MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_016842	GT	4	8	1115288	1115295	0 %	50 %	50 %	0 %	378973546
23502	NC_016842	TG	3	6	1115298	1115303	0 %	50 %	50 %	0 %	378973546
23503	NC_016842	GC	3	6	1115361	1115366	0 %	0 %	50 %	50 %	378973546
23504	NC_016842	ACG	2	6	1115465	1115470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973546
23505	NC_016842	GCG	2	6	1115526	1115531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973546
23506	NC_016842	GGA	3	9	1115556	1115564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973546
23507	NC_016842	TGC	2	6	1115583	1115588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973546
23508	NC_016842	AGG	2	6	1115672	1115677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973546
23509	NC_016842	AGA	2	6	1115742	1115747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973546
23510	NC_016842	TGCGA	2	10	1115756	1115765	20 %	20 %	40 %	20 %	378973546
23511	NC_016842	TCGTA	2	10	1115842	1115851	20 %	40 %	20 %	20 %	378973546
23512	NC_016842	AGA	2	6	1115925	1115930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973546
23513	NC_016842	CACT	2	8	1115998	1116005	25 %	25 %	0 %	50 %	378973546
23514	NC_016842	ACCTG	2	10	1116039	1116048	20 %	20 %	20 %	40 %	378973546
23515	NC_016842	TC	3	6	1116075	1116080	0 %	50 %	0 %	50 %	378973546
23516	NC_016842	GCG	2	6	1116108	1116113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973546
23517	NC_016842	CGA	2	6	1116226	1116231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973546
23518	NC_016842	GTA	2	6	1116265	1116270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973546
23519	NC_016842	GAA	2	6	1116276	1116281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973546
23520	NC_016842	AT	3	6	1116377	1116382	50 %	50 %	0 %	0 %	378973546
23521	NC_016842	GAA	2	6	1116460	1116465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973546
23522	NC_016842	GC	3	6	1116585	1116590	0 %	0 %	50 %	50 %	378973546
23523	NC_016842	CCA	2	6	1116618	1116623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973546
23524	NC_016842	CT	3	6	1116628	1116633	0 %	50 %	0 %	50 %	378973546
23525	NC_016842	GCG	2	6	1116667	1116672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23526	NC_016842	TC	3	6	1116674	1116679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23527	NC_016842	GCCCG	2	10	1116691	1116700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23528	NC_016842	GAA	2	6	1116714	1116719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23529	NC_016842	CTA	2	6	1116735	1116740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973547
23530	NC_016842	CGCCTT	2	12	1116741	1116752	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973547
23531	NC_016842	CAC	2	6	1116789	1116794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973547
23532	NC_016842	AGG	2	6	1116807	1116812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973547
23533	NC_016842	GT	3	6	1116815	1116820	0 %	50 %	50 %	0 %	378973547
23534	NC_016842	AT	3	6	1116843	1116848	50 %	50 %	0 %	0 %	378973547
23535	NC_016842	A	6	6	1117139	1117144	100 %	0 %	0 %	0 %	378973547
23536	NC_016842	CG	3	6	1117145	1117150	0 %	0 %	50 %	50 %	378973547
23537	NC_016842	ACT	2	6	1117155	1117160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973547
23538	NC_016842	CA	3	6	1117214	1117219	50 %	0 %	0 %	50 %	378973547
23539	NC_016842	CCTG	2	8	1117253	1117260	0 %	25 %	25 %	50 %	378973547
23540	NC_016842	TAA	2	6	1117265	1117270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973547
23541	NC_016842	A	6	6	1117269	1117274	100 %	0 %	0 %	0 %	378973547
23542	NC_016842	TCA	2	6	1117333	1117338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973547
23543	NC_016842	A	6	6	1117369	1117374	100 %	0 %	0 %	0 %	378973547
23544	NC_016842	CCA	2	6	1117415	1117420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973547
23545	NC_016842	ACT	2	6	1117429	1117434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973547
23546	NC_016842	A	6	6	1117476	1117481	100 %	0 %	0 %	0 %	378973547
23547	NC_016842	ACCC	2	8	1117504	1117511	25 %	0 %	0 %	75 %	378973547
23548	NC_016842	TGAT	2	8	1117540	1117547	25 %	50 %	25 %	0 %	378973547
23549	NC_016842	A	6	6	1117577	1117582	100 %	0 %	0 %	0 %	378973547
23550	NC_016842	GAATC	2	10	1117589	1117598	40 %	20 %	20 %	20 %	378973547
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23553	NC_016842	GC	4	8	1117907	1117914	0 %	0 %	50 %	50 %	378973547
23554	NC_016842	CA	3	6	1117919	1117924	50 %	0 %	0 %	50 %	378973547
23555	NC_016842	GAA	2	6	1117945	1117950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973547
