MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016844	A	7	7	194708	194714	100 %	0 %	0 %	0 %	378974811
4002	NC_016844	AC	3	6	194738	194743	50 %	0 %	0 %	50 %	378974811
4003	NC_016844	T	6	6	194797	194802	0 %	100 %	0 %	0 %	378974811
4004	NC_016844	A	6	6	195020	195025	100 %	0 %	0 %	0 %	378974811
4005	NC_016844	A	7	7	195053	195059	100 %	0 %	0 %	0 %	378974811
4006	NC_016844	GAT	2	6	195068	195073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974811
4007	NC_016844	GAA	2	6	195127	195132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974811
4008	NC_016844	ATA	2	6	195153	195158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974811
4009	NC_016844	GCA	2	6	195221	195226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974811
4010	NC_016844	A	6	6	195283	195288	100 %	0 %	0 %	0 %	378974811
4011	NC_016844	GCAG	2	8	195306	195313	25 %	0 %	50 %	25 %	378974811
4012	NC_016844	TTCT	2	8	195316	195323	0 %	75 %	0 %	25 %	378974811
4013	NC_016844	GAGTG	2	10	195348	195357	20 %	20 %	60 %	0 %	378974811
4014	NC_016844	AAG	2	6	195372	195377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974811
4015	NC_016844	TG	4	8	195392	195399	0 %	50 %	50 %	0 %	378974811
4016	NC_016844	T	8	8	195489	195496	0 %	100 %	0 %	0 %	378974811
4017	NC_016844	T	6	6	195587	195592	0 %	100 %	0 %	0 %	378974812
4018	NC_016844	AGT	2	6	195708	195713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974812
4019	NC_016844	CGG	2	6	195748	195753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974812
4020	NC_016844	GTAC	2	8	195821	195828	25 %	25 %	25 %	25 %	378974812
4021	NC_016844	GGT	2	6	195836	195841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974812
4022	NC_016844	GAAG	2	8	195991	195998	50 %	0 %	50 %	0 %	378974812
4023	NC_016844	CGTG	2	8	196007	196014	0 %	25 %	50 %	25 %	378974812
4024	NC_016844	AAAT	2	8	196052	196059	75 %	25 %	0 %	0 %	378974812
4025	NC_016844	AGAA	2	8	196154	196161	75 %	0 %	25 %	0 %	378974812
4026	NC_016844	AC	3	6	196212	196217	50 %	0 %	0 %	50 %	378974812
4027	NC_016844	GGA	2	6	196220	196225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974812
4028	NC_016844	ACA	2	6	196245	196250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974812
4029	NC_016844	CCGT	2	8	196298	196305	0 %	25 %	25 %	50 %	378974812
4030	NC_016844	GAG	2	6	196358	196363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974812
4031	NC_016844	CA	4	8	196420	196427	50 %	0 %	0 %	50 %	378974812
4032	NC_016844	A	6	6	196471	196476	100 %	0 %	0 %	0 %	378974812
4033	NC_016844	GC	3	6	196592	196597	0 %	0 %	50 %	50 %	378974812
4034	NC_016844	ATTA	2	8	196663	196670	50 %	50 %	0 %	0 %	378974812
4035	NC_016844	AGAA	2	8	196671	196678	75 %	0 %	25 %	0 %	378974812
4036	NC_016844	TTA	2	6	196827	196832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974812
4037	NC_016844	GCG	2	6	196840	196845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974812
4038	NC_016844	CTT	2	6	196883	196888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974812
4039	NC_016844	GGA	2	6	196949	196954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974813
4040	NC_016844	CGTC	2	8	196955	196962	0 %	25 %	25 %	50 %	378974813
4041	NC_016844	GC	3	6	196964	196969	0 %	0 %	50 %	50 %	378974813
4042	NC_016844	AGT	2	6	196971	196976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974813
4043	NC_016844	TGA	2	6	196988	196993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974813
4044	NC_016844	GAA	2	6	197080	197085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974813
4045	NC_016844	CAG	2	6	197173	197178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974813
4046	NC_016844	GAA	2	6	197204	197209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974813
4047	NC_016844	CGG	2	6	197210	197215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974813
4048	NC_016844	G	6	6	197214	197219	0 %	0 %	100 %	0 %	378974813
4049	NC_016844	AGC	2	6	197294	197299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974813
4050	NC_016844	GC	3	6	197358	197363	0 %	0 %	50 %	50 %	378974813
4051	NC_016844	ACGC	2	8	197385	197392	25 %	0 %	25 %	50 %	378974813
4052	NC_016844	CTC	2	6	197394	197399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974813
4053	NC_016844	CCTG	2	8	197573	197580	0 %	25 %	25 %	50 %	378974813
4054	NC_016844	GTC	2	6	197587	197592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974813
4055	NC_016844	GCAG	2	8	197602	197609	25 %	0 %	50 %	25 %	378974813
