MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 102345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019897	CGA	2	6	195997	196002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4502	NC_019897	GAA	2	6	196013	196018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748511
4503	NC_019897	TCG	2	6	196035	196040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4504	NC_019897	AAGG	2	8	196064	196071	50 %	0 %	50 %	0 %	430748511
4505	NC_019897	ATCG	2	8	196111	196118	25 %	25 %	25 %	25 %	430748511
4506	NC_019897	GGA	2	6	196132	196137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748511
4507	NC_019897	AGC	2	6	196164	196169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4508	NC_019897	GAG	2	6	196178	196183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748511
4509	NC_019897	GTC	2	6	196205	196210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4510	NC_019897	TGC	2	6	196212	196217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4511	NC_019897	GC	3	6	196216	196221	0 %	0 %	50 %	50 %	430748511
4512	NC_019897	TGGA	2	8	196235	196242	25 %	25 %	50 %	0 %	430748511
4513	NC_019897	CGATG	2	10	196249	196258	20 %	20 %	40 %	20 %	430748511
4514	NC_019897	GGC	2	6	196295	196300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748511
4515	NC_019897	GAA	2	6	196370	196375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748511
4516	NC_019897	TAT	2	6	196387	196392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748511
4517	NC_019897	CGG	3	9	196453	196461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748511
4518	NC_019897	GCG	2	6	196480	196485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748511
4519	NC_019897	GC	3	6	196495	196500	0 %	0 %	50 %	50 %	430748511
4520	NC_019897	AGC	2	6	196503	196508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748511
4521	NC_019897	GCGGCA	2	12	196536	196547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430748511
4522	NC_019897	GCG	2	6	196586	196591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_019897	GAAGA	2	10	196733	196742	60 %	0 %	40 %	0 %	430748512
4524	NC_019897	CGT	2	6	196816	196821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4525	NC_019897	GCT	2	6	196867	196872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4526	NC_019897	GAA	3	9	196883	196891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748512
4527	NC_019897	CGA	2	6	196894	196899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4528	NC_019897	CTG	2	6	196973	196978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4529	NC_019897	CGG	2	6	197029	197034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748512
4530	NC_019897	CGA	2	6	197134	197139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4531	NC_019897	TCGT	2	8	197267	197274	0 %	50 %	25 %	25 %	430748512
4532	NC_019897	CGT	2	6	197284	197289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4533	NC_019897	GAC	3	9	197300	197308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748512
4534	NC_019897	CCGG	2	8	197323	197330	0 %	0 %	50 %	50 %	430748512
4535	NC_019897	GCG	2	6	197361	197366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748512
4536	NC_019897	CGG	2	6	197368	197373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748512
4537	NC_019897	CAA	2	6	197383	197388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748512
4538	NC_019897	CGG	2	6	197397	197402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748512
4539	NC_019897	CAT	2	6	197428	197433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748512
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4541	NC_019897	GGC	2	6	197542	197547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748512
4542	NC_019897	TTCGA	2	10	197745	197754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4543	NC_019897	CCAT	2	8	197755	197762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_019897	TCG	2	6	197770	197775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_019897	CG	3	6	197817	197822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_019897	GGAT	2	8	197858	197865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_019897	AGC	2	6	197880	197885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748513
4548	NC_019897	TTC	2	6	197887	197892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748513
4549	NC_019897	CGG	2	6	197933	197938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748513
4550	NC_019897	TTCG	2	8	197941	197948	0 %	50 %	25 %	25 %	430748513
4551	NC_019897	CGG	2	6	198038	198043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748513
4552	NC_019897	GGAC	2	8	198080	198087	25 %	0 %	50 %	25 %	430748513
4553	NC_019897	GGAC	2	8	198122	198129	25 %	0 %	50 %	25 %	430748513
4554	NC_019897	GGAT	2	8	198160	198167	25 %	25 %	50 %	0 %	430748513
4555	NC_019897	CGG	2	6	198185	198190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748513
4556	NC_019897	GATG	2	8	198224	198231	25 %	25 %	50 %	0 %	430748513
4557	NC_019897	GC	3	6	198236	198241	0 %	0 %	50 %	50 %	430748513
4558	NC_019897	TTCG	2	8	198256	198263	0 %	50 %	25 %	25 %	430748513
4559	NC_019897	TTCG	2	8	198277	198284	0 %	50 %	25 %	25 %	430748513
4560	NC_019897	CCG	2	6	198314	198319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748513
4561	NC_019897	GC	3	6	198357	198362	0 %	0 %	50 %	50 %	430748513
4562	NC_019897	GAC	2	6	198466	198471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748513
4563	NC_019897	GCC	2	6	198474	198479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_019897	GGC	2	6	198493	198498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_019897	GTTC	2	8	198504	198511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_019897	CGGCG	2	10	198550	198559	0 %	0 %	60 %	40 %	430748514
4567	NC_019897	AGC	2	6	198596	198601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748514
4568	NC_019897	CGGGC	2	10	198630	198639	0 %	0 %	60 %	40 %	430748514
4569	NC_019897	G	6	6	198681	198686	0 %	0 %	100 %	0 %	430748514
4570	NC_019897	TCC	2	6	198710	198715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748514
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4575	NC_019897	A	6	6	199057	199062	100 %	0 %	0 %	0 %	430748514
4576	NC_019897	TGT	2	6	199177	199182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748515
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4582	NC_019897	CGG	2	6	199379	199384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748515
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4587	NC_019897	CCG	2	6	199625	199630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748515
