MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016843	GA	3	6	50589	50594	50 %	0 %	50 %	0 %	378973606
1002	NC_016843	CGC	2	6	50646	50651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973606
1003	NC_016843	GAA	2	6	50707	50712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973606
1004	NC_016843	GCGCA	2	10	50735	50744	20 %	0 %	40 %	40 %	378973606
1005	NC_016843	CA	3	6	50780	50785	50 %	0 %	0 %	50 %	378973606
1006	NC_016843	GCAG	2	8	50845	50852	25 %	0 %	50 %	25 %	378973606
1007	NC_016843	GCA	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1008	NC_016843	CTA	2	6	50925	50930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973606
1009	NC_016843	GTT	2	6	50944	50949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973606
1010	NC_016843	TGC	2	6	51000	51005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1011	NC_016843	GA	3	6	51100	51105	50 %	0 %	50 %	0 %	378973606
1012	NC_016843	TTG	3	9	51112	51120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973606
1013	NC_016843	TC	3	6	51162	51167	0 %	50 %	0 %	50 %	378973606
1014	NC_016843	AGC	2	6	51180	51185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1015	NC_016843	GCG	2	6	51313	51318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973606
1016	NC_016843	AAG	2	6	51346	51351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973606
1017	NC_016843	GGC	2	6	51395	51400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973606
1018	NC_016843	TTCT	2	8	51459	51466	0 %	75 %	0 %	25 %	378973606
1019	NC_016843	TTG	2	6	51476	51481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973606
1020	NC_016843	CAC	2	6	51488	51493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973606
1021	NC_016843	GCA	2	6	51555	51560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1022	NC_016843	CG	4	8	51624	51631	0 %	0 %	50 %	50 %	378973606
1023	NC_016843	AGA	2	6	51666	51671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973606
1024	NC_016843	GC	3	6	51676	51681	0 %	0 %	50 %	50 %	378973606
1025	NC_016843	TTC	2	6	51714	51719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973606
1026	NC_016843	TGC	2	6	51738	51743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1027	NC_016843	CA	3	6	51944	51949	50 %	0 %	0 %	50 %	378973606
1028	NC_016843	GC	3	6	52012	52017	0 %	0 %	50 %	50 %	378973606
1029	NC_016843	GAG	2	6	52099	52104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973606
1030	NC_016843	CTG	2	6	52108	52113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1031	NC_016843	TC	3	6	52157	52162	0 %	50 %	0 %	50 %	378973606
1032	NC_016843	GGGC	2	8	52163	52170	0 %	0 %	75 %	25 %	378973606
1033	NC_016843	TGA	2	6	52190	52195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973606
1034	NC_016843	TCG	2	6	52302	52307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973606
1035	NC_016843	CG	3	6	52358	52363	0 %	0 %	50 %	50 %	378973606
1036	NC_016843	A	6	6	52375	52380	100 %	0 %	0 %	0 %	378973606
1037	NC_016843	GAT	2	6	52399	52404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973606
1038	NC_016843	GGA	2	6	52448	52453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973606
1039	NC_016843	TAT	2	6	52489	52494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973606
1040	NC_016843	TGT	2	6	52512	52517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973606
1041	NC_016843	GT	3	6	52516	52521	0 %	50 %	50 %	0 %	378973606
1042	NC_016843	TCT	2	6	52574	52579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016843	TCG	3	9	52625	52633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1044	NC_016843	GTG	2	6	52634	52639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973607
1045	NC_016843	GCG	2	6	52657	52662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973607
1046	NC_016843	TCA	2	6	52697	52702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973607
1047	NC_016843	GGA	2	6	52750	52755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973607
1048	NC_016843	CGG	2	6	52794	52799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973607
1049	NC_016843	ATGC	2	8	52820	52827	25 %	25 %	25 %	25 %	378973607
1050	NC_016843	CAA	2	6	52848	52853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973607
1051	NC_016843	TGCAG	2	10	52866	52875	20 %	20 %	40 %	20 %	378973607
1052	NC_016843	GCA	2	6	52941	52946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1053	NC_016843	TG	3	6	52980	52985	0 %	50 %	50 %	0 %	378973607
1054	NC_016843	GGT	2	6	53073	53078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973607
1055	NC_016843	GT	3	6	53108	53113	0 %	50 %	50 %	0 %	378973607
1056	NC_016843	A	6	6	53187	53192	100 %	0 %	0 %	0 %	378973607
1057	NC_016843	CG	4	8	53229	53236	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1058	NC_016843	TAC	2	6	53237	53242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973607
1059	NC_016843	AAG	2	6	53276	53281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1060	NC_016843	AATC	2	8	53322	53329	50 %	25 %	0 %	25 %	378973607
1061	NC_016843	ATTA	2	8	53350	53357	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1062	NC_016843	GA	3	6	53365	53370	50 %	0 %	50 %	0 %	378973607
1063	NC_016843	TA	4	8	53540	53547	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1064	NC_016843	CG	3	6	53617	53622	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1065	NC_016843	TTA	2	6	53624	53629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973607
1066	NC_016843	CAAA	2	8	53692	53699	75 %	0 %	0 %	25 %	378973607
1067	NC_016843	GAA	2	6	53752	53757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1068	NC_016843	TAT	2	6	53772	53777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973607
1069	NC_016843	CGCTG	2	10	53790	53799	0 %	20 %	40 %	40 %	378973607
1070	NC_016843	CG	3	6	53802	53807	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1071	NC_016843	ATC	2	6	53831	53836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973607
1072	NC_016843	CGA	2	6	53853	53858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1073	NC_016843	AT	3	6	53862	53867	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1074	NC_016843	GAT	2	6	53881	53886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973607
