MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 4508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
2	NC_016843	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
3	NC_016843	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
4	NC_016843	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
5	NC_016843	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	378973569
6	NC_016843	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	378973570
7	NC_016843	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	378973570
8	NC_016843	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	378973571
9	NC_016843	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	378973571
10	NC_016843	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	378973571
11	NC_016843	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	378973571
12	NC_016843	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	378973572
13	NC_016843	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	378973572
14	NC_016843	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016843	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	378973573
16	NC_016843	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	378973573
17	NC_016843	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	378973573
18	NC_016843	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	378973573
19	NC_016843	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	378973573
20	NC_016843	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	378973575
21	NC_016843	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	378973575
22	NC_016843	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	378973575
23	NC_016843	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	378973576
24	NC_016843	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	378973576
25	NC_016843	AG	4	8	9425	9432	50 %	0 %	50 %	0 %	378973576
26	NC_016843	AC	3	6	9825	9830	50 %	0 %	0 %	50 %	378973576
27	NC_016843	AG	3	6	9888	9893	50 %	0 %	50 %	0 %	378973576
28	NC_016843	TC	3	6	9945	9950	0 %	50 %	0 %	50 %	378973576
29	NC_016843	GC	3	6	10085	10090	0 %	0 %	50 %	50 %	378973576
30	NC_016843	TC	3	6	10702	10707	0 %	50 %	0 %	50 %	378973577
31	NC_016843	GC	3	6	11291	11296	0 %	0 %	50 %	50 %	378973577
32	NC_016843	GT	3	6	11332	11337	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
33	NC_016843	GT	3	6	11522	11527	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
34	NC_016843	TA	3	6	11909	11914	50 %	50 %	0 %	0 %	378973577
35	NC_016843	CA	3	6	12029	12034	50 %	0 %	0 %	50 %	378973577
36	NC_016843	GT	3	6	12355	12360	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
37	NC_016843	GA	3	6	12513	12518	50 %	0 %	50 %	0 %	378973578
38	NC_016843	GT	3	6	12521	12526	0 %	50 %	50 %	0 %	378973578
39	NC_016843	GC	3	6	12615	12620	0 %	0 %	50 %	50 %	378973579
40	NC_016843	GC	3	6	13062	13067	0 %	0 %	50 %	50 %	378973579
41	NC_016843	GT	3	6	13145	13150	0 %	50 %	50 %	0 %	378973579
42	NC_016843	CA	4	8	13237	13244	50 %	0 %	0 %	50 %	378973579
43	NC_016843	GA	3	6	13321	13326	50 %	0 %	50 %	0 %	378973579
44	NC_016843	GC	3	6	13532	13537	0 %	0 %	50 %	50 %	378973579
45	NC_016843	CT	4	8	13581	13588	0 %	50 %	0 %	50 %	378973579
46	NC_016843	GC	3	6	14268	14273	0 %	0 %	50 %	50 %	378973580
47	NC_016843	CG	3	6	14302	14307	0 %	0 %	50 %	50 %	378973580
48	NC_016843	AT	3	6	14545	14550	50 %	50 %	0 %	0 %	378973580
49	NC_016843	TG	3	6	15955	15960	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
50	NC_016843	CG	3	6	16390	16395	0 %	0 %	50 %	50 %	378973581
51	NC_016843	CG	3	6	16497	16502	0 %	0 %	50 %	50 %	378973581
52	NC_016843	GT	4	8	16828	16835	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
53	NC_016843	CA	3	6	16837	16842	50 %	0 %	0 %	50 %	378973581
54	NC_016843	GT	3	6	17218	17223	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
55	NC_016843	CG	3	6	17337	17342	0 %	0 %	50 %	50 %	378973581
56	NC_016843	AG	3	6	17370	17375	50 %	0 %	50 %	0 %	378973581
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58	NC_016843	CG	4	8	17524	17531	0 %	0 %	50 %	50 %	378973581
59	NC_016843	GT	3	6	18264	18269	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
60	NC_016843	AT	3	6	18651	18656	50 %	50 %	0 %	0 %	378973582
61	NC_016843	GT	3	6	18707	18712	0 %	50 %	50 %	0 %	378973582
62	NC_016843	GC	3	6	18757	18762	0 %	0 %	50 %	50 %	378973582
63	NC_016843	CG	3	6	19430	19435	0 %	0 %	50 %	50 %	378973583
64	NC_016843	CG	3	6	19912	19917	0 %	0 %	50 %	50 %	378973583
65	NC_016843	GT	3	6	20345	20350	0 %	50 %	50 %	0 %	378973583
66	NC_016843	CG	3	6	20764	20769	0 %	0 %	50 %	50 %	378973583
