MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018015	TCTCGT	2	12	23955	23966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960204
502	NC_018015	GCC	3	9	23989	23997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960204
503	NC_018015	CTT	2	6	24112	24117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960204
504	NC_018015	TCC	2	6	24185	24190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960204
505	NC_018015	ATG	2	6	24302	24307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960204
506	NC_018015	TCC	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960204
507	NC_018015	CG	3	6	24327	24332	0 %	0 %	50 %	50 %	390960204
508	NC_018015	CGGC	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	390960204
509	NC_018015	CG	3	6	24433	24438	0 %	0 %	50 %	50 %	390960204
510	NC_018015	TGA	2	6	24441	24446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960204
511	NC_018015	GTC	2	6	24451	24456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960204
512	NC_018015	TCA	2	6	24471	24476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960204
513	NC_018015	TGA	2	6	24516	24521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960204
514	NC_018015	GGTG	2	8	24555	24562	0 %	25 %	75 %	0 %	390960204
515	NC_018015	CCTCGC	2	12	24600	24611	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_018015	CTC	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_018015	TCT	2	6	24669	24674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018015	CAC	2	6	24675	24680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_018015	GGA	2	6	24682	24687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018015	TTA	2	6	24704	24709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018015	CCCT	2	8	24718	24725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
522	NC_018015	CAGC	2	8	24759	24766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_018015	GAT	2	6	24822	24827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960205
524	NC_018015	GAG	2	6	24910	24915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
525	NC_018015	AGG	2	6	24923	24928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
526	NC_018015	CGA	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960205
527	NC_018015	AAG	2	6	25036	25041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960205
528	NC_018015	CCCG	2	8	25056	25063	0 %	0 %	25 %	75 %	390960205
529	NC_018015	TCA	2	6	25094	25099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960205
530	NC_018015	AGG	2	6	25123	25128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
531	NC_018015	CTTCC	2	10	25138	25147	0 %	40 %	0 %	60 %	390960205
532	NC_018015	GGC	2	6	25177	25182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960205
533	NC_018015	ACC	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960205
534	NC_018015	CGAGGT	2	12	25272	25283	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390960205
535	NC_018015	GGT	2	6	25362	25367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960205
536	NC_018015	CTC	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960205
537	NC_018015	GAG	2	6	25483	25488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
538	NC_018015	GAG	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
539	NC_018015	GCC	2	6	25524	25529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960205
540	NC_018015	GGA	2	6	25530	25535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
541	NC_018015	AGG	2	6	25544	25549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
542	NC_018015	GAG	2	6	25570	25575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
543	NC_018015	TCG	2	6	25592	25597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960205
544	NC_018015	AGA	2	6	25598	25603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960205
545	NC_018015	GAAGA	2	10	25624	25633	60 %	0 %	40 %	0 %	390960205
546	NC_018015	AGG	2	6	25646	25651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
547	NC_018015	GAG	2	6	25666	25671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
548	NC_018015	AGG	2	6	25685	25690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
549	NC_018015	AAG	2	6	25750	25755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960205
550	NC_018015	ACC	2	6	25765	25770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960205
551	NC_018015	ACC	3	9	25804	25812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960205
552	NC_018015	AAG	2	6	25813	25818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960205
553	NC_018015	ACC	2	6	25819	25824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960205
554	NC_018015	AAG	3	9	25828	25836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960205
555	NC_018015	GGC	2	6	25842	25847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960205
556	NC_018015	GAG	2	6	25849	25854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
557	NC_018015	AGG	2	6	25865	25870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960205
558	NC_018015	TCC	2	6	25886	25891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_018015	AAC	2	6	25921	25926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960206
560	NC_018015	CT	3	6	25934	25939	0 %	50 %	0 %	50 %	390960206
561	NC_018015	CCT	2	6	25941	25946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
562	NC_018015	GCG	2	6	25979	25984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960206
563	NC_018015	ACA	2	6	26009	26014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960206
564	NC_018015	G	6	6	26069	26074	0 %	0 %	100 %	0 %	390960206
