MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 chromosome

Total Repeats: 63525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017992	T	6	6	218459	218464	0 %	100 %	0 %	0 %	390933337
5003	NC_017992	TA	3	6	218480	218485	50 %	50 %	0 %	0 %	390933337
5004	NC_017992	T	6	6	218506	218511	0 %	100 %	0 %	0 %	390933337
5005	NC_017992	ATA	2	6	218531	218536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933337
5006	NC_017992	ACT	2	6	218550	218555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933337
5007	NC_017992	TCA	2	6	218592	218597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933337
5008	NC_017992	TGC	2	6	218623	218628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933337
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5010	NC_017992	CTG	2	6	218706	218711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933337
5011	NC_017992	ATT	2	6	218721	218726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933337
5012	NC_017992	TAG	2	6	218737	218742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933337
5013	NC_017992	TA	3	6	218750	218755	50 %	50 %	0 %	0 %	390933337
5014	NC_017992	TCC	2	6	218945	218950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933337
5015	NC_017992	TTC	2	6	218960	218965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933337
5016	NC_017992	CAA	3	9	218968	218976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933337
5017	NC_017992	TCT	2	6	219033	219038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933337
5018	NC_017992	ACT	2	6	219039	219044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933337
5019	NC_017992	ACC	2	6	219066	219071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933337
5020	NC_017992	TCA	2	6	219094	219099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933338
5021	NC_017992	TAT	2	6	219117	219122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933338
5022	NC_017992	CTTC	2	8	219127	219134	0 %	50 %	0 %	50 %	390933338
5023	NC_017992	TC	3	6	219133	219138	0 %	50 %	0 %	50 %	390933338
5024	NC_017992	TA	3	6	219147	219152	50 %	50 %	0 %	0 %	390933338
5025	NC_017992	T	6	6	219219	219224	0 %	100 %	0 %	0 %	390933338
5026	NC_017992	CAC	2	6	219272	219277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933338
5027	NC_017992	TCT	2	6	219316	219321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933338
5028	NC_017992	CCTGT	2	10	219404	219413	0 %	40 %	20 %	40 %	390933338
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5031	NC_017992	TTC	2	6	219492	219497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933338
5032	NC_017992	CTT	2	6	219657	219662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933338
5033	NC_017992	TAT	2	6	219675	219680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933338
5034	NC_017992	TAA	2	6	219702	219707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933338
5035	NC_017992	CAAAT	2	10	219721	219730	60 %	20 %	0 %	20 %	390933338
5036	NC_017992	CTG	2	6	219767	219772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933338
5037	NC_017992	TCT	2	6	219826	219831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933338
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5039	NC_017992	TAAA	2	8	220013	220020	75 %	25 %	0 %	0 %	390933338
5040	NC_017992	ACA	2	6	220031	220036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933338
5041	NC_017992	AAT	2	6	220054	220059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933338
5042	NC_017992	TCC	2	6	220141	220146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933338
5043	NC_017992	TAT	2	6	220173	220178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933338
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5059	NC_017992	CT	3	6	221265	221270	0 %	50 %	0 %	50 %	390933339
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5071	NC_017992	TAA	3	9	221857	221865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017992	TAT	2	6	221870	221875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017992	TA	3	6	221889	221894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017992	TA	4	8	221905	221912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017992	T	6	6	221920	221925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_017992	T	7	7	221973	221979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017992	AT	3	6	221989	221994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017992	GTATT	2	10	221995	222004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_017992	TA	3	6	222331	222336	50 %	50 %	0 %	0 %	390933340
5093	NC_017992	TAT	2	6	222482	222487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933340
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5103	NC_017992	TC	3	6	222870	222875	0 %	50 %	0 %	50 %	390933341
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5106	NC_017992	TTA	2	6	222959	222964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933341
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5109	NC_017992	ATC	2	6	223053	223058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933341
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5112	NC_017992	GGT	2	6	223220	223225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933341
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5124	NC_017992	TCA	2	6	223741	223746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933341
5125	NC_017992	TA	3	6	223748	223753	50 %	50 %	0 %	0 %	390933341
5126	NC_017992	GTA	2	6	223828	223833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390933341
5127	NC_017992	TCA	2	6	223906	223911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933341
5128	NC_017992	TCA	2	6	223916	223921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933341
5129	NC_017992	ATC	2	6	223941	223946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933342
5130	NC_017992	ATA	2	6	223951	223956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933342
5131	NC_017992	CAA	2	6	223970	223975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933342
5132	NC_017992	TC	3	6	224057	224062	0 %	50 %	0 %	50 %	390933342
5133	NC_017992	CAA	2	6	224090	224095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933342
5134	NC_017992	CTA	2	6	224135	224140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933342
