MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017268	G	8	8	220023	220030	0 %	0 %	100 %	0 %	384421755
4502	NC_017268	TGG	2	6	220098	220103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421755
4503	NC_017268	CGT	2	6	220107	220112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4504	NC_017268	CAGC	2	8	220117	220124	25 %	0 %	25 %	50 %	384421755
4505	NC_017268	A	6	6	220125	220130	100 %	0 %	0 %	0 %	384421755
4506	NC_017268	CTAT	2	8	220157	220164	25 %	50 %	0 %	25 %	384421755
4507	NC_017268	A	6	6	220215	220220	100 %	0 %	0 %	0 %	384421755
4508	NC_017268	GAC	2	6	220249	220254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4509	NC_017268	A	6	6	220316	220321	100 %	0 %	0 %	0 %	384421755
4510	NC_017268	GAA	2	6	220323	220328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421755
4511	NC_017268	ATT	2	6	220340	220345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421755
4512	NC_017268	TAT	2	6	220455	220460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421755
4513	NC_017268	CTG	2	6	220472	220477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4514	NC_017268	AG	4	8	220511	220518	50 %	0 %	50 %	0 %	384421755
4515	NC_017268	ATT	2	6	220522	220527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421755
4516	NC_017268	G	8	8	220543	220550	0 %	0 %	100 %	0 %	384421755
4517	NC_017268	AAGTC	2	10	220595	220604	40 %	20 %	20 %	20 %	384421755
4518	NC_017268	G	6	6	220626	220631	0 %	0 %	100 %	0 %	384421755
4519	NC_017268	GA	3	6	220731	220736	50 %	0 %	50 %	0 %	384421755
4520	NC_017268	GCG	2	6	220738	220743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421755
4521	NC_017268	TTC	2	6	220764	220769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421755
4522	NC_017268	CT	4	8	220841	220848	0 %	50 %	0 %	50 %	384421755
4523	NC_017268	TGA	2	6	220872	220877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421755
4524	NC_017268	TGG	2	6	220965	220970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421755
4525	NC_017268	AAG	2	6	221021	221026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421755
4526	NC_017268	AGG	2	6	221079	221084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421755
4527	NC_017268	G	7	7	221092	221098	0 %	0 %	100 %	0 %	384421755
4528	NC_017268	ACC	2	6	221191	221196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421755
4529	NC_017268	TGC	2	6	221264	221269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4530	NC_017268	TAG	2	6	221321	221326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421755
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4532	NC_017268	AGG	2	6	221597	221602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421755
4533	NC_017268	CG	4	8	221629	221636	0 %	0 %	50 %	50 %	384421755
4534	NC_017268	CGA	2	6	221679	221684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4535	NC_017268	GCA	2	6	221718	221723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4536	NC_017268	GGA	2	6	221742	221747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421755
4537	NC_017268	AGC	3	9	221763	221771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421755
4538	NC_017268	AAG	2	6	221788	221793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421755
4539	NC_017268	GGT	2	6	221824	221829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421755
4540	NC_017268	GGGA	2	8	221887	221894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017268	TG	3	6	221914	221919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017268	TG	4	8	222071	222078	0 %	50 %	50 %	0 %	384421756
4543	NC_017268	ATT	2	6	222131	222136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421756
4544	NC_017268	GAA	2	6	222172	222177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421756
4545	NC_017268	CGG	2	6	222193	222198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421756
4546	NC_017268	GGA	2	6	222246	222251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421756
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4549	NC_017268	ACG	2	6	222470	222475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421756
4550	NC_017268	GAA	2	6	222532	222537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421756
4551	NC_017268	CGA	2	6	222576	222581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421756
4552	NC_017268	GTA	2	6	222668	222673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421756
4553	NC_017268	T	6	6	222678	222683	0 %	100 %	0 %	0 %	384421756
4554	NC_017268	GC	3	6	222703	222708	0 %	0 %	50 %	50 %	384421756
4555	NC_017268	TGG	2	6	222711	222716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421756
4556	NC_017268	A	6	6	222782	222787	100 %	0 %	0 %	0 %	384421756