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4589	NC_019897	GCCC	2	8	199682	199689	0 %	0 %	25 %	75 %	430748515
4590	NC_019897	ATC	2	6	199747	199752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748515
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4592	NC_019897	CAG	2	6	199859	199864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748516
4593	NC_019897	AGC	2	6	199887	199892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748516
4594	NC_019897	GAT	2	6	199922	199927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748516
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4596	NC_019897	GCCG	2	8	200041	200048	0 %	0 %	50 %	50 %	430748516
4597	NC_019897	GAT	2	6	200054	200059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748516
4598	NC_019897	GAAGA	2	10	200103	200112	60 %	0 %	40 %	0 %	430748516
4599	NC_019897	TCG	2	6	200116	200121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748516
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4601	NC_019897	A	6	6	200153	200158	100 %	0 %	0 %	0 %	430748516
4602	NC_019897	TGC	2	6	200163	200168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748516
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4605	NC_019897	AGC	2	6	200208	200213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748516
4606	NC_019897	GAT	2	6	200237	200242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748516
4607	NC_019897	CTT	2	6	200249	200254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748516
4608	NC_019897	CAGATC	2	12	200291	200302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748516
4609	NC_019897	CGG	2	6	200356	200361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748516
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4615	NC_019897	TAT	2	6	200707	200712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_019897	ATT	2	6	200741	200746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_019897	TAA	2	6	200754	200759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_019897	CTG	2	6	200777	200782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_019897	TATT	2	8	200840	200847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_019897	GCC	2	6	200853	200858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4623	NC_019897	GGC	2	6	200953	200958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748517
4624	NC_019897	GCT	2	6	200973	200978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748517
4625	NC_019897	GTC	3	9	201015	201023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748517
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4627	NC_019897	CGT	2	6	201126	201131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748517
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4645	NC_019897	CGA	2	6	201764	201769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748517
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4656	NC_019897	GAAG	2	8	202229	202236	50 %	0 %	50 %	0 %	430748518
4657	NC_019897	GC	3	6	202244	202249	0 %	0 %	50 %	50 %	430748518
4658	NC_019897	GGCG	2	8	202292	202299	0 %	0 %	75 %	25 %	430748518
4659	NC_019897	CG	4	8	202307	202314	0 %	0 %	50 %	50 %	430748518
4660	NC_019897	CG	3	6	202331	202336	0 %	0 %	50 %	50 %	430748518
4661	NC_019897	CCG	2	6	202350	202355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748518
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4664	NC_019897	A	7	7	202509	202515	100 %	0 %	0 %	0 %	430748518
4665	NC_019897	GGC	2	6	202539	202544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748518
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4667	NC_019897	CGA	2	6	202603	202608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748518
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4672	NC_019897	ACGA	2	8	202722	202729	50 %	0 %	25 %	25 %	430748518
4673	NC_019897	GTC	2	6	202734	202739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748518
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4677	NC_019897	CGA	2	6	202870	202875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748518
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4679	NC_019897	CGGCG	2	10	202898	202907	0 %	0 %	60 %	40 %	430748518
4680	NC_019897	CGA	3	9	202910	202918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748518
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4687	NC_019897	TGA	2	6	203290	203295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748519
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4720	NC_019897	GCG	2	6	204099	204104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4721	NC_019897	GAGCG	2	10	204108	204117	20 %	0 %	60 %	20 %	430748520
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4724	NC_019897	GAAG	2	8	204285	204292	50 %	0 %	50 %	0 %	430748520
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4730	NC_019897	GCG	2	6	204436	204441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748520
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4745	NC_019897	TCG	2	6	205184	205189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748520
4746	NC_019897	GCT	2	6	205215	205220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748520
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4987	NC_019897	ACG	2	6	215092	215097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748529
4988	NC_019897	GCT	2	6	215132	215137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748529
4989	NC_019897	GC	5	10	215168	215177	0 %	0 %	50 %	50 %	430748529
4990	NC_019897	CGC	2	6	215228	215233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748529
4991	NC_019897	GCG	2	6	215245	215250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748529
4992	NC_019897	CGC	2	6	215251	215256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748529
4993	NC_019897	GCT	2	6	215270	215275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748529
4994	NC_019897	CCG	2	6	215294	215299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748529
4995	NC_019897	GAAGC	2	10	215323	215332	40 %	0 %	40 %	20 %	430748529
4996	NC_019897	GGCCGC	2	12	215339	215350	0 %	0 %	50 %	50 %	430748529
4997	NC_019897	CCGGCG	2	12	215370	215381	0 %	0 %	50 %	50 %	430748529
4998	NC_019897	CGG	2	6	215390	215395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748529
4999	NC_019897	ATG	2	6	215422	215427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748529
5000	NC_019897	GCAA	2	8	215462	215469	50 %	0 %	25 %	25 %	430748529

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