MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	AACAAA	2	12	3232	3243	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338705985
2	NC_015714	TTTGAC	2	12	5643	5654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338705987
3	NC_015714	GCAGGC	2	12	5660	5671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338705987
4	NC_015714	GTGTAT	2	12	6686	6697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338705987
5	NC_015714	TTAAAT	2	12	7966	7977	50 %	50 %	0 %	0 %	338705989
6	NC_015714	ATTGAA	2	12	8549	8560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338705990
7	NC_015714	TTGAGA	2	12	27405	27416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705999
8	NC_015714	GAACAG	2	12	31389	31400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706002
9	NC_015714	GTCTGG	2	12	31624	31635	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706002
10	NC_015714	TTTCCG	2	12	34251	34262	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706004
11	NC_015714	TTGACG	2	12	38915	38926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706007
12	NC_015714	TGCATG	4	24	42417	42440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706010
13	NC_015714	CCTCCC	2	12	49526	49537	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	338706018
14	NC_015714	CGTGCG	2	12	49881	49892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706019
15	NC_015714	GAGTCT	2	12	50349	50360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706019
16	NC_015714	TGTAAC	2	12	62492	62503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706030
17	NC_015714	AGGGGC	2	12	65827	65838	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338706034
18	NC_015714	GCCATT	2	12	66947	66958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706035
19	NC_015714	TCTTGC	2	12	67176	67187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706035
20	NC_015714	CGATCG	2	12	72517	72528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706043
21	NC_015714	TGAGCA	2	12	80113	80124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706050
22	NC_015714	CACTTT	2	12	84172	84183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706054
23	NC_015714	CGTGAA	2	12	85793	85804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706055
24	NC_015714	ATTTGT	2	12	86914	86925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338706056
25	NC_015714	ACGCTT	2	12	87102	87113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706056
26	NC_015714	CGCTTG	2	12	93021	93032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706062
27	NC_015714	AGGGGA	2	12	97412	97423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706067
28	NC_015714	CGCACG	2	12	104176	104187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706074
29	NC_015714	AGGCGC	2	12	104422	104433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706074
30	NC_015714	GTCGGT	2	12	107778	107789	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706078
31	NC_015714	AAAAGG	2	12	115058	115069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706082
32	NC_015714	ATCTGC	2	12	117129	117140	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706083
33	NC_015714	TTGTCG	2	12	131446	131457	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338706094
34	NC_015714	TCTTGA	2	12	133302	133313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706096
35	NC_015714	GCAGAC	2	12	134653	134664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706096
36	NC_015714	TGGTTG	2	12	135045	135056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015714	CCGGAG	2	12	136143	136154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015714	CAGCTG	2	12	136368	136379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015714	CCGTGC	2	12	147338	147349	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706104
40	NC_015714	GGCTTG	2	12	149540	149551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706108
41	NC_015714	GGCTTG	2	12	150175	150186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015714	CTGCGG	3	18	150253	150270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015714	TGGTTG	2	12	150999	151010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015714	CCGGAG	2	12	152097	152108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015714	CAGCTG	2	12	152322	152333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015714	TAAAAA	2	12	152653	152664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338706111
47	NC_015714	TACTGG	2	12	153544	153555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706112
48	NC_015714	ACCAGT	2	12	155957	155968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706115
49	NC_015714	AGCCCC	2	12	156786	156797	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015714	GTGTGC	2	12	171602	171613	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706129
51	NC_015714	ACTGTT	2	12	175758	175769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706133
52	NC_015714	TGCGTA	2	12	176783	176794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706133
53	NC_015714	TTGGGT	2	12	185339	185350	0 %	50 %	50 %	0 %	338706143
54	NC_015714	GGAAGA	2	12	190544	190555	50 %	0 %	50 %	0 %	338706149
55	NC_015714	GACACT	2	12	190705	190716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706149
56	NC_015714	GGTGAG	2	12	190871	190882	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338706149
57	NC_015714	GATAGC	2	12	191309	191320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706149
58	NC_015714	GAGAAA	2	12	195064	195075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706152
59	NC_015714	TCCTCT	2	12	198556	198567	0 %	50 %	0 %	50 %	338706156
60	NC_015714	CGGTGA	2	12	203627	203638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706163
61	NC_015714	AAAAGG	2	12	203892	203903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706163
62	NC_015714	TAAGGG	2	12	210679	210690	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706178
63	NC_015714	TTTGGT	2	12	211287	211298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706180
