MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018722	GCC	2	6	267546	267551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502148
5502	NC_018722	ATC	2	6	267605	267610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502148
5503	NC_018722	TGC	2	6	267629	267634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502148
5504	NC_018722	TCT	2	6	267697	267702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502148
5505	NC_018722	GC	3	6	267756	267761	0 %	0 %	50 %	50 %	408502148
5506	NC_018722	GTG	2	6	267790	267795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502148
5507	NC_018722	G	6	6	267870	267875	0 %	0 %	100 %	0 %	408502148
5508	NC_018722	CTT	2	6	267909	267914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502148
5509	NC_018722	GGA	2	6	267933	267938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502148
5510	NC_018722	AGG	2	6	267939	267944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502148
5511	NC_018722	GGAT	2	8	267989	267996	25 %	25 %	50 %	0 %	408502148
5512	NC_018722	GAG	2	6	268009	268014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502148
5513	NC_018722	TCG	2	6	268050	268055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502148
5514	NC_018722	GGA	2	6	268131	268136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502148
5515	NC_018722	AATC	2	8	268170	268177	50 %	25 %	0 %	25 %	408502148
5516	NC_018722	AAC	2	6	268234	268239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502148
5517	NC_018722	TCC	2	6	268276	268281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502148
5518	NC_018722	GT	3	6	268301	268306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_018722	GCGCG	2	10	268365	268374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5520	NC_018722	GAG	2	6	268430	268435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502149
5521	NC_018722	GGT	2	6	268441	268446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502149
5522	NC_018722	GT	3	6	268445	268450	0 %	50 %	50 %	0 %	408502149
5523	NC_018722	T	6	6	268526	268531	0 %	100 %	0 %	0 %	408502149
5524	NC_018722	CAG	2	6	268557	268562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502149
5525	NC_018722	CTTT	2	8	268700	268707	0 %	75 %	0 %	25 %	408502150
5526	NC_018722	GTT	2	6	268732	268737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502150
5527	NC_018722	CTG	2	6	268748	268753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502150
5528	NC_018722	GTG	2	6	268768	268773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502150
5529	NC_018722	TGC	2	6	268787	268792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502150
5530	NC_018722	TTTTC	2	10	268794	268803	0 %	80 %	0 %	20 %	408502150
5531	NC_018722	TTA	2	6	268830	268835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502150
5532	NC_018722	CG	3	6	268836	268841	0 %	0 %	50 %	50 %	408502150
5533	NC_018722	TTTTTC	2	12	268949	268960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408502150
5534	NC_018722	ATG	2	6	268987	268992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502150
5535	NC_018722	T	6	6	269084	269089	0 %	100 %	0 %	0 %	408502150
5536	NC_018722	CTT	2	6	269092	269097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502150
5537	NC_018722	TGGC	2	8	269123	269130	0 %	25 %	50 %	25 %	408502150
5538	NC_018722	TGCG	2	8	269150	269157	0 %	25 %	50 %	25 %	408502150
5539	NC_018722	GCC	2	6	269162	269167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502150
5540	NC_018722	GTG	2	6	269176	269181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502150
5541	NC_018722	CTT	2	6	269201	269206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502150
5542	NC_018722	T	8	8	269205	269212	0 %	100 %	0 %	0 %	408502150
5543	NC_018722	T	6	6	269226	269231	0 %	100 %	0 %	0 %	408502150
5544	NC_018722	GT	3	6	269248	269253	0 %	50 %	50 %	0 %	408502150
5545	NC_018722	GCG	2	6	269336	269341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_018722	CTA	2	6	269344	269349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_018722	GAG	2	6	269384	269389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_018722	TG	3	6	269413	269418	0 %	50 %	50 %	0 %	408502151
5549	NC_018722	G	9	9	269426	269434	0 %	0 %	100 %	0 %	408502151
5550	NC_018722	GCA	2	6	269565	269570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502151
5551	NC_018722	ATA	2	6	269627	269632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502151
5552	NC_018722	TGAC	2	8	269633	269640	25 %	25 %	25 %	25 %	408502151
5553	NC_018722	AGA	2	6	269706	269711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502151
5554	NC_018722	CTC	2	6	269719	269724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502151
5555	NC_018722	CG	3	6	269747	269752	0 %	0 %	50 %	50 %	408502151
5556	NC_018722	TCA	3	9	269910	269918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502151
5557	NC_018722	GGAA	2	8	269919	269926	50 %	0 %	50 %	0 %	408502151
5558	NC_018722	A	6	6	269959	269964	100 %	0 %	0 %	0 %	408502151
5559	NC_018722	TACAAT	2	12	270145	270156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408502151
5560	NC_018722	GGT	2	6	270172	270177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502151
