MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 23976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016842	CCTT	2	8	76111	76118	0 %	50 %	0 %	50 %	378972572
1503	NC_016842	GTCA	2	8	76123	76130	25 %	25 %	25 %	25 %	378972572
1504	NC_016842	TCG	2	6	76139	76144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972572
1505	NC_016842	AT	3	6	76158	76163	50 %	50 %	0 %	0 %	378972572
1506	NC_016842	TCA	2	6	76193	76198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972572
1507	NC_016842	AAG	2	6	76201	76206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972572
1508	NC_016842	CGT	2	6	76223	76228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972572
1509	NC_016842	C	6	6	76247	76252	0 %	0 %	0 %	100 %	378972572
1510	NC_016842	GC	3	6	76278	76283	0 %	0 %	50 %	50 %	378972572
1511	NC_016842	GAAAA	2	10	76357	76366	80 %	0 %	20 %	0 %	378972572
1512	NC_016842	ACGT	2	8	76374	76381	25 %	25 %	25 %	25 %	378972572
1513	NC_016842	TTA	2	6	76463	76468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378972572
1514	NC_016842	CGA	2	6	76469	76474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972572
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1517	NC_016842	CA	3	6	76629	76634	50 %	0 %	0 %	50 %	378972572
1518	NC_016842	T	6	6	76669	76674	0 %	100 %	0 %	0 %	378972572
1519	NC_016842	AAG	2	6	76690	76695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972572
1520	NC_016842	T	9	9	76701	76709	0 %	100 %	0 %	0 %	378972572
1521	NC_016842	CTC	2	6	76804	76809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972572
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1530	NC_016842	TGC	2	6	77119	77124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972572
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1532	NC_016842	GCG	2	6	77242	77247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972572
1533	NC_016842	AT	3	6	77270	77275	50 %	50 %	0 %	0 %	378972572
1534	NC_016842	CG	3	6	77322	77327	0 %	0 %	50 %	50 %	378972572
1535	NC_016842	GT	3	6	77393	77398	0 %	50 %	50 %	0 %	378972572
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1543	NC_016842	GTA	2	6	77729	77734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972572
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1547	NC_016842	GCG	2	6	78028	78033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972572
1548	NC_016842	T	6	6	78081	78086	0 %	100 %	0 %	0 %	378972572
1549	NC_016842	GA	3	6	78096	78101	50 %	0 %	50 %	0 %	378972572
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1552	NC_016842	CTGT	2	8	78224	78231	0 %	50 %	25 %	25 %	378972572
1553	NC_016842	T	6	6	78264	78269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016842	T	6	6	78285	78290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_016842	ACG	2	6	78655	78660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972573
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1563	NC_016842	GTC	2	6	78747	78752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016842	GCT	2	6	78807	78812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972574
1565	NC_016842	GCT	2	6	78839	78844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972574
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1589	NC_016842	CA	3	6	80267	80272	50 %	0 %	0 %	50 %	378972574
1590	NC_016842	ACA	2	6	80305	80310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972574
1591	NC_016842	CG	3	6	80311	80316	0 %	0 %	50 %	50 %	378972574
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1600	NC_016842	CGTGT	2	10	80702	80711	0 %	40 %	40 %	20 %	378972576
1601	NC_016842	CTT	2	6	80720	80725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972576
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1605	NC_016842	GC	3	6	80917	80922	0 %	0 %	50 %	50 %	378972576
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1608	NC_016842	T	6	6	81043	81048	0 %	100 %	0 %	0 %	378972576
1609	NC_016842	ATG	2	6	81257	81262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972576
1610	NC_016842	CG	3	6	81295	81300	0 %	0 %	50 %	50 %	378972576
1611	NC_016842	CAG	2	6	81337	81342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972576
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1616	NC_016842	CA	3	6	81683	81688	50 %	0 %	0 %	50 %	378972576
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1620	NC_016842	G	6	6	81896	81901	0 %	0 %	100 %	0 %	378972576
1621	NC_016842	GTGA	2	8	81949	81956	25 %	25 %	50 %	0 %	378972576
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1625	NC_016842	CGCA	2	8	82016	82023	25 %	0 %	25 %	50 %	378972576
1626	NC_016842	TCT	3	9	82045	82053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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