64	NC_015714	GTGTTT	2	12	220238	220249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706193
65	NC_015714	TGCGCT	2	12	220986	220997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706195
66	NC_015714	TCTTGT	2	12	222812	222823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338706196
67	NC_015714	GTGTTT	2	12	222841	222852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706196
68	NC_015714	TATGCT	2	12	226848	226859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706200
69	NC_015714	GTGCGA	2	12	232102	232113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015714	TCCTTC	2	12	233483	233494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015714	AGGAGA	2	12	234245	234256	50 %	0 %	50 %	0 %	338706202
72	NC_015714	GCAGAC	2	12	236330	236341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706205
73	NC_015714	GCGGGT	2	12	238971	238982	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706207
74	NC_015714	GGAAAC	2	12	245523	245534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706217
75	NC_015714	TTTCTG	2	12	246059	246070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338706217
76	NC_015714	GGAATG	2	12	247881	247892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706218
77	NC_015714	ACCTTG	2	12	248255	248266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706218
78	NC_015714	AACGCA	2	12	260380	260391	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338706225
79	NC_015714	CATGCG	2	12	263303	263314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706226
80	NC_015714	TTTTTC	2	12	266298	266309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338706230
81	NC_015714	TACAAT	2	12	267494	267505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338706231
82	NC_015714	CCCTGC	2	12	269655	269666	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706234
83	NC_015714	GTGCGA	2	12	280499	280510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015714	TCCTTC	2	12	281880	281891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015714	TCATTT	2	12	284042	284053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338706243
86	NC_015714	GGGTGA	2	12	292019	292030	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338706251
87	NC_015714	CTGCCG	2	12	300275	300286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706258
88	NC_015714	ATGCGT	2	12	300413	300424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706258
89	NC_015714	GCTGCA	2	12	301123	301134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706258
90	NC_015714	TGATGT	2	12	302345	302356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338706259
91	NC_015714	GCAGTT	2	12	302526	302537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706259
92	NC_015714	TGCGCT	2	12	304180	304191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706261
93	NC_015714	GGCTGC	2	12	308295	308306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706265
94	NC_015714	CGCGTC	2	12	312219	312230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706268
95	NC_015714	CTCCGT	2	12	312429	312440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706268
96	NC_015714	GAAATC	2	12	314811	314822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338706271
97	NC_015714	GTATGG	2	12	315053	315064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338706271
98	NC_015714	GTGAAA	2	12	315616	315627	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706271
99	NC_015714	ACGGTC	2	12	318532	318543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706272
100	NC_015714	TGAGCG	2	12	320553	320564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706273
101	NC_015714	CGGCAC	2	12	321005	321016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706273
102	NC_015714	TGCAGG	2	12	322863	322874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706275
103	NC_015714	GCACCG	2	12	328986	328997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706281
104	NC_015714	GCTGTG	2	12	336708	336719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706290
105	NC_015714	GTGCTC	2	12	336759	336770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706290
106	NC_015714	TGTTCG	2	12	336929	336940	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338706290
107	NC_015714	TTCATG	2	12	337045	337056	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706290
108	NC_015714	ACCGTC	2	12	337081	337092	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706290
109	NC_015714	TTTGGA	2	12	340742	340753	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338706290
110	NC_015714	GAGCGC	2	12	342203	342214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706291
111	NC_015714	CTTTGA	2	12	342646	342657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706291
112	NC_015714	TTACGA	2	12	342892	342903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706291
113	NC_015714	AATATA	2	12	350763	350774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015714	GTGTTG	2	12	367654	367665	0 %	50 %	50 %	0 %	338706310
115	NC_015714	TTTCCG	2	12	368023	368034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015714	CAGGAG	2	12	370051	370062	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338706313
117	NC_015714	CTTTTG	2	12	373327	373338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338706316
118	NC_015714	CGTGGT	2	12	376531	376542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706323
119	NC_015714	TCGCGT	2	12	386469	386480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706335
120	NC_015714	CTGAGC	2	12	390081	390092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706337
121	NC_015714	GTCATC	2	12	391287	391298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706338
122	NC_015714	GTGCGC	2	12	391869	391880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706339
123	NC_015714	TGCGAA	2	12	392918	392929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706340
124	NC_015714	CCGCGT	2	12	393742	393753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706341
125	NC_015714	TGCAGA	2	12	395121	395132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706342