4056	NC_016844	AGG	2	6	197620	197625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974813
4057	NC_016844	GTG	3	9	197653	197661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974813
4058	NC_016844	GAGAAA	2	12	197706	197717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974813
4059	NC_016844	CG	3	6	197721	197726	0 %	0 %	50 %	50 %	378974813
4060	NC_016844	GA	3	6	197736	197741	50 %	0 %	50 %	0 %	378974813
4061	NC_016844	GTA	2	6	197775	197780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974813
4062	NC_016844	GC	4	8	197818	197825	0 %	0 %	50 %	50 %	378974813
4063	NC_016844	CTC	2	6	197900	197905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974814
4064	NC_016844	TCT	2	6	197908	197913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974814
4065	NC_016844	AGC	2	6	197931	197936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4066	NC_016844	TCG	2	6	197967	197972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4067	NC_016844	GGC	2	6	198092	198097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974814
4068	NC_016844	TCG	3	9	198201	198209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4069	NC_016844	GCT	2	6	198232	198237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4070	NC_016844	GGA	2	6	198263	198268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974814
4071	NC_016844	TGT	2	6	198402	198407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974814
4072	NC_016844	CG	3	6	198427	198432	0 %	0 %	50 %	50 %	378974814
4073	NC_016844	GTC	2	6	198443	198448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4074	NC_016844	CTC	2	6	198449	198454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974814
4075	NC_016844	CAC	2	6	198514	198519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974814
4076	NC_016844	TGA	2	6	198571	198576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974814
4077	NC_016844	TCGTC	2	10	198610	198619	0 %	40 %	20 %	40 %	378974814
4078	NC_016844	ATC	2	6	198623	198628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974814
4079	NC_016844	TTCC	2	8	198661	198668	0 %	50 %	0 %	50 %	378974814
4080	NC_016844	CTG	2	6	198759	198764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4081	NC_016844	GAA	2	6	198915	198920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974814
4082	NC_016844	CGT	2	6	198973	198978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4083	NC_016844	GTC	2	6	198998	199003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4084	NC_016844	GTG	2	6	199011	199016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974814
4085	NC_016844	TGC	2	6	199042	199047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4086	NC_016844	CG	3	6	199051	199056	0 %	0 %	50 %	50 %	378974814
4087	NC_016844	GGC	2	6	199062	199067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974814
4088	NC_016844	GTC	2	6	199112	199117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4089	NC_016844	TCG	2	6	199146	199151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4090	NC_016844	ACG	2	6	199153	199158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4091	NC_016844	GCC	2	6	199197	199202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974814
4092	NC_016844	GGA	3	9	199208	199216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974814
4093	NC_016844	CGAG	2	8	199245	199252	25 %	0 %	50 %	25 %	378974814
4094	NC_016844	TCC	2	6	199260	199265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974814
4095	NC_016844	CAA	2	6	199276	199281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974814
4096	NC_016844	CCGCA	2	10	199337	199346	20 %	0 %	20 %	60 %	378974814
4097	NC_016844	CG	3	6	199351	199356	0 %	0 %	50 %	50 %	378974814
4098	NC_016844	CGG	2	6	199433	199438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974814
4099	NC_016844	CTG	2	6	199525	199530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974814
4100	NC_016844	CA	3	6	199573	199578	50 %	0 %	0 %	50 %	378974814
4101	NC_016844	T	6	6	199630	199635	0 %	100 %	0 %	0 %	378974814
4102	NC_016844	CAA	2	6	199636	199641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974814
4103	NC_016844	CG	3	6	199683	199688	0 %	0 %	50 %	50 %	378974814
4104	NC_016844	CCT	2	6	199723	199728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_016844	G	9	9	199732	199740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016844	GTA	2	6	199831	199836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974815
