MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018722	T	7	7	124326	124332	0 %	100 %	0 %	0 %	408502012
2502	NC_018722	GCG	2	6	124349	124354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502012
2503	NC_018722	CGCAG	2	10	124399	124408	20 %	0 %	40 %	40 %	408502012
2504	NC_018722	AGCAC	2	10	124435	124444	40 %	0 %	20 %	40 %	408502012
2505	NC_018722	TG	3	6	124449	124454	0 %	50 %	50 %	0 %	408502012
2506	NC_018722	GC	3	6	124503	124508	0 %	0 %	50 %	50 %	408502012
2507	NC_018722	ATA	2	6	124521	124526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502012
2508	NC_018722	CACG	2	8	124538	124545	25 %	0 %	25 %	50 %	408502012
2509	NC_018722	TTG	2	6	124551	124556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502012
2510	NC_018722	T	6	6	124567	124572	0 %	100 %	0 %	0 %	408502012
2511	NC_018722	GCA	2	6	124597	124602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502012
2512	NC_018722	GC	4	8	124607	124614	0 %	0 %	50 %	50 %	408502012
2513	NC_018722	TCC	2	6	124668	124673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_018722	GC	3	6	124689	124694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_018722	ACTG	2	8	124709	124716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_018722	TG	3	6	124755	124760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018722	GCT	2	6	124790	124795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_018722	TGAG	2	8	124852	124859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_018722	CCTC	2	8	124906	124913	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2520	NC_018722	TG	4	8	124951	124958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_018722	TCC	2	6	124969	124974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_018722	AGA	2	6	125034	125039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_018722	GAG	2	6	125087	125092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_018722	TCTCAA	2	12	125132	125143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_018722	GT	3	6	125177	125182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_018722	GAAC	2	8	125216	125223	50 %	0 %	25 %	25 %	408502013
2527	NC_018722	TGG	2	6	125245	125250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502013
2528	NC_018722	GC	3	6	125354	125359	0 %	0 %	50 %	50 %	408502013
2529	NC_018722	AG	3	6	125379	125384	50 %	0 %	50 %	0 %	408502013
2530	NC_018722	GGCG	2	8	125393	125400	0 %	0 %	75 %	25 %	408502013
2531	NC_018722	T	8	8	125406	125413	0 %	100 %	0 %	0 %	408502013
2532	NC_018722	T	6	6	125439	125444	0 %	100 %	0 %	0 %	408502013
2533	NC_018722	TCG	2	6	125451	125456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2534	NC_018722	A	6	6	125542	125547	100 %	0 %	0 %	0 %	408502013
2535	NC_018722	T	6	6	125560	125565	0 %	100 %	0 %	0 %	408502013
2536	NC_018722	T	6	6	125601	125606	0 %	100 %	0 %	0 %	408502013
2537	NC_018722	CCT	2	6	125651	125656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502013
2538	NC_018722	AGC	2	6	125689	125694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2539	NC_018722	TGC	2	6	125717	125722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2540	NC_018722	TGCG	2	8	125749	125756	0 %	25 %	50 %	25 %	408502013
2541	NC_018722	CCT	2	6	125759	125764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502013
2542	NC_018722	GGC	2	6	125825	125830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502013
2543	NC_018722	GC	4	8	125829	125836	0 %	0 %	50 %	50 %	408502013
2544	NC_018722	T	6	6	125854	125859	0 %	100 %	0 %	0 %	408502013
2545	NC_018722	CTG	2	6	125883	125888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2546	NC_018722	GT	3	6	125919	125924	0 %	50 %	50 %	0 %	408502013
2547	NC_018722	GT	3	6	125963	125968	0 %	50 %	50 %	0 %	408502013
2548	NC_018722	AGCA	2	8	125979	125986	50 %	0 %	25 %	25 %	408502013
2549	NC_018722	GCT	2	6	126072	126077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2550	NC_018722	AGG	2	6	126088	126093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502013
2551	NC_018722	GTT	2	6	126108	126113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502013
2552	NC_018722	GGT	2	6	126201	126206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502013
2553	NC_018722	A	6	6	126240	126245	100 %	0 %	0 %	0 %	408502013
2554	NC_018722	TCT	2	6	126317	126322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502013
2555	NC_018722	GA	3	6	126394	126399	50 %	0 %	50 %	0 %	408502013
2556	NC_018722	A	6	6	126416	126421	100 %	0 %	0 %	0 %	408502013
2557	NC_018722	GC	3	6	126441	126446	0 %	0 %	50 %	50 %	408502013
2558	NC_018722	CCG	2	6	126456	126461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502013
2559	NC_018722	TCG	2	6	126494	126499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502013
2560	NC_018722	CA	3	6	126630	126635	50 %	0 %	0 %	50 %	408502013
2561	NC_018722	CTTG	2	8	126701	126708	0 %	50 %	25 %	25 %	408502013
2562	NC_018722	CATTG	2	10	126729	126738	20 %	40 %	20 %	20 %	408502013
2563	NC_018722	TAG	2	6	126889	126894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502013
2564	NC_018722	GTG	2	6	126978	126983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_018722	GCA	2	6	126988	126993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502014
2566	NC_018722	CAG	2	6	127004	127009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502014
2567	NC_018722	G	6	6	127065	127070	0 %	0 %	100 %	0 %	408502014
2568	NC_018722	CCGTG	2	10	127090	127099	0 %	20 %	40 %	40 %	408502014