126	NC_015714	GCAGGA	2	12	395325	395336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338706342
127	NC_015714	CAGGGG	2	12	399285	399296	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338706346
128	NC_015714	GTACTG	2	12	402600	402611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706347
129	NC_015714	GGGGCG	2	12	405621	405632	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	338706350
130	NC_015714	TGTAGG	2	12	410385	410396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338706355
131	NC_015714	AAGGGG	2	12	410584	410595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706355
132	NC_015714	ATTAAA	2	12	411064	411075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706355
133	NC_015714	GGGAGA	2	12	412287	412298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706356
134	NC_015714	TATTGA	2	12	415609	415620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338706360
135	NC_015714	GAAGAT	2	12	422517	422528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706366
136	NC_015714	ACGCGC	2	12	425545	425556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706369
137	NC_015714	TTTTTG	2	12	432009	432020	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338706375
138	NC_015714	TGACCG	2	12	432945	432956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706376
139	NC_015714	ACGCTT	2	12	433675	433686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706376
140	NC_015714	TCCGAC	2	12	437271	437282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706379
141	NC_015714	GCGATT	2	12	437967	437978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706380
142	NC_015714	GGCCCT	2	12	441367	441378	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706383
143	NC_015714	GTTGCC	2	12	444495	444506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706385
144	NC_015714	GCGTGT	2	12	447050	447061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706388
145	NC_015714	TGTGCA	2	12	453627	453638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706395
146	NC_015714	CGTGCG	2	12	466502	466513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706407
147	NC_015714	CGTGCC	2	12	468590	468601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706409
148	NC_015714	ACGTGT	2	12	468888	468899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706409
149	NC_015714	ACAGGA	2	12	474228	474239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706415
150	NC_015714	GTGCGC	2	12	484283	484294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706422
151	NC_015714	ACGTGC	2	12	484952	484963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706422
152	NC_015714	GGCAGC	2	12	485442	485453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706422
153	NC_015714	GGTGCG	2	12	485925	485936	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706422
154	NC_015714	GGGGAA	2	12	488453	488464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706426
155	NC_015714	GTGTGC	2	12	491001	491012	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706429
156	NC_015714	GTGCGT	2	12	495238	495249	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706432
157	NC_015714	GAGGGC	2	12	495311	495322	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338706432
158	NC_015714	TCCTGT	2	12	501542	501553	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706437
159	NC_015714	TTGAAA	2	12	508210	508221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338706443
160	NC_015714	TTTGAG	2	12	512827	512838	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338706445
161	NC_015714	GTGACG	2	12	514931	514942	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706447
162	NC_015714	GCACCG	2	12	517687	517698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706448
163	NC_015714	CTGGTT	2	12	518504	518515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338706448
164	NC_015714	TGGAGA	2	12	521589	521600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706450
165	NC_015714	CGATGG	2	12	525665	525676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706454
166	NC_015714	CTGACG	2	12	526993	527004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706454
167	NC_015714	CTGTAT	2	12	529130	529141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706456
168	NC_015714	CTTGTC	2	12	531296	531307	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706458
169	NC_015714	GAATGG	2	12	533567	533578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706460
170	NC_015714	ATATTG	2	12	535497	535508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338706462
171	NC_015714	TCACCG	2	12	537471	537482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706465
172	NC_015714	CGTGTA	2	12	537912	537923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706465
173	NC_015714	AGCAGG	2	12	539756	539767	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338706466
174	NC_015714	GAAATG	2	12	549869	549880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706474
175	NC_015714	TTTCCA	2	12	551086	551097	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706475
176	NC_015714	ATGTGC	2	12	551962	551973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706475
177	NC_015714	AAAGGT	2	12	552564	552575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706475
178	NC_015714	TAACCC	2	12	558259	558270	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338706480
179	NC_015714	ATACTG	2	12	558353	558364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706480
180	NC_015714	CGCGTG	2	12	559923	559934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706481
181	NC_015714	TCTTTT	2	12	563980	563991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338706484
182	NC_015714	TCAGTA	2	12	565187	565198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706485
183	NC_015714	ATACCC	2	12	569350	569361	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338706489
184	NC_015714	AGCACC	2	12	576127	576138	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706497
185	NC_015714	AGCAGA	2	12	581303	581314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706504
