MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_018722	TGC	2	6	171820	171825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502049
3503	NC_018722	TAG	2	6	171847	171852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502049
3504	NC_018722	ATTCC	2	10	171898	171907	20 %	40 %	0 %	40 %	408502049
3505	NC_018722	GCG	2	6	171933	171938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502049
3506	NC_018722	AGC	2	6	171961	171966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502049
3507	NC_018722	GAGG	2	8	172039	172046	25 %	0 %	75 %	0 %	408502049
3508	NC_018722	CCG	2	6	172071	172076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502049
3509	NC_018722	TTG	2	6	172110	172115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502049
3510	NC_018722	ATAAG	2	10	172116	172125	60 %	20 %	20 %	0 %	408502049
3511	NC_018722	T	7	7	172140	172146	0 %	100 %	0 %	0 %	408502049
3512	NC_018722	A	7	7	172157	172163	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3513	NC_018722	GTT	2	6	172192	172197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502049
3514	NC_018722	A	7	7	172216	172222	100 %	0 %	0 %	0 %	408502049
3515	NC_018722	GCA	2	6	172287	172292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502049
3516	NC_018722	T	6	6	172322	172327	0 %	100 %	0 %	0 %	408502049
3517	NC_018722	CGC	2	6	172348	172353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502050
3518	NC_018722	CG	3	6	172483	172488	0 %	0 %	50 %	50 %	408502050
3519	NC_018722	TGG	2	6	172494	172499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502050
3520	NC_018722	ACGCA	2	10	172705	172714	40 %	0 %	20 %	40 %	408502050
3521	NC_018722	GA	3	6	172812	172817	50 %	0 %	50 %	0 %	408502050
3522	NC_018722	GAT	2	6	173031	173036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502051
3523	NC_018722	ATG	2	6	173116	173121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502051
3524	NC_018722	CAT	2	6	173226	173231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502051
3525	NC_018722	CATA	2	8	173267	173274	50 %	25 %	0 %	25 %	408502051
3526	NC_018722	TGG	2	6	173276	173281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502051
3527	NC_018722	AGAC	2	8	173293	173300	50 %	0 %	25 %	25 %	408502051
3528	NC_018722	A	6	6	173331	173336	100 %	0 %	0 %	0 %	408502051
3529	NC_018722	GA	3	6	173341	173346	50 %	0 %	50 %	0 %	408502051
3530	NC_018722	CAG	2	6	173355	173360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502051
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3532	NC_018722	AGT	2	6	173395	173400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502051
3533	NC_018722	CG	3	6	173466	173471	0 %	0 %	50 %	50 %	408502051
3534	NC_018722	TACT	2	8	173482	173489	25 %	50 %	0 %	25 %	408502051
3535	NC_018722	GC	3	6	173542	173547	0 %	0 %	50 %	50 %	408502052
3536	NC_018722	T	6	6	173623	173628	0 %	100 %	0 %	0 %	408502052
3537	NC_018722	A	7	7	173636	173642	100 %	0 %	0 %	0 %	408502052
3538	NC_018722	T	6	6	173711	173716	0 %	100 %	0 %	0 %	408502052
3539	NC_018722	CGTGA	2	10	173771	173780	20 %	20 %	40 %	20 %	408502052
3540	NC_018722	CTTGC	2	10	173796	173805	0 %	40 %	20 %	40 %	408502052
3541	NC_018722	GCG	2	6	173816	173821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502052
3542	NC_018722	TGA	2	6	173826	173831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502052
3543	NC_018722	CTTTT	2	10	173836	173845	0 %	80 %	0 %	20 %	408502052
3544	NC_018722	A	6	6	173846	173851	100 %	0 %	0 %	0 %	408502052
3545	NC_018722	GC	3	6	173860	173865	0 %	0 %	50 %	50 %	408502052
3546	NC_018722	TAG	2	6	173970	173975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502053
3547	NC_018722	AGT	2	6	174021	174026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502053
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3550	NC_018722	GC	3	6	174196	174201	0 %	0 %	50 %	50 %	408502053
3551	NC_018722	GTGTGC	2	12	174233	174244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502053
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3553	NC_018722	AC	3	6	174321	174326	50 %	0 %	0 %	50 %	408502053
3554	NC_018722	GCA	2	6	174330	174335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502053
3555	NC_018722	AC	3	6	174385	174390	50 %	0 %	0 %	50 %	408502053
3556	NC_018722	AGGG	2	8	174410	174417	25 %	0 %	75 %	0 %	408502053
3557	NC_018722	CAC	2	6	174450	174455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502053
3558	NC_018722	CGG	2	6	174463	174468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502053
3559	NC_018722	ACA	2	6	174522	174527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502053
3560	NC_018722	GGGA	2	8	174546	174553	25 %	0 %	75 %	0 %	408502053
3561	NC_018722	GGA	3	9	174574	174582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502053
3562	NC_018722	CG	3	6	174637	174642	0 %	0 %	50 %	50 %	408502053
3563	NC_018722	A	6	6	174644	174649	100 %	0 %	0 %	0 %	408502053
3564	NC_018722	A	6	6	174681	174686	100 %	0 %	0 %	0 %	408502053
3565	NC_018722	TG	3	6	174691	174696	0 %	50 %	50 %	0 %	408502053
3566	NC_018722	GA	3	6	174731	174736	50 %	0 %	50 %	0 %	408502053
3567	NC_018722	GCG	2	6	174780	174785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502053
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3569	NC_018722	ACG	2	6	174849	174854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502053
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3578	NC_018722	CAC	2	6	175226	175231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502054
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3580	NC_018722	TGA	3	9	175355	175363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502054
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3583	NC_018722	G	6	6	175415	175420	0 %	0 %	100 %	0 %	408502054
3584	NC_018722	CG	4	8	175429	175436	0 %	0 %	50 %	50 %	408502054
3585	NC_018722	CTGA	2	8	175497	175504	25 %	25 %	25 %	25 %	408502054
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3590	NC_018722	AAT	2	6	175719	175724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502054
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3592	NC_018722	CGT	3	9	175790	175798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502054
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3594	NC_018722	GC	3	6	175885	175890	0 %	0 %	50 %	50 %	408502054
3595	NC_018722	CTTCT	2	10	175918	175927	0 %	60 %	0 %	40 %	408502054
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3597	NC_018722	ACT	2	6	176020	176025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502054
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3601	NC_018722	GC	3	6	176137	176142	0 %	0 %	50 %	50 %	408502054
3602	NC_018722	GAC	2	6	176184	176189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502054
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3606	NC_018722	GAACG	2	10	176316	176325	40 %	0 %	40 %	20 %	408502054
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3608	NC_018722	A	6	6	176341	176346	100 %	0 %	0 %	0 %	408502054
3609	NC_018722	C	6	6	176352	176357	0 %	0 %	0 %	100 %	408502054
3610	NC_018722	TGG	2	6	176377	176382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502054
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3612	NC_018722	GA	3	6	176487	176492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_018722	TG	3	6	176518	176523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_018722	CCG	2	6	176531	176536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3753	NC_018722	T	7	7	182520	182526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3754	NC_018722	TAT	2	6	182554	182559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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