MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017278	GGC	2	6	183753	183758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438568
4502	NC_017278	GGT	2	6	183824	183829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438568
4503	NC_017278	ACC	2	6	183894	183899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438568
4504	NC_017278	TGGG	2	8	183994	184001	0 %	25 %	75 %	0 %	384438569
4505	NC_017278	GAGG	2	8	184008	184015	25 %	0 %	75 %	0 %	384438569
4506	NC_017278	CCT	2	6	184018	184023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438569
4507	NC_017278	GCC	2	6	184038	184043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438569
4508	NC_017278	AGGG	2	8	184063	184070	25 %	0 %	75 %	0 %	384438569
4509	NC_017278	C	6	6	184126	184131	0 %	0 %	0 %	100 %	384438569
4510	NC_017278	GGCTT	2	10	184330	184339	0 %	40 %	40 %	20 %	384438569
4511	NC_017278	TTC	2	6	184345	184350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438569
4512	NC_017278	CGG	2	6	184382	184387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4513	NC_017278	CCCGG	2	10	184412	184421	0 %	0 %	40 %	60 %	384438569
4514	NC_017278	G	6	6	184432	184437	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4515	NC_017278	GGC	2	6	184456	184461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4516	NC_017278	AGG	2	6	184558	184563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4517	NC_017278	AGG	2	6	184570	184575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4518	NC_017278	TGG	2	6	184600	184605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438569
4519	NC_017278	G	7	7	184657	184663	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4520	NC_017278	AGG	2	6	184672	184677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4521	NC_017278	GAC	2	6	184683	184688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438569
4522	NC_017278	C	7	7	184787	184793	0 %	0 %	0 %	100 %	384438569
4523	NC_017278	CGGGG	2	10	184822	184831	0 %	0 %	80 %	20 %	384438569
4524	NC_017278	G	6	6	184840	184845	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4525	NC_017278	G	7	7	184973	184979	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4526	NC_017278	CCT	2	6	185024	185029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438569
4527	NC_017278	G	6	6	185081	185086	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4528	NC_017278	C	6	6	185140	185145	0 %	0 %	0 %	100 %	384438569
4529	NC_017278	TGG	2	6	185164	185169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438569
4530	NC_017278	CCG	2	6	185207	185212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438569
4531	NC_017278	TAC	2	6	185217	185222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438569
4532	NC_017278	CGG	2	6	185293	185298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4533	NC_017278	GGC	2	6	185300	185305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4534	NC_017278	GGA	2	6	185358	185363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4535	NC_017278	ACCC	2	8	185377	185384	25 %	0 %	0 %	75 %	384438569
4536	NC_017278	G	6	6	185482	185487	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4537	NC_017278	GGC	2	6	185510	185515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4538	NC_017278	AGG	2	6	185542	185547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4539	NC_017278	CGGC	2	8	185564	185571	0 %	0 %	50 %	50 %	384438569
4540	NC_017278	CGC	2	6	185597	185602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438569
4541	NC_017278	GGCCAA	2	12	185672	185683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438569
4542	NC_017278	TGG	2	6	185686	185691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438569
4543	NC_017278	CTC	2	6	185732	185737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438569
4544	NC_017278	C	6	6	185743	185748	0 %	0 %	0 %	100 %	384438569
4545	NC_017278	AGG	2	6	185758	185763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4546	NC_017278	CTA	3	9	185840	185848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438569
4547	NC_017278	GGGAG	2	10	185915	185924	20 %	0 %	80 %	0 %	384438569
4548	NC_017278	GGA	2	6	185957	185962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4549	NC_017278	CGCTAC	2	12	185994	186005	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438569
4550	NC_017278	AAC	2	6	186006	186011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438569
4551	NC_017278	CCT	2	6	186017	186022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438569
4552	NC_017278	ACC	2	6	186025	186030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438569
4553	NC_017278	ATG	2	6	186036	186041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438569
4554	NC_017278	AGCC	2	8	186054	186061	25 %	0 %	25 %	50 %	384438569
4555	NC_017278	CTG	2	6	186078	186083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438569
4556	NC_017278	GCG	2	6	186139	186144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438569
4557	NC_017278	G	6	6	186204	186209	0 %	0 %	100 %	0 %	384438569
4558	NC_017278	GCCC	2	8	186301	186308	0 %	0 %	25 %	75 %	384438569
4559	NC_017278	GAG	2	6	186315	186320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438569
4560	NC_017278	GAG	2	6	186705	186710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438570
4561	NC_017278	GCC	2	6	186722	186727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438570
4562	NC_017278	GAT	2	6	186872	186877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438570
4563	NC_017278	GGTA	2	8	186886	186893	25 %	25 %	50 %	0 %	384438570
4564	NC_017278	TGGCCC	2	12	186936	186947	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438571
4565	NC_017278	CCT	2	6	187042	187047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438571
