MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_017268	GCC	2	6	1091744	1091749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422490
23004	NC_017268	AGC	2	6	1091754	1091759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422490
23005	NC_017268	CAA	2	6	1091765	1091770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422490
23006	NC_017268	GAC	2	6	1091804	1091809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23007	NC_017268	GAC	2	6	1091903	1091908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422491
23008	NC_017268	CAA	3	9	1091963	1091971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422491
23009	NC_017268	CTG	2	6	1091985	1091990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422491
23010	NC_017268	TAA	2	6	1091996	1092001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422491
23011	NC_017268	T	7	7	1092006	1092012	0 %	100 %	0 %	0 %	384422491
23012	NC_017268	CAC	2	6	1092057	1092062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422491
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23014	NC_017268	TGT	2	6	1092129	1092134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422491
23015	NC_017268	ACC	2	6	1092151	1092156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422491
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23017	NC_017268	AG	3	6	1092275	1092280	50 %	0 %	50 %	0 %	384422491
23018	NC_017268	GC	3	6	1092284	1092289	0 %	0 %	50 %	50 %	384422491
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23020	NC_017268	CCCT	2	8	1092363	1092370	0 %	25 %	0 %	75 %	384422491
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23028	NC_017268	CTG	2	6	1092815	1092820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422493
23029	NC_017268	GCA	2	6	1092822	1092827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422493
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23048	NC_017268	TGTGC	2	10	1093312	1093321	0 %	40 %	40 %	20 %	384422493
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23052	NC_017268	CTG	2	6	1093406	1093411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422493
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23055	NC_017268	A	6	6	1093461	1093466	100 %	0 %	0 %	0 %	384422493
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23089	NC_017268	TGCG	2	8	1094840	1094847	0 %	25 %	50 %	25 %	384422495
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23102	NC_017268	GTC	2	6	1095478	1095483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422495
23103	NC_017268	T	8	8	1095499	1095506	0 %	100 %	0 %	0 %	384422495
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23113	NC_017268	CA	3	6	1096024	1096029	50 %	0 %	0 %	50 %	384422495
23114	NC_017268	CAC	2	6	1096242	1096247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23115	NC_017268	AT	3	6	1096295	1096300	50 %	50 %	0 %	0 %	384422496
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23117	NC_017268	CAT	2	6	1096400	1096405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422496
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23230	NC_017268	TCCG	2	8	1101804	1101811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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23232	NC_017268	GAA	2	6	1101905	1101910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23238	NC_017268	CAA	2	6	1102402	1102407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422499
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23243	NC_017268	GCA	2	6	1102683	1102688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422499
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23342	NC_017268	CCA	2	6	1107452	1107457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422504
23343	NC_017268	TC	3	6	1107525	1107530	0 %	50 %	0 %	50 %	384422504
23344	NC_017268	ACCC	2	8	1107582	1107589	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23345	NC_017268	ACT	2	6	1107592	1107597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23347	NC_017268	TAC	2	6	1107623	1107628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422505
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23349	NC_017268	ACG	3	9	1107722	1107730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422505
23350	NC_017268	G	6	6	1107730	1107735	0 %	0 %	100 %	0 %	384422505
23351	NC_017268	CA	3	6	1107835	1107840	50 %	0 %	0 %	50 %	384422505
23352	NC_017268	AGG	2	6	1107913	1107918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422505
23353	NC_017268	CGC	2	6	1107970	1107975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422505
23354	NC_017268	AG	3	6	1107987	1107992	50 %	0 %	50 %	0 %	384422505
23355	NC_017268	GC	3	6	1108013	1108018	0 %	0 %	50 %	50 %	384422505
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23358	NC_017268	CCG	2	6	1108118	1108123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422506
23359	NC_017268	TTG	2	6	1108155	1108160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422506
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23449	NC_017268	GA	3	6	1112724	1112729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23450	NC_017268	CAA	2	6	1112807	1112812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23451	NC_017268	GCT	2	6	1112867	1112872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422510
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23453	NC_017268	CGA	2	6	1112981	1112986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422510
23454	NC_017268	CTG	2	6	1113044	1113049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422510
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23456	NC_017268	TGCG	2	8	1113259	1113266	0 %	25 %	50 %	25 %	384422511
23457	NC_017268	AC	3	6	1113289	1113294	50 %	0 %	0 %	50 %	384422511
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23460	NC_017268	G	6	6	1113414	1113419	0 %	0 %	100 %	0 %	384422511
23461	NC_017268	GAAAG	2	10	1113479	1113488	60 %	0 %	40 %	0 %	384422511
23462	NC_017268	GTT	2	6	1113546	1113551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422511
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23464	NC_017268	GC	3	6	1113560	1113565	0 %	0 %	50 %	50 %	384422511
23465	NC_017268	GAAC	2	8	1113589	1113596	50 %	0 %	25 %	25 %	384422511
23466	NC_017268	CGG	2	6	1113692	1113697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422511
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23468	NC_017268	GCT	2	6	1113774	1113779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422511
23469	NC_017268	GGT	2	6	1113833	1113838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422511
23470	NC_017268	CTC	2	6	1113848	1113853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422511
23471	NC_017268	T	6	6	1113870	1113875	0 %	100 %	0 %	0 %	384422511
23472	NC_017268	GCCCTC	2	12	1113897	1113908	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384422511
23473	NC_017268	C	6	6	1113953	1113958	0 %	0 %	0 %	100 %	384422511
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