MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 plasmid pTLIE01

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016149	GA	3	6	529	534	50 %	0 %	50 %	0 %	357418825
2	NC_016149	TG	3	6	635	640	0 %	50 %	50 %	0 %	357418825
3	NC_016149	GA	3	6	1094	1099	50 %	0 %	50 %	0 %	357418825
4	NC_016149	TA	3	6	1417	1422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016149	AT	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	357418827
6	NC_016149	AC	3	6	3175	3180	50 %	0 %	0 %	50 %	357418827
7	NC_016149	AT	3	6	3202	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	357418827
8	NC_016149	AT	3	6	4191	4196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016149	TG	3	6	4997	5002	0 %	50 %	50 %	0 %	357418828
10	NC_016149	CT	3	6	6947	6952	0 %	50 %	0 %	50 %	357418830
11	NC_016149	TA	3	6	7098	7103	50 %	50 %	0 %	0 %	357418830
12	NC_016149	GA	3	6	7112	7117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016149	GA	3	6	7168	7173	50 %	0 %	50 %	0 %	357418831
14	NC_016149	AT	4	8	7668	7675	50 %	50 %	0 %	0 %	357418831
15	NC_016149	AT	3	6	7744	7749	50 %	50 %	0 %	0 %	357418831
16	NC_016149	TC	3	6	8076	8081	0 %	50 %	0 %	50 %	357418831
17	NC_016149	TA	3	6	8221	8226	50 %	50 %	0 %	0 %	357418831
18	NC_016149	AT	3	6	8352	8357	50 %	50 %	0 %	0 %	357418831
19	NC_016149	CT	3	6	9063	9068	0 %	50 %	0 %	50 %	357418832
20	NC_016149	TA	3	6	9626	9631	50 %	50 %	0 %	0 %	357418832
21	NC_016149	AT	3	6	9896	9901	50 %	50 %	0 %	0 %	357418832
22	NC_016149	TC	3	6	10315	10320	0 %	50 %	0 %	50 %	357418833
23	NC_016149	CA	3	6	10457	10462	50 %	0 %	0 %	50 %	357418833
24	NC_016149	TC	3	6	10619	10624	0 %	50 %	0 %	50 %	357418833
25	NC_016149	AC	3	6	10904	10909	50 %	0 %	0 %	50 %	357418833
26	NC_016149	CT	3	6	11081	11086	0 %	50 %	0 %	50 %	357418833
27	NC_016149	CT	3	6	11895	11900	0 %	50 %	0 %	50 %	357418834
28	NC_016149	TC	3	6	13436	13441	0 %	50 %	0 %	50 %	357418835
29	NC_016149	TG	3	6	14058	14063	0 %	50 %	50 %	0 %	357418836
30	NC_016149	CT	4	8	14369	14376	0 %	50 %	0 %	50 %	357418836
31	NC_016149	CA	3	6	14830	14835	50 %	0 %	0 %	50 %	357418837
32	NC_016149	CT	3	6	14911	14916	0 %	50 %	0 %	50 %	357418837
33	NC_016149	TC	3	6	15313	15318	0 %	50 %	0 %	50 %	357418837
34	NC_016149	AG	3	6	16328	16333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016149	AT	3	6	16356	16361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016149	CT	3	6	17318	17323	0 %	50 %	0 %	50 %	357418839
37	NC_016149	CT	3	6	17642	17647	0 %	50 %	0 %	50 %	357418839
38	NC_016149	CT	3	6	17719	17724	0 %	50 %	0 %	50 %	357418839
39	NC_016149	AT	3	6	17929	17934	50 %	50 %	0 %	0 %	357418840
40	NC_016149	TG	3	6	18325	18330	0 %	50 %	50 %	0 %	357418840
41	NC_016149	TC	3	6	18575	18580	0 %	50 %	0 %	50 %	357418840
42	NC_016149	CT	3	6	18773	18778	0 %	50 %	0 %	50 %	357418840
43	NC_016149	TA	3	6	19416	19421	50 %	50 %	0 %	0 %	357418841
44	NC_016149	AC	3	6	19628	19633	50 %	0 %	0 %	50 %	357418841
45	NC_016149	AC	4	8	19913	19920	50 %	0 %	0 %	50 %	357418842
46	NC_016149	GA	3	6	19938	19943	50 %	0 %	50 %	0 %	357418842
47	NC_016149	CA	4	8	20374	20381	50 %	0 %	0 %	50 %	357418842
48	NC_016149	AC	3	6	20384	20389	50 %	0 %	0 %	50 %	357418842
49	NC_016149	AC	3	6	21187	21192	50 %	0 %	0 %	50 %	357418843
50	NC_016149	CT	3	6	21251	21256	0 %	50 %	0 %	50 %	357418843
51	NC_016149	TC	3	6	21406	21411	0 %	50 %	0 %	50 %	357418843
52	NC_016149	CT	3	6	21744	21749	0 %	50 %	0 %	50 %	357418843
53	NC_016149	CT	3	6	21807	21812	0 %	50 %	0 %	50 %	357418843
54	NC_016149	TC	4	8	22358	22365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016149	GT	3	6	22618	22623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016149	CA	4	8	22863	22870	50 %	0 %	0 %	50 %	357418844
57	NC_016149	AT	3	6	22927	22932	50 %	50 %	0 %	0 %	357418844
58	NC_016149	CT	4	8	23847	23854	0 %	50 %	0 %	50 %	357418844
59	NC_016149	CT	3	6	24512	24517	0 %	50 %	0 %	50 %	357418845
60	NC_016149	AG	3	6	24761	24766	50 %	0 %	50 %	0 %	357418845
61	NC_016149	CT	3	6	26162	26167	0 %	50 %	0 %	50 %	357418846
62	NC_016149	CT	3	6	27735	27740	0 %	50 %	0 %	50 %	357418847
63	NC_016149	CT	4	8	27849	27856	0 %	50 %	0 %	50 %	357418847
64	NC_016149	AT	3	6	28734	28739	50 %	50 %	0 %	0 %	357418848
65	NC_016149	AG	3	6	30159	30164	50 %	0 %	50 %	0 %	357418850
66	NC_016149	CT	4	8	30537	30544	0 %	50 %	0 %	50 %	357418850
67	NC_016149	AT	3	6	31357	31362	50 %	50 %	0 %	0 %	357418850

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.