MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 3039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016842	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	378972502
2	NC_016842	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	378972502
3	NC_016842	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	378972502
4	NC_016842	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	378972502
5	NC_016842	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	378972502
6	NC_016842	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	378972503
7	NC_016842	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	378972503
8	NC_016842	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	378972504
9	NC_016842	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	378972504
10	NC_016842	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	378972505
11	NC_016842	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	378972506
12	NC_016842	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	378972506
13	NC_016842	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016842	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	378972507
15	NC_016842	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	378972507
16	NC_016842	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	378972507
17	NC_016842	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	378972507
18	NC_016842	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	378972507
19	NC_016842	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	378972507
20	NC_016842	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	378972507
21	NC_016842	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	378972507
22	NC_016842	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	378972507
23	NC_016842	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	378972509
24	NC_016842	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	378972509
25	NC_016842	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	378972509
26	NC_016842	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	378972509
27	NC_016842	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	378972510
28	NC_016842	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	378972510
29	NC_016842	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	378972510
30	NC_016842	GCAT	2	8	10134	10141	25 %	25 %	25 %	25 %	378972510
31	NC_016842	ATGT	2	8	10213	10220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016842	GTGG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016842	GCTT	2	8	10623	10630	0 %	50 %	25 %	25 %	378972511
34	NC_016842	TGGA	2	8	11620	11627	25 %	25 %	50 %	0 %	378972511
35	NC_016842	AAGT	2	8	11844	11851	50 %	25 %	25 %	0 %	378972511
36	NC_016842	GAGC	2	8	12345	12352	25 %	0 %	50 %	25 %	378972511
37	NC_016842	GCGT	2	8	13222	13229	0 %	25 %	50 %	25 %	378972513
38	NC_016842	GTTT	2	8	13599	13606	0 %	75 %	25 %	0 %	378972513
39	NC_016842	GAAG	2	8	13657	13664	50 %	0 %	50 %	0 %	378972513
40	NC_016842	ACAT	2	8	13692	13699	50 %	25 %	0 %	25 %	378972513
41	NC_016842	AGGG	2	8	14110	14117	25 %	0 %	75 %	0 %	378972514
42	NC_016842	TTTC	2	8	14325	14332	0 %	75 %	0 %	25 %	378972514
43	NC_016842	AGAT	2	8	14983	14990	50 %	25 %	25 %	0 %	378972514
