MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 67311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015958	TG	3	6	21504	21509	0 %	50 %	50 %	0 %	345016466
502	NC_015958	AGC	2	6	21517	21522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016466
503	NC_015958	AG	4	8	21762	21769	50 %	0 %	50 %	0 %	345016466
504	NC_015958	GGT	2	6	21838	21843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016466
505	NC_015958	CTA	2	6	21845	21850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016466
506	NC_015958	AGG	2	6	21996	22001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016466
507	NC_015958	GA	3	6	22082	22087	50 %	0 %	50 %	0 %	345016466
508	NC_015958	ATG	2	6	22115	22120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016466
509	NC_015958	CAG	2	6	22146	22151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016466
510	NC_015958	TGT	2	6	22200	22205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016466
511	NC_015958	CTG	2	6	22214	22219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016466
512	NC_015958	GAA	2	6	22273	22278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016466
513	NC_015958	AT	3	6	22291	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	345016466
514	NC_015958	TAA	2	6	22328	22333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016466
515	NC_015958	GA	3	6	22365	22370	50 %	0 %	50 %	0 %	345016466
516	NC_015958	CAA	2	6	22454	22459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016466
517	NC_015958	TC	3	6	22481	22486	0 %	50 %	0 %	50 %	345016466
518	NC_015958	AGG	2	6	22500	22505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016466
519	NC_015958	GA	3	6	22578	22583	50 %	0 %	50 %	0 %	345016466
520	NC_015958	GAA	2	6	22585	22590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016466
521	NC_015958	AAAG	2	8	22594	22601	75 %	0 %	25 %	0 %	345016466
522	NC_015958	A	7	7	22605	22611	100 %	0 %	0 %	0 %	345016466
523	NC_015958	G	6	6	22701	22706	0 %	0 %	100 %	0 %	345016466
524	NC_015958	AAG	2	6	22753	22758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
525	NC_015958	GGA	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016467
526	NC_015958	CTAT	2	8	22804	22811	25 %	50 %	0 %	25 %	345016467
527	NC_015958	TTTGC	2	10	22915	22924	0 %	60 %	20 %	20 %	345016467
528	NC_015958	TGT	2	6	22991	22996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016467
529	NC_015958	ACAGG	2	10	23004	23013	40 %	0 %	40 %	20 %	345016467
530	NC_015958	AAG	2	6	23047	23052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
531	NC_015958	AGGC	2	8	23133	23140	25 %	0 %	50 %	25 %	345016467
532	NC_015958	TAG	2	6	23179	23184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016467
533	NC_015958	A	6	6	23252	23257	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
534	NC_015958	A	6	6	23322	23327	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
535	NC_015958	AGG	3	9	23342	23350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016467
536	NC_015958	G	6	6	23359	23364	0 %	0 %	100 %	0 %	345016467
537	NC_015958	AGA	2	6	23395	23400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
538	NC_015958	CTT	2	6	23419	23424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016467
539	NC_015958	ATC	2	6	23452	23457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016467
540	NC_015958	GCAT	2	8	23479	23486	25 %	25 %	25 %	25 %	345016467
541	NC_015958	AAT	2	6	23600	23605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016467
542	NC_015958	AAG	2	6	23677	23682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
543	NC_015958	CATT	2	8	23710	23717	25 %	50 %	0 %	25 %	345016467
544	NC_015958	GA	3	6	23718	23723	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
545	NC_015958	TTTC	2	8	23743	23750	0 %	75 %	0 %	25 %	345016467
546	NC_015958	GA	3	6	23753	23758	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
547	NC_015958	A	6	6	23778	23783	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
548	NC_015958	TAG	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016467
549	NC_015958	A	6	6	23815	23820	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
550	NC_015958	AGG	2	6	23930	23935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016467
551	NC_015958	GAAT	2	8	24034	24041	50 %	25 %	25 %	0 %	345016467
552	NC_015958	TA	3	6	24067	24072	50 %	50 %	0 %	0 %	345016467
553	NC_015958	TAC	2	6	24091	24096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016467
554	NC_015958	CAA	2	6	24098	24103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016467
555	NC_015958	CA	3	6	24162	24167	50 %	0 %	0 %	50 %	345016467
556	NC_015958	GGAA	2	8	24218	24225	50 %	0 %	50 %	0 %	345016467
557	NC_015958	ACA	2	6	24234	24239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016467
558	NC_015958	AGA	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016467
559	NC_015958	A	6	6	24264	24269	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
560	NC_015958	A	6	6	24280	24285	100 %	0 %	0 %	0 %	345016467
561	NC_015958	TAT	2	6	24305	24310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016467
562	NC_015958	CGG	2	6	24407	24412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015958	GGAGAA	2	12	24477	24488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015958	T	6	6	24519	24524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015958	T	6	6	24550	24555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015958	AGG	2	6	24561	24566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015958	GAA	2	6	24577	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
