MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016844	GTG	2	6	267791	267796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974890
5502	NC_016844	G	6	6	267871	267876	0 %	0 %	100 %	0 %	378974890
5503	NC_016844	CTT	2	6	267910	267915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974890
5504	NC_016844	GGA	2	6	267934	267939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974890
5505	NC_016844	AGG	2	6	267940	267945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974890
5506	NC_016844	GGAT	2	8	267990	267997	25 %	25 %	50 %	0 %	378974890
5507	NC_016844	GAG	2	6	268010	268015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974890
5508	NC_016844	TCG	2	6	268051	268056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974890
5509	NC_016844	GGA	2	6	268132	268137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974890
5510	NC_016844	AATC	2	8	268171	268178	50 %	25 %	0 %	25 %	378974890
5511	NC_016844	AAC	2	6	268235	268240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974890
5512	NC_016844	TCC	2	6	268277	268282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974890
5513	NC_016844	GT	3	6	268302	268307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016844	GCGCG	2	10	268366	268375	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_016844	GAG	2	6	268431	268436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974891
5516	NC_016844	GGT	2	6	268442	268447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974891
5517	NC_016844	GT	3	6	268446	268451	0 %	50 %	50 %	0 %	378974891
5518	NC_016844	T	6	6	268527	268532	0 %	100 %	0 %	0 %	378974891
5519	NC_016844	CAG	2	6	268558	268563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974891
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5521	NC_016844	GTT	2	6	268733	268738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974892
5522	NC_016844	CTG	2	6	268749	268754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974892
5523	NC_016844	GTG	2	6	268769	268774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974892
5524	NC_016844	TGC	2	6	268788	268793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974892
5525	NC_016844	TTTTC	2	10	268795	268804	0 %	80 %	0 %	20 %	378974892
5526	NC_016844	TTA	2	6	268831	268836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974892
5527	NC_016844	CG	3	6	268837	268842	0 %	0 %	50 %	50 %	378974892
5528	NC_016844	TTTTTC	2	12	268950	268961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378974892
5529	NC_016844	ATG	2	6	268988	268993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974892
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5531	NC_016844	CTT	2	6	269093	269098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974892
5532	NC_016844	TGGC	2	8	269124	269131	0 %	25 %	50 %	25 %	378974892
5533	NC_016844	TGCG	2	8	269151	269158	0 %	25 %	50 %	25 %	378974892
5534	NC_016844	GCC	2	6	269163	269168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974892
5535	NC_016844	GTG	2	6	269177	269182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974892
5536	NC_016844	CTT	2	6	269202	269207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974892
5537	NC_016844	T	8	8	269206	269213	0 %	100 %	0 %	0 %	378974892
5538	NC_016844	T	6	6	269227	269232	0 %	100 %	0 %	0 %	378974892
5539	NC_016844	GT	3	6	269249	269254	0 %	50 %	50 %	0 %	378974892
5540	NC_016844	GCG	2	6	269337	269342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016844	CTA	2	6	269345	269350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_016844	GAG	2	6	269385	269390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016844	TG	3	6	269414	269419	0 %	50 %	50 %	0 %	378974893
5544	NC_016844	G	9	9	269427	269435	0 %	0 %	100 %	0 %	378974893
5545	NC_016844	GCA	2	6	269566	269571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974893
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5547	NC_016844	TGAC	2	8	269634	269641	25 %	25 %	25 %	25 %	378974893
5548	NC_016844	AGA	2	6	269707	269712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974893
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5550	NC_016844	CG	3	6	269748	269753	0 %	0 %	50 %	50 %	378974893
5551	NC_016844	TCA	3	9	269911	269919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974893
5552	NC_016844	GGAA	2	8	269920	269927	50 %	0 %	50 %	0 %	378974893
5553	NC_016844	A	6	6	269960	269965	100 %	0 %	0 %	0 %	378974893
5554	NC_016844	TACAAT	2	12	270146	270157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378974893
5555	NC_016844	GGT	2	6	270173	270178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974893
5556	NC_016844	GGA	2	6	270222	270227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974893
5557	NC_016844	GAAT	2	8	270238	270245	50 %	25 %	25 %	0 %	378974893
5558	NC_016844	GAAA	2	8	270331	270338	75 %	0 %	25 %	0 %	378974893
5559	NC_016844	CG	3	6	270352	270357	0 %	0 %	50 %	50 %	378974893
5560	NC_016844	GTG	2	6	270407	270412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974893
5561	NC_016844	CCCG	2	8	270455	270462	0 %	0 %	25 %	75 %	378974893
5562	NC_016844	GTTC	2	8	270527	270534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_016844	GCAC	2	8	270566	270573	25 %	0 %	25 %	50 %	378974894
5564	NC_016844	CG	3	6	270594	270599	0 %	0 %	50 %	50 %	378974894
5565	NC_016844	CG	4	8	270627	270634	0 %	0 %	50 %	50 %	378974894
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5579	NC_016844	AG	3	6	271237	271242	50 %	0 %	50 %	0 %	378974894
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5582	NC_016844	TG	3	6	271349	271354	0 %	50 %	50 %	0 %	378974895
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5595	NC_016844	CA	3	6	271997	272002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_016844	GCTC	2	8	272005	272012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_016844	TCC	2	6	272014	272019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_016844	CTT	2	6	272062	272067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974897
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5601	NC_016844	GC	3	6	272224	272229	0 %	0 %	50 %	50 %	378974897
5602	NC_016844	CCCTGC	2	12	272315	272326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378974897
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5604	NC_016844	AT	3	6	272402	272407	50 %	50 %	0 %	0 %	378974897
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5608	NC_016844	T	6	6	272693	272698	0 %	100 %	0 %	0 %	378974897
5609	NC_016844	T	6	6	272731	272736	0 %	100 %	0 %	0 %	378974897
5610	NC_016844	GCG	2	6	272747	272752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974897
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5616	NC_016844	TCT	2	6	273190	273195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974897
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5618	NC_016844	GGA	2	6	273289	273294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974897
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5621	NC_016844	TAG	2	6	273402	273407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974897
5622	NC_016844	CACC	2	8	273410	273417	25 %	0 %	0 %	75 %	378974897
5623	NC_016844	GC	3	6	273456	273461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_016844	CGTGA	2	10	273469	273478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5754	NC_016844	GAT	2	6	280494	280499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5756	NC_016844	GAT	2	6	280709	280714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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