4107	NC_016844	G	6	6	199895	199900	0 %	0 %	100 %	0 %	378974815
4108	NC_016844	TG	3	6	199901	199906	0 %	50 %	50 %	0 %	378974815
4109	NC_016844	GGT	2	6	199989	199994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974815
4110	NC_016844	CG	3	6	200056	200061	0 %	0 %	50 %	50 %	378974815
4111	NC_016844	TTG	2	6	200138	200143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974815
4112	NC_016844	CTT	2	6	200196	200201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974815
4113	NC_016844	GTC	2	6	200203	200208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974815
4114	NC_016844	GCT	2	6	200217	200222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974815
4115	NC_016844	GC	3	6	200231	200236	0 %	0 %	50 %	50 %	378974815
4116	NC_016844	GCT	2	6	200273	200278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974816
4117	NC_016844	GA	3	6	200416	200421	50 %	0 %	50 %	0 %	378974816
4118	NC_016844	TGGCC	2	10	200510	200519	0 %	20 %	40 %	40 %	378974816
4119	NC_016844	TGC	2	6	200532	200537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974816
4120	NC_016844	CTG	2	6	200574	200579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974816
4121	NC_016844	GCC	2	6	200653	200658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974816
4122	NC_016844	GCG	2	6	200795	200800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974816
4123	NC_016844	TCCC	2	8	200840	200847	0 %	25 %	0 %	75 %	378974816
4124	NC_016844	CTC	2	6	200893	200898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974817
4125	NC_016844	GTT	2	6	200977	200982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974817
4126	NC_016844	CCT	2	6	201021	201026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974817
4127	NC_016844	CTGTG	2	10	201207	201216	0 %	40 %	40 %	20 %	378974817
4128	NC_016844	TTC	2	6	201253	201258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974817
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4130	NC_016844	TCTG	2	8	201290	201297	0 %	50 %	25 %	25 %	378974817
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4233	NC_016844	GT	3	6	205791	205796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_016844	GGTG	2	8	205814	205821	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_016844	GA	3	6	205855	205860	50 %	0 %	50 %	0 %	378974822
4236	NC_016844	CG	4	8	205910	205917	0 %	0 %	50 %	50 %	378974822
4237	NC_016844	GGCG	2	8	205938	205945	0 %	0 %	75 %	25 %	378974822
4238	NC_016844	CTC	2	6	206006	206011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974822
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4240	NC_016844	TGAT	2	8	206063	206070	25 %	50 %	25 %	0 %	378974822
4241	NC_016844	ATC	2	6	206071	206076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974822
4242	NC_016844	TGA	2	6	206093	206098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974822
4243	NC_016844	GT	4	8	206158	206165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_016844	AGGT	2	8	206192	206199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_016844	TGGT	2	8	206202	206209	0 %	50 %	50 %	0 %	378974823
4246	NC_016844	CGGTGA	2	12	206268	206279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974823
4247	NC_016844	GTG	2	6	206297	206302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974823
4248	NC_016844	GAA	2	6	206365	206370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974823
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4250	NC_016844	TG	4	8	206518	206525	0 %	50 %	50 %	0 %	378974823
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4374	NC_016844	TGA	2	6	213014	213019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974838
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4376	NC_016844	GTAA	2	8	213255	213262	50 %	25 %	25 %	0 %	378974838
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4386	NC_016844	CCTG	2	8	214078	214085	0 %	25 %	25 %	50 %	378974840
4387	NC_016844	TAT	2	6	214098	214103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974840
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4485	NC_016844	GAA	2	6	219168	219173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4498	NC_016844	GC	3	6	219904	219909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4499	NC_016844	GCAG	2	8	219913	219920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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