5561	NC_018722	GGA	2	6	270221	270226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502151
5562	NC_018722	GAAT	2	8	270237	270244	50 %	25 %	25 %	0 %	408502151
5563	NC_018722	GAAA	2	8	270330	270337	75 %	0 %	25 %	0 %	408502151
5564	NC_018722	CG	3	6	270351	270356	0 %	0 %	50 %	50 %	408502151
5565	NC_018722	GTG	2	6	270406	270411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502151
5566	NC_018722	CCCG	2	8	270454	270461	0 %	0 %	25 %	75 %	408502151
5567	NC_018722	GTTC	2	8	270526	270533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_018722	GCAC	2	8	270565	270572	25 %	0 %	25 %	50 %	408502152
5569	NC_018722	CG	3	6	270593	270598	0 %	0 %	50 %	50 %	408502152
5570	NC_018722	CG	4	8	270626	270633	0 %	0 %	50 %	50 %	408502152
5571	NC_018722	GC	3	6	270703	270708	0 %	0 %	50 %	50 %	408502152
5572	NC_018722	CGC	2	6	270720	270725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502152
5573	NC_018722	CGG	2	6	270764	270769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502152
5574	NC_018722	TTCTC	2	10	270787	270796	0 %	60 %	0 %	40 %	408502152
5575	NC_018722	CAT	2	6	270885	270890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502152
5576	NC_018722	T	7	7	270917	270923	0 %	100 %	0 %	0 %	408502152
5577	NC_018722	GC	3	6	270976	270981	0 %	0 %	50 %	50 %	408502152
5578	NC_018722	GT	3	6	271029	271034	0 %	50 %	50 %	0 %	408502152
5579	NC_018722	CGC	2	6	271091	271096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502152
5580	NC_018722	GTG	2	6	271111	271116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502152
5581	NC_018722	AGA	2	6	271117	271122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502152
5582	NC_018722	CGG	2	6	271130	271135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502152
5583	NC_018722	TG	3	6	271180	271185	0 %	50 %	50 %	0 %	408502152
5584	NC_018722	AG	3	6	271236	271241	50 %	0 %	50 %	0 %	408502152
5585	NC_018722	GCT	2	6	271245	271250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_018722	GT	3	6	271273	271278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_018722	TG	3	6	271348	271353	0 %	50 %	50 %	0 %	408502153
5588	NC_018722	GGA	3	9	271394	271402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502153
5589	NC_018722	GAT	2	6	271406	271411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502153
5590	NC_018722	CGG	2	6	271486	271491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502153
5591	NC_018722	GCC	2	6	271511	271516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502153
5592	NC_018722	GGA	2	6	271520	271525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502153
5593	NC_018722	GAA	2	6	271530	271535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502153
5594	NC_018722	GAG	2	6	271557	271562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502153
5595	NC_018722	ATT	2	6	271692	271697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502153
5596	NC_018722	TATC	2	8	271838	271845	25 %	50 %	0 %	25 %	408502153
5597	NC_018722	AGCT	2	8	271864	271871	25 %	25 %	25 %	25 %	408502153
5598	NC_018722	A	6	6	271894	271899	100 %	0 %	0 %	0 %	408502153
5599	NC_018722	GC	3	6	271943	271948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_018722	CA	3	6	271996	272001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_018722	GCTC	2	8	272004	272011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_018722	TCC	2	6	272013	272018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_018722	CTT	2	6	272061	272066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502154
5604	NC_018722	GGTG	2	8	272151	272158	0 %	25 %	75 %	0 %	408502154
5605	NC_018722	C	6	6	272182	272187	0 %	0 %	0 %	100 %	408502154
5606	NC_018722	GC	3	6	272223	272228	0 %	0 %	50 %	50 %	408502154
5607	NC_018722	CCCTGC	2	12	272314	272325	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502154
5608	NC_018722	GC	5	10	272346	272355	0 %	0 %	50 %	50 %	408502154
5609	NC_018722	AT	3	6	272401	272406	50 %	50 %	0 %	0 %	408502154
5610	NC_018722	GCT	2	6	272466	272471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502154
5611	NC_018722	AG	3	6	272591	272596	50 %	0 %	50 %	0 %	408502154
5612	NC_018722	TGCG	2	8	272679	272686	0 %	25 %	50 %	25 %	408502154
5613	NC_018722	T	6	6	272692	272697	0 %	100 %	0 %	0 %	408502154
5614	NC_018722	T	6	6	272730	272735	0 %	100 %	0 %	0 %	408502154
5615	NC_018722	GCG	2	6	272746	272751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502154
5616	NC_018722	GTA	2	6	272770	272775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502154
5617	NC_018722	TCA	2	6	272867	272872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502154
5618	NC_018722	GGT	2	6	272905	272910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502154
5619	NC_018722	G	6	6	273033	273038	0 %	0 %	100 %	0 %	408502154
5620	NC_018722	CTTT	2	8	273138	273145	0 %	75 %	0 %	25 %	408502154
5621	NC_018722	TCT	2	6	273189	273194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502154
5622	NC_018722	GGGA	2	8	273275	273282	25 %	0 %	75 %	0 %	408502154
5623	NC_018722	GGA	2	6	273288	273293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502154
5624	NC_018722	CAG	2	6	273325	273330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502154
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