MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018015	GAA	2	6	120584	120589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_018015	AGG	2	6	120613	120618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_018015	AGA	2	6	120705	120710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960301
2504	NC_018015	ATC	2	6	120731	120736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960301
2505	NC_018015	CTT	2	6	120817	120822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960301
2506	NC_018015	GCTA	2	8	120838	120845	25 %	25 %	25 %	25 %	390960301
2507	NC_018015	TCG	2	6	120854	120859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2508	NC_018015	CCT	2	6	120897	120902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960301
2509	NC_018015	GAG	2	6	120949	120954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960301
2510	NC_018015	CGT	2	6	121068	121073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2511	NC_018015	GTA	2	6	121108	121113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960301
2512	NC_018015	GTC	2	6	121129	121134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2513	NC_018015	CTC	2	6	121174	121179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960301
2514	NC_018015	GCGG	2	8	121189	121196	0 %	0 %	75 %	25 %	390960301
2515	NC_018015	GCG	3	9	121262	121270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960301
2516	NC_018015	TCG	2	6	121286	121291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2517	NC_018015	CTT	3	9	121339	121347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960301
2518	NC_018015	GAG	2	6	121363	121368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960301
2519	NC_018015	G	6	6	121407	121412	0 %	0 %	100 %	0 %	390960301
2520	NC_018015	GAAG	2	8	121426	121433	50 %	0 %	50 %	0 %	390960301
2521	NC_018015	TTG	2	6	121469	121474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960301
2522	NC_018015	GAC	2	6	121522	121527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2523	NC_018015	GGC	2	6	121576	121581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960301
2524	NC_018015	GAA	2	6	121606	121611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960301
2525	NC_018015	GAG	2	6	121645	121650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960301
2526	NC_018015	CGC	3	9	121674	121682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960301
2527	NC_018015	CGA	2	6	121707	121712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2528	NC_018015	TGG	2	6	121733	121738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960301
2529	NC_018015	CTG	2	6	121769	121774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2530	NC_018015	CTG	2	6	121781	121786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2531	NC_018015	CGA	2	6	121842	121847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2532	NC_018015	CTC	2	6	121885	121890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960301
2533	NC_018015	ACG	2	6	121892	121897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960301
2534	NC_018015	TA	3	6	121968	121973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_018015	CGA	2	6	122065	122070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_018015	GGCCCG	2	12	122079	122090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_018015	CGA	2	6	122119	122124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_018015	CGA	2	6	122287	122292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960302
2539	NC_018015	GGA	2	6	122308	122313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960302
2540	NC_018015	CCA	2	6	122494	122499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960302
2541	NC_018015	CTGG	2	8	122648	122655	0 %	25 %	50 %	25 %	390960302
2542	NC_018015	GGA	2	6	122692	122697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960302
2543	NC_018015	GAG	2	6	122705	122710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960302
2544	NC_018015	TGA	2	6	122712	122717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960302
2545	NC_018015	GGA	2	6	122830	122835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960302
2546	NC_018015	CTCA	2	8	122840	122847	25 %	25 %	0 %	50 %	390960302
2547	NC_018015	GAA	2	6	122915	122920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960303
2548	NC_018015	CG	3	6	123027	123032	0 %	0 %	50 %	50 %	390960303
2549	NC_018015	ATGGAG	2	12	123088	123099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390960303
2550	NC_018015	T	6	6	123123	123128	0 %	100 %	0 %	0 %	390960303
2551	NC_018015	TTC	2	6	123152	123157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960303
2552	NC_018015	G	6	6	123167	123172	0 %	0 %	100 %	0 %	390960303
2553	NC_018015	CCCA	2	8	123212	123219	25 %	0 %	0 %	75 %	390960303
2554	NC_018015	CCT	2	6	123249	123254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960303
2555	NC_018015	GGC	2	6	123260	123265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960303
2556	NC_018015	TCA	2	6	123356	123361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960303
2557	NC_018015	TGA	2	6	123399	123404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960303
2558	NC_018015	TC	4	8	123481	123488	0 %	50 %	0 %	50 %	390960304
2559	NC_018015	GGA	2	6	123542	123547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960304
2560	NC_018015	GTCC	2	8	123566	123573	0 %	25 %	25 %	50 %	390960304
2561	NC_018015	AGG	2	6	123598	123603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960304
2562	NC_018015	AGA	2	6	123631	123636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960304
2563	NC_018015	GGA	2	6	123674	123679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960304
2564	NC_018015	CTA	2	6	123758	123763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960304
2565	NC_018015	GCG	2	6	123871	123876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960304
2566	NC_018015	GAA	2	6	123913	123918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960304
2567	NC_018015	CCAC	2	8	123995	124002	25 %	0 %	0 %	75 %	390960304
2568	NC_018015	GCTG	2	8	124225	124232	0 %	25 %	50 %	25 %	390960305
2569	NC_018015	GCT	2	6	124312	124317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960305
2570	NC_018015	ACG	2	6	124338	124343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960305
2571	NC_018015	AGC	2	6	124372	124377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960305
2572	NC_018015	GGC	2	6	124384	124389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960305
2573	NC_018015	ATC	2	6	124397	124402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960305
2574	NC_018015	CTT	2	6	124561	124566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960305
2575	NC_018015	GAG	2	6	124612	124617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960305
