MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 23987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016843	GCAC	2	8	614001	614008	25 %	0 %	25 %	50 %	378974142
13002	NC_016843	CTT	2	6	614030	614035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974142
13003	NC_016843	CGTG	2	8	614073	614080	0 %	25 %	50 %	25 %	378974142
13004	NC_016843	GGA	2	6	614135	614140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974142
13005	NC_016843	CTGT	2	8	614158	614165	0 %	50 %	25 %	25 %	378974142
13006	NC_016843	T	6	6	614178	614183	0 %	100 %	0 %	0 %	378974142
13007	NC_016843	CAG	2	6	614205	614210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974142
13008	NC_016843	TCT	2	6	614241	614246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974142
13009	NC_016843	GAC	2	6	614268	614273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974142
13010	NC_016843	ATG	2	6	614288	614293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974142
13011	NC_016843	TCT	2	6	614296	614301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974142
13012	NC_016843	CCTT	2	8	614310	614317	0 %	50 %	0 %	50 %	378974142
13013	NC_016843	CCA	2	6	614362	614367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974142
13014	NC_016843	T	6	6	614378	614383	0 %	100 %	0 %	0 %	378974142
13015	NC_016843	CT	3	6	614421	614426	0 %	50 %	0 %	50 %	378974142
13016	NC_016843	T	6	6	614426	614431	0 %	100 %	0 %	0 %	378974142
13017	NC_016843	ACTG	2	8	614500	614507	25 %	25 %	25 %	25 %	378974142
13018	NC_016843	GCAC	2	8	614651	614658	25 %	0 %	25 %	50 %	378974142
13019	NC_016843	AC	3	6	614657	614662	50 %	0 %	0 %	50 %	378974142
13020	NC_016843	CGG	2	6	614676	614681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974142
13021	NC_016843	GC	4	8	614776	614783	0 %	0 %	50 %	50 %	378974142
13022	NC_016843	CTG	2	6	614820	614825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974142
13023	NC_016843	GC	3	6	614891	614896	0 %	0 %	50 %	50 %	378974142
13024	NC_016843	CCA	2	6	614897	614902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974142
13025	NC_016843	TCG	2	6	615074	615079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974142
13026	NC_016843	AGA	2	6	615102	615107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974142
13027	NC_016843	AG	3	6	615158	615163	50 %	0 %	50 %	0 %	378974143
13028	NC_016843	CAC	2	6	615179	615184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974143
13029	NC_016843	CGTG	2	8	615236	615243	0 %	25 %	50 %	25 %	378974143
13030	NC_016843	ACT	2	6	615334	615339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974143
13031	NC_016843	TGTT	2	8	615382	615389	0 %	75 %	25 %	0 %	378974143
13032	NC_016843	TG	3	6	615429	615434	0 %	50 %	50 %	0 %	378974143
13033	NC_016843	AAT	2	6	615438	615443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974143
13034	NC_016843	GC	3	6	615454	615459	0 %	0 %	50 %	50 %	378974143
13035	NC_016843	T	6	6	615461	615466	0 %	100 %	0 %	0 %	378974143
13036	NC_016843	CG	3	6	615474	615479	0 %	0 %	50 %	50 %	378974143
13037	NC_016843	CA	4	8	615501	615508	50 %	0 %	0 %	50 %	378974143
13038	NC_016843	CAT	2	6	615521	615526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974143
13039	NC_016843	TCAT	2	8	615541	615548	25 %	50 %	0 %	25 %	378974143
13040	NC_016843	TTG	2	6	615582	615587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974143
13041	NC_016843	TAA	2	6	615631	615636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974143
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13043	NC_016843	CTT	2	6	615671	615676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974143
13044	NC_016843	CCG	2	6	615718	615723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974143
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13046	NC_016843	GTT	2	6	615799	615804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974143
13047	NC_016843	TTTC	2	8	615805	615812	0 %	75 %	0 %	25 %	378974143
13048	NC_016843	ACGGCC	2	12	615850	615861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974143
13049	NC_016843	GCA	2	6	615898	615903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974143
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13052	NC_016843	TTA	2	6	616195	616200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974143
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13054	NC_016843	CAT	2	6	616248	616253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974143
13055	NC_016843	TAA	2	6	616274	616279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974144
13056	NC_016843	AAAGAA	2	12	616321	616332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378974144
13057	NC_016843	CGC	2	6	616333	616338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974144
13058	NC_016843	AGCA	2	8	616374	616381	50 %	0 %	25 %	25 %	378974144
13059	NC_016843	CG	4	8	616384	616391	0 %	0 %	50 %	50 %	378974144
13060	NC_016843	AC	3	6	616418	616423	50 %	0 %	0 %	50 %	378974144
13061	NC_016843	CA	3	6	616428	616433	50 %	0 %	0 %	50 %	378974144
13062	NC_016843	GCAC	2	8	616601	616608	25 %	0 %	25 %	50 %	378974144
13063	NC_016843	ACT	2	6	616627	616632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974144
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13065	NC_016843	A	8	8	616771	616778	100 %	0 %	0 %	0 %	378974144
13066	NC_016843	CA	3	6	616782	616787	50 %	0 %	0 %	50 %	378974144
13067	NC_016843	AAATAC	2	12	616826	616837	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378974144
13068	NC_016843	ACTG	2	8	616889	616896	25 %	25 %	25 %	25 %	378974144
