MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 plasmid pTCCB09

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016634	GGCG	2	8	60	67	0 %	0 %	75 %	25 %	384440649
2	NC_016634	GCGG	2	8	695	702	0 %	0 %	75 %	25 %	384440650
3	NC_016634	AGGG	2	8	735	742	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016634	GCGG	2	8	945	952	0 %	0 %	75 %	25 %	384440652
5	NC_016634	ACCC	2	8	1365	1372	25 %	0 %	0 %	75 %	384440653
6	NC_016634	AGCC	2	8	1398	1405	25 %	0 %	25 %	50 %	384440653
7	NC_016634	GCCC	2	8	1445	1452	0 %	0 %	25 %	75 %	384440653
8	NC_016634	GGGA	2	8	1538	1545	25 %	0 %	75 %	0 %	384440653
9	NC_016634	GGCC	2	8	2955	2962	0 %	0 %	50 %	50 %	384440656
10	NC_016634	GGCG	2	8	3183	3190	0 %	0 %	75 %	25 %	384440656
11	NC_016634	TCCT	2	8	3289	3296	0 %	50 %	0 %	50 %	384440656
12	NC_016634	AGGG	2	8	3332	3339	25 %	0 %	75 %	0 %	384440656
13	NC_016634	GGGA	2	8	3371	3378	25 %	0 %	75 %	0 %	384440656
14	NC_016634	CCCG	2	8	3452	3459	0 %	0 %	25 %	75 %	384440656
15	NC_016634	CCAG	2	8	4275	4282	25 %	0 %	25 %	50 %	384440656
16	NC_016634	TCCA	2	8	4528	4535	25 %	25 %	0 %	50 %	384440657
17	NC_016634	CCGT	2	8	4737	4744	0 %	25 %	25 %	50 %	384440658
18	NC_016634	CAGG	2	8	4819	4826	25 %	0 %	50 %	25 %	384440658
19	NC_016634	GGCG	2	8	5704	5711	0 %	0 %	75 %	25 %	384440659
20	NC_016634	GCCC	2	8	5966	5973	0 %	0 %	25 %	75 %	384440660
21	NC_016634	CCGC	2	8	6008	6015	0 %	0 %	25 %	75 %	384440660
22	NC_016634	GCGG	2	8	6176	6183	0 %	0 %	75 %	25 %	384440661
23	NC_016634	TGGA	2	8	6688	6695	25 %	25 %	50 %	0 %	384440661
24	NC_016634	GGCC	2	8	6857	6864	0 %	0 %	50 %	50 %	384440661
25	NC_016634	CGGG	2	8	6898	6905	0 %	0 %	75 %	25 %	384440661
26	NC_016634	CTTC	2	8	6961	6968	0 %	50 %	0 %	50 %	384440661
27	NC_016634	GAGG	2	8	7331	7338	25 %	0 %	75 %	0 %	384440662
28	NC_016634	GGGC	2	8	7482	7489	0 %	0 %	75 %	25 %	384440663
29	NC_016634	GACC	2	8	7522	7529	25 %	0 %	25 %	50 %	384440663
30	NC_016634	TGAA	2	8	8321	8328	50 %	25 %	25 %	0 %	384440664
31	NC_016634	TCAT	3	12	8394	8405	25 %	50 %	0 %	25 %	384440665
32	NC_016634	TTTA	2	8	8580	8587	25 %	75 %	0 %	0 %	384440665
33	NC_016634	ATCT	2	8	8930	8937	25 %	50 %	0 %	25 %	384440665
34	NC_016634	GAAA	2	8	9156	9163	75 %	0 %	25 %	0 %	384440665
35	NC_016634	GCTG	3	12	9621	9632	0 %	25 %	50 %	25 %	384440666
36	NC_016634	GAGG	2	8	9757	9764	25 %	0 %	75 %	0 %	384440666
37	NC_016634	AAGG	2	8	10073	10080	50 %	0 %	50 %	0 %	384440666
38	NC_016634	CAAA	2	8	10163	10170	75 %	0 %	0 %	25 %	384440667
39	NC_016634	CCCA	2	8	10214	10221	25 %	0 %	0 %	75 %	384440667
40	NC_016634	CTGT	2	8	10533	10540	0 %	50 %	25 %	25 %	384440667
41	NC_016634	CAAG	2	8	10955	10962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016634	CGCT	2	8	11293	11300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016634	CGGG	2	8	11503	11510	0 %	0 %	75 %	25 %	384440668
44	NC_016634	CCTT	2	8	11534	11541	0 %	50 %	0 %	50 %	384440668
45	NC_016634	GAGC	2	8	11792	11799	25 %	0 %	50 %	25 %	384440669
46	NC_016634	CAAC	2	8	11953	11960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016634	GAAA	2	8	12458	12465	75 %	0 %	25 %	0 %	384440670
48	NC_016634	GCCC	2	8	13484	13491	0 %	0 %	25 %	75 %	384440672
49	NC_016634	GCTG	2	8	13726	13733	0 %	25 %	50 %	25 %	384440672
50	NC_016634	CGGG	2	8	13861	13868	0 %	0 %	75 %	25 %	384440672
51	NC_016634	CAAG	2	8	14316	14323	50 %	0 %	25 %	25 %	384440673
52	NC_016634	CCGA	2	8	14330	14337	25 %	0 %	25 %	50 %	384440673
53	NC_016634	GTCC	2	8	14692	14699	0 %	25 %	25 %	50 %	384440675
54	NC_016634	GCCC	2	8	14763	14770	0 %	0 %	25 %	75 %	384440675
55	NC_016634	ACGG	2	8	15056	15063	25 %	0 %	50 %	25 %	384440676
56	NC_016634	GTCC	2	8	16053	16060	0 %	25 %	25 %	50 %	384440677
57	NC_016634	ACCC	2	8	16660	16667	25 %	0 %	0 %	75 %	384440678
58	NC_016634	CTTT	2	8	16994	17001	0 %	75 %	0 %	25 %	384440678
59	NC_016634	CCGC	2	8	17013	17020	0 %	0 %	25 %	75 %	384440678
60	NC_016634	CCCT	2	8	17701	17708	0 %	25 %	0 %	75 %	384440679
61	NC_016634	TAGT	2	8	17802	17809	25 %	50 %	25 %	0 %	384440679
62	NC_016634	TCCC	2	8	17820	17827	0 %	25 %	0 %	75 %	384440679
63	NC_016634	CGGG	2	8	18205	18212	0 %	0 %	75 %	25 %	384440680
64	NC_016634	AGGC	2	8	18371	18378	25 %	0 %	50 %	25 %	384440680
65	NC_016634	GGGC	2	8	18518	18525	0 %	0 %	75 %	25 %	384440680
66	NC_016634	GGCT	2	8	18576	18583	0 %	25 %	50 %	25 %	384440680
67	NC_016634	GCCC	2	8	18802	18809	0 %	0 %	25 %	75 %	384440680
68	NC_016634	CGCC	2	8	18817	18824	0 %	0 %	25 %	75 %	384440680
69	NC_016634	GGAA	2	8	18915	18922	50 %	0 %	50 %	0 %	384440680
70	NC_016634	ACGC	2	8	18962	18969	25 %	0 %	25 %	50 %	384440680
71	NC_016634	CCCG	2	8	18971	18978	0 %	0 %	25 %	75 %	384440680
72	NC_016634	CAGG	2	8	19012	19019	25 %	0 %	50 %	25 %	384440680
73	NC_016634	GGGC	2	8	19247	19254	0 %	0 %	75 %	25 %	384440680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.