MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017992	ATG	2	6	23249	23254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933157
502	NC_017992	A	6	6	23287	23292	100 %	0 %	0 %	0 %	390933157
503	NC_017992	ATC	2	6	23300	23305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933157
504	NC_017992	T	6	6	23326	23331	0 %	100 %	0 %	0 %	390933157
505	NC_017992	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017992	TAA	2	6	23387	23392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017992	TAA	2	6	23394	23399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017992	A	7	7	23414	23420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017992	CAT	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933158
510	NC_017992	TTG	2	6	23465	23470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933158
511	NC_017992	CTT	2	6	23476	23481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
512	NC_017992	CCTT	2	8	23504	23511	0 %	50 %	0 %	50 %	390933158
513	NC_017992	TCT	2	6	23519	23524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
514	NC_017992	TCA	2	6	23555	23560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933158
515	NC_017992	TAA	2	6	23583	23588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933158
516	NC_017992	CCT	2	6	23590	23595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933158
517	NC_017992	TCG	2	6	23673	23678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933158
518	NC_017992	CCG	2	6	23724	23729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933158
519	NC_017992	TCA	2	6	23750	23755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933158
520	NC_017992	T	6	6	23794	23799	0 %	100 %	0 %	0 %	390933158
521	NC_017992	ATTT	2	8	23806	23813	25 %	75 %	0 %	0 %	390933158
522	NC_017992	TCT	2	6	23836	23841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
523	NC_017992	GA	3	6	23873	23878	50 %	0 %	50 %	0 %	390933158
524	NC_017992	ATC	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933158
525	NC_017992	CGG	2	6	23932	23937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933158
526	NC_017992	TCT	2	6	23985	23990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
527	NC_017992	TTG	2	6	24000	24005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933158
528	NC_017992	CTT	2	6	24042	24047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
529	NC_017992	TTC	2	6	24048	24053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933158
530	NC_017992	CA	3	6	24112	24117	50 %	0 %	0 %	50 %	390933158
531	NC_017992	TTTA	2	8	24127	24134	25 %	75 %	0 %	0 %	390933158
532	NC_017992	A	6	6	24179	24184	100 %	0 %	0 %	0 %	390933158
533	NC_017992	GTCTT	2	10	24201	24210	0 %	60 %	20 %	20 %	390933158
534	NC_017992	ATT	2	6	24304	24309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933158
535	NC_017992	CCATAA	2	12	24501	24512	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390933158
536	NC_017992	A	6	6	24518	24523	100 %	0 %	0 %	0 %	390933158
537	NC_017992	CTG	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933158
538	NC_017992	TGT	2	6	24623	24628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933158
539	NC_017992	TC	3	6	24637	24642	0 %	50 %	0 %	50 %	390933158
540	NC_017992	CCT	2	6	24675	24680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_017992	AT	3	6	24720	24725	50 %	50 %	0 %	0 %	390933159
542	NC_017992	TTAT	2	8	24729	24736	25 %	75 %	0 %	0 %	390933159
543	NC_017992	AT	3	6	24748	24753	50 %	50 %	0 %	0 %	390933159
544	NC_017992	TAA	2	6	24757	24762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933159
545	NC_017992	TAT	2	6	24872	24877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933159
546	NC_017992	TTC	2	6	24929	24934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933159
547	NC_017992	TTC	2	6	24938	24943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933159
548	NC_017992	CT	3	6	24996	25001	0 %	50 %	0 %	50 %	390933159
549	NC_017992	T	6	6	25007	25012	0 %	100 %	0 %	0 %	390933159
550	NC_017992	CT	3	6	25013	25018	0 %	50 %	0 %	50 %	390933159
551	NC_017992	TATC	2	8	25120	25127	25 %	50 %	0 %	25 %	390933159
552	NC_017992	CAT	2	6	25160	25165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933159
553	NC_017992	CGT	2	6	25189	25194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933159
554	NC_017992	CCAT	2	8	25209	25216	25 %	25 %	0 %	50 %	390933159
555	NC_017992	AAG	2	6	25217	25222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933159
556	NC_017992	AT	3	6	25321	25326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017992	TAT	2	6	25330	25335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017992	A	7	7	25353	25359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017992	GCA	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017992	TCA	2	6	25380	25385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
561	NC_017992	T	7	7	25395	25401	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
562	NC_017992	ACG	2	6	25501	25506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
563	NC_017992	TGACT	2	10	25518	25527	20 %	40 %	20 %	20 %	390933160
564	NC_017992	ATC	2	6	25581	25586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
565	NC_017992	GCG	2	6	25688	25693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933160
566	NC_017992	GCG	2	6	25699	25704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933160
