MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 4502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
2	NC_016844	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
3	NC_016844	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
4	NC_016844	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
5	NC_016844	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	378974635
6	NC_016844	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	378974636
7	NC_016844	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	378974636
8	NC_016844	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	378974637
9	NC_016844	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	378974637
10	NC_016844	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	378974637
11	NC_016844	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	378974637
12	NC_016844	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	378974638
13	NC_016844	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	378974638
14	NC_016844	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016844	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	378974639
16	NC_016844	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	378974639
17	NC_016844	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	378974639
18	NC_016844	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	378974639
19	NC_016844	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	378974639
20	NC_016844	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	378974641
21	NC_016844	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	378974641
22	NC_016844	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	378974641
23	NC_016844	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016844	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016844	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016844	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016844	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016844	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016844	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016844	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	378974642
31	NC_016844	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	378974642
32	NC_016844	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
33	NC_016844	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
34	NC_016844	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	378974642
35	NC_016844	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	378974642
36	NC_016844	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
37	NC_016844	GA	3	6	12510	12515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016844	GT	3	6	12518	12523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016844	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
40	NC_016844	GC	3	6	13059	13064	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
41	NC_016844	GT	3	6	13142	13147	0 %	50 %	50 %	0 %	378974643
42	NC_016844	CA	4	8	13234	13241	50 %	0 %	0 %	50 %	378974643
43	NC_016844	GA	3	6	13318	13323	50 %	0 %	50 %	0 %	378974643
44	NC_016844	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
45	NC_016844	CT	4	8	13578	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	378974643
46	NC_016844	GC	3	6	14265	14270	0 %	0 %	50 %	50 %	378974644
47	NC_016844	CG	3	6	14299	14304	0 %	0 %	50 %	50 %	378974644
48	NC_016844	AT	3	6	14542	14547	50 %	50 %	0 %	0 %	378974644
49	NC_016844	TG	3	6	15952	15957	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
50	NC_016844	CG	3	6	16387	16392	0 %	0 %	50 %	50 %	378974645
51	NC_016844	CG	3	6	16494	16499	0 %	0 %	50 %	50 %	378974645
52	NC_016844	GT	4	8	16825	16832	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
53	NC_016844	CA	3	6	16834	16839	50 %	0 %	0 %	50 %	378974645
54	NC_016844	GT	3	6	17215	17220	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
55	NC_016844	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	378974645
56	NC_016844	AG	3	6	17367	17372	50 %	0 %	50 %	0 %	378974645
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58	NC_016844	CG	4	8	17521	17528	0 %	0 %	50 %	50 %	378974645
59	NC_016844	GT	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
60	NC_016844	AT	3	6	18648	18653	50 %	50 %	0 %	0 %	378974646
61	NC_016844	GT	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	378974646
62	NC_016844	GC	3	6	18754	18759	0 %	0 %	50 %	50 %	378974646
63	NC_016844	CG	3	6	19427	19432	0 %	0 %	50 %	50 %	378974647
64	NC_016844	CG	3	6	19909	19914	0 %	0 %	50 %	50 %	378974647