5135	NC_017992	CAA	2	6	224195	224200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933342
5136	NC_017992	TAT	2	6	224208	224213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933342
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5138	NC_017992	TAT	2	6	224230	224235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933343
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5142	NC_017992	TCG	2	6	224391	224396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933343
5143	NC_017992	TAT	2	6	224453	224458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933343
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5145	NC_017992	CTC	2	6	224482	224487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933343
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5147	NC_017992	ATTTA	2	10	224639	224648	40 %	60 %	0 %	0 %	390933343
5148	NC_017992	CA	3	6	224663	224668	50 %	0 %	0 %	50 %	390933343
5149	NC_017992	CTG	2	6	224674	224679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933343
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5169	NC_017992	ATT	2	6	225593	225598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933346
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5172	NC_017992	CTG	2	6	225809	225814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390933346
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5175	NC_017992	TCC	2	6	225881	225886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5180	NC_017992	GCA	2	6	225998	226003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933347
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5182	NC_017992	TTG	2	6	226094	226099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933347
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5198	NC_017992	CAA	2	6	226595	226600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390933348
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5201	NC_017992	ACT	2	6	226828	226833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933348
5202	NC_017992	AACC	2	8	226924	226931	50 %	0 %	0 %	50 %	390933348
5203	NC_017992	ATC	2	6	226947	226952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933348
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5205	NC_017992	TGTCT	2	10	226992	227001	0 %	60 %	20 %	20 %	390933348
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5209	NC_017992	CAG	2	6	227081	227086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933348
5210	NC_017992	TCA	3	9	227233	227241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933348
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5213	NC_017992	AGAT	2	8	227309	227316	50 %	25 %	25 %	0 %	390933348
5214	NC_017992	CT	3	6	227332	227337	0 %	50 %	0 %	50 %	390933348
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5220	NC_017992	AGC	2	6	227947	227952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933349
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5222	NC_017992	ACT	2	6	228003	228008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933349
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5225	NC_017992	TCA	2	6	228093	228098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933349
5226	NC_017992	TGG	2	6	228107	228112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390933349
5227	NC_017992	TCCTGC	2	12	228116	228127	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390933349
5228	NC_017992	GA	3	6	228150	228155	50 %	0 %	50 %	0 %	390933349
5229	NC_017992	TAC	2	6	228164	228169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933349
5230	NC_017992	CTA	2	6	228187	228192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933349
5231	NC_017992	ATA	2	6	228219	228224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390933349
5232	NC_017992	GCC	2	6	228275	228280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390933349
5233	NC_017992	TGT	2	6	228497	228502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390933349
5234	NC_017992	TAT	2	6	228551	228556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933349
5235	NC_017992	T	7	7	228610	228616	0 %	100 %	0 %	0 %	390933349
5236	NC_017992	T	6	6	228630	228635	0 %	100 %	0 %	0 %	390933349
5237	NC_017992	TC	3	6	228657	228662	0 %	50 %	0 %	50 %	390933349
5238	NC_017992	T	6	6	228686	228691	0 %	100 %	0 %	0 %	390933349
5239	NC_017992	GCA	2	6	228705	228710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390933349
5240	NC_017992	CAT	2	6	228718	228723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933349
5241	NC_017992	T	7	7	228765	228771	0 %	100 %	0 %	0 %	390933349
5242	NC_017992	AAATT	2	10	228774	228783	60 %	40 %	0 %	0 %	390933349
5243	NC_017992	T	6	6	228794	228799	0 %	100 %	0 %	0 %	390933349
5244	NC_017992	CCT	2	6	228843	228848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390933350
5245	NC_017992	ACC	2	6	228898	228903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390933350
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5247	NC_017992	CACC	2	8	228950	228957	25 %	0 %	0 %	75 %	390933350
5248	NC_017992	TAT	2	6	228975	228980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390933350
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5251	NC_017992	AAG	2	6	229099	229104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390933350
5252	NC_017992	CCAT	2	8	229109	229116	25 %	25 %	0 %	50 %	390933350
5253	NC_017992	CATG	2	8	229140	229147	25 %	25 %	25 %	25 %	390933350
5254	NC_017992	CTT	2	6	229189	229194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933350
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5256	NC_017992	TCT	2	6	229292	229297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390933350
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5263	NC_017992	ATC	2	6	229650	229655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933351
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5291	NC_017992	T	6	6	231043	231048	0 %	100 %	0 %	0 %	390933353
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5367	NC_017992	TCTT	2	8	234297	234304	0 %	75 %	0 %	25 %	390933356
5368	NC_017992	CAT	3	9	234325	234333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390933356
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