44	NC_016842	GCTC	2	8	15785	15792	0 %	25 %	25 %	50 %	378972514
45	NC_016842	GCTG	2	8	16215	16222	0 %	25 %	50 %	25 %	378972515
46	NC_016842	GTAC	2	8	16313	16320	25 %	25 %	25 %	25 %	378972515
47	NC_016842	TGCG	2	8	16697	16704	0 %	25 %	50 %	25 %	378972515
48	NC_016842	TGGT	2	8	17150	17157	0 %	50 %	50 %	0 %	378972515
49	NC_016842	GCAG	2	8	17504	17511	25 %	0 %	50 %	25 %	378972515
50	NC_016842	AAGG	2	8	17683	17690	50 %	0 %	50 %	0 %	378972515
51	NC_016842	GTGC	2	8	18157	18164	0 %	25 %	50 %	25 %	378972515
52	NC_016842	TTTA	2	8	18328	18335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016842	CGAT	2	8	18418	18425	25 %	25 %	25 %	25 %	378972516
54	NC_016842	CGTT	2	8	18641	18648	0 %	50 %	25 %	25 %	378972516
55	NC_016842	TATG	2	8	18687	18694	25 %	50 %	25 %	0 %	378972516
56	NC_016842	GTTA	2	8	19792	19799	25 %	50 %	25 %	0 %	378972517
57	NC_016842	GAAA	2	8	20644	20651	75 %	0 %	25 %	0 %	378972517
58	NC_016842	TGCG	2	8	20856	20863	0 %	25 %	50 %	25 %	378972517
59	NC_016842	GCTT	2	8	21176	21183	0 %	50 %	25 %	25 %	378972517
60	NC_016842	ACAA	2	8	22722	22729	75 %	0 %	0 %	25 %	378972518
61	NC_016842	GCAC	2	8	22861	22868	25 %	0 %	25 %	50 %	378972518
62	NC_016842	ATGT	2	8	23082	23089	25 %	50 %	25 %	0 %	378972518
63	NC_016842	CTTC	2	8	24293	24300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016842	AAAG	2	8	25263	25270	75 %	0 %	25 %	0 %	378972519
65	NC_016842	TTAT	2	8	25316	25323	25 %	75 %	0 %	0 %	378972519
66	NC_016842	GATT	2	8	25862	25869	25 %	50 %	25 %	0 %	378972520
67	NC_016842	AGCG	2	8	26000	26007	25 %	0 %	50 %	25 %	378972520
68	NC_016842	CCTT	2	8	26836	26843	0 %	50 %	0 %	50 %	378972520
69	NC_016842	GCAC	2	8	26942	26949	25 %	0 %	25 %	50 %	378972520
70	NC_016842	AGCG	2	8	27255	27262	25 %	0 %	50 %	25 %	378972520
71	NC_016842	CAGT	2	8	27346	27353	25 %	25 %	25 %	25 %	378972520
72	NC_016842	TGCG	2	8	27794	27801	0 %	25 %	50 %	25 %	378972521
73	NC_016842	CATC	2	8	27823	27830	25 %	25 %	0 %	50 %	378972521
74	NC_016842	AGTG	2	8	28056	28063	25 %	25 %	50 %	0 %	378972521
75	NC_016842	TTTG	2	8	28440	28447	0 %	75 %	25 %	0 %	378972521
76	NC_016842	AAAG	2	8	30940	30947	75 %	0 %	25 %	0 %	378972523
77	NC_016842	GCGG	2	8	31116	31123	0 %	0 %	75 %	25 %	378972523
78	NC_016842	TCGT	2	8	31282	31289	0 %	50 %	25 %	25 %	378972523
79	NC_016842	TGTC	2	8	31422	31429	0 %	50 %	25 %	25 %	378972523
80	NC_016842	ATCC	2	8	32112	32119	25 %	25 %	0 %	50 %	378972523
81	NC_016842	CTCG	2	8	32121	32128	0 %	25 %	25 %	50 %	378972523
82	NC_016842	GTAC	2	8	32145	32152	25 %	25 %	25 %	25 %	378972523
83	NC_016842	TTCA	2	8	32457	32464	25 %	50 %	0 %	25 %	378972523
84	NC_016842	GTTG	2	8	32486	32493	0 %	50 %	50 %	0 %	378972523
85	NC_016842	CAAA	2	8	32795	32802	75 %	0 %	0 %	25 %	378972523
86	NC_016842	TGCG	2	8	33242	33249	0 %	25 %	50 %	25 %	378972524
87	NC_016842	CCGC	2	8	33645	33652	0 %	0 %	25 %	75 %	378972524
88	NC_016842	GCCG	2	8	34514	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	378972525
89	NC_016842	ATTG	2	8	34800	34807	25 %	50 %	25 %	0 %	378972525
90	NC_016842	GACG	2	8	34951	34958	25 %	0 %	50 %	25 %	378972525
91	NC_016842	CGTG	2	8	35745	35752	0 %	25 %	50 %	25 %	378972526
92	NC_016842	GGGT	2	8	36288	36295	0 %	25 %	75 %	0 %	378972526
93	NC_016842	GACA	2	8	36430	36437	50 %	0 %	25 %	25 %	378972526
