MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016844	TCG	2	6	148325	148330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_016844	C	9	9	148349	148357	0 %	0 %	0 %	100 %	378974760
3003	NC_016844	GTTC	2	8	148387	148394	0 %	50 %	25 %	25 %	378974760
3004	NC_016844	CG	3	6	148396	148401	0 %	0 %	50 %	50 %	378974760
3005	NC_016844	GCA	2	6	148406	148411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974760
3006	NC_016844	CG	3	6	148412	148417	0 %	0 %	50 %	50 %	378974760
3007	NC_016844	CGGCTG	2	12	148597	148608	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974760
3008	NC_016844	TTC	2	6	148868	148873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974760
3009	NC_016844	CTTGC	2	10	148903	148912	0 %	40 %	20 %	40 %	378974760
3010	NC_016844	TTC	2	6	149037	149042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974761
3011	NC_016844	GCG	2	6	149051	149056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974761
3012	NC_016844	GC	3	6	149103	149108	0 %	0 %	50 %	50 %	378974761
3013	NC_016844	TCTT	2	8	149202	149209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_016844	TGC	2	6	149236	149241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016844	GGT	2	6	149285	149290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016844	GCG	2	6	149445	149450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974762
3017	NC_016844	AGC	2	6	149496	149501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974762
3018	NC_016844	TG	3	6	149528	149533	0 %	50 %	50 %	0 %	378974762
3019	NC_016844	GC	3	6	149541	149546	0 %	0 %	50 %	50 %	378974762
3020	NC_016844	CTG	3	9	149556	149564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974762
3021	NC_016844	AGGC	2	8	149602	149609	25 %	0 %	50 %	25 %	378974762
3022	NC_016844	TCC	2	6	149634	149639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974762
3023	NC_016844	CCA	2	6	149659	149664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974762
3024	NC_016844	GTC	2	6	149691	149696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974762
3025	NC_016844	GTG	2	6	149710	149715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974762
3026	NC_016844	GCA	3	9	149761	149769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974762
3027	NC_016844	GTTT	2	8	149890	149897	0 %	75 %	25 %	0 %	378974763
3028	NC_016844	TAC	2	6	149999	150004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974763
3029	NC_016844	TGT	2	6	150060	150065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974763
3030	NC_016844	GT	3	6	150115	150120	0 %	50 %	50 %	0 %	378974763
3031	NC_016844	G	9	9	150147	150155	0 %	0 %	100 %	0 %	378974763
3032	NC_016844	ACT	2	6	150240	150245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974764
3033	NC_016844	CGGA	2	8	150438	150445	25 %	0 %	50 %	25 %	378974764
3034	NC_016844	GTT	2	6	150532	150537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016844	GGCTGG	4	24	150538	150561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3036	NC_016844	GTAC	2	8	150583	150590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_016844	GCT	2	6	150656	150661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016844	TCC	2	6	150690	150695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974765
3039	NC_016844	T	6	6	150763	150768	0 %	100 %	0 %	0 %	378974765
3040	NC_016844	GC	3	6	150784	150789	0 %	0 %	50 %	50 %	378974765
3041	NC_016844	GAC	2	6	150838	150843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974765
3042	NC_016844	GCA	2	6	150854	150859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974765
3043	NC_016844	GCTT	2	8	150860	150867	0 %	50 %	25 %	25 %	378974765
3044	NC_016844	CCG	2	6	150875	150880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974765
3045	NC_016844	CTG	2	6	150900	150905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974765
3046	NC_016844	GTTTG	2	10	150916	150925	0 %	60 %	40 %	0 %	378974765
3047	NC_016844	G	6	6	150944	150949	0 %	0 %	100 %	0 %	378974765
3048	NC_016844	TCC	2	6	150974	150979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974765
3049	NC_016844	CCA	2	6	150999	151004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974765
3050	NC_016844	T	7	7	151005	151011	0 %	100 %	0 %	0 %	378974765
3051	NC_016844	GCGG	2	8	151108	151115	0 %	0 %	75 %	25 %	378974766
3052	NC_016844	GTC	2	6	151212	151217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974766
3053	NC_016844	CGGCTC	2	12	151235	151246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974766
3054	NC_016844	T	6	6	151268	151273	0 %	100 %	0 %	0 %	378974766
3055	NC_016844	GC	3	6	151289	151294	0 %	0 %	50 %	50 %	378974766
3056	NC_016844	GCA	3	9	151338	151346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974766
3057	NC_016844	T	6	6	151349	151354	0 %	100 %	0 %	0 %	378974766
3058	NC_016844	CCG	2	6	151362	151367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974766
3059	NC_016844	GAC	2	6	151394	151399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974766
3060	NC_016844	CCA	2	6	151450	151455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974766
3061	NC_016844	TCTT	2	8	151541	151548	0 %	75 %	0 %	25 %	378974767
3062	NC_016844	GTT	2	6	151743	151748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016844	CTGCGG	4	24	151751	151774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_016844	CG	3	6	151827	151832	0 %	0 %	50 %	50 %	378974769
3065	NC_016844	AGC	2	6	151870	151875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974769
3066	NC_016844	AGC	2	6	151879	151884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974769
3067	NC_016844	CCG	2	6	151910	151915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974769