65	NC_016844	GT	3	6	20342	20347	0 %	50 %	50 %	0 %	378974647
66	NC_016844	CG	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	378974647
67	NC_016844	CT	4	8	21104	21111	0 %	50 %	0 %	50 %	378974647
68	NC_016844	GC	3	6	21123	21128	0 %	0 %	50 %	50 %	378974647
69	NC_016844	GA	3	6	21663	21668	50 %	0 %	50 %	0 %	378974647
70	NC_016844	CA	3	6	21857	21862	50 %	0 %	0 %	50 %	378974647
71	NC_016844	CG	3	6	22422	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	378974648
72	NC_016844	AC	3	6	22429	22434	50 %	0 %	0 %	50 %	378974648
73	NC_016844	GT	3	6	22592	22597	0 %	50 %	50 %	0 %	378974648
74	NC_016844	CG	3	6	23212	23217	0 %	0 %	50 %	50 %	378974648
75	NC_016844	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	378974648
76	NC_016844	GA	4	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016844	CA	3	6	24383	24388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016844	TC	3	6	24424	24429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016844	GA	4	8	24489	24496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016844	TC	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016844	AG	3	6	25790	25795	50 %	0 %	50 %	0 %	378974650
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89	NC_016844	GT	4	8	27806	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
90	NC_016844	GT	3	6	28047	28052	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
91	NC_016844	AT	4	8	28140	28147	50 %	50 %	0 %	0 %	378974651
92	NC_016844	GT	3	6	28493	28498	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
93	NC_016844	TG	3	6	28508	28513	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
94	NC_016844	AT	3	6	28935	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016844	GC	3	6	29213	29218	0 %	0 %	50 %	50 %	378974652
96	NC_016844	TC	3	6	29584	29589	0 %	50 %	0 %	50 %	378974652
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104	NC_016844	GT	3	6	32400	32405	0 %	50 %	50 %	0 %	378974653
105	NC_016844	AC	3	6	32441	32446	50 %	0 %	0 %	50 %	378974653
106	NC_016844	GC	3	6	32985	32990	0 %	0 %	50 %	50 %	378974654
107	NC_016844	AG	3	6	33097	33102	50 %	0 %	50 %	0 %	378974654
108	NC_016844	AG	3	6	33106	33111	50 %	0 %	50 %	0 %	378974654
109	NC_016844	CG	3	6	33307	33312	0 %	0 %	50 %	50 %	378974654
110	NC_016844	AC	3	6	33732	33737	50 %	0 %	0 %	50 %	378974654
111	NC_016844	CG	3	6	33998	34003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016844	GT	3	6	34190	34195	0 %	50 %	50 %	0 %	378974655
113	NC_016844	CG	4	8	34814	34821	0 %	0 %	50 %	50 %	378974655
114	NC_016844	GC	3	6	34997	35002	0 %	0 %	50 %	50 %	378974655
115	NC_016844	GC	3	6	35052	35057	0 %	0 %	50 %	50 %	378974655
116	NC_016844	AT	3	6	35126	35131	50 %	50 %	0 %	0 %	378974655
117	NC_016844	TA	3	6	35215	35220	50 %	50 %	0 %	0 %	378974655
118	NC_016844	TG	3	6	35371	35376	0 %	50 %	50 %	0 %	378974655
119	NC_016844	GC	3	6	35441	35446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016844	TG	3	6	35491	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	378974656
121	NC_016844	CT	3	6	35669	35674	0 %	50 %	0 %	50 %	378974656
122	NC_016844	GT	4	8	35869	35876	0 %	50 %	50 %	0 %	378974656
123	NC_016844	GC	3	6	36016	36021	0 %	0 %	50 %	50 %	378974656
124	NC_016844	CA	4	8	36065	36072	50 %	0 %	0 %	50 %	378974656
125	NC_016844	AC	3	6	36093	36098	50 %	0 %	0 %	50 %	378974656
126	NC_016844	TG	3	6	36109	36114	0 %	50 %	50 %	0 %	378974656
127	NC_016844	CG	3	6	36636	36641	0 %	0 %	50 %	50 %	378974656
128	NC_016844	TG	3	6	36893	36898	0 %	50 %	50 %	0 %	378974657
129	NC_016844	GT	3	6	36967	36972	0 %	50 %	50 %	0 %	378974657
130	NC_016844	CA	3	6	37017	37022	50 %	0 %	0 %	50 %	378974657
131	NC_016844	GC	3	6	37522	37527	0 %	0 %	50 %	50 %	378974657
132	NC_016844	TG	3	6	37976	37981	0 %	50 %	50 %	0 %	378974657
133	NC_016844	GC	3	6	38086	38091	0 %	0 %	50 %	50 %	378974657
134	NC_016844	CT	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	378974658
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136	NC_016844	GT	3	6	40601	40606	0 %	50 %	50 %	0 %	378974660
137	NC_016844	TG	3	6	41097	41102	0 %	50 %	50 %	0 %	378974661
138	NC_016844	AT	3	6	41280	41285	50 %	50 %	0 %	0 %	378974661
139	NC_016844	CA	3	6	41617	41622	50 %	0 %	0 %	50 %	378974661
140	NC_016844	CA	3	6	41649	41654	50 %	0 %	0 %	50 %	378974661
141	NC_016844	CA	3	6	41696	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	378974661
142	NC_016844	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	378974662
143	NC_016844	CT	3	6	42795	42800	0 %	50 %	0 %	50 %	378974662
144	NC_016844	AG	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	378974662
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