MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017992	TGC	2	6	172574	172579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933290
4002	NC_017992	CAC	2	6	172601	172606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933290
4003	NC_017992	GCC	2	6	172628	172633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933290
4004	NC_017992	AGAT	2	8	172678	172685	50 %	25 %	25 %	0 %	390933290
4005	NC_017992	TAT	2	6	172769	172774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933290
4006	NC_017992	GCA	2	6	172809	172814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933290
4007	NC_017992	ATC	2	6	172842	172847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933290
4008	NC_017992	AT	3	6	172856	172861	50 %	50 %	0 %	0 %	390933290
4009	NC_017992	TA	3	6	172907	172912	50 %	50 %	0 %	0 %	390933290
4010	NC_017992	CCA	2	6	172957	172962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933290
4011	NC_017992	TAAA	2	8	173003	173010	75 %	25 %	0 %	0 %	390933290
4012	NC_017992	T	6	6	173032	173037	0 %	100 %	0 %	0 %	390933290
4013	NC_017992	AAAAGC	2	12	173049	173060	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390933290
4014	NC_017992	TAA	2	6	173095	173100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933290
4015	NC_017992	TAA	2	6	173107	173112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933290
4016	NC_017992	TGCT	2	8	173133	173140	0 %	50 %	25 %	25 %	390933290
4017	NC_017992	GCC	2	6	173151	173156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933290
4018	NC_017992	CCA	2	6	173199	173204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933290
4019	NC_017992	TTG	2	6	173238	173243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933290
4020	NC_017992	GATG	2	8	173261	173268	25 %	25 %	50 %	0 %	390933290
4021	NC_017992	CTG	2	6	173289	173294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933290
4022	NC_017992	TATT	2	8	173305	173312	25 %	75 %	0 %	0 %	390933290
4023	NC_017992	TTA	2	6	173344	173349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933290
4024	NC_017992	T	6	6	173375	173380	0 %	100 %	0 %	0 %	390933290
4025	NC_017992	ATC	2	6	173385	173390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933290
4026	NC_017992	CAAAGT	2	12	173450	173461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390933291
4027	NC_017992	AGA	2	6	173564	173569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933291
4028	NC_017992	ATC	2	6	173574	173579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933291
4029	NC_017992	TTA	2	6	173617	173622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933291
4030	NC_017992	GCT	2	6	173661	173666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933291
4031	NC_017992	GATA	2	8	173667	173674	50 %	25 %	25 %	0 %	390933291
4032	NC_017992	CTT	2	6	173677	173682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933291
4033	NC_017992	CAG	3	9	173767	173775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933291
4034	NC_017992	AAAGC	2	10	173818	173827	60 %	0 %	20 %	20 %	390933291
4035	NC_017992	TCT	2	6	173863	173868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933291
4036	NC_017992	CTG	2	6	173898	173903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933291
4037	NC_017992	A	6	6	173909	173914	100 %	0 %	0 %	0 %	390933291
4038	NC_017992	GTA	2	6	174018	174023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933291
4039	NC_017992	ATG	2	6	174072	174077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933291
4040	NC_017992	ATG	2	6	174129	174134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933291
4041	NC_017992	TCA	2	6	174187	174192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933291
4042	NC_017992	TGC	2	6	174295	174300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933291
4043	NC_017992	GAA	2	6	174337	174342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933291
4044	NC_017992	GTA	2	6	174359	174364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933291
4045	NC_017992	CAT	2	6	174376	174381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933291
4046	NC_017992	ATT	2	6	174442	174447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933292
4047	NC_017992	TTG	2	6	174455	174460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933292
4048	NC_017992	TCT	2	6	174530	174535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4049	NC_017992	TCT	2	6	174570	174575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4050	NC_017992	TGT	2	6	174646	174651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933292
4051	NC_017992	AGA	2	6	174691	174696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933292
4052	NC_017992	CTA	2	6	174771	174776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933292
4053	NC_017992	GATT	2	8	174778	174785	25 %	50 %	25 %	0 %	390933292
4054	NC_017992	AT	3	6	174868	174873	50 %	50 %	0 %	0 %	390933292
4055	NC_017992	TGA	2	6	174878	174883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933292
4056	NC_017992	A	6	6	174890	174895	100 %	0 %	0 %	0 %	390933292
4057	NC_017992	CTG	2	6	174929	174934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933292
4058	NC_017992	CATCTT	2	12	174939	174950	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390933292
4059	NC_017992	TCTGC	2	10	174969	174978	0 %	40 %	20 %	40 %	390933292
4060	NC_017992	CAA	2	6	175051	175056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933292
4061	NC_017992	GCC	2	6	175090	175095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933292
4062	NC_017992	CAAC	2	8	175110	175117	50 %	0 %	0 %	50 %	390933292
4063	NC_017992	TCT	2	6	175155	175160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4064	NC_017992	CTT	2	6	175188	175193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4065	NC_017992	TCA	3	9	175199	175207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933292
