MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 3832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018015	TTTG	2	8	556	563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018015	AGGA	2	8	1467	1474	50 %	0 %	50 %	0 %	390960178
3	NC_018015	TCCT	2	8	1969	1976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018015	CTCG	2	8	2217	2224	0 %	25 %	25 %	50 %	390960179
5	NC_018015	GCTC	2	8	3809	3816	0 %	25 %	25 %	50 %	390960182
6	NC_018015	TCCT	2	8	3945	3952	0 %	50 %	0 %	50 %	390960182
7	NC_018015	TCCT	2	8	4748	4755	0 %	50 %	0 %	50 %	390960183
8	NC_018015	TGGC	2	8	5584	5591	0 %	25 %	50 %	25 %	390960184
9	NC_018015	TGAA	2	8	5906	5913	50 %	25 %	25 %	0 %	390960184
10	NC_018015	ACCG	2	8	5923	5930	25 %	0 %	25 %	50 %	390960184
11	NC_018015	AACC	2	8	5963	5970	50 %	0 %	0 %	50 %	390960185
12	NC_018015	TCCT	2	8	6199	6206	0 %	50 %	0 %	50 %	390960185
13	NC_018015	GGCT	2	8	6645	6652	0 %	25 %	50 %	25 %	390960186
14	NC_018015	TGCA	2	8	6966	6973	25 %	25 %	25 %	25 %	390960186
15	NC_018015	GGCC	2	8	7531	7538	0 %	0 %	50 %	50 %	390960187
16	NC_018015	GGGC	2	8	9192	9199	0 %	0 %	75 %	25 %	390960189
17	NC_018015	GCTC	2	8	9548	9555	0 %	25 %	25 %	50 %	390960189
18	NC_018015	CTCG	2	8	9879	9886	0 %	25 %	25 %	50 %	390960189
19	NC_018015	AACG	2	8	10437	10444	50 %	0 %	25 %	25 %	390960191
20	NC_018015	GAGC	2	8	10699	10706	25 %	0 %	50 %	25 %	390960192
21	NC_018015	ACCG	2	8	10840	10847	25 %	0 %	25 %	50 %	390960192
22	NC_018015	CCAC	2	8	10974	10981	25 %	0 %	0 %	75 %	390960192
23	NC_018015	GCCT	2	8	11109	11116	0 %	25 %	25 %	50 %	390960192
24	NC_018015	GGAG	2	8	11791	11798	25 %	0 %	75 %	0 %	390960193
25	NC_018015	TCGC	2	8	12723	12730	0 %	25 %	25 %	50 %	390960194
26	NC_018015	GCCA	2	8	13478	13485	25 %	0 %	25 %	50 %	390960195
27	NC_018015	TTCT	2	8	13767	13774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018015	GGCT	2	8	14381	14388	0 %	25 %	50 %	25 %	390960196
29	NC_018015	CCTG	2	8	14840	14847	0 %	25 %	25 %	50 %	390960196
30	NC_018015	GCCC	2	8	15002	15009	0 %	0 %	25 %	75 %	390960196
31	NC_018015	CTTT	2	8	15092	15099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018015	AGAT	2	8	15467	15474	50 %	25 %	25 %	0 %	390960197
33	NC_018015	GAGG	2	8	16063	16070	25 %	0 %	75 %	0 %	390960197
34	NC_018015	GAGG	2	8	16377	16384	25 %	0 %	75 %	0 %	390960197
35	NC_018015	TCCT	2	8	17357	17364	0 %	50 %	0 %	50 %	390960198
36	NC_018015	GACC	2	8	17418	17425	25 %	0 %	25 %	50 %	390960198
37	NC_018015	GGTG	2	8	18189	18196	0 %	25 %	75 %	0 %	390960199
38	NC_018015	TGGC	2	8	18275	18282	0 %	25 %	50 %	25 %	390960199
39	NC_018015	TGGC	2	8	18411	18418	0 %	25 %	50 %	25 %	390960199
40	NC_018015	TGGC	2	8	18448	18455	0 %	25 %	50 %	25 %	390960199
41	NC_018015	GCAG	2	8	19774	19781	25 %	0 %	50 %	25 %	390960201
42	NC_018015	CGTT	2	8	20260	20267	0 %	50 %	25 %	25 %	390960201
43	NC_018015	GGCT	2	8	20669	20676	0 %	25 %	50 %	25 %	390960201
44	NC_018015	AGCG	2	8	20894	20901	25 %	0 %	50 %	25 %	390960201
45	NC_018015	CTCG	2	8	21157	21164	0 %	25 %	25 %	50 %	390960201
46	NC_018015	TCCT	2	8	21584	21591	0 %	50 %	0 %	50 %	390960202
47	NC_018015	CTTC	2	8	21954	21961	0 %	50 %	0 %	50 %	390960203
48	NC_018015	CCTT	2	8	22397	22404	0 %	50 %	0 %	50 %	390960203
