MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 87555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018020	GGC	2	6	234980	234985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401810
4502	NC_018020	CG	3	6	235013	235018	0 %	0 %	50 %	50 %	392401810
4503	NC_018020	CGT	2	6	235088	235093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401810
4504	NC_018020	TCGC	2	8	235095	235102	0 %	25 %	25 %	50 %	392401810
4505	NC_018020	GCT	2	6	235124	235129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401810
4506	NC_018020	GAAA	2	8	235376	235383	75 %	0 %	25 %	0 %	392401810
4507	NC_018020	T	6	6	235387	235392	0 %	100 %	0 %	0 %	392401810
4508	NC_018020	ATC	2	6	235428	235433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401810
4509	NC_018020	TCT	2	6	235531	235536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401810
4510	NC_018020	TGG	2	6	235558	235563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401810
4511	NC_018020	GGTC	2	8	235564	235571	0 %	25 %	50 %	25 %	392401810
4512	NC_018020	TTC	2	6	235605	235610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401810
4513	NC_018020	AGC	2	6	235675	235680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_018020	GCT	2	6	235684	235689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_018020	CG	3	6	235704	235709	0 %	0 %	50 %	50 %	392401811
4516	NC_018020	GC	3	6	235730	235735	0 %	0 %	50 %	50 %	392401811
4517	NC_018020	GTC	2	6	235762	235767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4518	NC_018020	CTG	2	6	235830	235835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4519	NC_018020	AGC	2	6	235841	235846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4520	NC_018020	CGC	2	6	235858	235863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4521	NC_018020	T	6	6	235868	235873	0 %	100 %	0 %	0 %	392401811
4522	NC_018020	GCT	2	6	235878	235883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4523	NC_018020	CGGCCC	2	12	235934	235945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4524	NC_018020	CTT	2	6	235948	235953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401811
4525	NC_018020	GCG	2	6	236000	236005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401811
4526	NC_018020	CCG	3	9	236054	236062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4527	NC_018020	CTT	2	6	236091	236096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401811
4528	NC_018020	T	6	6	236115	236120	0 %	100 %	0 %	0 %	392401811
4529	NC_018020	GCA	2	6	236123	236128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4530	NC_018020	TTG	2	6	236150	236155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401811
4531	NC_018020	TGC	2	6	236232	236237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4532	NC_018020	CTTTT	2	10	236239	236248	0 %	80 %	0 %	20 %	392401811
4533	NC_018020	T	7	7	236264	236270	0 %	100 %	0 %	0 %	392401811
4534	NC_018020	TTC	2	6	236317	236322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401811
4535	NC_018020	GCT	2	6	236355	236360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4536	NC_018020	GCA	2	6	236400	236405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4537	NC_018020	CAC	2	6	236470	236475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401811
4538	NC_018020	GT	3	6	236544	236549	0 %	50 %	50 %	0 %	392401811
4539	NC_018020	TCG	2	6	236558	236563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4540	NC_018020	TTCT	2	8	236602	236609	0 %	75 %	0 %	25 %	392401811
4541	NC_018020	TCG	2	6	236645	236650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4542	NC_018020	CTG	2	6	236662	236667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4543	NC_018020	CG	3	6	236707	236712	0 %	0 %	50 %	50 %	392401811
4544	NC_018020	TCG	2	6	236757	236762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4545	NC_018020	CGC	2	6	236847	236852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4546	NC_018020	TCG	3	9	236873	236881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4547	NC_018020	AAAT	2	8	236984	236991	75 %	25 %	0 %	0 %	392401811
4548	NC_018020	CGC	3	9	237006	237014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4549	NC_018020	T	6	6	237126	237131	0 %	100 %	0 %	0 %	392401811
4550	NC_018020	CGA	2	6	237141	237146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4551	NC_018020	GTC	2	6	237154	237159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4552	NC_018020	GCC	2	6	237169	237174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4553	NC_018020	GCCGG	2	10	237320	237329	0 %	0 %	60 %	40 %	392401811
4554	NC_018020	GCGAA	2	10	237339	237348	40 %	0 %	40 %	20 %	392401811
4555	NC_018020	CGC	2	6	237386	237391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401811
4556	NC_018020	ACG	2	6	237393	237398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401811
4557	NC_018020	A	6	6	237550	237555	100 %	0 %	0 %	0 %	392401811
4558	NC_018020	GGC	2	6	237667	237672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401811
4559	NC_018020	GAGC	2	8	237682	237689	25 %	0 %	50 %	25 %	392401811
4560	NC_018020	GGT	2	6	237712	237717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401811
4561	NC_018020	TCT	2	6	237726	237731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401811
4562	NC_018020	CGA	2	6	237827	237832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4563	NC_018020	GC	4	8	237838	237845	0 %	0 %	50 %	50 %	392401812
4564	NC_018020	A	6	6	237855	237860	100 %	0 %	0 %	0 %	392401812
4565	NC_018020	CGAT	2	8	237880	237887	25 %	25 %	25 %	25 %	392401812
4566	NC_018020	TTC	2	6	237895	237900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401812
4567	NC_018020	TCT	2	6	237911	237916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401812
