MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017268	ATAAG	2	10	172141	172150	60 %	20 %	20 %	0 %	384421696
3503	NC_017268	T	7	7	172165	172171	0 %	100 %	0 %	0 %	384421696
3504	NC_017268	A	7	7	172182	172188	100 %	0 %	0 %	0 %	384421696
3505	NC_017268	GTT	2	6	172217	172222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421696
3506	NC_017268	A	7	7	172241	172247	100 %	0 %	0 %	0 %	384421696
3507	NC_017268	GCA	2	6	172312	172317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421696
3508	NC_017268	T	6	6	172347	172352	0 %	100 %	0 %	0 %	384421696
3509	NC_017268	CGC	2	6	172373	172378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421697
3510	NC_017268	CG	3	6	172508	172513	0 %	0 %	50 %	50 %	384421697
3511	NC_017268	TGG	2	6	172519	172524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421697
3512	NC_017268	ACGCA	2	10	172730	172739	40 %	0 %	20 %	40 %	384421697
3513	NC_017268	GA	3	6	172837	172842	50 %	0 %	50 %	0 %	384421697
3514	NC_017268	GAT	2	6	173056	173061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421698
3515	NC_017268	ATG	2	6	173141	173146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421698
3516	NC_017268	CAT	2	6	173251	173256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421698
3517	NC_017268	CATA	2	8	173292	173299	50 %	25 %	0 %	25 %	384421698
3518	NC_017268	TGG	2	6	173301	173306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421698
3519	NC_017268	AGAC	2	8	173318	173325	50 %	0 %	25 %	25 %	384421698
3520	NC_017268	A	6	6	173356	173361	100 %	0 %	0 %	0 %	384421698
3521	NC_017268	GA	3	6	173366	173371	50 %	0 %	50 %	0 %	384421698
3522	NC_017268	CAG	2	6	173380	173385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421698
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3524	NC_017268	AGT	2	6	173420	173425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421698
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3526	NC_017268	TACT	2	8	173507	173514	25 %	50 %	0 %	25 %	384421698
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3529	NC_017268	A	7	7	173661	173667	100 %	0 %	0 %	0 %	384421699
3530	NC_017268	T	6	6	173736	173741	0 %	100 %	0 %	0 %	384421699
3531	NC_017268	CGTGA	2	10	173796	173805	20 %	20 %	40 %	20 %	384421699
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3534	NC_017268	TGA	2	6	173851	173856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421699
3535	NC_017268	CTTTT	2	10	173861	173870	0 %	80 %	0 %	20 %	384421699
3536	NC_017268	A	6	6	173871	173876	100 %	0 %	0 %	0 %	384421699
3537	NC_017268	GC	3	6	173885	173890	0 %	0 %	50 %	50 %	384421699
3538	NC_017268	TAG	2	6	173995	174000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421700
3539	NC_017268	AGT	2	6	174046	174051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421700
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3541	NC_017268	A	6	6	174120	174125	100 %	0 %	0 %	0 %	384421700
3542	NC_017268	GC	3	6	174221	174226	0 %	0 %	50 %	50 %	384421700
3543	NC_017268	GTGTGC	2	12	174258	174269	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384421700
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3546	NC_017268	GCA	2	6	174355	174360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421700
3547	NC_017268	AC	3	6	174410	174415	50 %	0 %	0 %	50 %	384421700
3548	NC_017268	AGGG	2	8	174435	174442	25 %	0 %	75 %	0 %	384421700
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3551	NC_017268	ACA	2	6	174547	174552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421700
3552	NC_017268	GGGA	2	8	174571	174578	25 %	0 %	75 %	0 %	384421700
3553	NC_017268	GGA	3	9	174599	174607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421700
3554	NC_017268	CG	3	6	174662	174667	0 %	0 %	50 %	50 %	384421700
3555	NC_017268	A	6	6	174669	174674	100 %	0 %	0 %	0 %	384421700
3556	NC_017268	A	6	6	174706	174711	100 %	0 %	0 %	0 %	384421700
3557	NC_017268	TG	3	6	174716	174721	0 %	50 %	50 %	0 %	384421700
3558	NC_017268	GA	3	6	174756	174761	50 %	0 %	50 %	0 %	384421700
3559	NC_017268	GCG	2	6	174805	174810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421700
3560	NC_017268	A	6	6	174842	174847	100 %	0 %	0 %	0 %	384421700
3561	NC_017268	ACG	2	6	174874	174879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421700
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3563	NC_017268	TGT	2	6	174914	174919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421700
3564	NC_017268	AAGG	2	8	174945	174952	50 %	0 %	50 %	0 %	384421700
3565	NC_017268	TG	3	6	175016	175021	0 %	50 %	50 %	0 %	384421701
3566	NC_017268	GGC	2	6	175120	175125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421701
3567	NC_017268	TGG	2	6	175142	175147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421701
