MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016844	TGT	2	6	25324	25329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974649
502	NC_016844	GCT	2	6	25357	25362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974649
503	NC_016844	T	9	9	25368	25376	0 %	100 %	0 %	0 %	378974649
504	NC_016844	AGA	2	6	25422	25427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016844	ACA	2	6	25630	25635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974650
506	NC_016844	T	6	6	25663	25668	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
507	NC_016844	TTA	2	6	25684	25689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974650
508	NC_016844	AG	3	6	25790	25795	50 %	0 %	50 %	0 %	378974650
509	NC_016844	GGA	2	6	25800	25805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974650
510	NC_016844	GATT	2	8	25859	25866	25 %	50 %	25 %	0 %	378974650
511	NC_016844	CTT	2	6	25910	25915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974650
512	NC_016844	T	6	6	25914	25919	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
513	NC_016844	AGCG	2	8	25997	26004	25 %	0 %	50 %	25 %	378974650
514	NC_016844	TG	3	6	26026	26031	0 %	50 %	50 %	0 %	378974650
515	NC_016844	GTATC	2	10	26076	26085	20 %	40 %	20 %	20 %	378974650
516	NC_016844	TGG	2	6	26087	26092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974650
517	NC_016844	GCA	2	6	26098	26103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974650
518	NC_016844	TGC	2	6	26112	26117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974650
519	NC_016844	T	6	6	26121	26126	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
520	NC_016844	CTT	2	6	26129	26134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974650
521	NC_016844	TGC	2	6	26156	26161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974650
522	NC_016844	T	6	6	26195	26200	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
523	NC_016844	GTT	2	6	26247	26252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974650
524	NC_016844	GT	3	6	26253	26258	0 %	50 %	50 %	0 %	378974650
525	NC_016844	A	7	7	26446	26452	100 %	0 %	0 %	0 %	378974650
526	NC_016844	GC	3	6	26470	26475	0 %	0 %	50 %	50 %	378974650
527	NC_016844	TCT	2	6	26548	26553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974650
528	NC_016844	T	7	7	26634	26640	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
529	NC_016844	T	6	6	26698	26703	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
530	NC_016844	TGT	2	6	26723	26728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974650
531	NC_016844	CG	3	6	26739	26744	0 %	0 %	50 %	50 %	378974650
532	NC_016844	CCTT	2	8	26833	26840	0 %	50 %	0 %	50 %	378974650
533	NC_016844	GCAC	2	8	26939	26946	25 %	0 %	25 %	50 %	378974650
534	NC_016844	TGC	2	6	26949	26954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974650
535	NC_016844	GGTGG	2	10	26983	26992	0 %	20 %	80 %	0 %	378974650
536	NC_016844	CAA	2	6	27136	27141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974650
537	NC_016844	GA	3	6	27241	27246	50 %	0 %	50 %	0 %	378974650
538	NC_016844	AGCG	2	8	27252	27259	25 %	0 %	50 %	25 %	378974650
539	NC_016844	T	6	6	27267	27272	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
540	NC_016844	TTGAGA	2	12	27320	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974650
541	NC_016844	CAGT	2	8	27343	27350	25 %	25 %	25 %	25 %	378974650
542	NC_016844	GT	4	8	27412	27419	0 %	50 %	50 %	0 %	378974650
543	NC_016844	GC	4	8	27454	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	378974650
544	NC_016844	T	6	6	27491	27496	0 %	100 %	0 %	0 %	378974650
545	NC_016844	GTG	2	6	27610	27615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
546	NC_016844	GTT	2	6	27657	27662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974651
547	NC_016844	TGG	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
548	NC_016844	TGG	2	6	27684	27689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
549	NC_016844	TATTT	2	10	27709	27718	20 %	80 %	0 %	0 %	378974651
550	NC_016844	CTGCG	2	10	27775	27784	0 %	20 %	40 %	40 %	378974651
551	NC_016844	TGCG	2	8	27791	27798	0 %	25 %	50 %	25 %	378974651
552	NC_016844	GT	4	8	27806	27813	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
553	NC_016844	CATC	2	8	27820	27827	25 %	25 %	0 %	50 %	378974651
554	NC_016844	T	6	6	27831	27836	0 %	100 %	0 %	0 %	378974651
555	NC_016844	GGT	2	6	27857	27862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
556	NC_016844	GTA	2	6	27931	27936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974651
557	NC_016844	GT	3	6	28047	28052	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
558	NC_016844	AGTG	2	8	28053	28060	25 %	25 %	50 %	0 %	378974651
559	NC_016844	ATG	2	6	28099	28104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974651
560	NC_016844	T	6	6	28109	28114	0 %	100 %	0 %	0 %	378974651
561	NC_016844	TTA	2	6	28130	28135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974651
562	NC_016844	AT	4	8	28140	28147	50 %	50 %	0 %	0 %	378974651
563	NC_016844	TCA	2	6	28201	28206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974651
564	NC_016844	T	6	6	28249	28254	0 %	100 %	0 %	0 %	378974651
565	NC_016844	G	6	6	28266	28271	0 %	0 %	100 %	0 %	378974651
566	NC_016844	T	6	6	28353	28358	0 %	100 %	0 %	0 %	378974651
567	NC_016844	CAG	2	6	28419	28424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974651
