NC_019897	CCG	2	6	244108	244113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5703	NC_019897	GCCG	2	8	244179	244186	0 %	0 %	50 %	50 %	430748553
5704	NC_019897	GAA	2	6	244191	244196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748553
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5708	NC_019897	TGCA	2	8	244354	244361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5709	NC_019897	TTA	2	6	244393	244398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748554
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5711	NC_019897	GAA	2	6	244457	244462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748554
5712	NC_019897	T	7	7	244568	244574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5713	NC_019897	CGA	2	6	244602	244607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748555
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5727	NC_019897	GTC	2	6	245143	245148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748555
5728	NC_019897	T	6	6	245176	245181	0 %	100 %	0 %	0 %	430748555
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5730	NC_019897	CTTC	2	8	245235	245242	0 %	50 %	0 %	50 %	430748555
5731	NC_019897	CGA	2	6	245250	245255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748555
5732	NC_019897	TCC	2	6	245264	245269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748555
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5735	NC_019897	CG	4	8	245399	245406	0 %	0 %	50 %	50 %	430748555
5736	NC_019897	CCA	2	6	245493	245498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748555
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5738	NC_019897	GGC	2	6	245607	245612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5739	NC_019897	CGG	3	9	245645	245653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5740	NC_019897	GCT	2	6	245713	245718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5742	NC_019897	GAG	2	6	245773	245778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_019897	ATC	2	6	245822	245827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748556
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5990	NC_019897	GTC	2	6	256709	256714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748567
5991	NC_019897	TCG	2	6	256719	256724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748567
5992	NC_019897	GCGAT	2	10	256740	256749	20 %	20 %	40 %	20 %	430748567
5993	NC_019897	GCCATC	2	12	256781	256792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748567
5994	NC_019897	TGG	2	6	256875	256880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748567
5995	NC_019897	GAC	2	6	256885	256890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748567
5996	NC_019897	GCT	2	6	256990	256995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748567
5997	NC_019897	TGC	3	9	257031	257039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748567
5998	NC_019897	TGG	2	6	257048	257053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748567
5999	NC_019897	GCC	2	6	257056	257061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748567
6000	NC_019897	GCC	2	6	257108	257113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748567

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