MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017268	T	7	7	124328	124334	0 %	100 %	0 %	0 %	384421661
2503	NC_017268	GCG	2	6	124351	124356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421661
2504	NC_017268	CGCAG	2	10	124401	124410	20 %	0 %	40 %	40 %	384421661
2505	NC_017268	AGCAC	2	10	124437	124446	40 %	0 %	20 %	40 %	384421661
2506	NC_017268	TG	3	6	124451	124456	0 %	50 %	50 %	0 %	384421661
2507	NC_017268	GC	3	6	124505	124510	0 %	0 %	50 %	50 %	384421661
2508	NC_017268	ATA	2	6	124523	124528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421661
2509	NC_017268	CACG	2	8	124540	124547	25 %	0 %	25 %	50 %	384421661
2510	NC_017268	TTG	2	6	124553	124558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421661
2511	NC_017268	T	6	6	124569	124574	0 %	100 %	0 %	0 %	384421661
2512	NC_017268	GCA	2	6	124599	124604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421661
2513	NC_017268	GC	4	8	124609	124616	0 %	0 %	50 %	50 %	384421661
2514	NC_017268	TCC	2	6	124670	124675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_017268	GC	3	6	124691	124696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_017268	ACTG	2	8	124711	124718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_017268	TG	3	6	124757	124762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_017268	GCT	2	6	124792	124797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_017268	TGAG	2	8	124854	124861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_017268	CCTC	2	8	124908	124915	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2521	NC_017268	TG	4	8	124953	124960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_017268	TCC	2	6	124971	124976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_017268	AGA	2	6	125036	125041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_017268	GAG	2	6	125089	125094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_017268	TCTCAA	2	12	125134	125145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_017268	GT	3	6	125179	125184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_017268	GAAC	2	8	125218	125225	50 %	0 %	25 %	25 %	384421662
2528	NC_017268	TGG	2	6	125247	125252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421662
2529	NC_017268	GC	3	6	125356	125361	0 %	0 %	50 %	50 %	384421662
2530	NC_017268	AG	3	6	125381	125386	50 %	0 %	50 %	0 %	384421662
2531	NC_017268	GGCG	2	8	125395	125402	0 %	0 %	75 %	25 %	384421662
2532	NC_017268	T	8	8	125408	125415	0 %	100 %	0 %	0 %	384421662
2533	NC_017268	T	6	6	125441	125446	0 %	100 %	0 %	0 %	384421662
2534	NC_017268	TCG	2	6	125453	125458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421662
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2537	NC_017268	T	6	6	125603	125608	0 %	100 %	0 %	0 %	384421662
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2540	NC_017268	TGC	2	6	125719	125724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421662
2541	NC_017268	TGCG	2	8	125751	125758	0 %	25 %	50 %	25 %	384421662
2542	NC_017268	CCT	2	6	125761	125766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421662
2543	NC_017268	GGC	2	6	125827	125832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421662
2544	NC_017268	GC	4	8	125831	125838	0 %	0 %	50 %	50 %	384421662
2545	NC_017268	T	6	6	125856	125861	0 %	100 %	0 %	0 %	384421662
2546	NC_017268	CTG	2	6	125885	125890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421662
2547	NC_017268	GT	3	6	125921	125926	0 %	50 %	50 %	0 %	384421662
2548	NC_017268	GT	3	6	125965	125970	0 %	50 %	50 %	0 %	384421662
2549	NC_017268	AGCA	2	8	125981	125988	50 %	0 %	25 %	25 %	384421662
2550	NC_017268	GCT	2	6	126074	126079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421662
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2555	NC_017268	TCT	2	6	126319	126324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421662
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2557	NC_017268	A	6	6	126418	126423	100 %	0 %	0 %	0 %	384421662
2558	NC_017268	GC	3	6	126443	126448	0 %	0 %	50 %	50 %	384421662
2559	NC_017268	CCG	2	6	126458	126463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421662
2560	NC_017268	TCG	2	6	126496	126501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421662
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2562	NC_017268	CTTG	2	8	126703	126710	0 %	50 %	25 %	25 %	384421662
2563	NC_017268	CATTG	2	10	126731	126740	20 %	40 %	20 %	20 %	384421662
2564	NC_017268	TAG	2	6	126891	126896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421662
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2569	NC_017268	CCGTG	2	10	127092	127101	0 %	20 %	40 %	40 %	384421663
2570	NC_017268	TCG	2	6	127140	127145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421663
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2597	NC_017268	GT	3	6	128679	128684	0 %	50 %	50 %	0 %	384421664
2598	NC_017268	TCA	2	6	128795	128800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421664
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2605	NC_017268	GAA	2	6	129142	129147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421664
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2610	NC_017268	TCA	2	6	129409	129414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421664
2611	NC_017268	AAAAG	2	10	129467	129476	80 %	0 %	20 %	0 %	384421664
2612	NC_017268	CG	3	6	129532	129537	0 %	0 %	50 %	50 %	384421664
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2617	NC_017268	TG	4	8	129622	129629	0 %	50 %	50 %	0 %	384421664
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2620	NC_017268	GCG	2	6	129715	129720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421664
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2624	NC_017268	TGAG	2	8	129787	129794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_017268	TG	3	6	129822	129827	0 %	50 %	50 %	0 %	384421665
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2749	NC_017268	C	10	10	136741	136750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2752	NC_017268	GACA	2	8	136815	136822	50 %	0 %	25 %	25 %	384421671
2753	NC_017268	AG	3	6	136833	136838	50 %	0 %	50 %	0 %	384421671
2754	NC_017268	CCT	2	6	136886	136891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421671
2755	NC_017268	CTG	2	6	136941	136946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421671
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2864	NC_017268	GA	3	6	142302	142307	50 %	0 %	50 %	0 %	384421675
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2871	NC_017268	T	7	7	142732	142738	0 %	100 %	0 %	0 %	384421675
2872	NC_017268	AGCCA	2	10	142747	142756	40 %	0 %	20 %	40 %	384421675
2873	NC_017268	CCA	2	6	142761	142766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421675
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