568	NC_016844	TTTG	2	8	28437	28444	0 %	75 %	25 %	0 %	378974651
569	NC_016844	TGA	2	6	28484	28489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974651
570	NC_016844	GT	3	6	28493	28498	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
571	NC_016844	TG	3	6	28508	28513	0 %	50 %	50 %	0 %	378974651
572	NC_016844	GTG	2	6	28690	28695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
573	NC_016844	TGA	2	6	28733	28738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974651
574	NC_016844	GGT	2	6	28882	28887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974651
575	NC_016844	TGA	2	6	28896	28901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016844	AT	3	6	28935	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016844	CTC	2	6	29026	29031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_016844	AGG	2	6	29053	29058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016844	G	6	6	29057	29062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016844	GCT	2	6	29129	29134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974652
581	NC_016844	TCC	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974652
582	NC_016844	GC	3	6	29213	29218	0 %	0 %	50 %	50 %	378974652
583	NC_016844	GAT	2	6	29252	29257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974652
584	NC_016844	ATC	2	6	29306	29311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974652
585	NC_016844	AAC	2	6	29321	29326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974652
586	NC_016844	A	7	7	29333	29339	100 %	0 %	0 %	0 %	378974652
587	NC_016844	A	6	6	29445	29450	100 %	0 %	0 %	0 %	378974652
588	NC_016844	TCT	2	6	29474	29479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974652
589	NC_016844	GAA	2	6	29548	29553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974652
590	NC_016844	TC	3	6	29584	29589	0 %	50 %	0 %	50 %	378974652
591	NC_016844	AG	3	6	29864	29869	50 %	0 %	50 %	0 %	378974653
592	NC_016844	ACC	2	6	29941	29946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974653
593	NC_016844	TGCGC	2	10	29963	29972	0 %	20 %	40 %	40 %	378974653
594	NC_016844	AGT	2	6	29977	29982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974653
595	NC_016844	CCG	2	6	30119	30124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974653
596	NC_016844	TCT	2	6	30158	30163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974653
597	NC_016844	CAC	2	6	30317	30322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974653
598	NC_016844	T	6	6	30335	30340	0 %	100 %	0 %	0 %	378974653
599	NC_016844	TC	3	6	30393	30398	0 %	50 %	0 %	50 %	378974653
600	NC_016844	AGC	2	6	30460	30465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974653
601	NC_016844	TGC	2	6	30490	30495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974653
602	NC_016844	TGT	2	6	30535	30540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974653
603	NC_016844	GTG	2	6	30564	30569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974653
604	NC_016844	TG	3	6	30633	30638	0 %	50 %	50 %	0 %	378974653
605	NC_016844	TCCAG	2	10	30789	30798	20 %	20 %	20 %	40 %	378974653
606	NC_016844	TTC	2	6	30801	30806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974653
607	NC_016844	TGC	2	6	30816	30821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974653
608	NC_016844	CGT	2	6	30922	30927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974653
609	NC_016844	AAAG	2	8	30937	30944	75 %	0 %	25 %	0 %	378974653
610	NC_016844	CA	3	6	30959	30964	50 %	0 %	0 %	50 %	378974653
611	NC_016844	GT	3	6	31052	31057	0 %	50 %	50 %	0 %	378974653
612	NC_016844	CTA	2	6	31103	31108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974653
613	NC_016844	GCGG	2	8	31113	31120	0 %	0 %	75 %	25 %	378974653
614	NC_016844	ATG	2	6	31167	31172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974653
615	NC_016844	CTT	2	6	31226	31231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974653
616	NC_016844	CTG	2	6	31247	31252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974653
617	NC_016844	TCGT	2	8	31279	31286	0 %	50 %	25 %	25 %	378974653
618	NC_016844	GAACAG	2	12	31304	31315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974653
619	NC_016844	A	6	6	31320	31325	100 %	0 %	0 %	0 %	378974653
620	NC_016844	TGGGG	2	10	31347	31356	0 %	20 %	80 %	0 %	378974653
621	NC_016844	GTT	2	6	31364	31369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974653
622	NC_016844	TCC	2	6	31402	31407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974653
623	NC_016844	TGTC	2	8	31419	31426	0 %	50 %	25 %	25 %	378974653
624	NC_016844	GC	3	6	31458	31463	0 %	0 %	50 %	50 %	378974653
625	NC_016844	GCT	2	6	31465	31470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974653
626	NC_016844	TCA	2	6	31519	31524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974653
627	NC_016844	T	7	7	31527	31533	0 %	100 %	0 %	0 %	378974653
628	NC_016844	GTCTGG	2	12	31539	31550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974653
629	NC_016844	GCA	2	6	31583	31588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974653
630	NC_016844	TGG	2	6	31624	31629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974653
631	NC_016844	GA	3	6	31731	31736	50 %	0 %	50 %	0 %	378974653
632	NC_016844	GCG	2	6	31752	31757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974653
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