MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 102345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019897	A	6	6	215468	215473	100 %	0 %	0 %	0 %	430748529
5002	NC_019897	CCT	2	6	215505	215510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748530
5003	NC_019897	AT	3	6	215523	215528	50 %	50 %	0 %	0 %	430748530
5004	NC_019897	GGC	2	6	215629	215634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748530
5005	NC_019897	CAA	2	6	215653	215658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748530
5006	NC_019897	TCG	2	6	215679	215684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748530
5007	NC_019897	GC	3	6	215733	215738	0 %	0 %	50 %	50 %	430748530
5008	NC_019897	CGG	2	6	215740	215745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748530
5009	NC_019897	ATG	2	6	215764	215769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748530
5010	NC_019897	GCA	2	6	215803	215808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_019897	CCGGA	2	10	215809	215818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5012	NC_019897	T	6	6	215838	215843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019897	GCC	2	6	215870	215875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_019897	T	7	7	215924	215930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019897	CGCC	2	8	215993	216000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5016	NC_019897	GGA	2	6	216003	216008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019897	T	6	6	216132	216137	0 %	100 %	0 %	0 %	430748531
5018	NC_019897	GGC	2	6	216177	216182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748531
5019	NC_019897	GGAA	2	8	216202	216209	50 %	0 %	50 %	0 %	430748531
5020	NC_019897	GCT	2	6	216254	216259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748531
5021	NC_019897	GTC	2	6	216399	216404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748531
5022	NC_019897	GAA	2	6	216509	216514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5023	NC_019897	GGGA	2	8	216605	216612	25 %	0 %	75 %	0 %	430748531
5024	NC_019897	GAA	3	9	216614	216622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5025	NC_019897	AT	3	6	216830	216835	50 %	50 %	0 %	0 %	430748531
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5028	NC_019897	GAA	2	6	216960	216965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5029	NC_019897	CGG	2	6	217038	217043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748531
5030	NC_019897	AAG	2	6	217059	217064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5031	NC_019897	AGTG	2	8	217071	217078	25 %	25 %	50 %	0 %	430748531
5032	NC_019897	GCC	2	6	217169	217174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748531
5033	NC_019897	TTA	2	6	217196	217201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748531
5034	NC_019897	GCCT	2	8	217218	217225	0 %	25 %	25 %	50 %	430748531
5035	NC_019897	GAA	2	6	217227	217232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5036	NC_019897	GAT	2	6	217289	217294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748531
5037	NC_019897	GAA	2	6	217314	217319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5038	NC_019897	GAA	2	6	217332	217337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748531
5039	NC_019897	CAG	2	6	217406	217411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_019897	CGATG	2	10	217443	217452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_019897	GAT	2	6	217453	217458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019897	GAA	2	6	217492	217497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019897	GGA	2	6	217501	217506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019897	GCG	2	6	217686	217691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019897	CGC	2	6	217782	217787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748532
5046	NC_019897	CGCC	2	8	217831	217838	0 %	0 %	25 %	75 %	430748532
5047	NC_019897	TGG	2	6	217967	217972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748532
5048	NC_019897	GGCAA	2	10	217982	217991	40 %	0 %	40 %	20 %	430748532
5049	NC_019897	GCT	2	6	218004	218009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748532
5050	NC_019897	ACGGGC	2	12	218017	218028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430748532
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5052	NC_019897	GGC	2	6	218103	218108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748532
5053	NC_019897	AAC	2	6	218143	218148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748532
5054	NC_019897	TTA	2	6	218169	218174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748532
5055	NC_019897	ATT	2	6	218177	218182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748532
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5057	NC_019897	GCG	2	6	218292	218297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748532
5058	NC_019897	TCA	2	6	218303	218308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748532
5059	NC_019897	CGG	2	6	218507	218512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748532
5060	NC_019897	CGA	2	6	218550	218555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748532
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5063	NC_019897	GGA	2	6	218697	218702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748532
5064	NC_019897	GGA	2	6	218709	218714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748532
5065	NC_019897	GCAAG	2	10	218724	218733	40 %	0 %	40 %	20 %	430748532
5066	NC_019897	AGC	2	6	218756	218761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748532
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5070	NC_019897	TCG	3	9	218900	218908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748532
5071	NC_019897	CG	3	6	218938	218943	0 %	0 %	50 %	50 %	430748532
5072	NC_019897	GC	3	6	218962	218967	0 %	0 %	50 %	50 %	430748532
5073	NC_019897	TCG	2	6	218978	218983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748532
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5092	NC_019897	AAGA	2	8	219748	219755	75 %	0 %	25 %	0 %	430748532
5093	NC_019897	GAAG	2	8	219792	219799	50 %	0 %	50 %	0 %	430748532
5094	NC_019897	GCT	2	6	219846	219851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748532
5095	NC_019897	GCGG	2	8	219891	219898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_019897	GAT	2	6	219912	219917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_019897	TTTTC	2	10	219971	219980	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5098	NC_019897	TCCC	2	8	219991	219998	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5099	NC_019897	CGA	2	6	220000	220005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_019897	TCAAC	2	10	220060	220069	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5101	NC_019897	A	6	6	220102	220107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019897	GGT	2	6	220111	220116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019897	ATT	2	6	220165	220170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748533
