MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017268	TCG	2	6	76455	76460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1502	NC_017268	AT	3	6	76474	76479	50 %	50 %	0 %	0 %	384421621
1503	NC_017268	TCA	2	6	76509	76514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421621
1504	NC_017268	AAG	2	6	76517	76522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421621
1505	NC_017268	CGT	2	6	76539	76544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1506	NC_017268	C	6	6	76563	76568	0 %	0 %	0 %	100 %	384421621
1507	NC_017268	GC	3	6	76594	76599	0 %	0 %	50 %	50 %	384421621
1508	NC_017268	GAAAA	2	10	76673	76682	80 %	0 %	20 %	0 %	384421621
1509	NC_017268	ACGT	2	8	76690	76697	25 %	25 %	25 %	25 %	384421621
1510	NC_017268	TTA	2	6	76779	76784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421621
1511	NC_017268	CGA	2	6	76785	76790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1512	NC_017268	CAT	2	6	76886	76891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421621
1513	NC_017268	AAT	2	6	76922	76927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421621
1514	NC_017268	CA	3	6	76945	76950	50 %	0 %	0 %	50 %	384421621
1515	NC_017268	T	6	6	76985	76990	0 %	100 %	0 %	0 %	384421621
1516	NC_017268	AAG	2	6	77006	77011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421621
1517	NC_017268	T	9	9	77017	77025	0 %	100 %	0 %	0 %	384421621
1518	NC_017268	CTC	2	6	77120	77125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421621
1519	NC_017268	GCG	2	6	77132	77137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1520	NC_017268	TCC	2	6	77149	77154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421621
1521	NC_017268	GCA	2	6	77184	77189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1522	NC_017268	CTTT	2	8	77256	77263	0 %	75 %	0 %	25 %	384421621
1523	NC_017268	GA	3	6	77267	77272	50 %	0 %	50 %	0 %	384421621
1524	NC_017268	GGC	2	6	77353	77358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1525	NC_017268	TGC	2	6	77360	77365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1526	NC_017268	CCA	2	6	77371	77376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421621
1527	NC_017268	TGC	2	6	77435	77440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1528	NC_017268	TCC	2	6	77520	77525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421621
1529	NC_017268	GCG	2	6	77558	77563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1530	NC_017268	AT	3	6	77586	77591	50 %	50 %	0 %	0 %	384421621
1531	NC_017268	CG	3	6	77638	77643	0 %	0 %	50 %	50 %	384421621
1532	NC_017268	GT	3	6	77709	77714	0 %	50 %	50 %	0 %	384421621
1533	NC_017268	TCA	2	6	77718	77723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421621
1534	NC_017268	AATAA	2	10	77727	77736	80 %	20 %	0 %	0 %	384421621
1535	NC_017268	TTC	2	6	77783	77788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421621
1536	NC_017268	T	6	6	77955	77960	0 %	100 %	0 %	0 %	384421621
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1538	NC_017268	TCA	2	6	78000	78005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421621
1539	NC_017268	T	6	6	78025	78030	0 %	100 %	0 %	0 %	384421621
1540	NC_017268	GTA	2	6	78045	78050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421621
1541	NC_017268	TGC	2	6	78115	78120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421621
1542	NC_017268	GGC	2	6	78137	78142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1543	NC_017268	GGC	2	6	78317	78322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1544	NC_017268	GCG	2	6	78344	78349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421621
1545	NC_017268	T	6	6	78397	78402	0 %	100 %	0 %	0 %	384421621
1546	NC_017268	GA	3	6	78412	78417	50 %	0 %	50 %	0 %	384421621
1547	NC_017268	TCC	2	6	78459	78464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421621
1548	NC_017268	GCTT	2	8	78521	78528	0 %	50 %	25 %	25 %	384421621
1549	NC_017268	CTGT	2	8	78540	78547	0 %	50 %	25 %	25 %	384421621
1550	NC_017268	T	6	6	78580	78585	0 %	100 %	0 %	0 %	384421622
1551	NC_017268	T	6	6	78601	78606	0 %	100 %	0 %	0 %	384421622
1552	NC_017268	AGT	2	6	78632	78637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421622
1553	NC_017268	A	6	6	78761	78766	100 %	0 %	0 %	0 %	384421623
1554	NC_017268	GAA	2	6	78873	78878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421623
1555	NC_017268	T	6	6	78888	78893	0 %	100 %	0 %	0 %	384421623
1556	NC_017268	TGA	2	6	78921	78926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421623
1557	NC_017268	GAA	2	6	78930	78935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421623
1558	NC_017268	ACG	2	6	78971	78976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421623
1559	NC_017268	GT	3	6	79044	79049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017268	GTC	2	6	79063	79068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017268	GCT	2	6	79123	79128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421624