4568	NC_018020	GCT	2	6	237917	237922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4569	NC_018020	GCC	2	6	237987	237992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401812
4570	NC_018020	TGC	2	6	238024	238029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4571	NC_018020	A	6	6	238033	238038	100 %	0 %	0 %	0 %	392401812
4572	NC_018020	ACG	2	6	238082	238087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4573	NC_018020	CGC	2	6	238172	238177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401812
4574	NC_018020	GCT	2	6	238220	238225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4575	NC_018020	TGG	2	6	238250	238255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401812
4576	NC_018020	ATC	2	6	238276	238281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401812
4577	NC_018020	GCG	2	6	238333	238338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401812
4578	NC_018020	GCG	2	6	238342	238347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401812
4579	NC_018020	CG	3	6	238421	238426	0 %	0 %	50 %	50 %	392401812
4580	NC_018020	GCG	2	6	238450	238455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401812
4581	NC_018020	GCG	3	9	238463	238471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401812
4582	NC_018020	CG	3	6	238503	238508	0 %	0 %	50 %	50 %	392401812
4583	NC_018020	GAG	2	6	238667	238672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392401812
4584	NC_018020	CGCGT	2	10	238740	238749	0 %	20 %	40 %	40 %	392401812
4585	NC_018020	CG	4	8	238751	238758	0 %	0 %	50 %	50 %	392401812
4586	NC_018020	A	7	7	238843	238849	100 %	0 %	0 %	0 %	392401812
4587	NC_018020	GCA	2	6	238853	238858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4588	NC_018020	CG	4	8	238867	238874	0 %	0 %	50 %	50 %	392401812
4589	NC_018020	AC	3	6	238975	238980	50 %	0 %	0 %	50 %	392401812
4590	NC_018020	GCG	2	6	239005	239010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401812
4591	NC_018020	GTC	2	6	239025	239030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401812
4592	NC_018020	GA	3	6	239064	239069	50 %	0 %	50 %	0 %	392401812
4593	NC_018020	TAG	2	6	239105	239110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401812
4594	NC_018020	A	7	7	239173	239179	100 %	0 %	0 %	0 %	392401813
4595	NC_018020	GCA	2	6	239190	239195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4596	NC_018020	AGC	3	9	239228	239236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4597	NC_018020	GC	3	6	239371	239376	0 %	0 %	50 %	50 %	392401813
4598	NC_018020	A	6	6	239443	239448	100 %	0 %	0 %	0 %	392401813
4599	NC_018020	CGT	2	6	239511	239516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4600	NC_018020	CGAG	2	8	239624	239631	25 %	0 %	50 %	25 %	392401813
4601	NC_018020	CGA	2	6	239655	239660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4602	NC_018020	CAC	2	6	239671	239676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401813
4603	NC_018020	TCT	2	6	239889	239894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401813
4604	NC_018020	CGA	2	6	239982	239987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4605	NC_018020	AGC	2	6	240020	240025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4606	NC_018020	AGC	2	6	240134	240139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4607	NC_018020	GCG	2	6	240158	240163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401813
4608	NC_018020	C	6	6	240169	240174	0 %	0 %	0 %	100 %	392401813
4609	NC_018020	CGAG	2	8	240183	240190	25 %	0 %	50 %	25 %	392401813
4610	NC_018020	CG	3	6	240195	240200	0 %	0 %	50 %	50 %	392401813
4611	NC_018020	AGC	2	6	240245	240250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4612	NC_018020	CCA	2	6	240264	240269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401813
4613	NC_018020	CAG	2	6	240286	240291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4614	NC_018020	GAAC	2	8	240300	240307	50 %	0 %	25 %	25 %	392401813
4615	NC_018020	AGC	2	6	240341	240346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4616	NC_018020	GCA	2	6	240350	240355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4617	NC_018020	ACC	2	6	240358	240363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401813
4618	NC_018020	CGCA	2	8	240549	240556	25 %	0 %	25 %	50 %	392401813
4619	NC_018020	CAG	2	6	240577	240582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401813
4620	NC_018020	AGCTCA	2	12	240641	240652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392401814
4621	NC_018020	GCC	2	6	240818	240823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401814
4622	NC_018020	GTG	2	6	240864	240869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401814
4623	NC_018020	GC	3	6	240923	240928	0 %	0 %	50 %	50 %	392401814
4624	NC_018020	GC	4	8	240962	240969	0 %	0 %	50 %	50 %	392401814
4625	NC_018020	T	7	7	240998	241004	0 %	100 %	0 %	0 %	392401814
4626	NC_018020	CGGCG	2	10	241020	241029	0 %	0 %	60 %	40 %	392401814
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4629	NC_018020	TGC	2	6	241077	241082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401814
4630	NC_018020	GC	3	6	241081	241086	0 %	0 %	50 %	50 %	392401814
4631	NC_018020	GCC	2	6	241109	241114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401814
4632	NC_018020	GCA	2	6	241118	241123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401814
4633	NC_018020	GCG	2	6	241130	241135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401814
4634	NC_018020	CGA	2	6	241180	241185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401814
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4639	NC_018020	CTG	2	6	241359	241364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401814