23556	NC_016842	T	6	6	1117957	1117962	0 %	100 %	0 %	0 %	378973547
23557	NC_016842	GGA	2	6	1117980	1117985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973547
23558	NC_016842	AGAA	2	8	1118123	1118130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23559	NC_016842	CGG	2	6	1118142	1118147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23560	NC_016842	GACG	2	8	1118184	1118191	25 %	0 %	50 %	25 %	378973548
23561	NC_016842	TTC	2	6	1118290	1118295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973548
23562	NC_016842	TCTGCA	2	12	1118330	1118341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973548
23563	NC_016842	CG	3	6	1118426	1118431	0 %	0 %	50 %	50 %	378973548
23564	NC_016842	ATC	2	6	1118440	1118445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973548
23565	NC_016842	GCT	2	6	1118529	1118534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973548
23566	NC_016842	CGAG	2	8	1118552	1118559	25 %	0 %	50 %	25 %	378973548
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23569	NC_016842	GC	3	6	1118670	1118675	0 %	0 %	50 %	50 %	378973548
23570	NC_016842	CACC	2	8	1118706	1118713	25 %	0 %	0 %	75 %	378973548
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23579	NC_016842	GCGA	2	8	1119113	1119120	25 %	0 %	50 %	25 %	378973549
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23583	NC_016842	CG	4	8	1119514	1119521	0 %	0 %	50 %	50 %	378973550
23584	NC_016842	GA	3	6	1119685	1119690	50 %	0 %	50 %	0 %	378973551
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23588	NC_016842	CCG	2	6	1119804	1119809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973551
23589	NC_016842	AGC	2	6	1119818	1119823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973551
23590	NC_016842	ACCA	2	8	1119826	1119833	50 %	0 %	0 %	50 %	378973551
23591	NC_016842	CAC	2	6	1119844	1119849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973551
23592	NC_016842	GAA	2	6	1119965	1119970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973551
23593	NC_016842	CTG	2	6	1119976	1119981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973551
23594	NC_016842	TGA	2	6	1120020	1120025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23595	NC_016842	CA	3	6	1120074	1120079	50 %	0 %	0 %	50 %	378973552
23596	NC_016842	ATGCGT	2	12	1120146	1120157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378973552
23597	NC_016842	TTC	2	6	1120268	1120273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973552
23598	NC_016842	GCT	3	9	1120321	1120329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973552
23599	NC_016842	CAC	2	6	1120335	1120340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973552
23600	NC_016842	AGA	2	6	1120438	1120443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973552
23601	NC_016842	CTC	2	6	1120472	1120477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973552
23602	NC_016842	CA	3	6	1120485	1120490	50 %	0 %	0 %	50 %	378973552
23603	NC_016842	CCA	2	6	1120504	1120509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973552
23604	NC_016842	AC	3	6	1120543	1120548	50 %	0 %	0 %	50 %	378973552
23605	NC_016842	GCG	2	6	1120561	1120566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973552
23606	NC_016842	CTT	2	6	1120591	1120596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973552
23607	NC_016842	CGCA	2	8	1120660	1120667	25 %	0 %	25 %	50 %	378973552
23608	NC_016842	AAC	2	6	1120800	1120805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973552
23609	NC_016842	TGTA	2	8	1120919	1120926	25 %	50 %	25 %	0 %	378973552
23610	NC_016842	ACC	2	6	1120977	1120982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973552
23611	NC_016842	AGCG	2	8	1121011	1121018	25 %	0 %	50 %	25 %	378973552
23612	NC_016842	TG	3	6	1121179	1121184	0 %	50 %	50 %	0 %	378973552
23613	NC_016842	T	6	6	1121255	1121260	0 %	100 %	0 %	0 %	378973552
23614	NC_016842	AGAA	2	8	1121268	1121275	75 %	0 %	25 %	0 %	378973552
23615	NC_016842	AAG	2	6	1121390	1121395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973552
23616	NC_016842	GC	3	6	1121401	1121406	0 %	0 %	50 %	50 %	378973552
23617	NC_016842	GCA	2	6	1121446	1121451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973552
23618	NC_016842	TAC	2	6	1121510	1121515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973552
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23620	NC_016842	GTTT	2	8	1121746	1121753	0 %	75 %	25 %	0 %	378973552
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23976	NC_016842	CG	3	6	1139274	1139279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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