567	NC_017992	CTG	2	6	25711	25716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933160
568	NC_017992	ATT	2	6	25731	25736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
569	NC_017992	TAT	2	6	25746	25751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
570	NC_017992	CCA	2	6	25756	25761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
571	NC_017992	ATA	2	6	25867	25872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933160
572	NC_017992	T	6	6	25913	25918	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
573	NC_017992	ACA	2	6	25972	25977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933160
574	NC_017992	GGC	2	6	25999	26004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390933160
575	NC_017992	TAT	2	6	26007	26012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
576	NC_017992	A	6	6	26028	26033	100 %	0 %	0 %	0 %	390933160
577	NC_017992	TCT	2	6	26059	26064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933160
578	NC_017992	AGCC	2	8	26090	26097	25 %	0 %	25 %	50 %	390933160
579	NC_017992	GCA	2	6	26107	26112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
580	NC_017992	T	6	6	26296	26301	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
581	NC_017992	ACC	2	6	26367	26372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
582	NC_017992	TCA	2	6	26393	26398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
583	NC_017992	TTA	2	6	26474	26479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933160
584	NC_017992	CCA	2	6	26504	26509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
585	NC_017992	TCA	2	6	26521	26526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
586	NC_017992	GATT	2	8	26528	26535	25 %	50 %	25 %	0 %	390933160
587	NC_017992	CAT	2	6	26546	26551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933160
588	NC_017992	TCG	2	6	26560	26565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933160
589	NC_017992	GCA	2	6	26570	26575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
590	NC_017992	GTC	2	6	26586	26591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933160
591	NC_017992	TC	3	6	26593	26598	0 %	50 %	0 %	50 %	390933160
592	NC_017992	CTT	2	6	26770	26775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933160
593	NC_017992	ATG	2	6	26788	26793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933160
594	NC_017992	AACC	2	8	26856	26863	50 %	0 %	0 %	50 %	390933160
595	NC_017992	TCC	2	6	26901	26906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933160
596	NC_017992	TC	3	6	26991	26996	0 %	50 %	0 %	50 %	390933160
597	NC_017992	GCA	2	6	27055	27060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
598	NC_017992	GCA	2	6	27107	27112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933160
599	NC_017992	ATCT	2	8	27222	27229	25 %	50 %	0 %	25 %	390933160
600	NC_017992	CCA	2	6	27266	27271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933160
601	NC_017992	T	6	6	27287	27292	0 %	100 %	0 %	0 %	390933160
602	NC_017992	CTC	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933161
603	NC_017992	AT	3	6	27362	27367	50 %	50 %	0 %	0 %	390933161
604	NC_017992	TCC	2	6	27441	27446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933161
605	NC_017992	GCT	2	6	27489	27494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933161
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607	NC_017992	ACG	2	6	27643	27648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933161
608	NC_017992	TC	3	6	27688	27693	0 %	50 %	0 %	50 %	390933161
609	NC_017992	TA	3	6	27727	27732	50 %	50 %	0 %	0 %	390933161
610	NC_017992	ACT	2	6	27750	27755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933161
611	NC_017992	TGC	2	6	27764	27769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933161
612	NC_017992	ATATCT	2	12	27888	27899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390933161
613	NC_017992	CTT	2	6	27904	27909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933161
614	NC_017992	T	6	6	27915	27920	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
615	NC_017992	ATG	2	6	27921	27926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933161
616	NC_017992	T	6	6	28079	28084	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
617	NC_017992	CAT	2	6	28219	28224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933161
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619	NC_017992	T	6	6	28375	28380	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
620	NC_017992	ACA	2	6	28395	28400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933161
621	NC_017992	TGTT	2	8	28406	28413	0 %	75 %	25 %	0 %	390933161
622	NC_017992	TC	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	390933161
623	NC_017992	CGA	2	6	28435	28440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933161
624	NC_017992	T	6	6	28460	28465	0 %	100 %	0 %	0 %	390933161
625	NC_017992	CTT	2	6	28486	28491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017992	TA	3	6	28510	28515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017992	T	6	6	28556	28561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017992	CAT	2	6	28612	28617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933162
629	NC_017992	TCA	2	6	28618	28623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933162
630	NC_017992	TGTATG	2	12	28629	28640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390933162
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