MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016844	G	8	8	220012	220019	0 %	0 %	100 %	0 %	378974851
4502	NC_016844	TGG	2	6	220087	220092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974851
4503	NC_016844	CGT	2	6	220096	220101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4504	NC_016844	CAGC	2	8	220106	220113	25 %	0 %	25 %	50 %	378974851
4505	NC_016844	A	6	6	220114	220119	100 %	0 %	0 %	0 %	378974851
4506	NC_016844	CTAT	2	8	220146	220153	25 %	50 %	0 %	25 %	378974851
4507	NC_016844	A	6	6	220204	220209	100 %	0 %	0 %	0 %	378974851
4508	NC_016844	GAC	2	6	220238	220243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4509	NC_016844	A	6	6	220305	220310	100 %	0 %	0 %	0 %	378974851
4510	NC_016844	GAA	2	6	220312	220317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974851
4511	NC_016844	ATT	2	6	220329	220334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974851
4512	NC_016844	TAT	2	6	220444	220449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974851
4513	NC_016844	CTG	2	6	220461	220466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4514	NC_016844	AG	4	8	220500	220507	50 %	0 %	50 %	0 %	378974851
4515	NC_016844	ATT	2	6	220511	220516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974851
4516	NC_016844	G	8	8	220532	220539	0 %	0 %	100 %	0 %	378974851
4517	NC_016844	AAGTC	2	10	220584	220593	40 %	20 %	20 %	20 %	378974851
4518	NC_016844	G	6	6	220615	220620	0 %	0 %	100 %	0 %	378974851
4519	NC_016844	GA	3	6	220720	220725	50 %	0 %	50 %	0 %	378974851
4520	NC_016844	GCG	2	6	220727	220732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974851
4521	NC_016844	TTC	2	6	220753	220758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974851
4522	NC_016844	CT	4	8	220830	220837	0 %	50 %	0 %	50 %	378974851
4523	NC_016844	TGA	2	6	220861	220866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974851
4524	NC_016844	TGG	2	6	220954	220959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974851
4525	NC_016844	AAG	2	6	221010	221015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974851
4526	NC_016844	AGG	2	6	221068	221073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974851
4527	NC_016844	G	7	7	221081	221087	0 %	0 %	100 %	0 %	378974851
4528	NC_016844	ACC	2	6	221180	221185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974851
4529	NC_016844	TGC	2	6	221253	221258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4530	NC_016844	TAG	2	6	221310	221315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974851
4531	NC_016844	AGC	2	6	221421	221426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4532	NC_016844	AGG	2	6	221586	221591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974851
4533	NC_016844	CG	4	8	221618	221625	0 %	0 %	50 %	50 %	378974851
4534	NC_016844	CGA	2	6	221668	221673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4535	NC_016844	GCA	2	6	221707	221712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4536	NC_016844	GGA	2	6	221731	221736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974851
4537	NC_016844	AGC	3	9	221752	221760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974851
4538	NC_016844	AAG	2	6	221777	221782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974851
4539	NC_016844	GGT	2	6	221813	221818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974851
4540	NC_016844	GGGA	2	8	221876	221883	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016844	TG	3	6	221903	221908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016844	TG	4	8	222060	222067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016844	ATT	2	6	222120	222125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974852
4544	NC_016844	GAA	2	6	222161	222166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974852
4545	NC_016844	CGG	2	6	222182	222187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974852
4546	NC_016844	GGA	2	6	222235	222240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974852
4547	NC_016844	AGG	2	6	222249	222254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974852
4548	NC_016844	CGC	2	6	222440	222445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974852
4549	NC_016844	ACG	2	6	222459	222464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974852
4550	NC_016844	GAA	2	6	222521	222526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974852
4551	NC_016844	CGA	2	6	222565	222570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974852
4552	NC_016844	GTA	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974852
4553	NC_016844	T	6	6	222667	222672	0 %	100 %	0 %	0 %	378974852
4554	NC_016844	GC	3	6	222692	222697	0 %	0 %	50 %	50 %	378974852
4555	NC_016844	TGG	2	6	222700	222705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974852
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4557	NC_016844	AGA	2	6	222802	222807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974852
4558	NC_016844	GCG	2	6	222811	222816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974852
4559	NC_016844	GTGTTT	2	12	222878	222889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974852
4560	NC_016844	GC	3	6	222972	222977	0 %	0 %	50 %	50 %	378974852
4561	NC_016844	GCA	2	6	223009	223014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974852
4562	NC_016844	CCGG	2	8	223025	223032	0 %	0 %	50 %	50 %	378974852
