MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Taylorella asinigenitalis MCE3 chromosome

Total Repeats: 32340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016043	TAA	2	6	144573	144578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589492
3003	NC_016043	AGT	2	6	144592	144597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589492
3004	NC_016043	CGAG	2	8	144607	144614	25 %	0 %	50 %	25 %	348589492
3005	NC_016043	ATC	2	6	144617	144622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589492
3006	NC_016043	GTA	2	6	144687	144692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589492
3007	NC_016043	GTT	2	6	144722	144727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589492
3008	NC_016043	ACT	2	6	144755	144760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589493
3009	NC_016043	T	6	6	144768	144773	0 %	100 %	0 %	0 %	348589493
3010	NC_016043	TCCA	2	8	144803	144810	25 %	25 %	0 %	50 %	348589493
3011	NC_016043	T	6	6	144852	144857	0 %	100 %	0 %	0 %	348589493
3012	NC_016043	GCC	2	6	144868	144873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589493
3013	NC_016043	TCGCTT	2	12	144932	144943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	348589493
3014	NC_016043	CCTG	2	8	144985	144992	0 %	25 %	25 %	50 %	348589493
3015	NC_016043	CTT	2	6	145055	145060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589493
3016	NC_016043	TA	3	6	145154	145159	50 %	50 %	0 %	0 %	348589493
3017	NC_016043	A	6	6	145175	145180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016043	ATTT	2	8	145235	145242	25 %	75 %	0 %	0 %	348589494
3019	NC_016043	GTC	2	6	145359	145364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589494
3020	NC_016043	AAG	2	6	145374	145379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589494
3021	NC_016043	TTTGAC	2	12	145406	145417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	348589494
3022	NC_016043	AGATG	2	10	145471	145480	40 %	20 %	40 %	0 %	348589494
3023	NC_016043	AGT	2	6	145498	145503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589494
3024	NC_016043	AGA	2	6	145642	145647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589494
3025	NC_016043	ATT	2	6	145938	145943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589494
3026	NC_016043	AGG	2	6	145956	145961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589494
3027	NC_016043	GCT	2	6	145970	145975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589494
3028	NC_016043	GCT	2	6	145979	145984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589494
3029	NC_016043	TGC	2	6	145987	145992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589494
3030	NC_016043	AGC	2	6	146093	146098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589495
3031	NC_016043	AAC	2	6	146114	146119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589495
3032	NC_016043	A	6	6	146143	146148	100 %	0 %	0 %	0 %	348589495
3033	NC_016043	TGA	2	6	146196	146201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589495
3034	NC_016043	A	6	6	146239	146244	100 %	0 %	0 %	0 %	348589495
3035	NC_016043	AGC	2	6	146291	146296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589495
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3037	NC_016043	AATG	2	8	146580	146587	50 %	25 %	25 %	0 %	348589495
3038	NC_016043	AAGA	2	8	146602	146609	75 %	0 %	25 %	0 %	348589495
3039	NC_016043	A	6	6	146626	146631	100 %	0 %	0 %	0 %	348589495
3040	NC_016043	GAT	2	6	146692	146697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589495
3041	NC_016043	AGC	2	6	146780	146785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589495
3042	NC_016043	AAG	2	6	146827	146832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589495
3043	NC_016043	A	7	7	146944	146950	100 %	0 %	0 %	0 %	348589495
3044	NC_016043	TGAAAT	2	12	147045	147056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	348589495
3045	NC_016043	GGC	2	6	147063	147068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589495
3046	NC_016043	AGGCTA	2	12	147104	147115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	348589495
3047	NC_016043	ACT	2	6	147150	147155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589495
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3049	NC_016043	A	6	6	147191	147196	100 %	0 %	0 %	0 %	348589495
3050	NC_016043	AGA	2	6	147224	147229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589495
3051	NC_016043	GTG	2	6	147248	147253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589495
3052	NC_016043	AGT	2	6	147363	147368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589495
3053	NC_016043	TAA	2	6	147401	147406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589495
3054	NC_016043	TCAGT	2	10	147461	147470	20 %	40 %	20 %	20 %	348589495
3055	NC_016043	CAA	2	6	147493	147498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589495
3056	NC_016043	AAT	2	6	147599	147604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589495
3057	NC_016043	TTA	2	6	147615	147620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589496
3058	NC_016043	T	8	8	147626	147633	0 %	100 %	0 %	0 %	348589496
