MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017268	AGGA	2	8	100524	100531	50 %	0 %	50 %	0 %	384421643
2002	NC_017268	GCG	2	6	100538	100543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421643
2003	NC_017268	CG	5	10	100542	100551	0 %	0 %	50 %	50 %	384421643
2004	NC_017268	GTA	2	6	100608	100613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421643
2005	NC_017268	GC	3	6	100855	100860	0 %	0 %	50 %	50 %	384421643
2006	NC_017268	GGT	2	6	100885	100890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421643
2007	NC_017268	GTC	2	6	100891	100896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421643
2008	NC_017268	TTC	2	6	100939	100944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421643
2009	NC_017268	CAGC	2	8	100964	100971	25 %	0 %	25 %	50 %	384421643
2010	NC_017268	CTT	2	6	100981	100986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421643
2011	NC_017268	TTG	2	6	100988	100993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421643
2012	NC_017268	CGCA	2	8	101006	101013	25 %	0 %	25 %	50 %	384421643
2013	NC_017268	GCC	2	6	101051	101056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421643
2014	NC_017268	GCG	2	6	101071	101076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421643
2015	NC_017268	GCT	2	6	101096	101101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421643
2016	NC_017268	GT	3	6	101156	101161	0 %	50 %	50 %	0 %	384421643
2017	NC_017268	CG	3	6	101166	101171	0 %	0 %	50 %	50 %	384421643
2018	NC_017268	GCT	2	6	101185	101190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421643
2019	NC_017268	TGC	2	6	101206	101211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421643
2020	NC_017268	GGA	2	6	101215	101220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421643
2021	NC_017268	GCC	2	6	101281	101286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421643
2022	NC_017268	TG	3	6	101292	101297	0 %	50 %	50 %	0 %	384421643
2023	NC_017268	ATA	2	6	101339	101344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421643
2024	NC_017268	CTG	2	6	101379	101384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421643
2025	NC_017268	GAG	2	6	101417	101422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421643
2026	NC_017268	GTGC	2	8	101438	101445	0 %	25 %	50 %	25 %	384421643
2027	NC_017268	TTG	2	6	101583	101588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421644
2028	NC_017268	GAT	2	6	101616	101621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421644
2029	NC_017268	AGC	2	6	101644	101649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421644
2030	NC_017268	GTG	2	6	101682	101687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421644
2031	NC_017268	GAG	2	6	101691	101696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421644
2032	NC_017268	ATG	2	6	101719	101724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421644
2033	NC_017268	GTG	2	6	101796	101801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421644
2034	NC_017268	CGT	2	6	101829	101834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421644
2035	NC_017268	CG	3	6	101866	101871	0 %	0 %	50 %	50 %	384421644
2036	NC_017268	TG	3	6	101876	101881	0 %	50 %	50 %	0 %	384421644
2037	NC_017268	GC	3	6	101936	101941	0 %	0 %	50 %	50 %	384421644
2038	NC_017268	GC	3	6	102072	102077	0 %	0 %	50 %	50 %	384421644
2039	NC_017268	GA	3	6	102100	102105	50 %	0 %	50 %	0 %	384421644
2040	NC_017268	TGC	2	6	102129	102134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421645
2041	NC_017268	GC	3	6	102188	102193	0 %	0 %	50 %	50 %	384421645
2042	NC_017268	CA	3	6	102207	102212	50 %	0 %	0 %	50 %	384421645
2043	NC_017268	GT	3	6	102222	102227	0 %	50 %	50 %	0 %	384421645
2044	NC_017268	TTC	2	6	102276	102281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421645
2045	NC_017268	GCGT	2	8	102314	102321	0 %	25 %	50 %	25 %	384421645
2046	NC_017268	GTG	2	6	102351	102356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421645
2047	NC_017268	TCCTC	2	10	102367	102376	0 %	40 %	0 %	60 %	384421645
2048	NC_017268	CTG	2	6	102380	102385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421645
2049	NC_017268	TGC	2	6	102399	102404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421645
2050	NC_017268	TTG	2	6	102461	102466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421645
2051	NC_017268	CG	4	8	102546	102553	0 %	0 %	50 %	50 %	384421645
2052	NC_017268	TGC	2	6	102596	102601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421645
2053	NC_017268	GTA	2	6	102770	102775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421646
2054	NC_017268	AAT	2	6	102778	102783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421646
2055	NC_017268	CG	3	6	102789	102794	0 %	0 %	50 %	50 %	384421646
2056	NC_017268	TTGA	2	8	102853	102860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_017268	GCG	2	6	102917	102922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421647
2058	NC_017268	AGC	2	6	102967	102972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421647
2059	NC_017268	GCC	2	6	102984	102989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421647
2060	NC_017268	GTC	2	6	103095	103100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421647
2061	NC_017268	AGCA	2	8	103116	103123	50 %	0 %	25 %	25 %	384421647
2062	NC_017268	GCT	2	6	103221	103226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421647
2063	NC_017268	ATG	2	6	103227	103232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421647
2064	NC_017268	CG	4	8	103283	103290	0 %	0 %	50 %	50 %	384421647
2065	NC_017268	TTC	2	6	103291	103296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421647
2066	NC_017268	CAT	2	6	103310	103315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421647
2067	NC_017268	TAA	2	6	103367	103372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421647
2068	NC_017268	GGA	2	6	103383	103388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421647