4066	NC_017992	CTT	2	6	175209	175214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4067	NC_017992	AAG	2	6	175269	175274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933292
4068	NC_017992	TGT	3	9	175278	175286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933292
4069	NC_017992	ATC	2	6	175420	175425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933292
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4071	NC_017992	TAT	2	6	175462	175467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933292
4072	NC_017992	TC	3	6	175470	175475	0 %	50 %	0 %	50 %	390933292
4073	NC_017992	T	6	6	175603	175608	0 %	100 %	0 %	0 %	390933292
4074	NC_017992	TGT	2	6	175650	175655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933292
4075	NC_017992	CAT	2	6	175725	175730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933292
4076	NC_017992	CTT	2	6	175734	175739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933292
4077	NC_017992	CAT	2	6	175776	175781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933292
4078	NC_017992	T	6	6	175825	175830	0 %	100 %	0 %	0 %	390933292
4079	NC_017992	ATTT	2	8	175867	175874	25 %	75 %	0 %	0 %	390933292
4080	NC_017992	TTC	2	6	175930	175935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933293
4081	NC_017992	CAT	2	6	175964	175969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
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4083	NC_017992	TCG	2	6	176107	176112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933293
4084	NC_017992	TA	3	6	176157	176162	50 %	50 %	0 %	0 %	390933293
4085	NC_017992	T	6	6	176184	176189	0 %	100 %	0 %	0 %	390933293
4086	NC_017992	GAA	2	6	176219	176224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933293
4087	NC_017992	CAT	2	6	176414	176419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
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4089	NC_017992	CAT	2	6	176528	176533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4090	NC_017992	GCA	2	6	176674	176679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933293
4091	NC_017992	TCTA	2	8	176706	176713	25 %	50 %	0 %	25 %	390933293
4092	NC_017992	CAA	2	6	176753	176758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933293
4093	NC_017992	GAA	2	6	176843	176848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933293
4094	NC_017992	GCT	2	6	176925	176930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933293
4095	NC_017992	TGCC	2	8	176972	176979	0 %	25 %	25 %	50 %	390933293
4096	NC_017992	GTA	2	6	176983	176988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933293
4097	NC_017992	TCA	2	6	177046	177051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4098	NC_017992	ATTTA	2	10	177156	177165	40 %	60 %	0 %	0 %	390933293
4099	NC_017992	CCA	2	6	177167	177172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933293
4100	NC_017992	ACG	3	9	177196	177204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933293
4101	NC_017992	TCA	2	6	177235	177240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4102	NC_017992	ATC	2	6	177241	177246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4103	NC_017992	TAC	2	6	177288	177293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4104	NC_017992	CGA	2	6	177330	177335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933293
4105	NC_017992	TCA	2	6	177341	177346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933293
4106	NC_017992	TCC	2	6	177353	177358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_017992	ATTTT	2	10	177385	177394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017992	A	8	8	177395	177402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017992	CTA	2	6	177463	177468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933294
4110	NC_017992	TGT	2	6	177496	177501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933294
4111	NC_017992	TCT	2	6	177528	177533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933294
4112	NC_017992	CT	3	6	177607	177612	0 %	50 %	0 %	50 %	390933294
4113	NC_017992	TC	3	6	177620	177625	0 %	50 %	0 %	50 %	390933294
4114	NC_017992	CTG	2	6	177646	177651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933294
4115	NC_017992	T	6	6	177678	177683	0 %	100 %	0 %	0 %	390933294
4116	NC_017992	ATC	2	6	177713	177718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933294
4117	NC_017992	TATT	2	8	177784	177791	25 %	75 %	0 %	0 %	390933294
4118	NC_017992	TGCCTC	2	12	177859	177870	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390933294
4119	NC_017992	GTCT	2	8	177896	177903	0 %	50 %	25 %	25 %	390933294
4120	NC_017992	T	6	6	177933	177938	0 %	100 %	0 %	0 %	390933294
4121	NC_017992	TA	3	6	178004	178009	50 %	50 %	0 %	0 %	390933294
4122	NC_017992	ACG	2	6	178225	178230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933294
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4124	NC_017992	CGT	2	6	178324	178329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933294
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4131	NC_017992	T	6	6	178812	178817	0 %	100 %	0 %	0 %	390933294
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4247	NC_017992	GTA	2	6	184441	184446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933299
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4249	NC_017992	AGA	2	6	184519	184524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017992	AAT	2	6	184536	184541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933300
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4497	NC_017992	CCT	2	6	196515	196520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4498	NC_017992	A	6	6	196567	196572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_017992	TAT	2	6	196573	196578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_017992	ATA	2	6	196586	196591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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