49	NC_018015	TTTC	2	8	22790	22797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018015	TCCT	2	8	23345	23352	0 %	50 %	0 %	50 %	390960204
51	NC_018015	CGCC	2	8	23400	23407	0 %	0 %	25 %	75 %	390960204
52	NC_018015	GGAA	2	8	23658	23665	50 %	0 %	50 %	0 %	390960204
53	NC_018015	CGGC	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	390960204
54	NC_018015	GGTG	2	8	24555	24562	0 %	25 %	75 %	0 %	390960204
55	NC_018015	CCCT	2	8	24718	24725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_018015	CAGC	2	8	24759	24766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018015	CCCG	2	8	25056	25063	0 %	0 %	25 %	75 %	390960205
58	NC_018015	TTCG	2	8	26391	26398	0 %	50 %	25 %	25 %	390960206
59	NC_018015	GGAA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	50 %	0 %	390960208
60	NC_018015	CAGG	2	8	27898	27905	25 %	0 %	50 %	25 %	390960208
61	NC_018015	CTCG	2	8	28661	28668	0 %	25 %	25 %	50 %	390960209
62	NC_018015	CAGG	2	8	28685	28692	25 %	0 %	50 %	25 %	390960209
63	NC_018015	CCTA	2	8	28786	28793	25 %	25 %	0 %	50 %	390960209
64	NC_018015	GCTG	2	8	28988	28995	0 %	25 %	50 %	25 %	390960209
65	NC_018015	CCCG	2	8	29091	29098	0 %	0 %	25 %	75 %	390960210
66	NC_018015	AGGG	2	8	31258	31265	25 %	0 %	75 %	0 %	390960212
67	NC_018015	GAAC	2	8	31636	31643	50 %	0 %	25 %	25 %	390960212
68	NC_018015	CCCT	2	8	31668	31675	0 %	25 %	0 %	75 %	390960212
69	NC_018015	GTTT	2	8	32804	32811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018015	TCGA	2	8	32834	32841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018015	GAGG	2	8	32995	33002	25 %	0 %	75 %	0 %	390960213
72	NC_018015	AAGG	2	8	33250	33257	50 %	0 %	50 %	0 %	390960213
73	NC_018015	AAGG	2	8	34120	34127	50 %	0 %	50 %	0 %	390960213
74	NC_018015	CCTA	2	8	34267	34274	25 %	25 %	0 %	50 %	390960214
75	NC_018015	CAGG	2	8	35233	35240	25 %	0 %	50 %	25 %	390960215
76	NC_018015	ACGG	2	8	35703	35710	25 %	0 %	50 %	25 %	390960215
77	NC_018015	GGCT	2	8	36154	36161	0 %	25 %	50 %	25 %	390960216
78	NC_018015	GAAA	2	8	36351	36358	75 %	0 %	25 %	0 %	390960216
79	NC_018015	GGCT	2	8	36371	36378	0 %	25 %	50 %	25 %	390960216
80	NC_018015	CCTT	2	8	37799	37806	0 %	50 %	0 %	50 %	390960218
81	NC_018015	CTCC	2	8	37945	37952	0 %	25 %	0 %	75 %	390960218
82	NC_018015	CGGC	2	8	38225	38232	0 %	0 %	50 %	50 %	390960219
83	NC_018015	AGGC	2	8	38452	38459	25 %	0 %	50 %	25 %	390960219
84	NC_018015	TGGA	2	8	39750	39757	25 %	25 %	50 %	0 %	390960221
85	NC_018015	CGCT	2	8	39803	39810	0 %	25 %	25 %	50 %	390960221
86	NC_018015	GAAG	2	8	40121	40128	50 %	0 %	50 %	0 %	390960221
87	NC_018015	GAGG	2	8	40493	40500	25 %	0 %	75 %	0 %	390960221
88	NC_018015	ATTA	2	8	42864	42871	50 %	50 %	0 %	0 %	390960224
89	NC_018015	GGAA	2	8	43093	43100	50 %	0 %	50 %	0 %	390960224
90	NC_018015	CGAC	2	8	43165	43172	25 %	0 %	25 %	50 %	390960224
91	NC_018015	CCTT	2	8	43630	43637	0 %	50 %	0 %	50 %	390960224
92	NC_018015	GGTC	2	8	44165	44172	0 %	25 %	50 %	25 %	390960225
93	NC_018015	GGGA	2	8	44613	44620	25 %	0 %	75 %	0 %	390960225
94	NC_018015	ACCG	2	8	44879	44886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018015	CCCG	2	8	45298	45305	0 %	0 %	25 %	75 %	390960226