4566	NC_017278	CCT	2	6	187057	187062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438571
4567	NC_017278	CCA	2	6	187173	187178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438571
4568	NC_017278	G	6	6	187202	187207	0 %	0 %	100 %	0 %	384438571
4569	NC_017278	C	8	8	187222	187229	0 %	0 %	0 %	100 %	384438571
4570	NC_017278	GAA	2	6	187231	187236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438571
4571	NC_017278	GTG	2	6	187247	187252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438571
4572	NC_017278	AGG	2	6	187263	187268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438571
4573	NC_017278	ACGC	2	8	187304	187311	25 %	0 %	25 %	50 %	384438571
4574	NC_017278	TGAAG	2	10	187374	187383	40 %	20 %	40 %	0 %	384438571
4575	NC_017278	GAG	2	6	187391	187396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017278	GGC	2	6	187451	187456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4577	NC_017278	ACCA	2	8	187482	187489	50 %	0 %	0 %	50 %	384438572
4578	NC_017278	GCCACC	2	12	187491	187502	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384438572
4579	NC_017278	CGGC	2	8	187513	187520	0 %	0 %	50 %	50 %	384438572
4580	NC_017278	ACC	2	6	187530	187535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4581	NC_017278	CAC	2	6	187550	187555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4582	NC_017278	CAG	2	6	187563	187568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4583	NC_017278	AAC	2	6	187599	187604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438572
4584	NC_017278	AAC	2	6	187674	187679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438572
4585	NC_017278	GCAACG	2	12	187774	187785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4586	NC_017278	CGG	2	6	187825	187830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4587	NC_017278	GCCT	2	8	187839	187846	0 %	25 %	25 %	50 %	384438572
4588	NC_017278	GGT	2	6	187847	187852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438572
4589	NC_017278	TGG	2	6	187906	187911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438572
4590	NC_017278	AAC	3	9	187944	187952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438572
4591	NC_017278	CGG	2	6	188069	188074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4592	NC_017278	ACA	2	6	188215	188220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438572
4593	NC_017278	CTT	2	6	188315	188320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438572
4594	NC_017278	GGGGAT	2	12	188427	188438	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384438572
4595	NC_017278	CGA	2	6	188441	188446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4596	NC_017278	ACC	2	6	188463	188468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4597	NC_017278	ACC	3	9	188472	188480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4598	NC_017278	GCT	2	6	188493	188498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4599	NC_017278	ACCT	2	8	188550	188557	25 %	25 %	0 %	50 %	384438572
4600	NC_017278	CAG	2	6	188592	188597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4601	NC_017278	TGG	2	6	188722	188727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438572
4602	NC_017278	GGC	2	6	188771	188776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4603	NC_017278	CGG	2	6	188815	188820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4604	NC_017278	GCC	2	6	188943	188948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438572
4605	NC_017278	GCC	2	6	189078	189083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438572
4606	NC_017278	TCT	2	6	189109	189114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438572
4607	NC_017278	GTG	2	6	189198	189203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438572
4608	NC_017278	CAC	2	6	189269	189274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4609	NC_017278	TGG	2	6	189322	189327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438572
4610	NC_017278	ACACCC	2	12	189388	189399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4611	NC_017278	ACGG	2	8	189480	189487	25 %	0 %	50 %	25 %	384438572
4612	NC_017278	GGC	2	6	189534	189539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438572
4613	NC_017278	CCA	2	6	189544	189549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4614	NC_017278	CGGA	2	8	189591	189598	25 %	0 %	50 %	25 %	384438572
4615	NC_017278	ACC	3	9	189681	189689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4616	NC_017278	CCG	2	6	189772	189777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438572
4617	NC_017278	CAC	2	6	189831	189836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4618	NC_017278	ACC	2	6	189837	189842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438572
4619	NC_017278	GCCACG	2	12	189858	189869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438572
4620	NC_017278	CTG	2	6	189877	189882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438572
4621	NC_017278	ACGG	2	8	189903	189910	25 %	0 %	50 %	25 %	384438572
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4623	NC_017278	GTC	2	6	189920	189925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438572
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4995	NC_017278	GTC	2	6	205471	205476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438581
4996	NC_017278	AGG	2	6	205478	205483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438581
4997	NC_017278	CGC	2	6	205535	205540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438581
4998	NC_017278	G	6	6	205558	205563	0 %	0 %	100 %	0 %	384438581
4999	NC_017278	CGGCG	2	10	205581	205590	0 %	0 %	60 %	40 %	384438581
5000	NC_017278	GTA	2	6	205606	205611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438581

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