1075	NC_016843	CG	3	6	53928	53933	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1076	NC_016843	AGA	2	6	54011	54016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1077	NC_016843	CTG	2	6	54020	54025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1078	NC_016843	A	7	7	54038	54044	100 %	0 %	0 %	0 %	378973607
1079	NC_016843	CAA	2	6	54084	54089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973607
1080	NC_016843	GCTAC	2	10	54154	54163	20 %	20 %	20 %	40 %	378973607
1081	NC_016843	TCGCT	2	10	54191	54200	0 %	40 %	20 %	40 %	378973607
1082	NC_016843	GGAA	2	8	54315	54322	50 %	0 %	50 %	0 %	378973607
1083	NC_016843	CG	3	6	54348	54353	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1084	NC_016843	TC	3	6	54363	54368	0 %	50 %	0 %	50 %	378973607
1085	NC_016843	AGC	2	6	54485	54490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1086	NC_016843	AGA	2	6	54503	54508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016843	CAGG	2	8	54519	54526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_016843	GTAC	2	8	54532	54539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_016843	A	6	6	54632	54637	100 %	0 %	0 %	0 %	378973608
1090	NC_016843	CATC	2	8	54676	54683	25 %	25 %	0 %	50 %	378973608
1091	NC_016843	T	8	8	54685	54692	0 %	100 %	0 %	0 %	378973608
1092	NC_016843	TTTC	2	8	54765	54772	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
1093	NC_016843	CTTT	2	8	54895	54902	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
1094	NC_016843	T	6	6	54900	54905	0 %	100 %	0 %	0 %	378973608
1095	NC_016843	CAT	2	6	55007	55012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973608
1096	NC_016843	TTC	2	6	55142	55147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973608
1097	NC_016843	ACG	2	6	55188	55193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973608
1098	NC_016843	AAT	2	6	55283	55288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973608
1099	NC_016843	TCG	2	6	55299	55304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973608
1100	NC_016843	ACT	2	6	55338	55343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973608
1101	NC_016843	TCGT	2	8	55361	55368	0 %	50 %	25 %	25 %	378973608
1102	NC_016843	ATA	2	6	55421	55426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973608
1103	NC_016843	ATGCT	2	10	55482	55491	20 %	40 %	20 %	20 %	378973609
1104	NC_016843	A	6	6	55534	55539	100 %	0 %	0 %	0 %	378973609
1105	NC_016843	AGG	2	6	55582	55587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973609
1106	NC_016843	GT	3	6	55625	55630	0 %	50 %	50 %	0 %	378973609
1107	NC_016843	ACG	2	6	55636	55641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973609
1108	NC_016843	CAG	2	6	55655	55660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973609
1109	NC_016843	CAC	2	6	55696	55701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973609
1110	NC_016843	AC	3	6	55725	55730	50 %	0 %	0 %	50 %	378973609
1111	NC_016843	GTG	2	6	55744	55749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016843	CA	3	6	55780	55785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_016843	GT	3	6	55792	55797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016843	ACA	2	6	55821	55826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973610
1115	NC_016843	CAT	2	6	55848	55853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973610
1116	NC_016843	ATA	2	6	55868	55873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973610
1117	NC_016843	T	7	7	55876	55882	0 %	100 %	0 %	0 %	378973610
1118	NC_016843	CTG	2	6	55915	55920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1119	NC_016843	CAA	2	6	55930	55935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973610
1120	NC_016843	GC	4	8	55940	55947	0 %	0 %	50 %	50 %	378973610
1121	NC_016843	GCA	2	6	55950	55955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1122	NC_016843	CTA	2	6	55967	55972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973610
1123	NC_016843	CTT	2	6	55979	55984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973610
1124	NC_016843	CTAA	2	8	56041	56048	50 %	25 %	0 %	25 %	378973610
1125	NC_016843	CTT	2	6	56099	56104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973610
1126	NC_016843	GCA	2	6	56179	56184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1127	NC_016843	TATG	2	8	56198	56205	25 %	50 %	25 %	0 %	378973610
1128	NC_016843	TCCT	2	8	56415	56422	0 %	50 %	0 %	50 %	378973610
1129	NC_016843	GCG	2	6	56435	56440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973610
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1141	NC_016843	CT	3	6	56977	56982	0 %	50 %	0 %	50 %	378973611
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1241	NC_016843	AAAT	2	8	62215	62222	75 %	25 %	0 %	0 %	378973617
1242	NC_016843	CAG	2	6	62256	62261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973617
1243	NC_016843	GC	3	6	62319	62324	0 %	0 %	50 %	50 %	378973617
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1245	NC_016843	TTC	2	6	62370	62375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973617
1246	NC_016843	TGTAAC	2	12	62399	62410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973617
1247	NC_016843	AAGG	2	8	62529	62536	50 %	0 %	50 %	0 %	378973617
1248	NC_016843	TTC	2	6	62613	62618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973617
1249	NC_016843	GTT	2	6	62631	62636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973617
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1251	NC_016843	C	6	6	62709	62714	0 %	0 %	0 %	100 %	378973617
1252	NC_016843	GC	3	6	62762	62767	0 %	0 %	50 %	50 %	378973617
1253	NC_016843	CAT	2	6	62793	62798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973617
1254	NC_016843	CCT	3	9	62806	62814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_016843	GTA	2	6	62830	62835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_016843	GCG	2	6	62863	62868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_016843	TG	3	6	62904	62909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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