96	NC_018015	GAAG	2	8	45787	45794	50 %	0 %	50 %	0 %	390960226
97	NC_018015	GAAC	2	8	45973	45980	50 %	0 %	25 %	25 %	390960226
98	NC_018015	GTGA	2	8	46010	46017	25 %	25 %	50 %	0 %	390960226
99	NC_018015	CAGC	2	8	46690	46697	25 %	0 %	25 %	50 %	390960227
100	NC_018015	TGAA	2	8	46964	46971	50 %	25 %	25 %	0 %	390960227
101	NC_018015	GGGC	2	8	47456	47463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018015	CTTT	2	8	47673	47680	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018015	ACCC	2	8	47771	47778	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_018015	GGTA	2	8	47959	47966	25 %	25 %	50 %	0 %	390960228
105	NC_018015	TCCC	2	8	48239	48246	0 %	25 %	0 %	75 %	390960228
106	NC_018015	CCTG	2	8	48339	48346	0 %	25 %	25 %	50 %	390960228
107	NC_018015	AGGA	2	8	49158	49165	50 %	0 %	50 %	0 %	390960229
108	NC_018015	CGGG	2	8	49249	49256	0 %	0 %	75 %	25 %	390960229
109	NC_018015	CTCC	2	8	50619	50626	0 %	25 %	0 %	75 %	390960230
110	NC_018015	CAAG	2	8	50973	50980	50 %	0 %	25 %	25 %	390960230
111	NC_018015	GTGG	2	8	52404	52411	0 %	25 %	75 %	0 %	390960232
112	NC_018015	TGGT	2	8	52506	52513	0 %	50 %	50 %	0 %	390960232
113	NC_018015	AGCT	2	8	53019	53026	25 %	25 %	25 %	25 %	390960233
114	NC_018015	TGGG	2	8	54167	54174	0 %	25 %	75 %	0 %	390960235
115	NC_018015	GAAA	2	8	54387	54394	75 %	0 %	25 %	0 %	390960235
116	NC_018015	GCTG	2	8	54650	54657	0 %	25 %	50 %	25 %	390960235
117	NC_018015	GGCA	2	8	54718	54725	25 %	0 %	50 %	25 %	390960235
118	NC_018015	CGGC	2	8	55661	55668	0 %	0 %	50 %	50 %	390960236
119	NC_018015	GTGA	2	8	56316	56323	25 %	25 %	50 %	0 %	390960237
120	NC_018015	CGAC	2	8	56911	56918	25 %	0 %	25 %	50 %	390960238
121	NC_018015	ATCC	2	8	57939	57946	25 %	25 %	0 %	50 %	390960240
122	NC_018015	ATCC	2	8	57963	57970	25 %	25 %	0 %	50 %	390960240
123	NC_018015	GGTT	2	8	59116	59123	0 %	50 %	50 %	0 %	390960242
124	NC_018015	ACCG	2	8	59229	59236	25 %	0 %	25 %	50 %	390960242
125	NC_018015	CAGT	2	8	59379	59386	25 %	25 %	25 %	25 %	390960242
126	NC_018015	AAGC	2	8	59681	59688	50 %	0 %	25 %	25 %	390960242
127	NC_018015	CTGG	2	8	60406	60413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018015	GATG	2	8	60427	60434	25 %	25 %	50 %	0 %	390960244
129	NC_018015	AGCA	2	8	60959	60966	50 %	0 %	25 %	25 %	390960244
130	NC_018015	GGAG	2	8	61549	61556	25 %	0 %	75 %	0 %	390960244
131	NC_018015	ACGG	2	8	61728	61735	25 %	0 %	50 %	25 %	390960244
132	NC_018015	TTTA	2	8	61987	61994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018015	AAGA	2	8	62060	62067	75 %	0 %	25 %	0 %	390960245
134	NC_018015	TATG	2	8	62303	62310	25 %	50 %	25 %	0 %	390960245
135	NC_018015	GAAG	2	8	62589	62596	50 %	0 %	50 %	0 %	390960246
136	NC_018015	CAAC	2	8	63712	63719	50 %	0 %	0 %	50 %	390960248
137	NC_018015	AGCC	2	8	64021	64028	25 %	0 %	25 %	50 %	390960248
138	NC_018015	GTTG	2	8	64215	64222	0 %	50 %	50 %	0 %	390960248
139	NC_018015	GTAG	2	8	64505	64512	25 %	25 %	50 %	0 %	390960248
140	NC_018015	ACCG	2	8	65609	65616	25 %	0 %	25 %	50 %	390960249
141	NC_018015	CTTC	2	8	66631	66638	0 %	50 %	0 %	50 %	390960249
142	NC_018015	CAGC	2	8	67216	67223	25 %	0 %	25 %	50 %	390960249
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