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5105	NC_019897	CGA	2	6	220245	220250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748533
5106	NC_019897	AGTC	2	8	220251	220258	25 %	25 %	25 %	25 %	430748533
5107	NC_019897	GA	3	6	220265	220270	50 %	0 %	50 %	0 %	430748533
5108	NC_019897	ACG	2	6	220321	220326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748533
5109	NC_019897	AGCC	2	8	220373	220380	25 %	0 %	25 %	50 %	430748533
5110	NC_019897	GACG	2	8	220431	220438	25 %	0 %	50 %	25 %	430748533
5111	NC_019897	TTC	2	6	220458	220463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748533
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5113	NC_019897	GGA	3	9	220503	220511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748533
5114	NC_019897	GAT	2	6	220558	220563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748533
5115	NC_019897	ACGGG	2	10	220588	220597	20 %	0 %	60 %	20 %	430748533
5116	NC_019897	CGG	2	6	220673	220678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748533
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5118	NC_019897	GCC	2	6	220792	220797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748533
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5120	NC_019897	GC	3	6	220830	220835	0 %	0 %	50 %	50 %	430748533
5121	NC_019897	GGA	2	6	220866	220871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748533
5122	NC_019897	TAT	2	6	220903	220908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748533
5123	NC_019897	ACG	2	6	220910	220915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748533
5124	NC_019897	GAA	2	6	220957	220962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748533
5125	NC_019897	TGA	2	6	221006	221011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748533
5126	NC_019897	ACGA	2	8	221119	221126	50 %	0 %	25 %	25 %	430748533
5127	NC_019897	ATTC	2	8	221127	221134	25 %	50 %	0 %	25 %	430748533
5128	NC_019897	TGA	2	6	221201	221206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748533
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5133	NC_019897	GTT	2	6	221465	221470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748534
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5143	NC_019897	GGA	2	6	222328	222333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_019897	GGC	2	6	222368	222373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5167	NC_019897	AAACA	2	10	223350	223359	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5170	NC_019897	ATG	2	6	223513	223518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_019897	CGGA	2	8	225888	225895	25 %	0 %	50 %	25 %	430748539
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5243	NC_019897	TCCGGC	2	12	225989	226000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430748539
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5245	NC_019897	CG	3	6	226055	226060	0 %	0 %	50 %	50 %	430748539
5246	NC_019897	ATCGAC	2	12	226118	226129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748539
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5248	NC_019897	CGA	2	6	226186	226191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748539
5249	NC_019897	ACGA	2	8	226214	226221	50 %	0 %	25 %	25 %	430748539
5250	NC_019897	GCTTCA	2	12	226251	226262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430748539
5251	NC_019897	GGC	2	6	226271	226276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748539
5252	NC_019897	GCG	2	6	226293	226298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748539
5253	NC_019897	CAT	2	6	226303	226308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748539
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5257	NC_019897	AGCGC	2	10	226564	226573	20 %	0 %	40 %	40 %	430748539
5258	NC_019897	CCG	2	6	226597	226602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748539
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5261	NC_019897	GAC	2	6	226658	226663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748539
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5272	NC_019897	TGC	2	6	227099	227104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748540
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5279	NC_019897	TCGCGA	2	12	227434	227445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430748541
5280	NC_019897	TCG	2	6	227560	227565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748541
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5320	NC_019897	GCGG	2	8	229289	229296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5322	NC_019897	GTT	2	6	229349	229354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5323	NC_019897	AGG	2	6	229442	229447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5332	NC_019897	CGG	2	6	229761	229766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748544
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5352	NC_019897	GCG	2	6	230558	230563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748544
5353	NC_019897	CGG	2	6	230581	230586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748544
5354	NC_019897	TCG	2	6	230595	230600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748544
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5356	NC_019897	TGC	2	6	230690	230695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748545
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5362	NC_019897	AGC	2	6	231071	231076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748545
5363	NC_019897	GCC	2	6	231100	231105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748545
5364	NC_019897	CGTTC	2	10	231129	231138	0 %	40 %	20 %	40 %	430748545
5365	NC_019897	TTC	2	6	231182	231187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748545
5366	NC_019897	GAC	2	6	231292	231297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748545
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5368	NC_019897	TGGCA	2	10	231387	231396	20 %	20 %	40 %	20 %	430748545
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5492	NC_019897	GC	3	6	236505	236510	0 %	0 %	50 %	50 %	430748548
5493	NC_019897	CG	3	6	236512	236517	0 %	0 %	50 %	50 %	430748548
5494	NC_019897	GGA	2	6	236546	236551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748548
5495	NC_019897	AGC	2	6	236557	236562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748548
5496	NC_019897	AGC	2	6	236575	236580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748548
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5500	NC_019897	GAG	2	6	236634	236639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748548

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