MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016844	TCG	2	6	76450	76455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974701
1502	NC_016844	AT	3	6	76469	76474	50 %	50 %	0 %	0 %	378974701
1503	NC_016844	TCA	2	6	76504	76509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974701
1504	NC_016844	AAG	2	6	76512	76517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974701
1505	NC_016844	CGT	2	6	76534	76539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974701
1506	NC_016844	C	6	6	76558	76563	0 %	0 %	0 %	100 %	378974701
1507	NC_016844	GC	3	6	76589	76594	0 %	0 %	50 %	50 %	378974701
1508	NC_016844	GAAAA	2	10	76668	76677	80 %	0 %	20 %	0 %	378974701
1509	NC_016844	ACGT	2	8	76685	76692	25 %	25 %	25 %	25 %	378974701
1510	NC_016844	TTA	2	6	76774	76779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974701
1511	NC_016844	CGA	2	6	76780	76785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974701
1512	NC_016844	CAT	2	6	76881	76886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974701
1513	NC_016844	AAT	2	6	76917	76922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974701
1514	NC_016844	CA	3	6	76940	76945	50 %	0 %	0 %	50 %	378974701
1515	NC_016844	T	6	6	76980	76985	0 %	100 %	0 %	0 %	378974701
1516	NC_016844	AAG	2	6	77001	77006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974701
1517	NC_016844	T	9	9	77012	77020	0 %	100 %	0 %	0 %	378974701
1518	NC_016844	CTC	2	6	77115	77120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974701
1519	NC_016844	GCG	2	6	77127	77132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974701
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1521	NC_016844	GCA	2	6	77179	77184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974701
1522	NC_016844	CTTT	2	8	77251	77258	0 %	75 %	0 %	25 %	378974701
1523	NC_016844	GA	3	6	77262	77267	50 %	0 %	50 %	0 %	378974701
1524	NC_016844	GGC	2	6	77348	77353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974701
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1530	NC_016844	AT	3	6	77581	77586	50 %	50 %	0 %	0 %	378974701
1531	NC_016844	CG	3	6	77633	77638	0 %	0 %	50 %	50 %	378974701
1532	NC_016844	GT	3	6	77704	77709	0 %	50 %	50 %	0 %	378974701
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1539	NC_016844	T	6	6	78020	78025	0 %	100 %	0 %	0 %	378974701
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1543	NC_016844	GGC	2	6	78312	78317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974701
1544	NC_016844	GCG	2	6	78339	78344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974701
1545	NC_016844	T	6	6	78392	78397	0 %	100 %	0 %	0 %	378974701
1546	NC_016844	GA	3	6	78407	78412	50 %	0 %	50 %	0 %	378974701
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1549	NC_016844	CTGT	2	8	78535	78542	0 %	50 %	25 %	25 %	378974701
1550	NC_016844	T	6	6	78575	78580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016844	T	6	6	78596	78601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016844	AGT	2	6	78627	78632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016844	A	6	6	78756	78761	100 %	0 %	0 %	0 %	378974702
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1556	NC_016844	TGA	2	6	78916	78921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974702
1557	NC_016844	GAA	2	6	78925	78930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974702
1558	NC_016844	ACG	2	6	78966	78971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974702
1559	NC_016844	GT	3	6	79039	79044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016844	GTC	2	6	79058	79063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_016844	GCT	2	6	79118	79123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974703
1562	NC_016844	GCT	2	6	79150	79155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974703
1563	NC_016844	GAA	2	6	79172	79177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974703
1564	NC_016844	GAG	2	6	79181	79186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974703
1565	NC_016844	GCGCC	2	10	79357	79366	0 %	0 %	40 %	60 %	378974703
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1570	NC_016844	TCG	2	6	79617	79622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974703
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1588	NC_016844	ACA	2	6	80616	80621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974703
1589	NC_016844	CG	3	6	80622	80627	0 %	0 %	50 %	50 %	378974703
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1592	NC_016844	GCGT	2	8	80859	80866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_016844	TGGTG	2	10	80871	80880	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_016844	CGTGT	2	10	81013	81022	0 %	40 %	40 %	20 %	378974705
1599	NC_016844	CTT	2	6	81031	81036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974705
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1603	NC_016844	GC	3	6	81228	81233	0 %	0 %	50 %	50 %	378974705
1604	NC_016844	GTG	2	6	81271	81276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974705
1605	NC_016844	CG	3	6	81325	81330	0 %	0 %	50 %	50 %	378974705
1606	NC_016844	T	6	6	81354	81359	0 %	100 %	0 %	0 %	378974705
1607	NC_016844	ATG	2	6	81568	81573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974705
1608	NC_016844	CG	3	6	81606	81611	0 %	0 %	50 %	50 %	378974705
1609	NC_016844	CAG	2	6	81648	81653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974705
1610	NC_016844	TAC	2	6	81670	81675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974705
1611	NC_016844	CGC	2	6	81677	81682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974705
1612	NC_016844	GTGC	2	8	81954	81961	0 %	25 %	50 %	25 %	378974705
1613	NC_016844	GGC	2	6	81972	81977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974705
1614	NC_016844	CA	3	6	81994	81999	50 %	0 %	0 %	50 %	378974705
1615	NC_016844	TGC	2	6	82004	82009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974705
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1617	NC_016844	GTG	2	6	82068	82073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974705
1618	NC_016844	G	6	6	82207	82212	0 %	0 %	100 %	0 %	378974705
1619	NC_016844	GTGA	2	8	82260	82267	25 %	25 %	50 %	0 %	378974705
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1622	NC_016844	CGT	2	6	82317	82322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974705
1623	NC_016844	CGCA	2	8	82327	82334	25 %	0 %	25 %	50 %	378974705
1624	NC_016844	TCT	3	9	82356	82364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_016844	AG	3	6	82372	82377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016844	T	7	7	82587	82593	0 %	100 %	0 %	0 %	378974706
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