186	NC_015714	GCGCTC	2	12	583101	583112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706505
187	NC_015714	TGTTCC	2	12	583769	583780	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706506
188	NC_015714	CGTCAT	2	12	585454	585465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706507
189	NC_015714	AGACAT	2	12	593521	593532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338706513
190	NC_015714	ACTACC	2	12	593549	593560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338706513
191	NC_015714	GCCCCT	2	12	603407	603418	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706523
192	NC_015714	CACACG	2	12	604140	604151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706524
193	NC_015714	ACGGCC	2	12	611284	611295	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706529
194	NC_015714	AAAGAA	2	12	611755	611766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338706530
195	NC_015714	AAATAC	2	12	612260	612271	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338706530
196	NC_015714	TCCTTT	2	12	613551	613562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706531
197	NC_015714	ACGCAC	2	12	615860	615871	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706533
198	NC_015714	GCCCAG	2	12	616586	616597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706533
199	NC_015714	CGGTTG	2	12	618577	618588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706536
200	NC_015714	TCCGCG	2	12	619947	619958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706537
201	NC_015714	TTTCAC	2	12	621059	621070	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706537
202	NC_015714	AGCGCG	2	12	624814	624825	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706541
203	NC_015714	ACGCGC	2	12	627573	627584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706543
204	NC_015714	GTTATT	2	12	630722	630733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338706546
205	NC_015714	GCACAC	2	12	636843	636854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706549
206	NC_015714	AGCCAT	2	12	638287	638298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706551
207	NC_015714	CTCGCT	2	12	648473	648484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706560
208	NC_015714	CACGCC	2	12	654452	654463	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338706566
209	NC_015714	CTCATC	2	12	654726	654737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338706567
210	NC_015714	CAAAAG	2	12	656628	656639	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338706568
211	NC_015714	CTGCTC	2	12	659623	659634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706570
212	NC_015714	ACCTAC	2	12	661913	661924	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338706572
213	NC_015714	GGCGCA	2	12	665938	665949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706575
214	NC_015714	GCACCG	2	12	667083	667094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706577
215	NC_015714	TGCACG	2	12	673939	673950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706580
216	NC_015714	CGGTGT	2	12	674737	674748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706580
217	NC_015714	TGAGCG	2	12	678691	678702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706583
218	NC_015714	TGCAAT	2	12	680886	680897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706584
219	NC_015714	TGTTTT	2	12	682122	682133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338706585
220	NC_015714	CGGCCG	2	12	687821	687832	0 %	0 %	50 %	50 %	338706590
221	NC_015714	ATTGAG	2	12	688611	688622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706590
222	NC_015714	GCTTCT	2	12	689491	689502	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706590
223	NC_015714	TACGCG	2	12	690300	690311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706591
224	NC_015714	GAAAGA	2	12	690467	690478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706591
225	NC_015714	TTCTCC	2	12	692456	692467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
226	NC_015714	CAGGAT	2	12	705410	705421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706602
227	NC_015714	CCTGTA	2	12	713556	713567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706609
228	NC_015714	TGCATT	2	12	716112	716123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706612
229	NC_015714	CCCATC	2	12	717366	717377	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338706613
230	NC_015714	CTCATC	2	12	717717	717728	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338706613
231	NC_015714	GTGTGG	2	12	720802	720813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706616
232	NC_015714	CCGGGC	2	12	721894	721905	0 %	0 %	50 %	50 %	338706618
233	NC_015714	CAGCAT	2	12	725173	725184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706621
234	NC_015714	AAGCGC	2	12	728862	728873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706622
235	NC_015714	GCCAAT	2	12	730357	730368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706624
236	NC_015714	ACCGTA	2	12	731490	731501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706625
237	NC_015714	AACCGC	2	12	733295	733306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706626
238	NC_015714	ATACAT	2	12	748204	748215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338706640
239	NC_015714	ATCTAG	2	12	753299	753310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706644
240	NC_015714	CCACAC	2	12	756367	756378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706646
241	NC_015714	GCCCCT	2	12	756705	756716	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706647
242	NC_015714	TTTCCG	2	12	757559	757570	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706648
243	NC_015714	GACACC	2	12	761537	761548	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706653
244	NC_015714	GGCACA	2	12	765813	765824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706657
245	NC_015714	TTAAAG	2	12	771508	771519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338706661