3568	NC_017268	CTT	2	6	175170	175175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421701
3569	NC_017268	GC	4	8	175240	175247	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
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3571	NC_017268	AGG	2	6	175266	175271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421701
3572	NC_017268	TGA	3	9	175380	175388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421701
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3574	NC_017268	GC	3	6	175431	175436	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3575	NC_017268	G	6	6	175440	175445	0 %	0 %	100 %	0 %	384421701
3576	NC_017268	CG	4	8	175454	175461	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3577	NC_017268	CTGA	2	8	175522	175529	25 %	25 %	25 %	25 %	384421701
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3584	NC_017268	CGT	3	9	175815	175823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421701
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3587	NC_017268	CTTCT	2	10	175943	175952	0 %	60 %	0 %	40 %	384421701
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3589	NC_017268	ACT	2	6	176045	176050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421701
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3591	NC_017268	GTGCT	2	10	176087	176096	0 %	40 %	40 %	20 %	384421701
3592	NC_017268	TTGG	2	8	176109	176116	0 %	50 %	50 %	0 %	384421701
3593	NC_017268	GC	3	6	176162	176167	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3594	NC_017268	GAC	2	6	176209	176214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421701
3595	NC_017268	AGC	2	6	176239	176244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421701
3596	NC_017268	GCGCG	2	10	176253	176262	0 %	0 %	60 %	40 %	384421701
3597	NC_017268	CGG	2	6	176313	176318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421701
3598	NC_017268	GAACG	2	10	176341	176350	40 %	0 %	40 %	20 %	384421701
3599	NC_017268	GC	5	10	176352	176361	0 %	0 %	50 %	50 %	384421701
3600	NC_017268	A	6	6	176366	176371	100 %	0 %	0 %	0 %	384421701
3601	NC_017268	C	6	6	176377	176382	0 %	0 %	0 %	100 %	384421701
3602	NC_017268	TGG	2	6	176402	176407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421701
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3604	NC_017268	GA	3	6	176512	176517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017268	TG	3	6	176543	176548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017268	CCG	2	6	176556	176561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_017268	TGCA	2	8	176565	176572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_017268	TC	3	6	176676	176681	0 %	50 %	0 %	50 %	384421702
3609	NC_017268	GAAA	2	8	176692	176699	75 %	0 %	25 %	0 %	384421702
3610	NC_017268	ATG	2	6	176795	176800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421702
3611	NC_017268	AG	3	6	176857	176862	50 %	0 %	50 %	0 %	384421702
3612	NC_017268	GCC	2	6	176902	176907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421702
3613	NC_017268	A	6	6	176929	176934	100 %	0 %	0 %	0 %	384421702
3614	NC_017268	ACCG	2	8	176942	176949	25 %	0 %	25 %	50 %	384421702
3615	NC_017268	AG	3	6	177016	177021	50 %	0 %	50 %	0 %	384421702
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3617	NC_017268	CT	3	6	177098	177103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_017268	TG	3	6	177125	177130	0 %	50 %	50 %	0 %	384421703
3619	NC_017268	GGC	2	6	177142	177147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421703
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3621	NC_017268	GAG	2	6	177202	177207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421703
3622	NC_017268	TCG	2	6	177254	177259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
3623	NC_017268	GTC	2	6	177309	177314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421703
3624	NC_017268	CCT	2	6	177315	177320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421703
3625	NC_017268	TGG	2	6	177341	177346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421703
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3627	NC_017268	CCTG	2	8	177423	177430	0 %	25 %	25 %	50 %	384421703
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3740	NC_017268	GGTGA	2	10	182252	182261	20 %	20 %	60 %	0 %	384421708
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3749	NC_017268	A	7	7	182705	182711	100 %	0 %	0 %	0 %	384421710
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3752	NC_017268	ATC	2	6	182837	182842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421710
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3869	NC_017268	TG	3	6	188627	188632	0 %	50 %	50 %	0 %	384421716
3870	NC_017268	TGA	2	6	188663	188668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421716
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