3068	NC_016844	CTG	2	6	151932	151937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974769
3069	NC_016844	TG	3	6	152002	152007	0 %	50 %	50 %	0 %	378974769
3070	NC_016844	CCT	2	6	152008	152013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974769
3071	NC_016844	CCA	2	6	152032	152037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974769
3072	NC_016844	CA	3	6	152093	152098	50 %	0 %	0 %	50 %	378974769
3073	NC_016844	GCGG	2	8	152223	152230	0 %	0 %	75 %	25 %	378974769
3074	NC_016844	CGGCTC	2	12	152256	152267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_016844	AGCA	2	8	152398	152405	50 %	0 %	25 %	25 %	378974770
3076	NC_016844	TTCA	2	8	152485	152492	25 %	50 %	0 %	25 %	378974770
3077	NC_016844	TAA	2	6	152511	152516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974770
3078	NC_016844	TG	4	8	152548	152555	0 %	50 %	50 %	0 %	378974770
3079	NC_016844	CAC	2	6	152597	152602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974770
3080	NC_016844	GGTG	2	8	152742	152749	0 %	25 %	75 %	0 %	378974770
3081	NC_016844	AGT	2	6	152799	152804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974770
3082	NC_016844	AGA	2	6	152872	152877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974770
3083	NC_016844	GC	3	6	152933	152938	0 %	0 %	50 %	50 %	378974770
3084	NC_016844	GC	3	6	153048	153053	0 %	0 %	50 %	50 %	378974770
3085	NC_016844	AGC	2	6	153106	153111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974770
3086	NC_016844	TGG	2	6	153154	153159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974770
3087	NC_016844	CAT	2	6	153160	153165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974770
3088	NC_016844	CT	4	8	153234	153241	0 %	50 %	0 %	50 %	378974770
3089	NC_016844	CCT	2	6	153335	153340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974770
3090	NC_016844	TGTTT	2	10	153358	153367	0 %	80 %	20 %	0 %	378974770
3091	NC_016844	AGC	2	6	153440	153445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974770
3092	NC_016844	GTG	2	6	153506	153511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974770
3093	NC_016844	AGGA	2	8	153539	153546	50 %	0 %	50 %	0 %	378974770
3094	NC_016844	CCGGAG	2	12	153614	153625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974770
3095	NC_016844	CA	3	6	153703	153708	50 %	0 %	0 %	50 %	378974770
3096	NC_016844	GGAA	2	8	153762	153769	50 %	0 %	50 %	0 %	378974770
3097	NC_016844	AGA	2	6	153808	153813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974770
3098	NC_016844	CAGCTG	2	12	153838	153849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974770
3099	NC_016844	CGG	2	6	153878	153883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974770
3100	NC_016844	TTC	2	6	153977	153982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974770
3101	NC_016844	GAGT	2	8	154029	154036	25 %	25 %	50 %	0 %	378974770
3102	NC_016844	AGC	2	6	154054	154059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974770
3103	NC_016844	CCTG	2	8	154095	154102	0 %	25 %	25 %	50 %	378974770
3104	NC_016844	CACT	2	8	154105	154112	25 %	25 %	0 %	50 %	378974770
3105	NC_016844	CTC	2	6	154117	154122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_016844	C	9	9	154137	154145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3107	NC_016844	TAAAAA	2	12	154169	154180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016844	CG	3	6	154311	154316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_016844	GCG	2	6	154369	154374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974771
3110	NC_016844	TCGT	2	8	154405	154412	0 %	50 %	25 %	25 %	378974771
3111	NC_016844	GGTCT	2	10	154433	154442	0 %	40 %	40 %	20 %	378974771
3112	NC_016844	T	7	7	154490	154496	0 %	100 %	0 %	0 %	378974771
3113	NC_016844	TAC	2	6	154535	154540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974771
3114	NC_016844	CTTC	2	8	154610	154617	0 %	50 %	0 %	50 %	378974771
3115	NC_016844	TC	3	6	154673	154678	0 %	50 %	0 %	50 %	378974771
3116	NC_016844	TCG	2	6	154711	154716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974771
3117	NC_016844	GAA	2	6	154728	154733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974771
3118	NC_016844	TG	3	6	154772	154777	0 %	50 %	50 %	0 %	378974771
3119	NC_016844	GCT	2	6	154795	154800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974771
3120	NC_016844	T	6	6	154848	154853	0 %	100 %	0 %	0 %	378974771
3121	NC_016844	CGT	2	6	154898	154903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974771
3122	NC_016844	CGG	2	6	154920	154925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974771
3123	NC_016844	TTC	2	6	154932	154937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974771
3124	NC_016844	AC	4	8	154975	154982	50 %	0 %	0 %	50 %	378974771
3125	NC_016844	TGG	2	6	154988	154993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974771
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3236	NC_016844	CTG	2	6	159542	159547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_016844	TGCG	2	8	159960	159967	0 %	25 %	50 %	25 %	378974776
3245	NC_016844	GAT	2	6	160003	160008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974776
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3248	NC_016844	GCA	2	6	160182	160187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974776
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3250	NC_016844	CTTT	2	8	160209	160216	0 %	75 %	0 %	25 %	378974776
3251	NC_016844	AGC	3	9	160264	160272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974776
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3366	NC_016844	A	9	9	165625	165633	100 %	0 %	0 %	0 %	378974782
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