MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017268	TGT	2	6	25325	25330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017268	GCT	2	6	25358	25363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017268	T	9	9	25369	25377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017268	AGA	2	6	25423	25428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017268	ACA	2	6	25631	25636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421571
506	NC_017268	T	6	6	25664	25669	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
507	NC_017268	TTA	2	6	25685	25690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421571
508	NC_017268	AG	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	384421571
509	NC_017268	GGA	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421571
510	NC_017268	GATT	2	8	25860	25867	25 %	50 %	25 %	0 %	384421571
511	NC_017268	CTT	2	6	25911	25916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421571
512	NC_017268	T	6	6	25915	25920	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
513	NC_017268	AGCG	2	8	25998	26005	25 %	0 %	50 %	25 %	384421571
514	NC_017268	TG	3	6	26027	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
515	NC_017268	GTATC	2	10	26077	26086	20 %	40 %	20 %	20 %	384421571
516	NC_017268	TGG	2	6	26088	26093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421571
517	NC_017268	GCA	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421571
518	NC_017268	TGC	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421571
519	NC_017268	T	6	6	26122	26127	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
520	NC_017268	CTT	2	6	26130	26135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421571
521	NC_017268	TGC	2	6	26157	26162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421571
522	NC_017268	T	6	6	26196	26201	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
523	NC_017268	GTT	2	6	26248	26253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421571
524	NC_017268	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
525	NC_017268	A	7	7	26447	26453	100 %	0 %	0 %	0 %	384421571
526	NC_017268	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
527	NC_017268	TCT	2	6	26549	26554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421571
528	NC_017268	T	7	7	26635	26641	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
529	NC_017268	T	6	6	26699	26704	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
530	NC_017268	TGT	2	6	26724	26729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421571
531	NC_017268	CG	3	6	26740	26745	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
532	NC_017268	CCTT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	0 %	50 %	384421571
533	NC_017268	GCAC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	384421571
534	NC_017268	TGC	2	6	26950	26955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421571
535	NC_017268	GGTGG	2	10	26984	26993	0 %	20 %	80 %	0 %	384421571
536	NC_017268	CAA	2	6	27137	27142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421571
537	NC_017268	GA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	384421571
538	NC_017268	AGCG	2	8	27253	27260	25 %	0 %	50 %	25 %	384421571
539	NC_017268	T	6	6	27268	27273	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
540	NC_017268	TTGAGA	2	12	27321	27332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421571
541	NC_017268	CAGT	2	8	27344	27351	25 %	25 %	25 %	25 %	384421571
542	NC_017268	GT	4	8	27413	27420	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
543	NC_017268	GC	4	8	27455	27462	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
544	NC_017268	T	6	6	27492	27497	0 %	100 %	0 %	0 %	384421571
545	NC_017268	GTG	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
546	NC_017268	GTT	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421572
547	NC_017268	TGG	2	6	27675	27680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
548	NC_017268	TGG	2	6	27685	27690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
549	NC_017268	TATTT	2	10	27710	27719	20 %	80 %	0 %	0 %	384421572
550	NC_017268	CTGCG	2	10	27776	27785	0 %	20 %	40 %	40 %	384421572
551	NC_017268	TGCG	2	8	27792	27799	0 %	25 %	50 %	25 %	384421572
552	NC_017268	GT	4	8	27807	27814	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
553	NC_017268	CATC	2	8	27821	27828	25 %	25 %	0 %	50 %	384421572
554	NC_017268	T	6	6	27832	27837	0 %	100 %	0 %	0 %	384421572
555	NC_017268	GGT	2	6	27858	27863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
556	NC_017268	GTA	2	6	27932	27937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421572
557	NC_017268	GT	3	6	28048	28053	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
558	NC_017268	AGTG	2	8	28054	28061	25 %	25 %	50 %	0 %	384421572
559	NC_017268	ATG	2	6	28100	28105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421572
560	NC_017268	T	6	6	28110	28115	0 %	100 %	0 %	0 %	384421572
561	NC_017268	TTA	2	6	28131	28136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421572
562	NC_017268	AT	4	8	28141	28148	50 %	50 %	0 %	0 %	384421572
563	NC_017268	TCA	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421572
564	NC_017268	T	6	6	28250	28255	0 %	100 %	0 %	0 %	384421572
565	NC_017268	G	6	6	28267	28272	0 %	0 %	100 %	0 %	384421572
566	NC_017268	T	6	6	28354	28359	0 %	100 %	0 %	0 %	384421572
567	NC_017268	CAG	2	6	28420	28425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421572
