MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017268	CCG	2	6	293559	293564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421812
6002	NC_017268	ATA	2	6	293598	293603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421812
6003	NC_017268	GC	3	6	293616	293621	0 %	0 %	50 %	50 %	384421812
6004	NC_017268	ACA	2	6	293635	293640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421812
6005	NC_017268	TC	3	6	293656	293661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_017268	AGT	2	6	293687	293692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017268	GCG	2	6	293693	293698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017268	GCAC	2	8	293703	293710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_017268	GACC	2	8	293739	293746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_017268	CTT	2	6	293826	293831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421813
6011	NC_017268	T	7	7	293830	293836	0 %	100 %	0 %	0 %	384421813
6012	NC_017268	CCA	2	6	293879	293884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421813
6013	NC_017268	TG	3	6	293899	293904	0 %	50 %	50 %	0 %	384421813
6014	NC_017268	TCA	2	6	293935	293940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421813
6015	NC_017268	CCA	2	6	294002	294007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421813
6016	NC_017268	TCTGC	2	10	294083	294092	0 %	40 %	20 %	40 %	384421813
6017	NC_017268	CTT	2	6	294137	294142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421813
6018	NC_017268	CGG	2	6	294180	294185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421813
6019	NC_017268	GTA	2	6	294222	294227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421813
6020	NC_017268	TGC	2	6	294277	294282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421813
6021	NC_017268	GC	3	6	294322	294327	0 %	0 %	50 %	50 %	384421813
6022	NC_017268	TGA	2	6	294383	294388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421813
6023	NC_017268	GAAT	2	8	294497	294504	50 %	25 %	25 %	0 %	384421813
6024	NC_017268	GCG	2	6	294523	294528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421813
6025	NC_017268	GCC	2	6	294537	294542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421813
6026	NC_017268	TTG	2	6	294547	294552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421813
6027	NC_017268	GGGTGA	2	12	294713	294724	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384421813
6028	NC_017268	ACA	2	6	294754	294759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421813
6029	NC_017268	TCC	2	6	294870	294875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421813
6030	NC_017268	AGGA	2	8	294881	294888	50 %	0 %	50 %	0 %	384421813
6031	NC_017268	GGC	2	6	294900	294905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421813
6032	NC_017268	GCC	2	6	294972	294977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421813
6033	NC_017268	CGC	2	6	295010	295015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421813
6034	NC_017268	CGA	2	6	295031	295036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421813
6035	NC_017268	AG	3	6	295057	295062	50 %	0 %	50 %	0 %	384421813
6036	NC_017268	TCG	2	6	295111	295116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421813
6037	NC_017268	GTA	2	6	295119	295124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421813
6038	NC_017268	GGA	2	6	295130	295135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421813
6039	NC_017268	ACA	2	6	295239	295244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421813
6040	NC_017268	GAG	2	6	295248	295253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421813
6041	NC_017268	GAT	2	6	295283	295288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017268	TTTCC	2	10	295330	295339	0 %	60 %	0 %	40 %	384421814
6043	NC_017268	GGA	2	6	295352	295357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421814
6044	NC_017268	GC	3	6	295378	295383	0 %	0 %	50 %	50 %	384421814
6045	NC_017268	GAG	2	6	295400	295405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421814
6046	NC_017268	CTT	2	6	295446	295451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017268	G	9	9	295472	295480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017268	AG	5	10	295481	295490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017268	CGTTG	2	10	295513	295522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_017268	GTGC	2	8	295525	295532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_017268	GCCG	2	8	295550	295557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_017268	ATC	2	6	295570	295575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421815
6053	NC_017268	AGC	2	6	295606	295611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6054	NC_017268	GTC	2	6	295616	295621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6055	NC_017268	GC	3	6	295640	295645	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6056	NC_017268	TTCT	2	8	295662	295669	0 %	75 %	0 %	25 %	384421815
6057	NC_017268	CGC	2	6	295686	295691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421815
6058	NC_017268	GCG	2	6	295750	295755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421815
6059	NC_017268	CAA	2	6	295781	295786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421815
6060	NC_017268	CAT	2	6	295796	295801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421815
6061	NC_017268	CTC	2	6	295805	295810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421815
6062	NC_017268	AGA	2	6	295820	295825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421815
6063	NC_017268	TGA	2	6	295839	295844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421815
6064	NC_017268	GC	3	6	295864	295869	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6065	NC_017268	CTG	2	6	295930	295935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6066	NC_017268	ACG	2	6	296062	296067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6067	NC_017268	CGT	2	6	296131	296136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6068	NC_017268	AGC	2	6	296177	296182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421815
6069	NC_017268	GC	4	8	296187	296194	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6070	NC_017268	GC	3	6	296212	296217	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6071	NC_017268	G	7	7	296223	296229	0 %	0 %	100 %	0 %	384421815
6072	NC_017268	CTT	2	6	296264	296269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421815
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6074	NC_017268	CG	4	8	296301	296308	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6075	NC_017268	GAG	2	6	296333	296338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421815
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6080	NC_017268	CGTC	2	8	296682	296689	0 %	25 %	25 %	50 %	384421815
6081	NC_017268	AGA	2	6	296699	296704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421815
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6086	NC_017268	GAG	2	6	296917	296922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421815
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6089	NC_017268	CG	3	6	297062	297067	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
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6094	NC_017268	GAT	2	6	297550	297555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421815
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6096	NC_017268	GC	3	6	297646	297651	0 %	0 %	50 %	50 %	384421815
6097	NC_017268	CGTG	2	8	297771	297778	0 %	25 %	50 %	25 %	384421815
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6100	NC_017268	G	6	6	297995	298000	0 %	0 %	100 %	0 %	384421815
6101	NC_017268	TGA	2	6	298031	298036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421815
6102	NC_017268	AGTG	2	8	298052	298059	25 %	25 %	50 %	0 %	384421815
6103	NC_017268	GT	3	6	298065	298070	0 %	50 %	50 %	0 %	384421816
6104	NC_017268	TGG	2	6	298121	298126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421816
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6108	NC_017268	GT	3	6	298196	298201	0 %	50 %	50 %	0 %	384421817
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6111	NC_017268	CATG	2	8	298318	298325	25 %	25 %	25 %	25 %	384421817
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6116	NC_017268	CG	4	8	298457	298464	0 %	0 %	50 %	50 %	384421818
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6120	NC_017268	GC	3	6	298601	298606	0 %	0 %	50 %	50 %	384421818
6121	NC_017268	CAG	2	6	298712	298717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421818
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6124	NC_017268	CT	3	6	298878	298883	0 %	50 %	0 %	50 %	384421818
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6499	NC_017268	CTC	2	6	315460	315465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421834
6500	NC_017268	GTCG	2	8	315474	315481	0 %	25 %	50 %	25 %	384421834

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