246	NC_015714	ATTCCC	2	12	774163	774174	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338706664
247	NC_015714	AGTCCA	2	12	778283	778294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706666
248	NC_015714	CCTGCG	2	12	782674	782685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706672
249	NC_015714	ACGTGC	2	12	784132	784143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706673
250	NC_015714	TGCAAG	2	12	787089	787100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706679
251	NC_015714	CACCTG	2	12	788350	788361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706680
252	NC_015714	CTGCGC	2	12	789429	789440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706681
253	NC_015714	GGGCAG	2	12	789815	789826	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338706681
254	NC_015714	TGTGAC	2	12	792599	792610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706684
255	NC_015714	CGGGGG	2	12	793522	793533	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	338706685
256	NC_015714	TTTCCA	2	12	794109	794120	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706686
257	NC_015714	GCATAC	2	12	796095	796106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706687
258	NC_015714	TTGGAA	2	12	797548	797559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706689
259	NC_015714	TAACGT	2	12	800449	800460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706692
260	NC_015714	GAGCAA	2	12	802951	802962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706695
261	NC_015714	ACGCAG	2	12	803863	803874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015714	GCGAGC	2	12	805020	805031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706698
263	NC_015714	CATCTT	2	12	808983	808994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706700
264	NC_015714	AGAGCG	2	12	812458	812469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338706704
265	NC_015714	ACACGC	2	12	812698	812709	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
266	NC_015714	AACTCA	2	12	819031	819042	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338706711
267	NC_015714	GCACAC	2	12	821028	821039	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706713
268	NC_015714	GCAGGG	2	12	821150	821161	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
269	NC_015714	CCAGTC	2	12	826892	826903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706719
270	NC_015714	GCGCAC	2	12	838515	838526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706728
271	NC_015714	GCAAGC	2	12	843168	843179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706732
272	NC_015714	ACCCCT	2	12	844501	844512	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338706734
273	NC_015714	ACACGC	2	12	846226	846237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706736
274	NC_015714	CAGAGA	2	12	846885	846896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
275	NC_015714	CTGCGC	2	12	855319	855330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706743
276	NC_015714	GCATCT	2	12	857103	857114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706745
277	NC_015714	GTGCAC	2	12	863169	863180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_015714	GGTATC	2	12	866994	867005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706752
279	NC_015714	CACGCG	2	12	870491	870502	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706754
280	NC_015714	AAAGAC	2	12	875725	875736	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338706761
281	NC_015714	TGCTCC	2	12	876861	876872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706763
282	NC_015714	CAAACA	2	12	878941	878952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706765
283	NC_015714	CCATCC	2	12	883671	883682	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_015714	CACCTT	2	12	885812	885823	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338706772
285	NC_015714	CAGGTG	2	12	890016	890027	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706776
286	NC_015714	AAAGAC	2	12	892724	892735	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338706780
287	NC_015714	TATCAG	2	12	895159	895170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706782
288	NC_015714	CTGCGC	2	12	898802	898813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706784
289	NC_015714	GGCGCA	2	12	900965	900976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706786
290	NC_015714	GCGATA	2	12	904338	904349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706788
291	NC_015714	TTTTCA	2	12	917486	917497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338706803
292	NC_015714	CTTCTG	3	18	918814	918831	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706804
293	NC_015714	CAAGCT	2	12	921781	921792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706805
294	NC_015714	ACAGGC	2	12	923688	923699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706805
295	NC_015714	AGCAGT	2	12	931513	931524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706810
296	NC_015714	CTTGCG	2	12	931570	931581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706810
297	NC_015714	TCGTAT	2	12	931810	931821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706810
298	NC_015714	CAATCG	2	12	932594	932605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706811
299	NC_015714	GCGCAA	2	12	933485	933496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706811
300	NC_015714	GCTCCT	2	12	934935	934946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706812
301	NC_015714	GCGCTC	2	12	936057	936068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706813
302	NC_015714	GCAGGA	2	12	938658	938669	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	338706815
303	NC_015714	AAATGG	2	12	940898	940909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706816
304	NC_015714	AAGCTC	2	12	941348	941359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706816
305	NC_015714	AAAGGT	2	12	944434	944445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706821
306	NC_015714	CTGCGC	2	12	944918	944929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706821
