MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017268	GC	3	6	267769	267774	0 %	0 %	50 %	50 %	384421791
5502	NC_017268	GTG	2	6	267803	267808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421791
5503	NC_017268	G	6	6	267883	267888	0 %	0 %	100 %	0 %	384421791
5504	NC_017268	CTT	2	6	267922	267927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421791
5505	NC_017268	GGA	2	6	267946	267951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
5506	NC_017268	AGG	2	6	267952	267957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
5507	NC_017268	GGAT	2	8	268002	268009	25 %	25 %	50 %	0 %	384421791
5508	NC_017268	GAG	2	6	268022	268027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
5509	NC_017268	TCG	2	6	268063	268068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421791
5510	NC_017268	GGA	2	6	268144	268149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421791
5511	NC_017268	AATC	2	8	268183	268190	50 %	25 %	0 %	25 %	384421791
5512	NC_017268	AAC	2	6	268247	268252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421791
5513	NC_017268	TCC	2	6	268289	268294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421791
5514	NC_017268	GT	3	6	268314	268319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017268	GCGCG	2	10	268378	268387	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5516	NC_017268	GAG	2	6	268443	268448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421792
5517	NC_017268	GGT	2	6	268454	268459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421792
5518	NC_017268	GT	3	6	268458	268463	0 %	50 %	50 %	0 %	384421792
5519	NC_017268	T	6	6	268539	268544	0 %	100 %	0 %	0 %	384421792
5520	NC_017268	CAG	2	6	268570	268575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421792
5521	NC_017268	CTTT	2	8	268713	268720	0 %	75 %	0 %	25 %	384421793
5522	NC_017268	GTT	2	6	268745	268750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421793
5523	NC_017268	CTG	2	6	268761	268766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421793
5524	NC_017268	GTG	2	6	268781	268786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421793
5525	NC_017268	TGC	2	6	268800	268805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421793
5526	NC_017268	TTTTC	2	10	268807	268816	0 %	80 %	0 %	20 %	384421793
5527	NC_017268	TTA	2	6	268843	268848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421793
5528	NC_017268	CG	3	6	268849	268854	0 %	0 %	50 %	50 %	384421793
5529	NC_017268	TTTTTC	2	12	268962	268973	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384421793
5530	NC_017268	ATG	2	6	269000	269005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421793
5531	NC_017268	T	6	6	269097	269102	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
5532	NC_017268	CTT	2	6	269105	269110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421793
5533	NC_017268	TGGC	2	8	269136	269143	0 %	25 %	50 %	25 %	384421793
5534	NC_017268	TGCG	2	8	269163	269170	0 %	25 %	50 %	25 %	384421793
5535	NC_017268	GCC	2	6	269175	269180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421793
5536	NC_017268	GTG	2	6	269189	269194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421793
5537	NC_017268	CTT	2	6	269214	269219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421793
5538	NC_017268	T	8	8	269218	269225	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
5539	NC_017268	T	6	6	269239	269244	0 %	100 %	0 %	0 %	384421793
5540	NC_017268	GT	3	6	269261	269266	0 %	50 %	50 %	0 %	384421793
5541	NC_017268	GCG	2	6	269349	269354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017268	CTA	2	6	269357	269362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_017268	GAG	2	6	269397	269402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017268	TG	3	6	269426	269431	0 %	50 %	50 %	0 %	384421794
5545	NC_017268	G	9	9	269439	269447	0 %	0 %	100 %	0 %	384421794
5546	NC_017268	GCA	2	6	269578	269583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421794
5547	NC_017268	ATA	2	6	269640	269645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421794
5548	NC_017268	TGAC	2	8	269646	269653	25 %	25 %	25 %	25 %	384421794
5549	NC_017268	AGA	2	6	269719	269724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421794
5550	NC_017268	CTC	2	6	269732	269737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421794
5551	NC_017268	CG	3	6	269760	269765	0 %	0 %	50 %	50 %	384421794
5552	NC_017268	TCA	3	9	269923	269931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421794
5553	NC_017268	GGAA	2	8	269932	269939	50 %	0 %	50 %	0 %	384421794
5554	NC_017268	A	6	6	269972	269977	100 %	0 %	0 %	0 %	384421794
5555	NC_017268	TACAAT	2	12	270158	270169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384421794
5556	NC_017268	GGT	2	6	270185	270190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421794
5557	NC_017268	GGA	2	6	270234	270239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421794
5558	NC_017268	GAAT	2	8	270250	270257	50 %	25 %	25 %	0 %	384421794
5559	NC_017268	GAAA	2	8	270343	270350	75 %	0 %	25 %	0 %	384421794
