MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016844	GAA	2	6	50709	50714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974670
1002	NC_016844	GCGCA	2	10	50737	50746	20 %	0 %	40 %	40 %	378974670
1003	NC_016844	CA	3	6	50782	50787	50 %	0 %	0 %	50 %	378974670
1004	NC_016844	GCAG	2	8	50847	50854	25 %	0 %	50 %	25 %	378974670
1005	NC_016844	GCA	2	6	50873	50878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1006	NC_016844	CTA	2	6	50927	50932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974670
1007	NC_016844	GTT	2	6	50946	50951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974670
1008	NC_016844	TGC	2	6	51002	51007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1009	NC_016844	GA	3	6	51102	51107	50 %	0 %	50 %	0 %	378974670
1010	NC_016844	TTG	3	9	51114	51122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974670
1011	NC_016844	TC	3	6	51164	51169	0 %	50 %	0 %	50 %	378974670
1012	NC_016844	AGC	2	6	51182	51187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1013	NC_016844	GCG	2	6	51315	51320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974670
1014	NC_016844	AAG	2	6	51348	51353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974670
1015	NC_016844	GGC	2	6	51397	51402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974670
1016	NC_016844	TTCT	2	8	51461	51468	0 %	75 %	0 %	25 %	378974670
1017	NC_016844	TTG	2	6	51478	51483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974670
1018	NC_016844	CAC	2	6	51490	51495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974670
1019	NC_016844	GCA	2	6	51557	51562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1020	NC_016844	CG	4	8	51626	51633	0 %	0 %	50 %	50 %	378974670
1021	NC_016844	AGA	2	6	51668	51673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974670
1022	NC_016844	GC	3	6	51678	51683	0 %	0 %	50 %	50 %	378974670
1023	NC_016844	TTC	2	6	51716	51721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974670
1024	NC_016844	TGC	2	6	51740	51745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1025	NC_016844	CA	3	6	51946	51951	50 %	0 %	0 %	50 %	378974670
1026	NC_016844	GC	3	6	52014	52019	0 %	0 %	50 %	50 %	378974670
1027	NC_016844	GAG	2	6	52101	52106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974670
1028	NC_016844	CTG	2	6	52110	52115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1029	NC_016844	TC	3	6	52159	52164	0 %	50 %	0 %	50 %	378974670
1030	NC_016844	GGGC	2	8	52165	52172	0 %	0 %	75 %	25 %	378974670
1031	NC_016844	TGA	2	6	52192	52197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974670
1032	NC_016844	TCG	2	6	52304	52309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974670
1033	NC_016844	CG	3	6	52360	52365	0 %	0 %	50 %	50 %	378974670
1034	NC_016844	A	6	6	52377	52382	100 %	0 %	0 %	0 %	378974670
1035	NC_016844	GAT	2	6	52401	52406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974670
1036	NC_016844	GGA	2	6	52450	52455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974670
1037	NC_016844	TAT	2	6	52491	52496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974670
1038	NC_016844	TGT	2	6	52514	52519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974670
1039	NC_016844	GT	3	6	52518	52523	0 %	50 %	50 %	0 %	378974670
1040	NC_016844	TCT	2	6	52576	52581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016844	TCG	3	9	52627	52635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974671
1042	NC_016844	GTG	2	6	52636	52641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974671
1043	NC_016844	GCG	2	6	52659	52664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974671
1044	NC_016844	TCA	2	6	52699	52704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974671
1045	NC_016844	GGA	2	6	52752	52757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974671
1046	NC_016844	CGG	2	6	52796	52801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974671
1047	NC_016844	ATGC	2	8	52822	52829	25 %	25 %	25 %	25 %	378974671
1048	NC_016844	CAA	2	6	52850	52855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974671
1049	NC_016844	TGCAG	2	10	52868	52877	20 %	20 %	40 %	20 %	378974671
1050	NC_016844	GCA	2	6	52943	52948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974671
1051	NC_016844	TG	3	6	52982	52987	0 %	50 %	50 %	0 %	378974671
1052	NC_016844	GGT	2	6	53075	53080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974671
1053	NC_016844	GT	3	6	53110	53115	0 %	50 %	50 %	0 %	378974671
1054	NC_016844	A	6	6	53189	53194	100 %	0 %	0 %	0 %	378974671
1055	NC_016844	CG	4	8	53231	53238	0 %	0 %	50 %	50 %	378974671
1056	NC_016844	TAC	2	6	53239	53244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974671
1057	NC_016844	AAG	2	6	53278	53283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974671
1058	NC_016844	AATC	2	8	53324	53331	50 %	25 %	0 %	25 %	378974671
1059	NC_016844	ATTA	2	8	53352	53359	50 %	50 %	0 %	0 %	378974671
1060	NC_016844	GA	3	6	53367	53372	50 %	0 %	50 %	0 %	378974671
1061	NC_016844	TA	4	8	53542	53549	50 %	50 %	0 %	0 %	378974671
1062	NC_016844	CG	3	6	53619	53624	0 %	0 %	50 %	50 %	378974671
1063	NC_016844	TTA	2	6	53626	53631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974671
1064	NC_016844	CAAA	2	8	53694	53701	75 %	0 %	0 %	25 %	378974671
1065	NC_016844	GAA	2	6	53754	53759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974671
1066	NC_016844	TAT	2	6	53774	53779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974671
1067	NC_016844	CGCTG	2	10	53792	53801	0 %	20 %	40 %	40 %	378974671
1068	NC_016844	CG	3	6	53804	53809	0 %	0 %	50 %	50 %	378974671
1069	NC_016844	ATC	2	6	53833	53838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974671
1070	NC_016844	CGA	2	6	53855	53860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974671
1071	NC_016844	AT	3	6	53864	53869	50 %	50 %	0 %	0 %	378974671
1072	NC_016844	GAT	2	6	53883	53888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974671
1073	NC_016844	CG	3	6	53930	53935	0 %	0 %	50 %	50 %	378974671
1074	NC_016844	AGA	2	6	54013	54018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974671