13069	NC_016843	TGA	2	6	617010	617015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974144
13070	NC_016843	GGAA	2	8	617047	617054	50 %	0 %	50 %	0 %	378974144
13071	NC_016843	AGAA	2	8	617083	617090	75 %	0 %	25 %	0 %	378974144
13072	NC_016843	ACC	2	6	617135	617140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974144
13073	NC_016843	GC	3	6	617183	617188	0 %	0 %	50 %	50 %	378974144
13074	NC_016843	A	7	7	617209	617215	100 %	0 %	0 %	0 %	378974144
13075	NC_016843	A	7	7	617254	617260	100 %	0 %	0 %	0 %	378974144
13076	NC_016843	CT	3	6	617290	617295	0 %	50 %	0 %	50 %	378974144
13077	NC_016843	AT	3	6	617376	617381	50 %	50 %	0 %	0 %	378974144
13078	NC_016843	TG	3	6	617407	617412	0 %	50 %	50 %	0 %	378974144
13079	NC_016843	GCAC	2	8	617438	617445	25 %	0 %	25 %	50 %	378974144
13080	NC_016843	AAAAG	2	10	617481	617490	80 %	0 %	20 %	0 %	378974144
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13083	NC_016843	A	8	8	617704	617711	100 %	0 %	0 %	0 %	378974144
13084	NC_016843	AGC	2	6	617722	617727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974144
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13086	NC_016843	A	7	7	617742	617748	100 %	0 %	0 %	0 %	378974144
13087	NC_016843	CAG	2	6	617794	617799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974145
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13089	NC_016843	AG	3	6	617871	617876	50 %	0 %	50 %	0 %	378974145
13090	NC_016843	CCA	2	6	617905	617910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974145
13091	NC_016843	ATC	2	6	617936	617941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974145
13092	NC_016843	CAG	2	6	617948	617953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974145
13093	NC_016843	CAA	2	6	618037	618042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974145
13094	NC_016843	GC	4	8	618073	618080	0 %	0 %	50 %	50 %	378974145
13095	NC_016843	TCCTTT	2	12	618117	618128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974145
13096	NC_016843	CAG	2	6	618223	618228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974145
13097	NC_016843	CTCC	2	8	618238	618245	0 %	25 %	0 %	75 %	378974145
13098	NC_016843	AAT	2	6	618310	618315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974145
13099	NC_016843	AGC	2	6	618360	618365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974145
13100	NC_016843	GCC	2	6	618426	618431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_016843	CT	3	6	618447	618452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_016843	CCA	2	6	618472	618477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_016843	CTG	2	6	618509	618514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974146
13104	NC_016843	ATT	2	6	618623	618628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974146
13105	NC_016843	C	6	6	618639	618644	0 %	0 %	0 %	100 %	378974146
13106	NC_016843	CCG	2	6	618661	618666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974146
13107	NC_016843	TCA	2	6	618688	618693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974146
13108	NC_016843	TAC	2	6	618731	618736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974146
13109	NC_016843	CAA	2	6	618823	618828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974146
13110	NC_016843	CTG	2	6	618868	618873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974146
13111	NC_016843	CTG	2	6	618881	618886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974146
13112	NC_016843	GCA	2	6	618966	618971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974146
13113	NC_016843	ACC	2	6	619007	619012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974146
13114	NC_016843	CAC	2	6	619064	619069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974146
13115	NC_016843	CTC	2	6	619121	619126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13116	NC_016843	GC	3	6	619267	619272	0 %	0 %	50 %	50 %	378974147
13117	NC_016843	TACA	2	8	619302	619309	50 %	25 %	0 %	25 %	378974147
13118	NC_016843	CGC	3	9	619467	619475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974147
13119	NC_016843	TCC	2	6	619480	619485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974147
13120	NC_016843	TCCC	2	8	619488	619495	0 %	25 %	0 %	75 %	378974147
13121	NC_016843	TCCT	2	8	619497	619504	0 %	50 %	0 %	50 %	378974147
13122	NC_016843	CA	4	8	619507	619514	50 %	0 %	0 %	50 %	378974147
13123	NC_016843	ACC	2	6	619540	619545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974147
13124	NC_016843	AGCC	2	8	619577	619584	25 %	0 %	25 %	50 %	378974147
13125	NC_016843	CGC	2	6	619635	619640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974147
13126	NC_016843	CTC	2	6	619641	619646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974147
13127	NC_016843	A	7	7	619649	619655	100 %	0 %	0 %	0 %	378974147
13128	NC_016843	GGA	2	6	619657	619662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974147
13129	NC_016843	TCC	2	6	619698	619703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974147
13130	NC_016843	ACCC	2	8	619761	619768	25 %	0 %	0 %	75 %	378974147
13131	NC_016843	GC	3	6	619863	619868	0 %	0 %	50 %	50 %	378974147
13132	NC_016843	GGT	2	6	619962	619967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974147
13133	NC_016843	GC	3	6	619982	619987	0 %	0 %	50 %	50 %	378974147
13134	NC_016843	AAT	2	6	619996	620001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974147
13135	NC_016843	A	6	6	620002	620007	100 %	0 %	0 %	0 %	378974147
13136	NC_016843	CG	4	8	620011	620018	0 %	0 %	50 %	50 %	378974147
13137	NC_016843	TGC	2	6	620025	620030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974147