565	NC_018015	CTC	2	6	26122	26127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
566	NC_018015	CTA	2	6	26184	26189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960206
567	NC_018015	TTCG	2	8	26391	26398	0 %	50 %	25 %	25 %	390960206
568	NC_018015	TCC	2	6	26459	26464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
569	NC_018015	TCC	2	6	26501	26506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960206
570	NC_018015	GAT	2	6	26621	26626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960207
571	NC_018015	GGT	2	6	26627	26632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960207
572	NC_018015	ACT	2	6	26668	26673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
573	NC_018015	CAC	2	6	26708	26713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960207
574	NC_018015	CTC	2	6	26862	26867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
575	NC_018015	TCC	2	6	26896	26901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
576	NC_018015	CTT	2	6	26972	26977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960207
577	NC_018015	TCC	2	6	26980	26985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
578	NC_018015	ACG	2	6	27013	27018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960207
579	NC_018015	CTC	2	6	27024	27029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
580	NC_018015	ACT	2	6	27055	27060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
581	NC_018015	ACT	2	6	27070	27075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960207
582	NC_018015	AC	3	6	27212	27217	50 %	0 %	0 %	50 %	390960207
583	NC_018015	CCT	2	6	27230	27235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960207
584	NC_018015	GGA	2	6	27367	27372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018015	AAC	2	6	27374	27379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_018015	AAG	2	6	27395	27400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018015	TTC	2	6	27539	27544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960208
588	NC_018015	GAG	2	6	27557	27562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960208
589	NC_018015	GGAA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	50 %	0 %	390960208
590	NC_018015	TGA	2	6	27679	27684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960208
591	NC_018015	GTG	2	6	27719	27724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960208
592	NC_018015	GAG	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960208
593	NC_018015	CAGG	2	8	27898	27905	25 %	0 %	50 %	25 %	390960208
594	NC_018015	GGT	2	6	27922	27927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960208
595	NC_018015	GGGAA	2	10	27959	27968	40 %	0 %	60 %	0 %	390960208
596	NC_018015	CCT	2	6	27971	27976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960208
597	NC_018015	GAC	2	6	28038	28043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960209
598	NC_018015	GC	3	6	28108	28113	0 %	0 %	50 %	50 %	390960209
599	NC_018015	GGA	2	6	28115	28120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
600	NC_018015	GAG	2	6	28181	28186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
601	NC_018015	GAC	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960209
602	NC_018015	GAA	2	6	28229	28234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960209
603	NC_018015	GAG	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
604	NC_018015	GTG	2	6	28263	28268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960209
605	NC_018015	TC	3	6	28334	28339	0 %	50 %	0 %	50 %	390960209
606	NC_018015	GGA	2	6	28388	28393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
607	NC_018015	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960209
608	NC_018015	GA	3	6	28443	28448	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
609	NC_018015	CTC	2	6	28461	28466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960209
610	NC_018015	CTC	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960209
611	NC_018015	GGA	2	6	28589	28594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
612	NC_018015	GT	3	6	28649	28654	0 %	50 %	50 %	0 %	390960209
613	NC_018015	CTCG	2	8	28661	28668	0 %	25 %	25 %	50 %	390960209
614	NC_018015	CAGG	2	8	28685	28692	25 %	0 %	50 %	25 %	390960209
615	NC_018015	CTT	2	6	28743	28748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960209
616	NC_018015	TGT	2	6	28771	28776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960209
617	NC_018015	CCTA	2	8	28786	28793	25 %	25 %	0 %	50 %	390960209
618	NC_018015	GAGAG	2	10	28817	28826	40 %	0 %	60 %	0 %	390960209
619	NC_018015	GCC	2	6	28833	28838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960209
620	NC_018015	TGG	2	6	28860	28865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960209
621	NC_018015	GA	3	6	28923	28928	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
622	NC_018015	CGG	2	6	28980	28985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960209
623	NC_018015	GCTG	2	8	28988	28995	0 %	25 %	50 %	25 %	390960209
624	NC_018015	GA	3	6	29007	29012	50 %	0 %	50 %	0 %	390960209
625	NC_018015	GAG	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960209
626	NC_018015	CT	3	6	29067	29072	0 %	50 %	0 %	50 %	390960210
627	NC_018015	CCA	2	6	29073	29078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960210
628	NC_018015	CG	3	6	29084	29089	0 %	0 %	50 %	50 %	390960210
629	NC_018015	CCCG	2	8	29091	29098	0 %	0 %	25 %	75 %	390960210
630	NC_018015	ATC	2	6	29108	29113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960210
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