4557	NC_017268	AGA	2	6	222813	222818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421756
4558	NC_017268	GCG	2	6	222822	222827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421756
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4560	NC_017268	GC	3	6	222983	222988	0 %	0 %	50 %	50 %	384421756
4561	NC_017268	GCA	2	6	223020	223025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421756
4562	NC_017268	CCGG	2	8	223036	223043	0 %	0 %	50 %	50 %	384421756
4563	NC_017268	GC	3	6	223093	223098	0 %	0 %	50 %	50 %	384421756
4564	NC_017268	CCG	2	6	223210	223215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421756
4565	NC_017268	ATT	2	6	223273	223278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421757
4566	NC_017268	CGTG	2	8	223283	223290	0 %	25 %	50 %	25 %	384421757
4567	NC_017268	TTTC	2	8	223294	223301	0 %	75 %	0 %	25 %	384421757
4568	NC_017268	GT	3	6	223304	223309	0 %	50 %	50 %	0 %	384421757
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4572	NC_017268	TCGTT	2	10	223526	223535	0 %	60 %	20 %	20 %	384421758
4573	NC_017268	GC	3	6	223539	223544	0 %	0 %	50 %	50 %	384421758
4574	NC_017268	TTC	2	6	223589	223594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421758
4575	NC_017268	TGCGCT	2	12	223637	223648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421758
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4577	NC_017268	CTG	2	6	223737	223742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421758
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4579	NC_017268	TTG	2	6	223768	223773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421758
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4582	NC_017268	TGC	2	6	223859	223864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421758
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4584	NC_017268	TA	3	6	223946	223951	50 %	50 %	0 %	0 %	384421758
4585	NC_017268	T	7	7	223952	223958	0 %	100 %	0 %	0 %	384421758
4586	NC_017268	GAT	3	9	223959	223967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421758
4587	NC_017268	TGT	3	9	224137	224145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421758
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4589	NC_017268	GC	3	6	224189	224194	0 %	0 %	50 %	50 %	384421758
4590	NC_017268	ATT	2	6	224275	224280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421758
4591	NC_017268	ACG	2	6	224281	224286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421758
4592	NC_017268	TGA	2	6	224297	224302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421758
4593	NC_017268	CGT	2	6	224353	224358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421758
4594	NC_017268	ATC	2	6	224587	224592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421758
4595	NC_017268	AGT	2	6	224705	224710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421758
4596	NC_017268	GAC	2	6	224850	224855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421758
4597	NC_017268	AGGT	2	8	224883	224890	25 %	25 %	50 %	0 %	384421758
4598	NC_017268	T	7	7	224904	224910	0 %	100 %	0 %	0 %	384421759
4599	NC_017268	GC	3	6	224969	224974	0 %	0 %	50 %	50 %	384421759
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4602	NC_017268	TTTA	2	8	225080	225087	25 %	75 %	0 %	0 %	384421759
4603	NC_017268	T	6	6	225102	225107	0 %	100 %	0 %	0 %	384421759
4604	NC_017268	A	8	8	225159	225166	100 %	0 %	0 %	0 %	384421759
4605	NC_017268	ACG	2	6	225189	225194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421759
4606	NC_017268	TTTG	2	8	225200	225207	0 %	75 %	25 %	0 %	384421759
4607	NC_017268	ATT	2	6	225280	225285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421759
4608	NC_017268	TCT	2	6	225291	225296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421759
4609	NC_017268	T	8	8	225325	225332	0 %	100 %	0 %	0 %	384421759
4610	NC_017268	A	6	6	225369	225374	100 %	0 %	0 %	0 %	384421759
4611	NC_017268	ATG	2	6	225381	225386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421759
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4614	NC_017268	TCTTGT	2	12	225463	225474	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384421759
4615	NC_017268	GTGTTT	2	12	225492	225503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421759
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4621	NC_017268	T	6	6	225762	225767	0 %	100 %	0 %	0 %	384421759
4622	NC_017268	AGGC	2	8	225916	225923	25 %	0 %	50 %	25 %	384421759
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4624	NC_017268	T	7	7	226082	226088	0 %	100 %	0 %	0 %	384421759
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5000	NC_017268	AACG	2	8	243816	243823	50 %	0 %	25 %	25 %	384421773

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