3059	NC_016043	GAA	2	6	147725	147730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589496
3060	NC_016043	GAA	3	9	147794	147802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589496
3061	NC_016043	GAG	2	6	147818	147823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589496
3062	NC_016043	TGAC	2	8	147879	147886	25 %	25 %	25 %	25 %	348589496
3063	NC_016043	TGC	2	6	147901	147906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589496
3064	NC_016043	GAT	2	6	147923	147928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589496
3065	NC_016043	AAG	2	6	147978	147983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589496
3066	NC_016043	GGT	2	6	148001	148006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589496
3067	NC_016043	ATA	2	6	148046	148051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589496
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3069	NC_016043	AAAT	2	8	148113	148120	75 %	25 %	0 %	0 %	348589496
3070	NC_016043	A	6	6	148134	148139	100 %	0 %	0 %	0 %	348589496
3071	NC_016043	TA	3	6	148299	148304	50 %	50 %	0 %	0 %	348589496
3072	NC_016043	ATT	2	6	148385	148390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589496
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3075	NC_016043	CTG	2	6	148428	148433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589496
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3079	NC_016043	TTCTGC	2	12	148615	148626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	348589496
3080	NC_016043	TGAC	2	8	148821	148828	25 %	25 %	25 %	25 %	348589496
3081	NC_016043	ATTT	2	8	148842	148849	25 %	75 %	0 %	0 %	348589496
3082	NC_016043	TAA	2	6	148915	148920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589496
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3084	NC_016043	CAG	2	6	149129	149134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589496
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3086	NC_016043	CAT	2	6	149276	149281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589497
3087	NC_016043	TGGG	2	8	149287	149294	0 %	25 %	75 %	0 %	348589497
3088	NC_016043	GCA	2	6	149304	149309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589497
3089	NC_016043	CGA	2	6	149354	149359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589497
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3091	NC_016043	A	6	6	149424	149429	100 %	0 %	0 %	0 %	348589497
3092	NC_016043	CT	3	6	149451	149456	0 %	50 %	0 %	50 %	348589497
3093	NC_016043	GCG	2	6	149616	149621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589497
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3095	NC_016043	TTG	2	6	149803	149808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589497
3096	NC_016043	GT	3	6	149905	149910	0 %	50 %	50 %	0 %	348589497
3097	NC_016043	AAT	2	6	149914	149919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589497
3098	NC_016043	ATT	2	6	149929	149934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016043	A	6	6	149989	149994	100 %	0 %	0 %	0 %	348589498
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3101	NC_016043	TGC	2	6	150052	150057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589498
3102	NC_016043	A	6	6	150076	150081	100 %	0 %	0 %	0 %	348589498
3103	NC_016043	CAG	2	6	150287	150292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589498
3104	NC_016043	AAATC	2	10	150298	150307	60 %	20 %	0 %	20 %	348589498
3105	NC_016043	ACAA	2	8	150362	150369	75 %	0 %	0 %	25 %	348589498
3106	NC_016043	CAC	2	6	150418	150423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589498
3107	NC_016043	CT	3	6	150554	150559	0 %	50 %	0 %	50 %	348589498
3108	NC_016043	TTG	2	6	150677	150682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589498
3109	NC_016043	GCA	2	6	150689	150694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589498
3110	NC_016043	TC	3	6	150745	150750	0 %	50 %	0 %	50 %	348589498
3111	NC_016043	AGA	2	6	150760	150765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589498
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3114	NC_016043	A	7	7	150866	150872	100 %	0 %	0 %	0 %	348589498
3115	NC_016043	ACTGAT	2	12	150969	150980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	348589499
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3118	NC_016043	AGA	2	6	151114	151119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589499
3119	NC_016043	TGG	2	6	151153	151158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589499
3120	NC_016043	CGA	2	6	151294	151299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589499
3121	NC_016043	GATA	2	8	151331	151338	50 %	25 %	25 %	0 %	348589499
3122	NC_016043	TCA	2	6	151353	151358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589499
3123	NC_016043	T	6	6	151388	151393	0 %	100 %	0 %	0 %	348589499
3124	NC_016043	GCAAAT	2	12	151438	151449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	348589499
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3241	NC_016043	TCTT	2	8	157624	157631	0 %	75 %	0 %	25 %	348589506
3242	NC_016043	GAT	2	6	157765	157770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589506
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