MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017278	GGC	2	6	162272	162277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438544
4002	NC_017278	GGA	2	6	162287	162292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438544
4003	NC_017278	CCT	3	9	162420	162428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438545
4004	NC_017278	CCT	2	6	162438	162443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438545
4005	NC_017278	CCAGGG	2	12	162498	162509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438545
4006	NC_017278	AGG	2	6	162518	162523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438545
4007	NC_017278	CTG	2	6	162640	162645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438545
4008	NC_017278	GCC	2	6	162656	162661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438545
4009	NC_017278	CCCCG	2	10	162673	162682	0 %	0 %	20 %	80 %	384438545
4010	NC_017278	AGG	2	6	162683	162688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438545
4011	NC_017278	GTC	2	6	162706	162711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438545
4012	NC_017278	CTGGGC	2	12	162712	162723	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384438545
4013	NC_017278	CGC	2	6	162746	162751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438545
4014	NC_017278	CT	3	6	162809	162814	0 %	50 %	0 %	50 %	384438546
4015	NC_017278	G	6	6	162862	162867	0 %	0 %	100 %	0 %	384438546
4016	NC_017278	GGA	2	6	162883	162888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438546
4017	NC_017278	G	6	6	162916	162921	0 %	0 %	100 %	0 %	384438546
4018	NC_017278	CCA	3	9	162928	162936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438546
4019	NC_017278	AGGTCC	2	12	162939	162950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384438546
4020	NC_017278	TCCAGG	2	12	163002	163013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384438546
4021	NC_017278	GGGCCT	2	12	163132	163143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384438547
4022	NC_017278	CCG	2	6	163190	163195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438547
4023	NC_017278	TCC	2	6	163212	163217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438547
4024	NC_017278	CGG	2	6	163218	163223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438547
4025	NC_017278	AGG	4	12	163236	163247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438547
4026	NC_017278	GCCC	2	8	163269	163276	0 %	0 %	25 %	75 %	384438547
4027	NC_017278	GGC	2	6	163301	163306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438547
4028	NC_017278	CCT	2	6	163318	163323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438547
4029	NC_017278	AGG	2	6	163359	163364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438547
4030	NC_017278	AGA	2	6	163387	163392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438547
4031	NC_017278	TCC	2	6	163414	163419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438547
4032	NC_017278	AAG	2	6	163428	163433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438547
4033	NC_017278	AGG	2	6	163539	163544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438547
4034	NC_017278	CTG	2	6	163658	163663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438547
4035	NC_017278	GGC	2	6	163664	163669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438547
4036	NC_017278	CCCGC	2	10	163726	163735	0 %	0 %	20 %	80 %	384438547
4037	NC_017278	GGA	3	9	163738	163746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438547
4038	NC_017278	GCTCC	2	10	163754	163763	0 %	20 %	20 %	60 %	384438547
4039	NC_017278	ACC	2	6	163777	163782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438548
4040	NC_017278	AGG	2	6	163786	163791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4041	NC_017278	AGCCCG	2	12	163804	163815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438548
4042	NC_017278	GCCA	2	8	163831	163838	25 %	0 %	25 %	50 %	384438548
4043	NC_017278	C	6	6	163841	163846	0 %	0 %	0 %	100 %	384438548
4044	NC_017278	CCT	2	6	163982	163987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438548
4045	NC_017278	GGA	2	6	163988	163993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4046	NC_017278	G	6	6	164011	164016	0 %	0 %	100 %	0 %	384438548
4047	NC_017278	AGG	2	6	164020	164025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4048	NC_017278	CGGG	2	8	164038	164045	0 %	0 %	75 %	25 %	384438548
4049	NC_017278	GAG	2	6	164046	164051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4050	NC_017278	GTC	2	6	164061	164066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438548
4051	NC_017278	GCG	2	6	164074	164079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438548
4052	NC_017278	C	6	6	164084	164089	0 %	0 %	0 %	100 %	384438548
4053	NC_017278	CGG	2	6	164123	164128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438548
4054	NC_017278	GTA	2	6	164175	164180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438548
4055	NC_017278	GAG	2	6	164181	164186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4056	NC_017278	G	6	6	164186	164191	0 %	0 %	100 %	0 %	384438548
4057	NC_017278	GAG	2	6	164193	164198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4058	NC_017278	CCT	3	9	164246	164254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438548
4059	NC_017278	GCCC	2	8	164261	164268	0 %	0 %	25 %	75 %	384438548
4060	NC_017278	GGC	2	6	164273	164278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438548
4061	NC_017278	GAG	3	9	164352	164360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4062	NC_017278	GAG	3	9	164385	164393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4063	NC_017278	GAG	3	9	164397	164405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4064	NC_017278	GCCCAG	2	12	164409	164420	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438548
