MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017268	CA	3	6	593283	593288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12502	NC_017268	GC	3	6	593344	593349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_017268	CTTCT	2	10	593350	593359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12504	NC_017268	CTT	2	6	593377	593382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_017268	GTG	2	6	593394	593399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017268	CGG	2	6	593410	593415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_017268	GC	3	6	593581	593586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_017268	AAAC	2	8	593673	593680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12509	NC_017268	CCGG	2	8	593731	593738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_017268	GCA	2	6	593767	593772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_017268	T	7	7	593819	593825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017268	CTC	2	6	593843	593848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_017268	CTG	2	6	593853	593858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_017268	AGG	2	6	593866	593871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017268	GGC	2	6	593888	593893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12517	NC_017268	CAC	2	6	593969	593974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_017268	CGG	2	6	594007	594012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017268	GCG	2	6	594079	594084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_017268	AAG	2	6	594090	594095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017268	GCT	2	6	594146	594151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_017268	GC	3	6	594163	594168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_017268	ACG	2	6	594169	594174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_017268	TC	3	6	594200	594205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_017268	CGC	2	6	594254	594259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_017268	CA	3	6	594277	594282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_017268	CCG	2	6	594302	594307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_017268	AGGG	2	8	594309	594316	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017268	GCA	2	6	594600	594605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422060
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12531	NC_017268	CT	3	6	594685	594690	0 %	50 %	0 %	50 %	384422060
12532	NC_017268	CTCG	2	8	594716	594723	0 %	25 %	25 %	50 %	384422060
12533	NC_017268	CCTCA	2	10	594751	594760	20 %	20 %	0 %	60 %	384422060
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12554	NC_017268	A	6	6	595435	595440	100 %	0 %	0 %	0 %	384422060
12555	NC_017268	TTG	2	6	595441	595446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422060
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12558	NC_017268	GC	3	6	595604	595609	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
12559	NC_017268	GC	5	10	595629	595638	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
12560	NC_017268	AC	3	6	595646	595651	50 %	0 %	0 %	50 %	384422060
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12564	NC_017268	CGTG	2	8	595838	595845	0 %	25 %	50 %	25 %	384422060
12565	NC_017268	CG	4	8	595871	595878	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
12566	NC_017268	CG	4	8	595887	595894	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
12567	NC_017268	TCCT	2	8	595929	595936	0 %	50 %	0 %	50 %	384422060
12568	NC_017268	GACC	2	8	595945	595952	25 %	0 %	25 %	50 %	384422060
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12573	NC_017268	ATC	3	9	596268	596276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422060
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12582	NC_017268	CGTG	2	8	596680	596687	0 %	25 %	50 %	25 %	384422060
12583	NC_017268	GC	4	8	596704	596711	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
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12593	NC_017268	GC	3	6	597116	597121	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
12594	NC_017268	CG	4	8	597180	597187	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
12595	NC_017268	GC	3	6	597196	597201	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
12596	NC_017268	ACA	2	6	597207	597212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422061
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12598	NC_017268	AGACAT	2	12	597262	597273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384422061
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12603	NC_017268	CA	3	6	597465	597470	50 %	0 %	0 %	50 %	384422061
12604	NC_017268	CG	3	6	597516	597521	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
12605	NC_017268	GAT	2	6	597581	597586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422061
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12608	NC_017268	ATATCG	2	12	597704	597715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384422061
12609	NC_017268	TTC	2	6	597727	597732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422061
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12612	NC_017268	TGC	3	9	597842	597850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422061
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12615	NC_017268	GTACG	2	10	597996	598005	20 %	20 %	40 %	20 %	384422061
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12619	NC_017268	ATCC	2	8	598112	598119	25 %	25 %	0 %	50 %	384422061
12620	NC_017268	GC	3	6	598142	598147	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
12621	NC_017268	A	7	7	598167	598173	100 %	0 %	0 %	0 %	384422061
12622	NC_017268	GCT	2	6	598195	598200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422061
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12625	NC_017268	GC	3	6	598286	598291	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
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12731	NC_017268	CCACC	2	10	602682	602691	20 %	0 %	0 %	80 %	384422066
12732	NC_017268	ACA	2	6	602696	602701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422066
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12741	NC_017268	CACC	2	8	603086	603093	25 %	0 %	0 %	75 %	384422066
12742	NC_017268	AG	3	6	603096	603101	50 %	0 %	50 %	0 %	384422066
12743	NC_017268	A	8	8	603201	603208	100 %	0 %	0 %	0 %	384422066
12744	NC_017268	CCG	2	6	603214	603219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422066
12745	NC_017268	C	6	6	603297	603302	0 %	0 %	0 %	100 %	384422066
12746	NC_017268	AGC	2	6	603316	603321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422066
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12997	NC_017268	ACT	2	6	614509	614514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422075
12998	NC_017268	TGTT	2	8	614557	614564	0 %	75 %	25 %	0 %	384422075
12999	NC_017268	TG	3	6	614604	614609	0 %	50 %	50 %	0 %	384422075
13000	NC_017268	AAT	2	6	614613	614618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422075

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