2576	NC_018015	TCA	2	6	124643	124648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_018015	ACA	2	6	124711	124716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960306
2578	NC_018015	AATCGA	2	12	124754	124765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390960306
2579	NC_018015	CAGGGG	2	12	124766	124777	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	390960306
2580	NC_018015	GCCT	2	8	124795	124802	0 %	25 %	25 %	50 %	390960306
2581	NC_018015	ATA	2	6	124851	124856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960306
2582	NC_018015	AGG	2	6	124870	124875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960306
2583	NC_018015	CCT	2	6	124930	124935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2584	NC_018015	GAGC	2	8	124949	124956	25 %	0 %	50 %	25 %	390960307
2585	NC_018015	C	7	7	124999	125005	0 %	0 %	0 %	100 %	390960307
2586	NC_018015	CCG	3	9	125019	125027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960307
2587	NC_018015	CGA	2	6	125116	125121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960307
2588	NC_018015	CGG	2	6	125170	125175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960307
2589	NC_018015	TGA	2	6	125200	125205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960307
2590	NC_018015	ATT	2	6	125250	125255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960307
2591	NC_018015	GAG	2	6	125312	125317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960307
2592	NC_018015	CTT	2	6	125384	125389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960307
2593	NC_018015	AGA	2	6	125410	125415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960307
2594	NC_018015	CAG	2	6	125426	125431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960307
2595	NC_018015	G	6	6	125431	125436	0 %	0 %	100 %	0 %	390960307
2596	NC_018015	TGG	3	9	125556	125564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960307
2597	NC_018015	CG	3	6	125677	125682	0 %	0 %	50 %	50 %	390960307
2598	NC_018015	GTG	2	6	125732	125737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960307
2599	NC_018015	CGC	2	6	125746	125751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960307
2600	NC_018015	GAG	2	6	125852	125857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960307
2601	NC_018015	CTT	2	6	125888	125893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960307
2602	NC_018015	TTC	2	6	125910	125915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960307
2603	NC_018015	CTC	2	6	126008	126013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2604	NC_018015	CCT	2	6	126076	126081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2605	NC_018015	TGT	2	6	126082	126087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960307
2606	NC_018015	TGG	2	6	126133	126138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960307
2607	NC_018015	TTA	2	6	126139	126144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960307
2608	NC_018015	GAG	2	6	126176	126181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960307
2609	NC_018015	GAC	2	6	126209	126214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960307
2610	NC_018015	CTC	2	6	126227	126232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2611	NC_018015	CGTCA	2	10	126269	126278	20 %	20 %	20 %	40 %	390960307
2612	NC_018015	CTC	2	6	126322	126327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2613	NC_018015	AAT	2	6	126366	126371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_018015	CTC	2	6	126409	126414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_018015	AT	4	8	126437	126444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_018015	TGG	2	6	126451	126456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_018015	GTA	2	6	126501	126506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960308
2618	NC_018015	TAC	2	6	126603	126608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960308
2619	NC_018015	TCC	2	6	126616	126621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960308
2620	NC_018015	GTG	2	6	126657	126662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960308
2621	NC_018015	GGA	2	6	126686	126691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960308
2622	NC_018015	TCG	2	6	126715	126720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960308
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2743	NC_018015	GA	3	6	132155	132160	50 %	0 %	50 %	0 %	390960312
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2745	NC_018015	AG	3	6	132213	132218	50 %	0 %	50 %	0 %	390960312
2746	NC_018015	ACA	2	6	132290	132295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960312
2747	NC_018015	GCC	2	6	132301	132306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960312
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2749	NC_018015	CG	3	6	132362	132367	0 %	0 %	50 %	50 %	390960312
2750	NC_018015	CTC	2	6	132397	132402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960312
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2772	NC_018015	TCT	2	6	133300	133305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2773	NC_018015	CGA	2	6	133417	133422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960313
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2843	NC_018015	CGC	2	6	136552	136557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960317
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2850	NC_018015	CCGG	2	8	136888	136895	0 %	0 %	50 %	50 %	390960317
2851	NC_018015	ACGAGC	2	12	136967	136978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960317
2852	NC_018015	GGT	2	6	137054	137059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2853	NC_018015	GGA	2	6	137066	137071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960318
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2855	NC_018015	CCTCA	2	10	137099	137108	20 %	20 %	0 %	60 %	390960318
2856	NC_018015	ATG	2	6	137136	137141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960318
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2859	NC_018015	CG	3	6	137164	137169	0 %	0 %	50 %	50 %	390960318
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2865	NC_018015	TCG	2	6	137524	137529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960318
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2990	NC_018015	CCG	2	6	143640	143645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960326
2991	NC_018015	TCC	2	6	143712	143717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960326
2992	NC_018015	CCT	2	6	143761	143766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960326
2993	NC_018015	CTT	2	6	143786	143791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960326
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2995	NC_018015	TCT	2	6	143878	143883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960326
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