4065	NC_017278	AGG	3	9	164428	164436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4066	NC_017278	AGG	3	9	164440	164448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4067	NC_017278	AGG	2	6	164464	164469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4068	NC_017278	CCAGGC	2	12	164520	164531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438548
4069	NC_017278	CCGGG	2	10	164565	164574	0 %	0 %	60 %	40 %	384438548
4070	NC_017278	AGG	2	6	164599	164604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4071	NC_017278	AGG	2	6	164611	164616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438548
4072	NC_017278	GGA	2	6	164629	164634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438549
4073	NC_017278	TCC	2	6	164697	164702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438549
4074	NC_017278	GGC	2	6	164717	164722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438549
4075	NC_017278	CCG	2	6	164733	164738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438549
4076	NC_017278	C	6	6	164769	164774	0 %	0 %	0 %	100 %	384438549
4077	NC_017278	G	7	7	164822	164828	0 %	0 %	100 %	0 %	384438549
4078	NC_017278	CCT	2	6	164854	164859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438549
4079	NC_017278	AGGG	2	8	164922	164929	25 %	0 %	75 %	0 %	384438549
4080	NC_017278	GGTGGG	2	12	164930	164941	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384438549
4081	NC_017278	AGG	2	6	164955	164960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438549
4082	NC_017278	G	7	7	165004	165010	0 %	0 %	100 %	0 %	384438549
4083	NC_017278	AAG	2	6	165011	165016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438549
4084	NC_017278	CCTGG	2	10	165029	165038	0 %	20 %	40 %	40 %	384438549
4085	NC_017278	G	6	6	165049	165054	0 %	0 %	100 %	0 %	384438549
4086	NC_017278	GGTC	2	8	165064	165071	0 %	25 %	50 %	25 %	384438549
4087	NC_017278	CCTCC	2	10	165083	165092	0 %	20 %	0 %	80 %	384438549
4088	NC_017278	CCAG	2	8	165121	165128	25 %	0 %	25 %	50 %	384438549
4089	NC_017278	G	6	6	165157	165162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017278	GCC	2	6	165229	165234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438550
4091	NC_017278	GGA	2	6	165253	165258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4092	NC_017278	GCC	2	6	165275	165280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438550
4093	NC_017278	G	8	8	165313	165320	0 %	0 %	100 %	0 %	384438550
4094	NC_017278	TGG	3	9	165321	165329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438550
4095	NC_017278	GGA	2	6	165352	165357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4096	NC_017278	AGG	2	6	165378	165383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4097	NC_017278	TCC	2	6	165408	165413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4098	NC_017278	GGGGC	2	10	165414	165423	0 %	0 %	80 %	20 %	384438550
4099	NC_017278	ACC	2	6	165501	165506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438550
4100	NC_017278	CTC	2	6	165512	165517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4101	NC_017278	GGGA	2	8	165531	165538	25 %	0 %	75 %	0 %	384438550
4102	NC_017278	GGC	2	6	165559	165564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438550
4103	NC_017278	GGA	2	6	165574	165579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4104	NC_017278	CGGG	2	8	165601	165608	0 %	0 %	75 %	25 %	384438550
4105	NC_017278	GGC	2	6	165610	165615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438550
4106	NC_017278	CCT	2	6	165643	165648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4107	NC_017278	ACC	3	9	165677	165685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438550
4108	NC_017278	GCC	3	9	165686	165694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438550
4109	NC_017278	CCT	2	6	165706	165711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4110	NC_017278	C	6	6	165718	165723	0 %	0 %	0 %	100 %	384438550
4111	NC_017278	GGT	2	6	165730	165735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438550
4112	NC_017278	GGA	2	6	165757	165762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4113	NC_017278	GGC	2	6	165804	165809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438550
4114	NC_017278	GCC	2	6	165839	165844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438550
4115	NC_017278	G	7	7	165850	165856	0 %	0 %	100 %	0 %	384438550
4116	NC_017278	CTC	2	6	165863	165868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4117	NC_017278	GGC	2	6	165960	165965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438550
4118	NC_017278	ACC	2	6	165984	165989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438550
4119	NC_017278	CCTGGA	2	12	166060	166071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384438550
4120	NC_017278	GGGGA	2	10	166082	166091	20 %	0 %	80 %	0 %	384438550
4121	NC_017278	CCT	2	6	166114	166119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438550
4122	NC_017278	GAG	2	6	166157	166162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438550
4123	NC_017278	CTC	2	6	166194	166199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438551
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4248	NC_017278	TCT	2	6	171650	171655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4494	NC_017278	CCA	2	6	183409	183414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438567
4495	NC_017278	GCC	2	6	183476	183481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438567
4496	NC_017278	GGT	2	6	183493	183498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438567
4497	NC_017278	GCCT	2	8	183538	183545	0 %	25 %	25 %	50 %	384438567
4498	NC_017278	GAG	3	9	183551	183559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438567
4499	NC_017278	GGCGG	2	10	183583	183592	0 %	0 %	80 %	20 %	384438567
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