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4657	NC_018020	GCA	2	6	241734	241739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401814
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4660	NC_018020	GCC	2	6	241998	242003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4662	NC_018020	CG	3	6	242101	242106	0 %	0 %	50 %	50 %	392401815
4663	NC_018020	CG	3	6	242199	242204	0 %	0 %	50 %	50 %	392401815
4664	NC_018020	GCA	2	6	242210	242215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401815
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4690	NC_018020	CGG	2	6	243587	243592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401816
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4708	NC_018020	ATC	2	6	244791	244796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401817
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4710	NC_018020	GC	4	8	244958	244965	0 %	0 %	50 %	50 %	392401817
4711	NC_018020	CAAA	2	8	245051	245058	75 %	0 %	0 %	25 %	392401817
4712	NC_018020	TCG	2	6	245062	245067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401817
4713	NC_018020	GCCCT	2	10	245072	245081	0 %	20 %	20 %	60 %	392401817
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4717	NC_018020	ACG	2	6	245280	245285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401817
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4727	NC_018020	GC	3	6	245693	245698	0 %	0 %	50 %	50 %	392401818
4728	NC_018020	TGC	2	6	245718	245723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401818
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4730	NC_018020	GCA	2	6	245827	245832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401818
4731	NC_018020	T	6	6	245848	245853	0 %	100 %	0 %	0 %	392401818
4732	NC_018020	CGC	2	6	245962	245967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401818
4733	NC_018020	CTC	2	6	245984	245989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392401818
4734	NC_018020	CTT	2	6	246010	246015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401818
4735	NC_018020	CGA	2	6	246082	246087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401818
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4738	NC_018020	GCC	2	6	246344	246349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4739	NC_018020	A	8	8	246381	246388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4740	NC_018020	GCT	2	6	246457	246462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4741	NC_018020	A	6	6	246477	246482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_018020	CTT	2	6	246511	246516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4743	NC_018020	GAA	2	6	246537	246542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4745	NC_018020	GT	3	6	246661	246666	0 %	50 %	50 %	0 %	392401819
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4863	NC_018020	AGA	2	6	251834	251839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_018020	GCTG	2	8	251874	251881	0 %	25 %	50 %	25 %	392401823
4865	NC_018020	A	7	7	251908	251914	100 %	0 %	0 %	0 %	392401823
4866	NC_018020	AAAAG	2	10	251946	251955	80 %	0 %	20 %	0 %	392401823
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4868	NC_018020	GAA	2	6	252022	252027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401823
4869	NC_018020	C	6	6	252115	252120	0 %	0 %	0 %	100 %	392401823
4870	NC_018020	GCAA	2	8	252149	252156	50 %	0 %	25 %	25 %	392401823
4871	NC_018020	CAA	2	6	252195	252200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401823
4872	NC_018020	GCC	2	6	252279	252284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4873	NC_018020	TGC	2	6	252323	252328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4874	NC_018020	GCCT	2	8	252344	252351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4875	NC_018020	AGT	2	6	252619	252624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4977	NC_018020	AACG	2	8	256947	256954	50 %	0 %	25 %	25 %	392401828
4978	NC_018020	GC	4	8	256983	256990	0 %	0 %	50 %	50 %	392401828
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4983	NC_018020	ACT	2	6	257201	257206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401828
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4985	NC_018020	TCTT	2	8	257321	257328	0 %	75 %	0 %	25 %	392401828
4986	NC_018020	TCGA	2	8	257341	257348	25 %	25 %	25 %	25 %	392401828
4987	NC_018020	GGGC	2	8	257472	257479	0 %	0 %	75 %	25 %	392401828
4988	NC_018020	CGA	2	6	257504	257509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401828
4989	NC_018020	GCGAA	2	10	257531	257540	40 %	0 %	40 %	20 %	392401828
4990	NC_018020	CAT	2	6	257781	257786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401828
4991	NC_018020	A	6	6	257827	257832	100 %	0 %	0 %	0 %	392401828
4992	NC_018020	CAG	2	6	257848	257853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401828
4993	NC_018020	AGA	2	6	257859	257864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401828
4994	NC_018020	AAGA	2	8	257869	257876	75 %	0 %	25 %	0 %	392401828
4995	NC_018020	CTCG	2	8	257913	257920	0 %	25 %	25 %	50 %	392401828
4996	NC_018020	GCG	2	6	257999	258004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401828
4997	NC_018020	GAA	2	6	258016	258021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401828
4998	NC_018020	CGA	2	6	258051	258056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401828
4999	NC_018020	ACT	2	6	258062	258067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401828
5000	NC_018020	TGC	2	6	258075	258080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401828

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