1075	NC_016844	CTG	2	6	54022	54027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974671
1076	NC_016844	A	7	7	54040	54046	100 %	0 %	0 %	0 %	378974671
1077	NC_016844	CAA	2	6	54086	54091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974671
1078	NC_016844	GCTAC	2	10	54156	54165	20 %	20 %	20 %	40 %	378974671
1079	NC_016844	TCGCT	2	10	54193	54202	0 %	40 %	20 %	40 %	378974671
1080	NC_016844	GGAA	2	8	54317	54324	50 %	0 %	50 %	0 %	378974671
1081	NC_016844	CG	3	6	54350	54355	0 %	0 %	50 %	50 %	378974671
1082	NC_016844	TC	3	6	54365	54370	0 %	50 %	0 %	50 %	378974671
1083	NC_016844	AGC	2	6	54487	54492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974671
1084	NC_016844	AGA	2	6	54505	54510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016844	CAGG	2	8	54521	54528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_016844	GTAC	2	8	54534	54541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_016844	A	6	6	54634	54639	100 %	0 %	0 %	0 %	378974672
1088	NC_016844	CATC	2	8	54678	54685	25 %	25 %	0 %	50 %	378974672
1089	NC_016844	T	8	8	54687	54694	0 %	100 %	0 %	0 %	378974672
1090	NC_016844	TTTC	2	8	54767	54774	0 %	75 %	0 %	25 %	378974672
1091	NC_016844	CTTT	2	8	54897	54904	0 %	75 %	0 %	25 %	378974672
1092	NC_016844	T	6	6	54902	54907	0 %	100 %	0 %	0 %	378974672
1093	NC_016844	CAT	2	6	55009	55014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974672
1094	NC_016844	TTC	2	6	55144	55149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974672
1095	NC_016844	ACG	2	6	55190	55195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974672
1096	NC_016844	AAT	2	6	55285	55290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974672
1097	NC_016844	TCG	2	6	55301	55306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974672
1098	NC_016844	ACT	2	6	55340	55345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974672
1099	NC_016844	TCGT	2	8	55363	55370	0 %	50 %	25 %	25 %	378974672
1100	NC_016844	ATA	2	6	55423	55428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974672
1101	NC_016844	ATGCT	2	10	55484	55493	20 %	40 %	20 %	20 %	378974673
1102	NC_016844	A	6	6	55536	55541	100 %	0 %	0 %	0 %	378974673
1103	NC_016844	AGG	2	6	55584	55589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974673
1104	NC_016844	GT	3	6	55627	55632	0 %	50 %	50 %	0 %	378974673
1105	NC_016844	ACG	2	6	55638	55643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974673
1106	NC_016844	CAG	2	6	55657	55662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974673
1107	NC_016844	CAC	2	6	55698	55703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974673
1108	NC_016844	AC	3	6	55727	55732	50 %	0 %	0 %	50 %	378974673
1109	NC_016844	GTG	2	6	55746	55751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016844	CA	3	6	55782	55787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_016844	GT	3	6	55794	55799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016844	ACA	2	6	55823	55828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974674
1113	NC_016844	CAT	2	6	55850	55855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974674
1114	NC_016844	ATA	2	6	55870	55875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974674
1115	NC_016844	T	7	7	55878	55884	0 %	100 %	0 %	0 %	378974674
1116	NC_016844	CTG	2	6	55917	55922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1117	NC_016844	CAA	2	6	55932	55937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974674
1118	NC_016844	GC	4	8	55942	55949	0 %	0 %	50 %	50 %	378974674
1119	NC_016844	GCA	2	6	55952	55957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1120	NC_016844	CTA	2	6	55969	55974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974674
1121	NC_016844	CTT	2	6	55981	55986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974674
1122	NC_016844	CTAA	2	8	56043	56050	50 %	25 %	0 %	25 %	378974674
1123	NC_016844	CTT	2	6	56101	56106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974674
1124	NC_016844	GCA	2	6	56181	56186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1125	NC_016844	TATG	2	8	56200	56207	25 %	50 %	25 %	0 %	378974674
1126	NC_016844	TCCT	2	8	56417	56424	0 %	50 %	0 %	50 %	378974674
1127	NC_016844	GCG	2	6	56437	56442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974674
1128	NC_016844	TCC	2	6	56558	56563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974675
1129	NC_016844	GTG	2	6	56717	56722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974675
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1133	NC_016844	TTC	2	6	56863	56868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974675
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1230	NC_016844	CCGCG	2	10	61706	61715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1231	NC_016844	ATC	2	6	61751	61756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974681
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1239	NC_016844	AAAT	2	8	62217	62224	75 %	25 %	0 %	0 %	378974681
1240	NC_016844	CAG	2	6	62258	62263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974681
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1249	NC_016844	C	6	6	62711	62716	0 %	0 %	0 %	100 %	378974681
1250	NC_016844	GC	3	6	62764	62769	0 %	0 %	50 %	50 %	378974681
1251	NC_016844	CAT	2	6	62795	62800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974681
1252	NC_016844	CCT	3	9	62808	62816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_016844	GTA	2	6	62832	62837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_016844	GCG	2	6	62865	62870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_016844	TGTC	2	8	62881	62888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1256	NC_016844	TG	3	6	62906	62911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_016844	CCT	2	6	63022	63027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974682
1258	NC_016844	GCG	2	6	63030	63035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974682
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