MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_018722	CTC	2	6	592199	592204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502415
12503	NC_018722	TCG	2	6	592272	592277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502415
12504	NC_018722	CCG	2	6	592311	592316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502415
12505	NC_018722	GAA	2	6	592439	592444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502415
12506	NC_018722	GCC	2	6	592448	592453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502415
12507	NC_018722	GCAGA	2	10	592485	592494	40 %	0 %	40 %	20 %	408502415
12508	NC_018722	GC	3	6	592518	592523	0 %	0 %	50 %	50 %	408502415
12509	NC_018722	CAG	2	6	592548	592553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502415
12510	NC_018722	G	6	6	592618	592623	0 %	0 %	100 %	0 %	408502415
12511	NC_018722	TCT	2	6	592628	592633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502415
12512	NC_018722	CG	4	8	592668	592675	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12513	NC_018722	GCC	2	6	592711	592716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502416
12514	NC_018722	GCC	2	6	592760	592765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502416
12515	NC_018722	GC	3	6	592771	592776	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12516	NC_018722	CGC	2	6	592828	592833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502416
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12518	NC_018722	CGT	2	6	592845	592850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502416
12519	NC_018722	CG	3	6	592922	592927	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12520	NC_018722	CAC	2	6	592933	592938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502416
12521	NC_018722	GCA	2	6	592956	592961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502416
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12523	NC_018722	CG	3	6	593011	593016	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12524	NC_018722	CGC	2	6	593105	593110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502416
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12529	NC_018722	AGAT	2	8	593284	593291	50 %	25 %	25 %	0 %	408502416
12530	NC_018722	CG	4	8	593318	593325	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12531	NC_018722	GGT	2	6	593385	593390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502416
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12533	NC_018722	GC	3	6	593456	593461	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
12534	NC_018722	TCAC	2	8	593495	593502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12535	NC_018722	GC	3	6	593529	593534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_018722	GCG	2	6	593570	593575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_018722	TGG	2	6	593576	593581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_018722	TTC	3	9	593586	593594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_018722	TATT	2	8	593598	593605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_018722	AGG	2	6	593682	593687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502417
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12547	NC_018722	CTTCT	2	10	594071	594080	0 %	60 %	0 %	40 %	408502417
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12551	NC_018722	CCGG	2	8	594461	594468	0 %	0 %	50 %	50 %	408502417
12552	NC_018722	GCA	2	6	594497	594502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502417
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12554	NC_018722	CTC	2	6	594573	594578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502417
12555	NC_018722	CTG	2	6	594583	594588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502417
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12557	NC_018722	GGC	2	6	594618	594623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502417
12558	NC_018722	GCC	2	6	594687	594692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502417
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12560	NC_018722	CGG	2	6	594737	594742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502417
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12565	NC_018722	ACG	2	6	594899	594904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502417
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12569	NC_018722	CCG	2	6	595032	595037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_018722	AGGG	2	8	595039	595046	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_018722	GCA	2	6	595330	595335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502418
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12574	NC_018722	CTCG	2	8	595446	595453	0 %	25 %	25 %	50 %	408502418
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12594	NC_018722	AAAAT	2	10	596107	596116	80 %	20 %	0 %	0 %	408502418
12595	NC_018722	ACGA	2	8	596123	596130	50 %	0 %	25 %	25 %	408502418
12596	NC_018722	A	6	6	596165	596170	100 %	0 %	0 %	0 %	408502418
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12600	NC_018722	GC	3	6	596334	596339	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
12601	NC_018722	GC	5	10	596359	596368	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
12602	NC_018722	AC	3	6	596376	596381	50 %	0 %	0 %	50 %	408502418
12603	NC_018722	GC	4	8	596432	596439	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
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12606	NC_018722	CGTG	2	8	596568	596575	0 %	25 %	50 %	25 %	408502418
12607	NC_018722	CG	4	8	596601	596608	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
12608	NC_018722	CG	4	8	596617	596624	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
12609	NC_018722	TCCT	2	8	596659	596666	0 %	50 %	0 %	50 %	408502418
12610	NC_018722	GACC	2	8	596675	596682	25 %	0 %	25 %	50 %	408502418
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12612	NC_018722	ACA	2	6	596783	596788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502418
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12614	NC_018722	AGA	2	6	596943	596948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502418
12615	NC_018722	ATC	3	9	596998	597006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502418
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12622	NC_018722	TGCGC	2	10	597372	597381	0 %	20 %	40 %	40 %	408502418
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12624	NC_018722	CGTG	2	8	597410	597417	0 %	25 %	50 %	25 %	408502418
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12737	NC_018722	CATC	2	8	601906	601913	25 %	25 %	0 %	50 %	408502422
12738	NC_018722	T	7	7	601923	601929	0 %	100 %	0 %	0 %	408502422
12739	NC_018722	CTG	2	6	601997	602002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502422
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12742	NC_018722	TGC	2	6	602068	602073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502422
12743	NC_018722	A	7	7	602107	602113	100 %	0 %	0 %	0 %	408502422
12744	NC_018722	TGC	2	6	602125	602130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12745	NC_018722	TTA	2	6	602143	602148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12747	NC_018722	CG	3	6	602305	602310	0 %	0 %	50 %	50 %	408502423
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12992	NC_018722	TCC	2	6	613256	613261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502433
12993	NC_018722	A	6	6	613302	613307	100 %	0 %	0 %	0 %	408502433
12994	NC_018722	TCC	2	6	613323	613328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502433
12995	NC_018722	CGA	2	6	613355	613360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502433
12996	NC_018722	ACC	2	6	613370	613375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502433
12997	NC_018722	CTT	2	6	613419	613424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502433
12998	NC_018722	CAC	2	6	613452	613457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502433
12999	NC_018722	TGCAC	2	10	613592	613601	20 %	20 %	20 %	40 %	408502433
13000	NC_018722	AGA	2	6	613634	613639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502433

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