MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Taylorella asinigenitalis MCE3 chromosome

Total Repeats: 19360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016043	GAT	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
2	NC_016043	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
3	NC_016043	AGC	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589353
4	NC_016043	ACA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589353
5	NC_016043	ACT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
6	NC_016043	GAG	2	6	328	333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589353
7	NC_016043	GAT	2	6	334	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
8	NC_016043	GAA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589353
9	NC_016043	CTA	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
10	NC_016043	ATT	2	6	591	596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
11	NC_016043	TAC	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589353
12	NC_016043	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
13	NC_016043	GAT	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
14	NC_016043	ATT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
15	NC_016043	CAG	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589353
16	NC_016043	AGT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589353
17	NC_016043	CCT	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589353
18	NC_016043	TTC	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589353
19	NC_016043	ATT	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589353
20	NC_016043	CAA	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589353
21	NC_016043	AAT	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016043	CAT	2	6	1613	1618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589354
23	NC_016043	AGA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589354
24	NC_016043	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589354
25	NC_016043	TGC	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589354
26	NC_016043	TCT	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589354
27	NC_016043	TAG	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589354
28	NC_016043	TTA	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589354
29	NC_016043	GTT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589354
30	NC_016043	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589354
31	NC_016043	GTG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589354
32	NC_016043	TCA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589354
33	NC_016043	TTA	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589354
34	NC_016043	AGA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589354
35	NC_016043	TGA	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589354
36	NC_016043	TGT	2	6	2697	2702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589354
37	NC_016043	ACG	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589355
38	NC_016043	AGT	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
39	NC_016043	GAA	2	6	3048	3053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
40	NC_016043	TGG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589355
41	NC_016043	TGG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589355
42	NC_016043	TCG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
43	NC_016043	AAT	2	6	3377	3382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589355
44	NC_016043	TGA	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
45	NC_016043	GAA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
46	NC_016043	CTG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
47	NC_016043	GAG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589355
48	NC_016043	CGG	2	6	3628	3633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589355
49	NC_016043	CAG	2	6	3793	3798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589355
50	NC_016043	AGA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
51	NC_016043	ATG	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
52	NC_016043	ATC	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
53	NC_016043	TAT	3	9	4270	4278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589355
54	NC_016043	ACC	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589355
55	NC_016043	GAT	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589355
56	NC_016043	GAA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589355
57	NC_016043	AAT	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589355
58	NC_016043	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589355
59	NC_016043	CAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
60	NC_016043	GCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
61	NC_016043	ACT	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589355
62	NC_016043	GCC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589355
63	NC_016043	TCG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589355
64	NC_016043	TTC	2	6	5442	5447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589356
65	NC_016043	TGG	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589356
66	NC_016043	CTG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589356
67	NC_016043	GAT	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589356
68	NC_016043	TCC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589356
69	NC_016043	CGG	2	6	5905	5910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589356
70	NC_016043	GTA	2	6	5980	5985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589356
71	NC_016043	GAC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589356
72	NC_016043	TAT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016043	CAA	2	6	6259	6264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589357
74	NC_016043	TCA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589357
75	NC_016043	AAG	2	6	6527	6532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589357
76	NC_016043	CTT	2	6	6556	6561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589357
77	NC_016043	GAA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589357
78	NC_016043	GGC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589357
79	NC_016043	CGA	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589357
80	NC_016043	GAT	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589357
81	NC_016043	GTT	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589357
82	NC_016043	GCC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589357
83	NC_016043	GCT	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016043	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589358
85	NC_016043	GCA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589358
86	NC_016043	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
87	NC_016043	ACC	2	6	7556	7561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589358
88	NC_016043	ATC	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
89	NC_016043	CTT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589358
90	NC_016043	ATT	2	6	7860	7865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589358
91	NC_016043	TCA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589358
92	NC_016043	TCC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589358
93	NC_016043	AAG	2	6	7970	7975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589358
94	NC_016043	ACG	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589359
95	NC_016043	TGA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
96	NC_016043	TGG	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589359
97	NC_016043	ATG	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
98	NC_016043	TCT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
99	NC_016043	TTC	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
100	NC_016043	CTT	2	6	8504	8509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589359
101	NC_016043	TAT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589359
102	NC_016043	GGC	2	6	8614	8619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589359
103	NC_016043	CTC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348589359
104	NC_016043	ATG	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589359
105	NC_016043	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589359
106	NC_016043	AAT	2	6	8977	8982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589360
107	NC_016043	AAG	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589360
108	NC_016043	TAG	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589360
109	NC_016043	CAT	2	6	9164	9169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589360
110	NC_016043	GAG	2	6	9242	9247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589360
111	NC_016043	AGC	2	6	9414	9419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589360
112	NC_016043	GTG	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589360
113	NC_016043	CGG	2	6	9465	9470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589360
114	NC_016043	CGT	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589360
115	NC_016043	GCC	2	6	9631	9636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589360
116	NC_016043	GAG	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589360
117	NC_016043	CCA	2	6	9857	9862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589361
118	NC_016043	ATT	2	6	9867	9872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589361
119	NC_016043	GGA	2	6	9903	9908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589361
120	NC_016043	AAT	2	6	9964	9969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589361
121	NC_016043	GGC	2	6	10008	10013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589361
122	NC_016043	TGA	2	6	10251	10256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589361
123	NC_016043	ATG	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589361
124	NC_016043	CTG	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589361
125	NC_016043	TTC	2	6	10648	10653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589361
126	NC_016043	TAA	3	9	10680	10688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589361
127	NC_016043	TGA	2	6	10725	10730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589361
128	NC_016043	GTA	2	6	10744	10749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589361
129	NC_016043	TGC	2	6	10851	10856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589361
130	NC_016043	CTT	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589361
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499	NC_016043	GCA	2	6	42996	43001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589393
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