307	NC_015714	CAACAT	2	12	949909	949920	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338706827
308	NC_015714	CAAAAA	2	12	955244	955255	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338706832
309	NC_015714	TTCTCC	2	12	960358	960369	0 %	50 %	0 %	50 %	338706836
310	NC_015714	ACTCGA	2	12	960376	960387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706837
311	NC_015714	AGATCA	2	12	961764	961775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338706838
312	NC_015714	AGCAAC	2	12	962148	962159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338706838
313	NC_015714	CTTTCC	2	12	963084	963095	0 %	50 %	0 %	50 %	338706840
314	NC_015714	CTGATA	2	12	964526	964537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338706840
315	NC_015714	GGCTTG	2	12	969576	969587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706845
316	NC_015714	GGCTTG	2	12	969831	969842	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706845
317	NC_015714	CAGCTC	2	12	972020	972031	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706846
318	NC_015714	ACCTGC	2	12	974429	974440	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338706846
319	NC_015714	TCTTCA	2	12	975824	975835	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706847
320	NC_015714	CAGCCA	2	12	978101	978112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706848
321	NC_015714	TCTGCG	2	12	982233	982244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706853
322	NC_015714	GGACGT	2	12	982816	982827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706854
323	NC_015714	ACAAAC	2	12	983000	983011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706855
324	NC_015714	ACGGCG	2	12	986332	986343	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706859
325	NC_015714	GAGCAG	2	12	988895	988906	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
326	NC_015714	CTTGCA	2	12	992864	992875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706868
327	NC_015714	CAGCGC	2	12	993569	993580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706868
328	NC_015714	TACCGT	2	12	997582	997593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706871
329	NC_015714	TGGCGG	2	12	1003983	1003994	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706876
330	NC_015714	ACGCTG	2	12	1004307	1004318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706876
331	NC_015714	ACTGAC	2	12	1011215	1011226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706880
332	NC_015714	GCGCGT	2	12	1013862	1013873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706882
333	NC_015714	AAAAGA	3	18	1025328	1025345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338706895
334	NC_015714	TGCCTC	2	12	1031286	1031297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706901
335	NC_015714	CGGTTA	2	12	1038902	1038913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706909
336	NC_015714	CTCGCC	2	12	1039662	1039673	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706909
337	NC_015714	CATGTT	2	12	1044531	1044542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706914
338	NC_015714	TTCGCC	2	12	1044603	1044614	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706914
339	NC_015714	CCCGCT	2	12	1045297	1045308	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706914
340	NC_015714	TCTTGC	2	12	1046378	1046389	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338706915
341	NC_015714	GCCACC	2	12	1053848	1053859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338706922
342	NC_015714	GGAGCC	2	12	1058693	1058704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706927
343	NC_015714	GGTGCG	2	12	1060909	1060920	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706929
344	NC_015714	AGAGGA	2	12	1061696	1061707	50 %	0 %	50 %	0 %	338706930
345	NC_015714	GAGGTG	2	12	1064343	1064354	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338706932
346	NC_015714	TCTTTT	2	12	1066424	1066435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338706933
347	NC_015714	ACGCAG	2	12	1069684	1069695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706937
348	NC_015714	TATGAG	2	12	1074821	1074832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706942
349	NC_015714	TGACGA	2	12	1083540	1083551	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706946
350	NC_015714	ATCTGC	2	12	1089686	1089697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706952
351	NC_015714	AACTCC	2	12	1091888	1091899	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338706953
352	NC_015714	AAAGCG	2	12	1092649	1092660	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706954
353	NC_015714	ACTGCA	2	12	1094694	1094705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706955
354	NC_015714	TAATTC	2	12	1098031	1098042	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338706958
355	NC_015714	CATGCA	2	12	1099146	1099157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706959
356	NC_015714	AGGGGG	2	12	1106768	1106779	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
357	NC_015714	GCCCTC	2	12	1107951	1107962	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	338706968
358	NC_015714	CTGTGC	2	12	1108875	1108886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706969
359	NC_015714	CGCCTT	2	12	1110369	1110380	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706970
360	NC_015714	TCTGCA	2	12	1111957	1111968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706971
361	NC_015714	ATGCGT	2	12	1113773	1113784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706976
362	NC_015714	GCTGAC	2	12	1120254	1120265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706980
363	NC_015714	AATTTC	2	12	1121510	1121521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338706981
364	NC_015714	AGCCCC	2	12	1122383	1122394	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338706982
365	NC_015714	TCCTCG	2	12	1123398	1123409	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338706983

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.