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68	NC_016843	GC	3	6	21126	21131	0 %	0 %	50 %	50 %	378973583
69	NC_016843	GA	3	6	21666	21671	50 %	0 %	50 %	0 %	378973583
70	NC_016843	CA	3	6	21860	21865	50 %	0 %	0 %	50 %	378973583
71	NC_016843	CG	3	6	22425	22430	0 %	0 %	50 %	50 %	378973584
72	NC_016843	AC	3	6	22432	22437	50 %	0 %	0 %	50 %	378973584
73	NC_016843	GT	3	6	22595	22600	0 %	50 %	50 %	0 %	378973584
74	NC_016843	CG	3	6	23215	23220	0 %	0 %	50 %	50 %	378973584
75	NC_016843	GA	3	6	23683	23688	50 %	0 %	50 %	0 %	378973584
76	NC_016843	GA	4	8	24348	24355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016843	CA	3	6	24386	24391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016843	TC	3	6	24427	24432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016843	GA	4	8	24492	24499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016843	TC	3	6	24572	24577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82	NC_016843	TG	3	6	26029	26034	0 %	50 %	50 %	0 %	378973586
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85	NC_016843	CG	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	378973586
86	NC_016843	GA	3	6	27244	27249	50 %	0 %	50 %	0 %	378973586
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89	NC_016843	GT	4	8	27809	27816	0 %	50 %	50 %	0 %	378973587
90	NC_016843	GT	3	6	28050	28055	0 %	50 %	50 %	0 %	378973587
91	NC_016843	AT	4	8	28143	28150	50 %	50 %	0 %	0 %	378973587
92	NC_016843	GT	3	6	28496	28501	0 %	50 %	50 %	0 %	378973587
93	NC_016843	TG	3	6	28511	28516	0 %	50 %	50 %	0 %	378973587
94	NC_016843	AT	3	6	28938	28943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016843	GC	3	6	29216	29221	0 %	0 %	50 %	50 %	378973588
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99	NC_016843	TG	3	6	30636	30641	0 %	50 %	50 %	0 %	378973589
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102	NC_016843	GC	3	6	31461	31466	0 %	0 %	50 %	50 %	378973589
103	NC_016843	GA	3	6	31734	31739	50 %	0 %	50 %	0 %	378973589
104	NC_016843	GT	3	6	32403	32408	0 %	50 %	50 %	0 %	378973589
105	NC_016843	AC	3	6	32444	32449	50 %	0 %	0 %	50 %	378973589
106	NC_016843	GC	3	6	32988	32993	0 %	0 %	50 %	50 %	378973590
107	NC_016843	AG	3	6	33100	33105	50 %	0 %	50 %	0 %	378973590
108	NC_016843	AG	3	6	33109	33114	50 %	0 %	50 %	0 %	378973590
109	NC_016843	CG	3	6	33310	33315	0 %	0 %	50 %	50 %	378973590
110	NC_016843	AC	3	6	33735	33740	50 %	0 %	0 %	50 %	378973590
111	NC_016843	CG	3	6	34001	34006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016843	GT	3	6	34190	34195	0 %	50 %	50 %	0 %	378973591
113	NC_016843	CG	4	8	34814	34821	0 %	0 %	50 %	50 %	378973591
114	NC_016843	GC	3	6	34997	35002	0 %	0 %	50 %	50 %	378973591
115	NC_016843	GC	3	6	35052	35057	0 %	0 %	50 %	50 %	378973591
116	NC_016843	AT	3	6	35126	35131	50 %	50 %	0 %	0 %	378973591
117	NC_016843	TA	3	6	35215	35220	50 %	50 %	0 %	0 %	378973591
118	NC_016843	TG	3	6	35371	35376	0 %	50 %	50 %	0 %	378973591
119	NC_016843	GC	3	6	35441	35446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016843	TG	3	6	35491	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	378973592
121	NC_016843	CT	3	6	35669	35674	0 %	50 %	0 %	50 %	378973592
122	NC_016843	GT	4	8	35869	35876	0 %	50 %	50 %	0 %	378973592
123	NC_016843	GC	3	6	36016	36021	0 %	0 %	50 %	50 %	378973592
124	NC_016843	CA	4	8	36065	36072	50 %	0 %	0 %	50 %	378973592
125	NC_016843	AC	3	6	36093	36098	50 %	0 %	0 %	50 %	378973592
126	NC_016843	TG	3	6	36109	36114	0 %	50 %	50 %	0 %	378973592
127	NC_016843	CG	3	6	36636	36641	0 %	0 %	50 %	50 %	378973592
128	NC_016843	TG	3	6	36893	36898	0 %	50 %	50 %	0 %	378973593
129	NC_016843	GT	3	6	36967	36972	0 %	50 %	50 %	0 %	378973593
130	NC_016843	CA	3	6	37017	37022	50 %	0 %	0 %	50 %	378973593
131	NC_016843	GC	3	6	37522	37527	0 %	0 %	50 %	50 %	378973593
132	NC_016843	TG	3	6	37976	37981	0 %	50 %	50 %	0 %	378973593
133	NC_016843	GC	3	6	38086	38091	0 %	0 %	50 %	50 %	378973593
134	NC_016843	AG	3	6	38184	38189	50 %	0 %	50 %	0 %	378973593
135	NC_016843	CT	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	378973594
136	NC_016843	GT	3	6	40576	40581	0 %	50 %	50 %	0 %	378973596
137	NC_016843	GT	3	6	40601	40606	0 %	50 %	50 %	0 %	378973596
138	NC_016843	TG	3	6	41097	41102	0 %	50 %	50 %	0 %	378973597
139	NC_016843	AT	3	6	41280	41285	50 %	50 %	0 %	0 %	378973597
140	NC_016843	CA	3	6	41617	41622	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
141	NC_016843	CA	3	6	41649	41654	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
142	NC_016843	CA	3	6	41696	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
143	NC_016843	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	378973598
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