4563	NC_016844	GC	3	6	223082	223087	0 %	0 %	50 %	50 %	378974852
4564	NC_016844	CCG	2	6	223199	223204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974852
4565	NC_016844	ATT	2	6	223262	223267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974853
4566	NC_016844	CGTG	2	8	223272	223279	0 %	25 %	50 %	25 %	378974853
4567	NC_016844	TTTC	2	8	223283	223290	0 %	75 %	0 %	25 %	378974853
4568	NC_016844	GT	3	6	223293	223298	0 %	50 %	50 %	0 %	378974853
4569	NC_016844	TTC	2	6	223348	223353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974853
4570	NC_016844	AGC	2	6	223383	223388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016844	T	9	9	223463	223471	0 %	100 %	0 %	0 %	378974854
4572	NC_016844	TCGTT	2	10	223515	223524	0 %	60 %	20 %	20 %	378974854
4573	NC_016844	GC	3	6	223528	223533	0 %	0 %	50 %	50 %	378974854
4574	NC_016844	TTC	2	6	223578	223583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974854
4575	NC_016844	TGCGCT	2	12	223626	223637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
4576	NC_016844	TTG	2	6	223676	223681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974854
4577	NC_016844	CTG	2	6	223726	223731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
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4579	NC_016844	TTG	2	6	223757	223762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974854
4580	NC_016844	AGG	2	6	223772	223777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974854
4581	NC_016844	ACA	2	6	223841	223846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974854
4582	NC_016844	TGC	2	6	223848	223853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
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4584	NC_016844	TA	3	6	223935	223940	50 %	50 %	0 %	0 %	378974854
4585	NC_016844	T	7	7	223941	223947	0 %	100 %	0 %	0 %	378974854
4586	NC_016844	GAT	3	9	223948	223956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974854
4587	NC_016844	TGT	3	9	224126	224134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974854
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4589	NC_016844	GC	3	6	224178	224183	0 %	0 %	50 %	50 %	378974854
4590	NC_016844	ATT	2	6	224264	224269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974854
4591	NC_016844	ACG	2	6	224270	224275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974854
4592	NC_016844	TGA	2	6	224286	224291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974854
4593	NC_016844	CGT	2	6	224342	224347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
4594	NC_016844	ATC	2	6	224576	224581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974854
4595	NC_016844	AGT	2	6	224694	224699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974854
4596	NC_016844	GAC	2	6	224839	224844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974854
4597	NC_016844	AGGT	2	8	224872	224879	25 %	25 %	50 %	0 %	378974854
4598	NC_016844	T	7	7	224893	224899	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
4599	NC_016844	GC	3	6	224958	224963	0 %	0 %	50 %	50 %	378974855
4600	NC_016844	CTG	2	6	224971	224976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974855
4601	NC_016844	T	6	6	225009	225014	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
4602	NC_016844	TTTA	2	8	225069	225076	25 %	75 %	0 %	0 %	378974855
4603	NC_016844	T	6	6	225091	225096	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
4604	NC_016844	A	8	8	225148	225155	100 %	0 %	0 %	0 %	378974855
4605	NC_016844	ACG	2	6	225178	225183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974855
4606	NC_016844	TTTG	2	8	225189	225196	0 %	75 %	25 %	0 %	378974855
4607	NC_016844	ATT	2	6	225269	225274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974855
4608	NC_016844	TCT	2	6	225280	225285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974855
4609	NC_016844	T	8	8	225314	225321	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
4610	NC_016844	A	6	6	225358	225363	100 %	0 %	0 %	0 %	378974855
4611	NC_016844	ATG	2	6	225370	225375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974855
4612	NC_016844	CAA	2	6	225394	225399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974855
4613	NC_016844	TTA	2	6	225446	225451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974855
4614	NC_016844	TCTTGT	2	12	225452	225463	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974855
4615	NC_016844	GTGTTT	2	12	225481	225492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974855
4616	NC_016844	T	6	6	225490	225495	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
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4619	NC_016844	CAG	2	6	225623	225628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974855
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4621	NC_016844	T	6	6	225751	225756	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
4622	NC_016844	AGGC	2	8	225905	225912	25 %	0 %	50 %	25 %	378974855
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4624	NC_016844	T	7	7	226071	226077	0 %	100 %	0 %	0 %	378974855
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4999	NC_016844	AACG	2	8	243804	243811	50 %	0 %	25 %	25 %	378974871
5000	NC_016844	AAG	2	6	243865	243870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974871

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