5560	NC_017268	CG	3	6	270364	270369	0 %	0 %	50 %	50 %	384421794
5561	NC_017268	GTG	2	6	270419	270424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421794
5562	NC_017268	CCCG	2	8	270467	270474	0 %	0 %	25 %	75 %	384421794
5563	NC_017268	GTTC	2	8	270539	270546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_017268	GCAC	2	8	270578	270585	25 %	0 %	25 %	50 %	384421795
5565	NC_017268	CG	3	6	270606	270611	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
5566	NC_017268	CG	4	8	270639	270646	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
5567	NC_017268	GC	3	6	270716	270721	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
5568	NC_017268	CGC	2	6	270733	270738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421795
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5570	NC_017268	TTCTC	2	10	270800	270809	0 %	60 %	0 %	40 %	384421795
5571	NC_017268	CAT	2	6	270898	270903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421795
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5573	NC_017268	GC	3	6	270989	270994	0 %	0 %	50 %	50 %	384421795
5574	NC_017268	GT	3	6	271042	271047	0 %	50 %	50 %	0 %	384421795
5575	NC_017268	CGC	2	6	271104	271109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421795
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5578	NC_017268	CGG	2	6	271143	271148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421795
5579	NC_017268	TG	3	6	271193	271198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017268	AG	3	6	271249	271254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017268	GCT	2	6	271258	271263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_017268	GT	3	6	271286	271291	0 %	50 %	50 %	0 %	384421796
5583	NC_017268	TG	3	6	271361	271366	0 %	50 %	50 %	0 %	384421796
5584	NC_017268	GGA	3	9	271407	271415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421796
5585	NC_017268	GAT	2	6	271419	271424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421796
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5589	NC_017268	GAA	2	6	271543	271548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421797
5590	NC_017268	GAG	2	6	271570	271575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421797
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5592	NC_017268	TATC	2	8	271851	271858	25 %	50 %	0 %	25 %	384421797
5593	NC_017268	AGCT	2	8	271877	271884	25 %	25 %	25 %	25 %	384421797
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5595	NC_017268	GC	3	6	271956	271961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_017268	CA	3	6	272009	272014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_017268	GCTC	2	8	272017	272024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_017268	TCC	2	6	272026	272031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_017268	CTT	2	6	272074	272079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421798
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5601	NC_017268	C	6	6	272195	272200	0 %	0 %	0 %	100 %	384421798
5602	NC_017268	GC	3	6	272236	272241	0 %	0 %	50 %	50 %	384421798
5603	NC_017268	CCCTGC	2	12	272327	272338	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384421798
5604	NC_017268	GC	5	10	272359	272368	0 %	0 %	50 %	50 %	384421798
5605	NC_017268	AT	3	6	272414	272419	50 %	50 %	0 %	0 %	384421798
5606	NC_017268	GCT	2	6	272479	272484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421798
5607	NC_017268	AG	3	6	272604	272609	50 %	0 %	50 %	0 %	384421798
5608	NC_017268	TGCG	2	8	272692	272699	0 %	25 %	50 %	25 %	384421798
5609	NC_017268	T	6	6	272705	272710	0 %	100 %	0 %	0 %	384421798
5610	NC_017268	T	6	6	272743	272748	0 %	100 %	0 %	0 %	384421798
5611	NC_017268	GCG	2	6	272759	272764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421798
5612	NC_017268	GTA	2	6	272783	272788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421798
5613	NC_017268	TCA	2	6	272880	272885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421798
5614	NC_017268	GGT	2	6	272918	272923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421798
5615	NC_017268	G	6	6	273046	273051	0 %	0 %	100 %	0 %	384421798
5616	NC_017268	CTTT	2	8	273151	273158	0 %	75 %	0 %	25 %	384421798
5617	NC_017268	TCT	2	6	273202	273207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421798
5618	NC_017268	GGGA	2	8	273288	273295	25 %	0 %	75 %	0 %	384421798
5619	NC_017268	GGA	2	6	273301	273306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421798
5620	NC_017268	CAG	2	6	273338	273343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421798
5621	NC_017268	CAG	2	6	273359	273364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421798
5622	NC_017268	TAG	2	6	273414	273419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421798
5623	NC_017268	CACC	2	8	273422	273429	25 %	0 %	0 %	75 %	384421798
5624	NC_017268	GC	3	6	273468	273473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_017268	CGTGA	2	10	273481	273490	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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