568	NC_017268	TTTG	2	8	28438	28445	0 %	75 %	25 %	0 %	384421572
569	NC_017268	TGA	2	6	28485	28490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421572
570	NC_017268	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
571	NC_017268	TG	3	6	28509	28514	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
572	NC_017268	GTG	2	6	28691	28696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
573	NC_017268	TGA	2	6	28734	28739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421572
574	NC_017268	GGT	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421572
575	NC_017268	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017268	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017268	CTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017268	AGG	2	6	29054	29059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017268	G	6	6	29058	29063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017268	GCT	2	6	29130	29135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421573
581	NC_017268	TCC	2	6	29156	29161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421573
582	NC_017268	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	384421573
583	NC_017268	GAT	2	6	29253	29258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421573
584	NC_017268	ATC	2	6	29307	29312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421573
585	NC_017268	AAC	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421573
586	NC_017268	A	7	7	29334	29340	100 %	0 %	0 %	0 %	384421573
587	NC_017268	A	6	6	29446	29451	100 %	0 %	0 %	0 %	384421573
588	NC_017268	TCT	2	6	29475	29480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421573
589	NC_017268	GAA	2	6	29549	29554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421573
590	NC_017268	TC	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	384421573
591	NC_017268	AG	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	384421574
592	NC_017268	ACC	2	6	29942	29947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421574
593	NC_017268	TGCGC	2	10	29964	29973	0 %	20 %	40 %	40 %	384421574
594	NC_017268	AGT	2	6	29978	29983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421574
595	NC_017268	CCG	2	6	30120	30125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421574
596	NC_017268	TCT	2	6	30159	30164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421574
597	NC_017268	CAC	2	6	30318	30323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421574
598	NC_017268	T	6	6	30336	30341	0 %	100 %	0 %	0 %	384421574
599	NC_017268	TC	3	6	30394	30399	0 %	50 %	0 %	50 %	384421574
600	NC_017268	AGC	2	6	30461	30466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421574
601	NC_017268	TGC	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421574
602	NC_017268	TGT	2	6	30536	30541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421574
603	NC_017268	GTG	2	6	30565	30570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421574
604	NC_017268	TG	3	6	30634	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	384421574
605	NC_017268	TCCAG	2	10	30790	30799	20 %	20 %	20 %	40 %	384421574
606	NC_017268	TTC	2	6	30802	30807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421574
607	NC_017268	TGC	2	6	30817	30822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421574
608	NC_017268	CGT	2	6	30923	30928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421574
609	NC_017268	AAAG	2	8	30938	30945	75 %	0 %	25 %	0 %	384421574
610	NC_017268	CA	3	6	30960	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	384421574
611	NC_017268	GT	3	6	31053	31058	0 %	50 %	50 %	0 %	384421574
612	NC_017268	CTA	2	6	31104	31109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421574
613	NC_017268	GCGG	2	8	31114	31121	0 %	0 %	75 %	25 %	384421574
614	NC_017268	ATG	2	6	31168	31173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421574
615	NC_017268	CTT	2	6	31227	31232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421574
616	NC_017268	CTG	2	6	31248	31253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421574
617	NC_017268	TCGT	2	8	31280	31287	0 %	50 %	25 %	25 %	384421574
618	NC_017268	GAACAG	2	12	31305	31316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384421574
619	NC_017268	A	6	6	31321	31326	100 %	0 %	0 %	0 %	384421574
620	NC_017268	TGGGG	2	10	31348	31357	0 %	20 %	80 %	0 %	384421574
621	NC_017268	GTT	2	6	31365	31370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421574
622	NC_017268	TCC	2	6	31403	31408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421574
623	NC_017268	TGTC	2	8	31420	31427	0 %	50 %	25 %	25 %	384421574
624	NC_017268	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	384421574
625	NC_017268	GCT	2	6	31466	31471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421574
626	NC_017268	TCA	2	6	31520	31525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421574
627	NC_017268	T	7	7	31528	31534	0 %	100 %	0 %	0 %	384421574
628	NC_017268	GTCTGG	2	12	31540	31551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384421574
629	NC_017268	GCA	2	6	31584	31589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421574
630	NC_017268	TGG	2	6	31625	31630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421574
631	NC_017268	GA	3	6	31732	31737	50 %	0 %	50 %	0 %	384421574
632	NC_017268	GCG	2	6	31753	31758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421574
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