MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016843	A	6	6	194371	194376	100 %	0 %	0 %	0 %	378973749
4002	NC_016843	GAA	2	6	194383	194388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973749
4003	NC_016843	CCT	2	6	194419	194424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973749
4004	NC_016843	GT	3	6	194530	194535	0 %	50 %	50 %	0 %	378973749
4005	NC_016843	A	7	7	194568	194574	100 %	0 %	0 %	0 %	378973749
4006	NC_016843	AC	3	6	194598	194603	50 %	0 %	0 %	50 %	378973749
4007	NC_016843	T	6	6	194657	194662	0 %	100 %	0 %	0 %	378973749
4008	NC_016843	A	6	6	194880	194885	100 %	0 %	0 %	0 %	378973749
4009	NC_016843	A	7	7	194913	194919	100 %	0 %	0 %	0 %	378973749
4010	NC_016843	GAT	2	6	194928	194933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973749
4011	NC_016843	GAA	2	6	194987	194992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973749
4012	NC_016843	ATA	2	6	195013	195018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973749
4013	NC_016843	GCA	2	6	195081	195086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973749
4014	NC_016843	A	6	6	195143	195148	100 %	0 %	0 %	0 %	378973749
4015	NC_016843	GCAG	2	8	195166	195173	25 %	0 %	50 %	25 %	378973749
4016	NC_016843	TTCT	2	8	195176	195183	0 %	75 %	0 %	25 %	378973749
4017	NC_016843	GAGTG	2	10	195208	195217	20 %	20 %	60 %	0 %	378973749
4018	NC_016843	AAG	2	6	195232	195237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973749
4019	NC_016843	TG	4	8	195252	195259	0 %	50 %	50 %	0 %	378973749
4020	NC_016843	T	8	8	195349	195356	0 %	100 %	0 %	0 %	378973749
4021	NC_016843	T	6	6	195447	195452	0 %	100 %	0 %	0 %	378973750
4022	NC_016843	AGT	2	6	195568	195573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973750
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4024	NC_016843	GTAC	2	8	195681	195688	25 %	25 %	25 %	25 %	378973750
4025	NC_016843	GGT	2	6	195696	195701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973750
4026	NC_016843	GAAG	2	8	195851	195858	50 %	0 %	50 %	0 %	378973750
4027	NC_016843	CGTG	2	8	195867	195874	0 %	25 %	50 %	25 %	378973750
4028	NC_016843	AAAT	2	8	195912	195919	75 %	25 %	0 %	0 %	378973750
4029	NC_016843	AGAA	2	8	196014	196021	75 %	0 %	25 %	0 %	378973750
4030	NC_016843	AC	3	6	196072	196077	50 %	0 %	0 %	50 %	378973750
4031	NC_016843	GGA	2	6	196080	196085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973750
4032	NC_016843	ACA	2	6	196105	196110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973750
4033	NC_016843	CCGT	2	8	196158	196165	0 %	25 %	25 %	50 %	378973750
4034	NC_016843	GAG	2	6	196218	196223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973750
4035	NC_016843	CA	4	8	196280	196287	50 %	0 %	0 %	50 %	378973750
4036	NC_016843	A	6	6	196331	196336	100 %	0 %	0 %	0 %	378973750
4037	NC_016843	GC	3	6	196452	196457	0 %	0 %	50 %	50 %	378973750
4038	NC_016843	ATTA	2	8	196523	196530	50 %	50 %	0 %	0 %	378973750
4039	NC_016843	AGAA	2	8	196531	196538	75 %	0 %	25 %	0 %	378973750
4040	NC_016843	TTA	2	6	196687	196692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973750
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4042	NC_016843	CTT	2	6	196743	196748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973750
4043	NC_016843	GGA	2	6	196809	196814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973751
4044	NC_016843	CGTC	2	8	196815	196822	0 %	25 %	25 %	50 %	378973751
4045	NC_016843	GC	3	6	196824	196829	0 %	0 %	50 %	50 %	378973751
4046	NC_016843	AGT	2	6	196831	196836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973751
4047	NC_016843	TGA	2	6	196848	196853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973751
4048	NC_016843	GAA	2	6	196940	196945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973751
4049	NC_016843	CAG	2	6	197033	197038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973751
4050	NC_016843	GAA	2	6	197064	197069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973751
4051	NC_016843	CGG	2	6	197070	197075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973751
4052	NC_016843	G	6	6	197074	197079	0 %	0 %	100 %	0 %	378973751
4053	NC_016843	AGC	2	6	197154	197159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973751
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4055	NC_016843	ACGC	2	8	197245	197252	25 %	0 %	25 %	50 %	378973751
4056	NC_016843	CTC	2	6	197254	197259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973751
4057	NC_016843	CCTG	2	8	197433	197440	0 %	25 %	25 %	50 %	378973751
4058	NC_016843	GTC	2	6	197447	197452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973751
4059	NC_016843	GCAG	2	8	197462	197469	25 %	0 %	50 %	25 %	378973751
4060	NC_016843	AGG	2	6	197480	197485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973751
4061	NC_016843	GTG	3	9	197513	197521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973751
4062	NC_016843	GAGAAA	2	12	197566	197577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973751