568	NC_015958	ATA	2	6	24676	24681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
569	NC_015958	A	6	6	24735	24740	100 %	0 %	0 %	0 %	345016468
570	NC_015958	CTA	2	6	24764	24769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016468
571	NC_015958	CCT	2	6	24811	24816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345016468
572	NC_015958	GAA	2	6	24823	24828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
573	NC_015958	TA	4	8	24854	24861	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
574	NC_015958	AAG	2	6	24914	24919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016468
575	NC_015958	GAT	2	6	24942	24947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
576	NC_015958	AT	3	6	24987	24992	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
577	NC_015958	TAAT	2	8	25157	25164	50 %	50 %	0 %	0 %	345016468
578	NC_015958	ACA	2	6	25180	25185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016468
579	NC_015958	ATT	2	6	25216	25221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016468
580	NC_015958	TAG	2	6	25227	25232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
581	NC_015958	TAA	2	6	25259	25264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
582	NC_015958	ACA	2	6	25294	25299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016468
583	NC_015958	AGAA	2	8	25321	25328	75 %	0 %	25 %	0 %	345016468
584	NC_015958	TTA	2	6	25352	25357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016468
585	NC_015958	GA	3	6	25412	25417	50 %	0 %	50 %	0 %	345016468
586	NC_015958	ATTG	2	8	25434	25441	25 %	50 %	25 %	0 %	345016468
587	NC_015958	GGT	2	6	25444	25449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016468
588	NC_015958	AG	3	6	25476	25481	50 %	0 %	50 %	0 %	345016468
589	NC_015958	TTG	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016468
590	NC_015958	T	6	6	25501	25506	0 %	100 %	0 %	0 %	345016468
591	NC_015958	AAT	2	6	25518	25523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
592	NC_015958	AGG	2	6	25524	25529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016468
593	NC_015958	ATAGA	2	10	25610	25619	60 %	20 %	20 %	0 %	345016468
594	NC_015958	TGA	2	6	25620	25625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016468
595	NC_015958	TAA	2	6	25631	25636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016468
596	NC_015958	GTA	2	6	25746	25751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016469
597	NC_015958	AT	3	6	25818	25823	50 %	50 %	0 %	0 %	345016469
598	NC_015958	AGCA	2	8	25867	25874	50 %	0 %	25 %	25 %	345016469
599	NC_015958	TGGG	2	8	25941	25948	0 %	25 %	75 %	0 %	345016469
600	NC_015958	A	7	7	26004	26010	100 %	0 %	0 %	0 %	345016469
601	NC_015958	GTT	2	6	26102	26107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016469
602	NC_015958	GAT	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016469
603	NC_015958	ATT	2	6	26138	26143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016469
604	NC_015958	GAC	2	6	26161	26166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016469
605	NC_015958	GAAA	2	8	26269	26276	75 %	0 %	25 %	0 %	345016469
606	NC_015958	TA	3	6	26284	26289	50 %	50 %	0 %	0 %	345016469
607	NC_015958	AGG	2	6	26314	26319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015958	GATAG	2	10	26334	26343	40 %	20 %	40 %	0 %	345016470
609	NC_015958	ATT	2	6	26379	26384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
610	NC_015958	GCA	2	6	26430	26435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
611	NC_015958	TAC	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016470
612	NC_015958	TAG	2	6	26653	26658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016470
613	NC_015958	AGA	2	6	26675	26680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016470
614	NC_015958	TGG	2	6	26723	26728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016470
615	NC_015958	AGC	2	6	26756	26761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016470
616	NC_015958	CTG	2	6	26794	26799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016470
617	NC_015958	GAT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016470
618	NC_015958	A	7	7	26867	26873	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
619	NC_015958	CAA	2	6	26965	26970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016470
620	NC_015958	GAA	2	6	27000	27005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016470
621	NC_015958	AT	3	6	27100	27105	50 %	50 %	0 %	0 %	345016470
622	NC_015958	AGGA	2	8	27166	27173	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
623	NC_015958	AGGA	2	8	27196	27203	50 %	0 %	50 %	0 %	345016470
624	NC_015958	AAT	2	6	27372	27377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016470
625	NC_015958	A	6	6	27382	27387	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
626	NC_015958	ATT	2	6	27451	27456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016470
627	NC_015958	CAAAA	2	10	27473	27482	80 %	0 %	0 %	20 %	345016470
628	NC_015958	A	7	7	27479	27485	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
629	NC_015958	A	6	6	27487	27492	100 %	0 %	0 %	0 %	345016470
630	NC_015958	TGAAT	2	10	27535	27544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_015958	GAAA	2	8	27626	27633	75 %	0 %	25 %	0 %	345016471
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