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13140	NC_016843	TTC	2	6	620127	620132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974147
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13142	NC_016843	TCA	2	6	620188	620193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974147
13143	NC_016843	GCT	2	6	620213	620218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974147
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13145	NC_016843	CTC	2	6	620370	620375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974147
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13147	NC_016843	CTG	2	6	620449	620454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974147
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13154	NC_016843	CTGC	2	8	620611	620618	0 %	25 %	25 %	50 %	378974147
13155	NC_016843	GC	3	6	620682	620687	0 %	0 %	50 %	50 %	378974147
13156	NC_016843	AC	3	6	620688	620693	50 %	0 %	0 %	50 %	378974147
13157	NC_016843	A	7	7	620700	620706	100 %	0 %	0 %	0 %	378974147
13158	NC_016843	ATGCA	2	10	620751	620760	40 %	20 %	20 %	20 %	378974147
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13164	NC_016843	CA	3	6	620875	620880	50 %	0 %	0 %	50 %	378974147
13165	NC_016843	ACA	2	6	620894	620899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974147
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13167	NC_016843	CAA	2	6	620985	620990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974147
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13169	NC_016843	CTG	2	6	621084	621089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974147
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13173	NC_016843	CATC	2	8	621470	621477	25 %	25 %	0 %	50 %	378974147
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13183	NC_016843	CG	4	8	621888	621895	0 %	0 %	50 %	50 %	378974148
13184	NC_016843	TGC	2	6	621907	621912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974148
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13188	NC_016843	GGC	2	6	622027	622032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974148
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13190	NC_016843	GT	3	6	622186	622191	0 %	50 %	50 %	0 %	378974148
13191	NC_016843	GCA	2	6	622223	622228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974148
13192	NC_016843	AGTCC	2	10	622238	622247	20 %	20 %	20 %	40 %	378974148
13193	NC_016843	AGC	2	6	622254	622259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974148
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13196	NC_016843	GA	3	6	622393	622398	50 %	0 %	50 %	0 %	378974148
13197	NC_016843	CA	3	6	622450	622455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13198	NC_016843	GCA	2	6	622476	622481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974149
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13200	NC_016843	GC	3	6	622671	622676	0 %	0 %	50 %	50 %	378974149
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13203	NC_016843	CACC	2	8	622786	622793	25 %	0 %	0 %	75 %	378974149
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13210	NC_016843	CGGTTG	2	12	623143	623154	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974150
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13231	NC_016843	AC	3	6	624119	624124	50 %	0 %	0 %	50 %	378974150
13232	NC_016843	CAGA	2	8	624140	624147	50 %	0 %	25 %	25 %	378974150
13233	NC_016843	GC	3	6	624174	624179	0 %	0 %	50 %	50 %	378974150
13234	NC_016843	CTC	2	6	624228	624233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13235	NC_016843	AC	3	6	624307	624312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13236	NC_016843	CGCA	2	8	624350	624357	25 %	0 %	25 %	50 %	378974151
13237	NC_016843	AACCT	2	10	624375	624384	40 %	20 %	0 %	40 %	378974151
13238	NC_016843	AG	3	6	624419	624424	50 %	0 %	50 %	0 %	378974151
13239	NC_016843	GCA	2	6	624495	624500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974151
13240	NC_016843	TCCGCG	2	12	624513	624524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974151
13241	NC_016843	GAAG	2	8	624583	624590	50 %	0 %	50 %	0 %	378974151
13242	NC_016843	GTA	2	6	624641	624646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974151
13243	NC_016843	CCA	2	6	624722	624727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974151
13244	NC_016843	CAG	2	6	624733	624738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974151
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13246	NC_016843	GTA	2	6	624791	624796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974151
13247	NC_016843	TCA	2	6	624820	624825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974151
13248	NC_016843	TGC	2	6	624964	624969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974151
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13258	NC_016843	AGT	2	6	625614	625619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974151
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13302	NC_016843	GAA	2	6	627862	627867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13366	NC_016843	CGC	2	6	630888	630893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974156
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13491	NC_016843	CAC	2	6	637235	637240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974161
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13493	NC_016843	GTA	2	6	637366	637371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974162
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