4063	NC_016843	CG	3	6	197581	197586	0 %	0 %	50 %	50 %	378973751
4064	NC_016843	GA	3	6	197596	197601	50 %	0 %	50 %	0 %	378973751
4065	NC_016843	GTA	2	6	197635	197640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973751
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4072	NC_016843	TCG	3	9	198061	198069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
4073	NC_016843	GCT	2	6	198092	198097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
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4077	NC_016843	GTC	2	6	198303	198308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
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4080	NC_016843	TGA	2	6	198431	198436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973752
4081	NC_016843	TCGTC	2	10	198470	198479	0 %	40 %	20 %	40 %	378973752
4082	NC_016843	ATC	2	6	198483	198488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973752
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4088	NC_016843	GTG	2	6	198871	198876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973752
4089	NC_016843	TGC	2	6	198902	198907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
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4091	NC_016843	GGC	2	6	198922	198927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973752
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4093	NC_016843	TCG	2	6	199006	199011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
4094	NC_016843	ACG	2	6	199013	199018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973752
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4096	NC_016843	GGA	3	9	199068	199076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973752
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4098	NC_016843	TCC	2	6	199120	199125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973752
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4101	NC_016843	CG	3	6	199211	199216	0 %	0 %	50 %	50 %	378973752
4102	NC_016843	CGG	2	6	199293	199298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973752
4103	NC_016843	CTG	2	6	199385	199390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973752
4104	NC_016843	CA	3	6	199433	199438	50 %	0 %	0 %	50 %	378973752
4105	NC_016843	T	6	6	199490	199495	0 %	100 %	0 %	0 %	378973752
4106	NC_016843	CAA	2	6	199496	199501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973752
4107	NC_016843	CG	3	6	199543	199548	0 %	0 %	50 %	50 %	378973752
4108	NC_016843	CCT	2	6	199583	199588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973752
4109	NC_016843	G	10	10	199592	199601	0 %	0 %	100 %	0 %	378973752
4110	NC_016843	GTA	2	6	199692	199697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973753
4111	NC_016843	G	6	6	199756	199761	0 %	0 %	100 %	0 %	378973753
4112	NC_016843	TG	3	6	199762	199767	0 %	50 %	50 %	0 %	378973753
4113	NC_016843	GGT	2	6	199850	199855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973753
4114	NC_016843	CG	3	6	199917	199922	0 %	0 %	50 %	50 %	378973753
4115	NC_016843	TTG	2	6	199999	200004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973753
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4119	NC_016843	GC	3	6	200092	200097	0 %	0 %	50 %	50 %	378973753
4120	NC_016843	GCT	2	6	200134	200139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973754
4121	NC_016843	GA	3	6	200277	200282	50 %	0 %	50 %	0 %	378973754
4122	NC_016843	TGGCC	2	10	200371	200380	0 %	20 %	40 %	40 %	378973754
4123	NC_016843	TGC	2	6	200393	200398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973754
4124	NC_016843	CTG	2	6	200435	200440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973754
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4128	NC_016843	CTC	2	6	200754	200759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973755
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4232	NC_016843	TTTTA	2	10	205441	205450	20 %	80 %	0 %	0 %	378973759
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4237	NC_016843	GT	3	6	205652	205657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_016843	GGTG	2	8	205675	205682	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_016843	GA	3	6	205716	205721	50 %	0 %	50 %	0 %	378973760
4240	NC_016843	CG	4	8	205771	205778	0 %	0 %	50 %	50 %	378973760
4241	NC_016843	GGCG	2	8	205799	205806	0 %	0 %	75 %	25 %	378973760
4242	NC_016843	AAG	2	6	205881	205886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973760
4243	NC_016843	TGAT	2	8	205924	205931	25 %	50 %	25 %	0 %	378973760
4244	NC_016843	ATC	2	6	205932	205937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973760
4245	NC_016843	TGA	2	6	205954	205959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973760
4246	NC_016843	GT	4	8	206019	206026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_016843	AGGT	2	8	206053	206060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_016843	TGGT	2	8	206063	206070	0 %	50 %	50 %	0 %	378973761
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