2569	NC_018722	TCG	2	6	127138	127143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502014
2570	NC_018722	GC	3	6	127192	127197	0 %	0 %	50 %	50 %	408502014
2571	NC_018722	T	6	6	127278	127283	0 %	100 %	0 %	0 %	408502014
2572	NC_018722	GAT	2	6	127340	127345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502014
2573	NC_018722	T	8	8	127351	127358	0 %	100 %	0 %	0 %	408502014
2574	NC_018722	TG	3	6	127386	127391	0 %	50 %	50 %	0 %	408502014
2575	NC_018722	GTA	2	6	127392	127397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502014
2576	NC_018722	A	6	6	127416	127421	100 %	0 %	0 %	0 %	408502014
2577	NC_018722	TTTTAA	2	12	127474	127485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502014
2578	NC_018722	CTA	2	6	127559	127564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502014
2579	NC_018722	AC	3	6	127565	127570	50 %	0 %	0 %	50 %	408502014
2580	NC_018722	TG	3	6	127602	127607	0 %	50 %	50 %	0 %	408502014
2581	NC_018722	GAC	2	6	127633	127638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502014
2582	NC_018722	TG	3	6	127661	127666	0 %	50 %	50 %	0 %	408502014
2583	NC_018722	CTC	2	6	127703	127708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502014
2584	NC_018722	GT	4	8	127738	127745	0 %	50 %	50 %	0 %	408502014
2585	NC_018722	TGCA	2	8	127874	127881	25 %	25 %	25 %	25 %	408502014
2586	NC_018722	A	7	7	127896	127902	100 %	0 %	0 %	0 %	408502014
2587	NC_018722	GCAT	2	8	127916	127923	25 %	25 %	25 %	25 %	408502014
2588	NC_018722	ACG	2	6	127926	127931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502014
2589	NC_018722	CA	3	6	128067	128072	50 %	0 %	0 %	50 %	408502014
2590	NC_018722	GAA	2	6	128186	128191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502014
2591	NC_018722	CCGA	2	8	128310	128317	25 %	0 %	25 %	50 %	408502014
2592	NC_018722	TTC	3	9	128401	128409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502014
2593	NC_018722	TAT	2	6	128473	128478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502015
2594	NC_018722	CTT	2	6	128518	128523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502015
2595	NC_018722	T	6	6	128585	128590	0 %	100 %	0 %	0 %	408502015
2596	NC_018722	GT	3	6	128677	128682	0 %	50 %	50 %	0 %	408502015
2597	NC_018722	TCA	2	6	128793	128798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502015
2598	NC_018722	AACCA	2	10	128814	128823	60 %	0 %	0 %	40 %	408502015
2599	NC_018722	CTT	2	6	128859	128864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502015
2600	NC_018722	CGA	2	6	129009	129014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502015
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2602	NC_018722	GCG	2	6	129033	129038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502015
2603	NC_018722	T	8	8	129061	129068	0 %	100 %	0 %	0 %	408502015
2604	NC_018722	GAA	2	6	129140	129145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502015
2605	NC_018722	CTT	2	6	129189	129194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502015
2606	NC_018722	CGA	2	6	129233	129238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502015
2607	NC_018722	AAG	2	6	129250	129255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502015
2608	NC_018722	TAA	2	6	129322	129327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502015
2609	NC_018722	TCA	2	6	129407	129412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502015
2610	NC_018722	AAAAG	2	10	129465	129474	80 %	0 %	20 %	0 %	408502015
2611	NC_018722	CG	3	6	129530	129535	0 %	0 %	50 %	50 %	408502015
2612	NC_018722	GCA	2	6	129545	129550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502015
2613	NC_018722	CAG	2	6	129557	129562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502015
2614	NC_018722	T	6	6	129573	129578	0 %	100 %	0 %	0 %	408502015
2615	NC_018722	A	6	6	129612	129617	100 %	0 %	0 %	0 %	408502015
2616	NC_018722	TG	4	8	129620	129627	0 %	50 %	50 %	0 %	408502015
2617	NC_018722	CTT	2	6	129657	129662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502015
2618	NC_018722	CG	3	6	129672	129677	0 %	0 %	50 %	50 %	408502015
2619	NC_018722	GCG	2	6	129713	129718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502015
2620	NC_018722	AGT	2	6	129740	129745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502015
2621	NC_018722	CAT	2	6	129760	129765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502015
2622	NC_018722	CCT	2	6	129767	129772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_018722	TGAG	2	8	129785	129792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_018722	TG	3	6	129820	129825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_018722	GT	3	6	129884	129889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2627	NC_018722	TTG	2	6	129980	129985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502016
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2750	NC_018722	C	9	9	136739	136747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2751	NC_018722	AGA	2	6	136756	136761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2872	NC_018722	T	7	7	142728	142734	0 %	100 %	0 %	0 %	408502025
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2998	NC_018722	GTC	2	6	148103	148108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502029
2999	NC_018722	CGC	2	6	148187	148192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502029
3000	NC_018722	AGT	2	6	148193	148198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502029

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