1562	NC_017268	GCT	2	6	79155	79160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421624
1563	NC_017268	GAA	2	6	79177	79182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421624
1564	NC_017268	GAG	2	6	79186	79191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421624
1565	NC_017268	GCGCC	2	10	79362	79371	0 %	0 %	40 %	60 %	384421624
1566	NC_017268	ATG	2	6	79397	79402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421624
1567	NC_017268	TGA	2	6	79455	79460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421624
1568	NC_017268	AGG	2	6	79508	79513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421624
1569	NC_017268	GCT	2	6	79608	79613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421624
1570	NC_017268	TCG	2	6	79622	79627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421624
1571	NC_017268	GCA	2	6	79635	79640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421624
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1573	NC_017268	AAC	2	6	79719	79724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421624
1574	NC_017268	GC	3	6	79741	79746	0 %	0 %	50 %	50 %	384421624
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1587	NC_017268	CA	3	6	80583	80588	50 %	0 %	0 %	50 %	384421624
1588	NC_017268	ACA	2	6	80621	80626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421625
1589	NC_017268	CG	3	6	80627	80632	0 %	0 %	50 %	50 %	384421625
1590	NC_017268	TTG	2	6	80690	80695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421625
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1592	NC_017268	GCGT	2	8	80864	80871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_017268	TGGTG	2	10	80876	80885	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_017268	TGT	2	6	81006	81011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421626
1598	NC_017268	CGTGT	2	10	81018	81027	0 %	40 %	40 %	20 %	384421626
1599	NC_017268	CTT	2	6	81036	81041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421626
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1602	NC_017268	CTT	2	6	81150	81155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421626
1603	NC_017268	GC	3	6	81233	81238	0 %	0 %	50 %	50 %	384421626
1604	NC_017268	GTG	2	6	81276	81281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421626
1605	NC_017268	CG	3	6	81330	81335	0 %	0 %	50 %	50 %	384421626
1606	NC_017268	T	6	6	81359	81364	0 %	100 %	0 %	0 %	384421626
1607	NC_017268	ATG	2	6	81573	81578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421626
1608	NC_017268	CG	3	6	81611	81616	0 %	0 %	50 %	50 %	384421626
1609	NC_017268	CAG	2	6	81653	81658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1610	NC_017268	TAC	2	6	81675	81680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421626
1611	NC_017268	CGC	2	6	81682	81687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421626
1612	NC_017268	GTGC	2	8	81959	81966	0 %	25 %	50 %	25 %	384421626
1613	NC_017268	GGC	2	6	81977	81982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421626
1614	NC_017268	CA	3	6	81999	82004	50 %	0 %	0 %	50 %	384421626
1615	NC_017268	TGC	2	6	82009	82014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1616	NC_017268	AGC	2	6	82021	82026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1617	NC_017268	GTG	2	6	82073	82078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421626
1618	NC_017268	G	6	6	82212	82217	0 %	0 %	100 %	0 %	384421626
1619	NC_017268	GTGA	2	8	82265	82272	25 %	25 %	50 %	0 %	384421626
1620	NC_017268	TGC	2	6	82299	82304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1621	NC_017268	CGT	2	6	82310	82315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1622	NC_017268	CGT	2	6	82322	82327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421626
1623	NC_017268	CGCA	2	8	82332	82339	25 %	0 %	25 %	50 %	384421626
1624	NC_017268	TCT	3	9	82361	82369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421627
1625	NC_017268	AG	3	6	82377	82382	50 %	0 %	50 %	0 %	384421627
1626	NC_017268	T	7	7	82592	82598	0 %	100 %	0 %	0 %	384421628
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1628	NC_017268	GTG	3	9	82722	82730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421628
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1662	NC_017268	GCA	2	6	84257	84262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1743	NC_017268	GATC	2	8	87961	87968	25 %	25 %	25 %	25 %	384421632
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1745	NC_017268	AT	3	6	88146	88151	50 %	50 %	0 %	0 %	384421632
1746	NC_017268	TG	3	6	88227	88232	0 %	50 %	50 %	0 %	384421632
1747	NC_017268	AGGA	2	8	88233	88240	50 %	0 %	50 %	0 %	384421632
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