94	NC_016842	TAAG	2	8	36813	36820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016842	GTGC	2	8	37189	37196	0 %	25 %	50 %	25 %	378972527
96	NC_016842	GCGA	2	8	37471	37478	25 %	0 %	50 %	25 %	378972527
97	NC_016842	ACGT	2	8	37679	37686	25 %	25 %	25 %	25 %	378972527
98	NC_016842	GAGC	2	8	37734	37741	25 %	0 %	50 %	25 %	378972527
99	NC_016842	TGCG	2	8	38048	38055	0 %	25 %	50 %	25 %	378972527
100	NC_016842	CTTG	2	8	38422	38429	0 %	50 %	25 %	25 %	378972528
101	NC_016842	ACGA	2	8	38549	38556	50 %	0 %	25 %	25 %	378972528
102	NC_016842	GACT	2	8	39606	39613	25 %	25 %	25 %	25 %	378972528
103	NC_016842	GGTT	2	8	39625	39632	0 %	50 %	50 %	0 %	378972528
104	NC_016842	GTAT	2	8	39936	39943	25 %	50 %	25 %	0 %	378972528
105	NC_016842	TTTC	2	8	40096	40103	0 %	75 %	0 %	25 %	378972529
106	NC_016842	TCGG	2	8	40169	40176	0 %	25 %	50 %	25 %	378972529
107	NC_016842	TCCA	2	8	40473	40480	25 %	25 %	0 %	50 %	378972530
108	NC_016842	GAAA	2	8	41026	41033	75 %	0 %	25 %	0 %	378972530
109	NC_016842	AGAA	2	8	41217	41224	75 %	0 %	25 %	0 %	378972531
110	NC_016842	GAAA	2	8	41625	41632	75 %	0 %	25 %	0 %	378972531
111	NC_016842	CATC	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	378972534
112	NC_016842	GCTC	2	8	44238	44245	0 %	25 %	25 %	50 %	378972534
113	NC_016842	GGGT	2	8	44280	44287	0 %	25 %	75 %	0 %	378972534
114	NC_016842	ACCC	2	8	44489	44496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_016842	GCAC	2	8	45359	45366	25 %	0 %	25 %	50 %	378972535
116	NC_016842	AGGA	2	8	45741	45748	50 %	0 %	50 %	0 %	378972536
117	NC_016842	TTAC	2	8	47158	47165	25 %	50 %	0 %	25 %	378972538
118	NC_016842	TCCC	2	8	47202	47209	0 %	25 %	0 %	75 %	378972538
119	NC_016842	TGGG	2	8	47826	47833	0 %	25 %	75 %	0 %	378972538
120	NC_016842	GTCG	2	8	48719	48726	0 %	25 %	50 %	25 %	378972538
121	NC_016842	GGAC	2	8	48769	48776	25 %	0 %	50 %	25 %	378972538
122	NC_016842	CGCC	2	8	49293	49300	0 %	0 %	25 %	75 %	378972538
123	NC_016842	AGCG	2	8	49425	49432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016842	CGGG	2	8	49493	49500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016842	GAGG	2	8	49930	49937	25 %	0 %	75 %	0 %	378972539
126	NC_016842	GCAG	2	8	50846	50853	25 %	0 %	50 %	25 %	378972540
127	NC_016842	TTCT	2	8	51460	51467	0 %	75 %	0 %	25 %	378972540
128	NC_016842	GGGC	2	8	52164	52171	0 %	0 %	75 %	25 %	378972540
129	NC_016842	ATGC	2	8	52821	52828	25 %	25 %	25 %	25 %	378972541
130	NC_016842	AATC	2	8	53323	53330	50 %	25 %	0 %	25 %	378972541
131	NC_016842	ATTA	2	8	53351	53358	50 %	50 %	0 %	0 %	378972541
132	NC_016842	CAAA	2	8	53693	53700	75 %	0 %	0 %	25 %	378972541
133	NC_016842	GGAA	2	8	54316	54323	50 %	0 %	50 %	0 %	378972541
134	NC_016842	CAGG	2	8	54520	54527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016842	GTAC	2	8	54533	54540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016842	CATC	2	8	54677	54684	25 %	25 %	0 %	50 %	378972542
137	NC_016842	TTTC	2	8	54766	54773	0 %	75 %	0 %	25 %	378972542
138	NC_016842	CTTT	2	8	54896	54903	0 %	75 %	0 %	25 %	378972542
139	NC_016842	TCGT	2	8	55362	55369	0 %	50 %	25 %	25 %	378972542
140	NC_016842	CTAA	2	8	56042	56049	50 %	25 %	0 %	25 %	378972544
141	NC_016842	TATG	2	8	56199	56206	25 %	50 %	25 %	0 %	378972544
142	NC_016842	TCCT	2	8	56416	56423	0 %	50 %	0 %	50 %	378972544
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