2069	NC_017268	TATT	2	8	103399	103406	25 %	75 %	0 %	0 %	384421647
2070	NC_017268	T	6	6	103405	103410	0 %	100 %	0 %	0 %	384421647
2071	NC_017268	CTGCT	2	10	103463	103472	0 %	40 %	20 %	40 %	384421647
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2073	NC_017268	CTACT	2	10	103526	103535	20 %	40 %	0 %	40 %	384421647
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2079	NC_017268	TCTT	2	8	103730	103737	0 %	75 %	0 %	25 %	384421647
2080	NC_017268	TC	3	6	103829	103834	0 %	50 %	0 %	50 %	384421647
2081	NC_017268	TCG	2	6	103858	103863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421647
2082	NC_017268	TCA	2	6	104020	104025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421648
2083	NC_017268	GCGGT	2	10	104034	104043	0 %	20 %	60 %	20 %	384421648
2084	NC_017268	G	6	6	104052	104057	0 %	0 %	100 %	0 %	384421648
2085	NC_017268	GTC	2	6	104080	104085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421648
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2087	NC_017268	ATTT	2	8	104135	104142	25 %	75 %	0 %	0 %	384421648
2088	NC_017268	GC	4	8	104180	104187	0 %	0 %	50 %	50 %	384421648
2089	NC_017268	CG	3	6	104223	104228	0 %	0 %	50 %	50 %	384421648
2090	NC_017268	GGTT	2	8	104237	104244	0 %	50 %	50 %	0 %	384421648
2091	NC_017268	G	7	7	104278	104284	0 %	0 %	100 %	0 %	384421648
2092	NC_017268	CT	3	6	104329	104334	0 %	50 %	0 %	50 %	384421648
2093	NC_017268	AAG	2	6	104375	104380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421648
2094	NC_017268	GC	3	6	104390	104395	0 %	0 %	50 %	50 %	384421648
2095	NC_017268	AGCA	2	8	104406	104413	50 %	0 %	25 %	25 %	384421648
2096	NC_017268	GCA	2	6	104482	104487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421648
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2099	NC_017268	GGA	2	6	104809	104814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421648
2100	NC_017268	GT	3	6	105002	105007	0 %	50 %	50 %	0 %	384421648
2101	NC_017268	CTA	3	9	105088	105096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421648
2102	NC_017268	TCC	2	6	105127	105132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421648
2103	NC_017268	GAG	2	6	105134	105139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421648
2104	NC_017268	A	6	6	105258	105263	100 %	0 %	0 %	0 %	384421648
2105	NC_017268	CTT	2	6	105266	105271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421648
2106	NC_017268	GAA	2	6	105287	105292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421648
2107	NC_017268	GCGT	2	8	105293	105300	0 %	25 %	50 %	25 %	384421648
2108	NC_017268	CGA	2	6	105331	105336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421648
2109	NC_017268	CG	5	10	105337	105346	0 %	0 %	50 %	50 %	384421648
2110	NC_017268	GA	3	6	105422	105427	50 %	0 %	50 %	0 %	384421648
2111	NC_017268	GGT	2	6	105435	105440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421648
2112	NC_017268	GCG	2	6	105446	105451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421648
2113	NC_017268	A	6	6	105521	105526	100 %	0 %	0 %	0 %	384421648
2114	NC_017268	CAGG	2	8	105538	105545	25 %	0 %	50 %	25 %	384421648
2115	NC_017268	GCAG	2	8	105634	105641	25 %	0 %	50 %	25 %	384421648
2116	NC_017268	GCT	2	6	105655	105660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421648
2117	NC_017268	GTGCT	2	10	105716	105725	0 %	40 %	40 %	20 %	384421648
2118	NC_017268	AC	3	6	105727	105732	50 %	0 %	0 %	50 %	384421648
2119	NC_017268	CG	3	6	105764	105769	0 %	0 %	50 %	50 %	384421648
2120	NC_017268	AGCG	2	8	105799	105806	25 %	0 %	50 %	25 %	384421648
2121	NC_017268	GC	3	6	105857	105862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_017268	TTC	2	6	105863	105868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_017268	CGC	2	6	105934	105939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421649
2124	NC_017268	CG	3	6	105949	105954	0 %	0 %	50 %	50 %	384421649
2125	NC_017268	GC	3	6	105991	105996	0 %	0 %	50 %	50 %	384421649
2126	NC_017268	CGC	2	6	106019	106024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421649
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2134	NC_017268	CTG	2	6	106362	106367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2143	NC_017268	CAGG	2	8	106781	106788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2147	NC_017268	GC	3	6	106883	106888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2246	NC_017268	CG	3	6	111641	111646	0 %	0 %	50 %	50 %	384421654
2247	NC_017268	AG	3	6	111729	111734	50 %	0 %	50 %	0 %	384421654
2248	NC_017268	A	6	6	111767	111772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_017268	GATG	2	8	111828	111835	25 %	25 %	50 %	0 %	384421655
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2254	NC_017268	GTG	2	6	112174	112179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421655
2255	NC_017268	GTG	2	6	112252	112257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421655
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2257	NC_017268	GTG	2	6	112331	112336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421655
2258	NC_017268	GC	3	6	112353	112358	0 %	0 %	50 %	50 %	384421655
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2262	NC_017268	CAT	2	6	112572	112577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421655
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2265	NC_017268	CGTG	2	8	112620	112627	0 %	25 %	50 %	25 %	384421655
2266	NC_017268	TGA	2	6	112653	112658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421655
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2292	NC_017268	A	9	9	113575	113583	100 %	0 %	0 %	0 %	384421655
2293	NC_017268	AAG	2	6	113660	113665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2294	NC_017268	T	6	6	113750	113755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2375	NC_017268	T	7	7	117666	117672	0 %	100 %	0 %	0 %	384421657
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